« Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Synthèse par clade » : différence entre les versions
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Conjugaison |
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====Type z synthèse====
=====Historique du typage x-16s-y-23s5s-z=====
*La question des duplications des tRNAs reliées à leurs fonctions (
*: - Les intercalaires: Très vite est apparue l'idée que la structure en boucle du tRNA devrait opposer une résistance à la réplication et aux réparations de l'ADN. Ceci aurait pour conséquence une destruction du tRNA et surtout des rRNAs qui contiennent l'équivalent de 1 20 40 structures de type tRNA pour respectivement 5s 16s 23s. Cette opposition aux maintenances de l'ADN engendre aussi la conservation de ces gènes de génération en génération. Elle devrait se traduire aussi par une très grande variabilité des intercalaires. C'est ce que j'ai mis en évidence dans cette première approche.
*: - 1ère ébauche du typage. En partant toujours de l'article (ref article2) qui m'a mis sur la voie des opérons à RNAs j'ai étudié les duplications chez [[Recherche:Gen%C3%A8se_et_duplication_des_g%C3%A8nes_des_tRNAs/Annexe/Tableaux#Les_duplications_par_op%C3%A9rons_sans_rRNAs:_eco_eal|E.Coli]], où la duplication ne se fait plus dans ces opérons, mais dans un cluster de tRNAs seuls. Ce qui m'a amené à comparer les intercalaires en relation avec le %GC de 16 génomes. Petit à petit sont apparus alors les types z et y (notation, 16s-y-23s5s-z ou x-16s-y-23s5s-z'), d'abord z puisqu'il est à l'origine des duplications et les différences de celles-ci entre bsu et eco, ensuite est apparu y qui s'imposait par la constance du cas '''atc-gca''' qui n'a aucune relation avec la fonction des tRNAs.
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