« Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Firmicutes » : différence entre les versions

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*Synthèse de toutes les [[#B-C_blocs_longs_bascules_z9-23_dans_tout_type|bascules rouges dans tout type]] de blocs z9-23 z4-8 x9-23: à noter la bascule très forte de cgt et le changement de sens de atgj entre z9-23 et z4-8.
*[[#B-C_blocs_longs_comparaisons_synthèse|Synthèse des bascules]] dans les comparaisons entre blocs longs: A noter l'importance aussi grande des bascules 9-23/4-8 que celles des B9-23/C9-23, 8 contre 7 tRNAs.
=====Firmicutes z1-3=====
{| class="wikitable" style="font-family:Liberation,serif;border:2px solid black;"
|+z1-3. B+C z+z', comparaison des 1-3 aux 9-23 et 4-8. Parallèle avec Bx9-23.
|-style="border-bottom:2px solid black;"
|
{| class="wikitable" style="font-family:Liberation,serif;border:2px solid black;"
|+z9-23. Codon simples forts
|-style="border-bottom:2px solid black;"
!tRNA!!B+C z9-23!!B+C z4-8!!Bx9-23!!B+C z1-3
|-
|bgcolor="#ff6600"| atgi||bgcolor="#ffff00"| 16||16||||'''67
|-
|bgcolor="#ff6600"| atgj||bgcolor="#ffff00"| 26||26||||
|-
|tgc||bgcolor="#ffff00"| 19||5||||24
|-
|tgg||bgcolor="#ffff00"| 26||bgcolor="#66ffff"| ||8||5
|-
|bgcolor="#ff6600"| gca||bgcolor="#ffff00"| 21||26||16||'''67
|-
|cac||bgcolor="#ffff00"| 16||bgcolor="#66ffff"| ||bgcolor="#99ff33"| ||bgcolor="#66ffff"|
|-style="border-bottom:2px solid black;"
|atc||bgcolor="#ffff00"| 30||10||24||14
|-
|ttc||41||26||bgcolor="#99ff33"| 8||'''91
|-
|tac||38||57||bgcolor="#99ff33"| ||bgcolor="#66ffff"|
|-
|aac||38||'''88||73||'''239
|-
|cca||38||36||'''81||bgcolor="#66ffff"|
|-
|caa||39||47||73||bgcolor="#66ffff"|
|-
|aaa||49||52||73||'''81
|-
|atgf||50||bgcolor="#66ffff"| 5||24||'''105
|-
|gac||55||78||81||'''100
|-
|gaa||56||'''98||73||24
|-
|gta||57||'''93||57||14
|}
||
{| class="wikitable" style="font-family:Liberation,serif;border:2px solid black;"
|+z9-23. Codons multiples forts
|-style="border-bottom:2px solid black;"
!tRNA!!B+C z9-23!!B+C z4-8!!Bx9-23!!B+C z1-3
|-
|bgcolor="#ff6600"| aga||bgcolor="#ffff00"| 14||16||||
|-style="border-bottom:2px solid black;"
|bgcolor="#ff6600"| cgt||bgcolor="#ffff00"| 33||36||'''81||10
|-
|gga||38||41||'''65||10
|-style="border-bottom:2px solid black;"
|ggc||49||57||24||bgcolor="#66ffff"| 5
|-
|acc||bgcolor="#ffff00"| 14||'''31||||'''57
|-style="border-bottom:2px solid black;"
|aca||bgcolor="#ffff00"| 14||52||16||bgcolor="#66ffff"| 5
|-
|agc||19||10||'''65||
|-
|bgcolor="#ff6600"| tcc||14||5||||
|-style="border-bottom:2px solid black;"
|tca||30||bgcolor="#66ffff"| 5||16||5
|-
|ctg||bgcolor="#ffff00"| 10||||||5
|-
|bgcolor="#ff6600"| ttg||bgcolor="#ffff00"| 15||||||
|-
|tta||bgcolor="#ffff00"| 27||16||24||14
|-style="border-bottom:3px solid black;"
|cta||bgcolor="#ffff00"| 29||31||49||bgcolor="#66ffff"|
|-
|4 xxc||16||||'''57||10
|-
|11 xxg||16||26||||19
|-
|autres||||10||8||29
|-
|eff||1092||193||123||209
|}
|}
 
==Noms firmicutes==