« Recherche:Genèse et duplication des gènes des tRNAs » : différence entre les versions
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*C'est en cherchant à dépasser cet handicap que je me suis mis à étudier les gènes de tRNAs de la base gtRNAdb. Article sur l'invalidation du "codon usage" <ref>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29859934</ref>.
*D'abord l'étude était limitée aux effectifs des 111 génomes étudiés pour les corrélations, pour contrer le "codon usage". Ensuite je l'ai étendue au grand nombre des bactéries puis des archées et enfin aux eucaryotes pour trouver une corrélations des tRNas entre domaines. La corrélation trouvée me confortait dans l'idée que le comportement des gènes de tRNAs n'était pas lié aux aas qu'ils auront à traduire une fois transcrits et modifiés en tRNA.
*Pour éliminer toute relation avec les aas, et donc au "codon usage", je me suis mis à étudier les processus qui modifient les gènes de tRNAs, dans l'ADN, sans considération pour la traduction. Ainsi les duplications à l'identique ou non d'un gène tRNA et l'insertion ou non d'un intron dans ce gène, produisent toujours un tRNA qui traduit toujours le même codon, mais ses comportements vis à vis de ces processus obéissent aux lois physique de l'ADN lors des réparations, de la transcription et de la réplication. Ainsi 4 processus spectaculaires régissent les gènes de tRNAs sans pour autant bouleverser de même "le codon usage", c'est
*#la [[/Annexe/Tableaux#Multiplicit%C3%A9_Tableau_I|bascule]] entre les gènes de tRNA des codons se terminant par la '''base c''' chez les procaryotes aux gènes des codons se terminant par la '''base t''' chez les eucaryotes;
*#l'abscence quasi totale des gènes de tRNA du [[/Annexe/Tableaux#Les_introns_des_eucaryotes._Effectifs|'''codon ata''']] (Ile) chez les procaryotes avec leur remplacement par des gènes de tRNA du '''codon atg''' et leur présence systématique chez les eucaryotes rendue possible par l'insertion d'un intron en leur sein;
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