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Description

Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs discontinus de 1 à 400 pbs sont présentés ici regroupés en clade. Ce regroupement est utilisé dans la comparaison entre les diagrammes continus et discontinus au chapitre correspondant. Les diagrammes présentés ici illustrent les colonnes fcp et corelaxc du tableau dudit chapitre.

Les abscisses sont la somme de 10 en 10 fréquences successives (fq10) et les ordonnées en pour 1000 (‰) du total des intercalaires positifs continus du génome, fc%. La courbe de tendance est un polynôme de d°3 (poly 3). Y sont ajoutés les effectifs du diagramme (diagr) et du total. La corrélation cx est indiquée entre deux diagrammes, verticalement, en 1er celui du haut et en 2ème celui du bas.
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Les liens à ces pages sont     ksk    npu    sma    aua    rpl    mba    mja    cdc   
Date 06.02.23
Source Travail personnel
Auteur Mekkiwik

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actuel6 février 2023 à 15:49Vignette pour la version du 6 février 2023 à 15:491 870 × 596 (188 kio)MekkiwikSuite à une modification globale de ces diagrammes, je les publie ici regroupés avec de nouvelles cractéristiques.
31 janvier 2022 à 20:13Vignette pour la version du 31 janvier 2022 à 20:13917 × 777 (150 kio)Mekkiwikmise à jour sur les effectifs après le contrôle du 25.1.22. Normalistion des étiquettes.
28 octobre 2021 à 17:08Vignette pour la version du 28 octobre 2021 à 17:08870 × 714 (127 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs et continus de 1 à 40 pbs se sont révélés intéressants parce qu'ils présentent des courbes semblables. :Le [[v:fr:Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tR...

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