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====ase intercalaires rRNA====
*Voir la présentation des blocs à rRNA dans le chapitre [[#ase_blocs|ase blocs]] de l'étude préliminaire. A comparer avec le tableau [[#ase_autres_intercalaires|ase autres intercalaires]].
*Remarque: '''ase''' a 6 blocs à rRNAs seuls. Trois sont sur le brin de référence et les 3 autres sur le brin complément. Les intercalaires cds-16s sont tous plus grands que ceux 5s-cds. Par exemple le 1er bloc a 556 et 134 pbs pour respectivement cds-16s et 5s-cds. Cette orientation est quasiment générale chez tous les génomes que j'ai étudié ici. Je l'ai notée dans les chapitres '''génome-bloc''' de chaque génome.
*Note: J'ai supposé souvent que les blocs à tRNA sans rRNA sont aussi orientés de l'intercalaire le plus grand au plus petit. Dans [[#ase _cumuls|ase cumuls]] et de même pour les autres génomes, j'ai noté cette orientation dans la colonne cdsd, pour cds dirigé. Je n'ai conservé pour les calculs que le plus petit intercalaire des 2 cds bordant le bloc. L'idée était que cette orientation provoquait la création du cds en fin de bloc. Ces cds sont souvent de petites protéines et souvent hypothétiques. Aussi je présente ci-dessous la transformation deb-fin, du chapitre précédent, qui est imposée par l'adressage en intercalaire plus grand et plus petit.
<pre>
deb fin tri grand petit* tri grand petit
78 202 17 132 -12 25 19 19
279 257 8 42 8 26 31 23
387 151 18 296 13 8 42 8
595 338 24 151 19 35 69 51
92 274 25 19 19 43 81 37
434 817 27 278 22 16 91 54
185 74 26 31 23 12 103 79
42 8 28 409 32 47 116 91
1343 459 31 699 34 17 132 -12
430 148 32 411 35 38 136 112
94 138 43 81 37 37 136 116
79 103 19 373 38 11 138 94
55 221 22 1132 38 24 151 19
203 89 30 317 43 36 167 55
262 244 21 827 47 44 171 64
91 54 35 69 51 45 175 136
132 -12 16 91 54 34 178 113
296 13 13 221 55 7 185 74
373 38 36 167 55 1 202 78
217 315 44 171 64 14 203 89
47 827 40 419 65 46 204 190
38 1132 42 599 71 13 221 55
362 131 7 185 74 15 262 244
19 151 50 1017 77 5 274 92
19 19 1 202 78 27 278 22
23 31 12 103 79 2 279 257
22 278 14 203 89 18 296 13
409 32 47 116 91 41 296 135
104 345 5 274 92 20 315 217
317 43 11 138 94 30 317 43
699 34 29 345 104 29 345 104
35 411 38 136 112 23 362 131
412 380 34 178 113 48 370 329
113 178 37 136 116 19 373 38
69 51 23 362 131 3 387 151
167 55 41 296 135 28 409 32
136 116 45 175 136 32 411 35
136 112 10 430 148 33 412 380
546 451 3 387 151 40 419 65
65 419 46 204 190 10 430 148
135 296 20 315 217 49 524 408
599 71 15 262 244 39 546 451
81 37 2 279 257 4 595 338
64 171 48 370 329 42 599 71
136 175 4 595 338 31 699 34
190 204 33 412 380 6 817 434
91 116 49 524 408 21 827 47
329 370 6 817 434 50 1017 77
524 408 39 546 451 22 1132 38
77 1017 9 1343 459 9 1343 459
</pre>
*Comparaison cds-cds tRNA-cds: deb fin, c'est l'ordre des adresses et grand petit l'ordre après réorientation. Leur pourcentage est calculé par rapport à la colonne, c'est à dire la moitié du total des tRNA-cds. Voir le tableau des [[#ase_les_fréquences|cds-cds]] de la bactérie '''ase''', et les doublets tRNA-cds ci-dessus.
<pre>
actino cds total total <0 0-200 201-370 371-600 >600 deb fin grand petit
ase cds-cds 8,256 8197 1652 4867 1047 399 232
ase cds ‰ 202 593 128 49 28
ase tRNA ‰ 10 570 200 160 60 600 540 360 780
ase tRNA 100 1 57 20 16 6 30 27 18 39
</pre>
*Calculs: voir [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/g%C3%A9nomes_synth%C3%A8se#tRNA-cds_calculs|les détails]]
<pre>
actino cds total total <0 0-200 reste cds≥0 bornes p q tRNAs
ase cds-cds 8 256 8197 1652 4867 1678 6545 petit 0,744 0,256 49
ase cds ‰ 202 744 256 42,310 p2 2pq 1-q2 q2
ase tRNA 100 1 57 42 49,249 0,553 0,381 0,934 0,066
calculs proba effect attendu plage 2σ grand varq varp attendus
petit 0,744 39 45,8 42 – 49 3,5 20,135 nq2(1-q2) np2(1-p2) petit grand
grand 0,256 17 27,1 20 – 34 7,0 34,056 3,009 12,113 45,779 27,096
</pre>
==Bifidobacterium longum NCC2705==
===blo opérons===
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