Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Cette image présente les différents paramètres nécessaires pour la construction du tableau de classement des formes des courbes de tendance en moyennes glissantes et du tableau de classement du rebond des courbes de tendance en polynôme de d°3. Ici les 3 courbes, du haut, montrent l'exemple du génome agrc de forme M5 en moyennes glissantes; les 3 courbes, en bas, comparent les 2 tendances, polynôme et moyennes glissantes, pour 3 génomes, cbei de forme E2 et rru et cdc de forme E1. Les tableaux de paramètres, en bas de ces courbes, permet de relier les nombres indiqués sur le diagramme, à ces paramètres. C'est pour une raison de clarification que j'ai repris ces nombres, et non leurs libéllés, qui étaient nécessaires pour la clareté des formes en moyennes glissantes.

• Les données intercalaires, en freq10   agrc cbei rru cdc,  en freq1  agrc cbei rru cdc
• Les calculs: la légende des paramètres et le détail des calculs sont dans la page du génome abs et les résultats des 4 génomes, dans  agrc  cbei  rru cdc 
• Les courbes: en rouge, ce sont les tendances en moyennes glissantes de période 9 (mg9); en bleu, les tendances en polynôme de d°3 définies sur les plages xm-abscis. Les courbes en mg9 de xm à 400 ne changent pas quand la plage de définition change (les 2 diagrammes de agrc). La courbe en fréquences freq10 montre l'abscisse du minimum local, ici il est de 50 pour agrc et le minimum local des courbes en poly3 et en fréquences freq1 est pris arbitrairement au milieu de freq10, ici 45 puisque freq10 de 5 s'étale entre 41 et 50. Pour les autres génomes le minimum local est à trouver dans les données intercalaires, en freq10, en général entre 30 et 60.
• Les droites de référence pour le calcul des rebonds. Elles sont fléchées pour définir leur longueur: en noir oblique (ou diagonale) pour les courbes rouges en mg9, en rouge horizontale pour les courbes bleues en poly3.
• Les nombres: pour les courbes bleues ce sont des étoiles indiquant les abscisses xm et flexa, flexo est à la veticale de flexa coupant la courbe bleue; pour les courbes rouges il y a en général 4 nombres et 3 si les 2 xm sont identiques et ce dernier est représenté par l'étoile, ce sont les gros points gris des abscisses xm x1m bornf puis l'ordonnée de xm en gros point noir.
• Les coefficients de détermination R2: R2.21 est celui des courbes en polynôme de d°21 de 1 à 400 en freq1 (la courbe n'est pas présentée dans les diagrammes des formes), il est à comparer à celui de poly3, R2.3, affiché seulement pour les courbes ici.
• Le calcul des rebonds: courbe rouge, supd est la somme des différences "ordonnée(x) moins ordonnée de la diagonale de la courbe rouge (pte*x+cste)" pour une abscisse x donnée et supdt le total des intercalaires de la plage xm-x1m; les rebonds supf et supft sont calculés de la même façon mais limités à la plage xm-bornf; courbe bleue, sup4 est la somme des différences "ordonnée(x) moins flexo", et sup4t le total des intercalaires de la plage xm-flexa. Les rebonds supf et sup4 sont comparables puisqu'ils sont liés à la forme, par contre supdt et sup4t ne peuvent pas être comparés puisqu'ils sont définis sur des plages de nature différente, xm-flexa variable avec la forme et xm-x1m qui ne l'est pas. J'ai ajouté la pente au point d'inflexion pour la comparer à la pente de la diagonale.