« Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Synthèse par clade » : différence entre les versions

Contenu supprimé Contenu ajouté
Ligne 912 :
*: - Cela explique aussi que les types x de x-16s-y-23s5s-z' fassent intervenir des tRNAs et des séquences différentes des z, avec des fréquences plus faibles, car ce processus x change le sens de la direction de réparation/réplication qui, apparemment se fait dans le sens 16s 23s 5s.
*: - La destruction des clusters conserve les séquences de tRNAs et ne détruit que les rRNAs. Voir
*: - Un autre processus est à l'origine de la création de séquence de tRNAs dans les clusters sans rRNAs où les gènes sont répétés alors que dans les clusters avec rRNAs les gènes ne sont jamais répétés. Cas des actinomycètes où le processus z est réduit à 2 z1-3 pour 354 blocs étudiés.
*: - Si on revient au processus de création de type alphabet, nous voyons que le processus par modèle le reproduit mais par gène maiset pasnon par base par base. Le gène tRNA étant rigide (feuille de trèfle) le modèle est reproduit à l'identique sauf pour 3 bases (codon) ou 5 (codon plus les 2 bases l'entourant très sensibles lors de la maturation des ttRNAs) qui varient sous la contrainte physique du cluster dans le bloc de réparation.
*: - La synthèse des z longs supérieurs à 3 m'a conduit à penser que même les comparaisons B-C révèlent la différence entre les 2 clusters qui contraignent différemment la réparation.
*: - L'ajout des autres firmicutes ne modifie pas les résultats.
*: - La comparaison entre proteobacteria, alpha + gamma, obéit toujours à la même hypothèse de la contrainte phsique du cluster.
 
=====Différents comportements des z=====