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*: - Le typage x y z, les longueurs de z: Si les annexes permettent de repérer les duplications avec ou sans rRNAs, les fiches ne concernent que les clusters à rRNAs sans l'encombrement des intercalaires. J'ai échantillonné chaque clade avec le 1er génome de la rupture du tri sur les 2 1ers qualificatifs du nom. Cette étude m' a permis alors de définir plus proprement les types et notamment de définir les 3 longueurs de z, sans 1-3 et >3 tRNAs. Ainsi sont apparus les 1-3 majoritaires de z dont l'exemple impressionnant des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria|alphas]]. L'abondance d'un type donné de z1-3 pose alors le [[#Les_types_1-3_majoritaires|problème du génome]]: est-ce que cette abondance est due au fait que je suis tombé sur un génome particulier ou bien c'est une propriété générale. Dans la quasi totalité des cas il y a plusieurs génomes pour un type donné.
*: - Le typage x-y-z', x n'est pas un accident: Ce n'est qu'à la [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Synth%C3%A8se_par_clade#Type_x_synth%C3%A8se|synthèse finale sur les x]] que j'ai démontré leur existence propre et qu'ils ne sont pas dus à un réassemblent au hasard, par les réparations de l'ADN, d'un cluster 16s-y-23s5s-z. Les destructions et les réassemblements sont étudié dans les comparaisons entre 2 génomes proches phylogénétiquement: [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_eco|ecoN-eco]], [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_lmo|bsu-lmo]], [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#Peptoclostridium_difficile_CD196|cdc]] - [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_opérons|cdc8]].
 
=====généralités=====
*les longueurs, les taux, les génomes, les cds, les 16s5s23s, les cassés deino, les z' équivalents aux z. Sans z 1-3 4-8 9-23
=====Hypothèse de la contrainte physique du cluster=====
 
=====sans z=====
 
=====1-3=====
=====4-8=====
=====9-23=====
=====conclusion=====
* En conclusion: Malgré la ressemblance forte entre clostridia et bacilli pour les z longs, que ça soit les z9-23 (23 tRNAs jaunes) ou les z4-8 (17 sur 23 jaunes), les bascules fortes rouges ttg gca aga, la déficience en atgf chez les z4-8 et les caractéristiques uniques des x9-23 des bacilli ainsi que les nombreuses petites différences relevées (notamment les bascules des z4-8) laissent penser que chaque type de longueur z ou x correspond à un processus de création différent, Ce sont z1-3 z4-8 z9-23 et pour les avant 16s, x1-3 x4-8 x9-23 z'1-3 z'4-8 z'9-23.