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Description

Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs discontinus de 1 à 400 pbs sont présentés ici regroupés en classes successives de A0 à D33. Ce regroupement est utilisé dans le classement des diagrammes continus et discontinus au chapitre correspondant.

Les abscisses sont la somme de 10 en 10 fréquences successives (fq10) et les ordonnées en pour 1000 (‰) du total des intercalaires positifs discontinus du génome, fx‰. La courbe de tendance est un polynôme de d°3 (poly 3). Y sont ajoutés les effectifs du diagramme (diagr) et du total. L'ordre du diagramme, ou classe, est indiqué entre deux, verticalement, en 1er celui du haut et en 2ème celui du bas. Exemple A2 B1: A2 classe de abq et B1 classe de agrc.
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Série cD32, de la classes D32 D33. Les liens à ces pages sont    ksk   agrl.
Date 27.01.23
Source Travail personnel
Auteur Mekkiwik

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actuel18 février 2023 à 15:12Vignette pour la version du 18 février 2023 à 15:121 873 × 777 (318 kio)Mekkiwikajout de diagramme des classes, 3 corrélations, 2 étendus et 5 courbures
27 janvier 2023 à 16:18Vignette pour la version du 27 janvier 2023 à 16:181 870 × 300 (106 kio)MekkiwikSuite à une modification globale de ces diagrammes, je les publie ordonnés par classe et non génome par génome non ordonnés.
29 janvier 2022 à 11:36Vignette pour la version du 29 janvier 2022 à 11:361 313 × 804 (182 kio)Mekkiwikmise à jour sur les effectifs après le contrôle du 25.1.22
15 décembre 2021 à 17:22Vignette pour la version du 15 décembre 2021 à 17:221 313 × 809 (182 kio)Mekkiwikchangement 31-400 en 51-400
11 décembre 2021 à 20:54Vignette pour la version du 11 décembre 2021 à 20:541 312 × 808 (164 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs, continus et discontinus de 1 à 400 pbs et de 31 à 400, sont présentés ici pour montrer la grande différence entre continus et discontinus. Les abscisses...

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