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Les sols constituent la partie superficielle de la croûte terrestre. Ils sont formés à partir de l’altération de la roche mère et par la décomposition de la litière et de la matière organique. <ref>Sol (pédologie). In Wikipédia [en ligne]. Disponible sur https://fr.wikipedia.org/w/index.php?title=Sol_(pédologie)&oldid=170278112. (consulté le 01.05.2020)</ref>Ceux-ci sont à la fois constitués d’une '''partie solide regroupant les matières minérales et organiques ainsi que d’une partie fluide regroupant les gaz, liquides ou solutions''' contenant des ions ou minéraux. La proportion de ces deux parties dépend du type de sol, de sa localisation ou encore de son hydratation.
 
Ce sont les ions, les sels minéraux tels que l’azote (N), le magnésium (Mg), le phosphore (P) ou encore le calcium (Ca) et l’eau présents dans les sols, que les plantes assimilent et consomment afin de permettre leur développement. '''Plus un sol est riche en ces différents sels minéraux, plus il sera décrit comme fertile'''. Un '''ensoleillement''' suffisant et une '''température''' adéquate sont aussi des éléments permettant de juger la fertilité d’un sol. En se développant, les plantes appauvrissent les sols en leur retirant leurs minéraux mais lorsque la plante meurt, celle-ci va se décomposer et par différents procédés, rendre à la terre ces différents minéraux. On comprend donc que dans le cas de culture de terres où l’objectif est de récolter les plantes sans utiliser d’engrais, le sol s’épuise petit à petit de ses ressources, le rendant donc moins fertile. On appelle ce phénomène la '''désertification'''. <ref>Analyse de sol. Capinov.[en ligne] Disponible sur https://www.capinov.fr/analyse-de-sol-laboratoire-php.php. (consulté le 14.05.2020)</ref>On peut par exemple noter que la culture d'une tonne de blé par hectare retire au sol kg de Ca et de Mg, 2,5 kg de S, 4 kg de K, 4,5 kg de P et 20 kg de N.
 
Les sols obtiennent ces précieux nutriments et sels minéraux de différentes manières.
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<ref name=":1" />Pour l’azote, il existe plusieurs procédés. Le premier a lieu lors des orages. L'azote de l’air peut réagir avec l’oxygène pour former de l’oxyde d’azote qui sera amené par les pluies dans les sols. De plus, il existe des bactéries appelées Azotobacter dans le sol qui synthétisent de l’azote directement à partir de l’azote atmosphérique. Enfin, il existe des micro-organismes (Rhizobium) vivant en symbiose avec les plantes à qui ils fournissent des composés azotés en échange de matière organique.
 
Le reste des minéraux est amené par la décomposition de la litière. <ref>La terre et l'humus. Luxorion. [en ligne]. Disponible sur http://www.astrosurf.com/luxorion/eco-terre-humus.htm<nowiki/>(consulté le 14.05.2020)</ref>Cela s’effectue en deux étapes : la transformation de la litière en humus (humification) puis la minéralisation de cet humus. Toute la matière organique déposée en surface (tiges, feuilles mortes, cadavres, déchets organiques) est décomposée par les divers organismes de la faune épigée : acariens, mille pattes, collemboles, crustacés, bactéries, champignons, actinomycètes ou des lombrics et scarabées. On estime qu’il y aurait entre dix millions et un milliard de bactéries par gramme de sol. Toute cette faune crée des galeries dans le sol, l'aérant et permettant la bonne porosité de celui-ci. Ces organismes se nourrissent du sucre, des protéines, de la cellulose présents dans la matière organique afin de les transformer en matière minérale. Cette matière forme l’humus et ce procédé peut durer quelquesjusqu'à semaines voire quelquesplusieurs semaines, en fonction du type de sol et des conditions météorologiques. Puis, sous l’action d’autres micro-organismes, l’humus s’oxyde et se décompose en libérant l’eau, les gaz et les sels minéraux qu’il contient; c’est le phénomène de minéralisation. Ainsi, les matières organiques resituent aux sols les minéraux qu’elles avaient absorbé.
 
D'autres acteurs participent au bon fonctionnement d'un sol. On distingue la '''faune endogée''' qui se nourrit des racines mortes des plantes et nettoie le sous sol pour préparer les galeries suivantes. Cette faune comprend les mêmes groupes que la faune épigée : thysanoures, collemboles, acariens, myriapodes. Ces espèces sont par contre plus petites que celles de la faune épigée et souvent de couleur blanche. Ces êtres vivants sont plus allongés afin de suivre les réseaux des racines les plus fines. Grâce à toute cette faune, les racines mortes ne s’accumulent pas dans le sol, laissant la place à l’eau et aux nouvelles racines des plantes se développant. Elle assure une porosité de 60% au sol de profondeur, ce qui permet la respiration des racines. On remarque également la faune anécique (vers de terre ou grands lombrics). Les êtres vivants qui la composent font des allers-retours entre le sous sol et la surface du sol, ils remontent des argiles (ions chargés négativement) des strates inférieures du sol, les mélangent avec l'humus (ions négatifs) des strates supérieures du sol. Ils ont la glande de Morren riche en Calcium (ions positifs) et c’est dans leur intestin que se forme le complexe argilo-humique.