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Recherche:Genèse et duplication des gènes des tRNAs/Annexe/Tableur

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Tableur
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Annexe 2
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Paris le 01.08.18

Liste des génomes

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E79

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E79 liste

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Lien tableaux 

tRNAs;KEGG;Génome
1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009)
211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010)
414;aga;Anopheles gambiae
684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011)
7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1)
4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8)
639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X)
1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008)
743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3)
596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010)
827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008)
408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009)
13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1)
906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011)
383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008)
518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1)
554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1)
498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011)
1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3)
289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6)
256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0)
326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1)
494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007)
485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2)
3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011)
1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1)
283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011)
2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006)
203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1)
738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2)
435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011)
367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2)
622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013)
373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1)
82;lma;Leishmania major
2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009)
458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3)
353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2)
582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0)
155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009)
191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1)
258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003)
481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006)
469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011)
749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1)
252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2)
421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3)
338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3)
674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2)
856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007)
506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009)
738;osa;Oryza sativa
326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3)
1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010)
503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4)
476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2)
411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008)
2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2)
418;ppp;Physcomitrella patens 
35;pfa;Plasmodium falciparum
517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2)
618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) 
407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012)
334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1)
446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1)
374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2)
578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0)
804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2)
1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) 
807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3)
230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2)
575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3)
455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2)
540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007)
2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1)
5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2)
499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X)
2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009)
1198;zma;Zea mays (Version 5b.60)

E79 décomptes

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Lien tableaux 

acs;;;;aga;;;;aml;;;;ath;;;;bacu;;;;bdi;;;;bta;;;;cbr;;;;cbre;;;;cel;;;;cfa;;;;cge;;;;cjap;;;;cjc;;;;cmk;;;;cpic;;;;cpo;;;;csi;;;;dme;;;;dno;;;;dsi;;;;dya;;;;ecb;;;;eeu;;;;fca;;;;gac;;;;gfr;;;;gga;;;;ggo;;;;gmo;;;;gmx;;;;hgl;;;;hsa-18;;;;lav;;;;lcm;;;;lma;;;;mcc;;;;mdo;;;;meu;;;;mgp;;;;mlu;;;;mmr;;;;mmu;;;;mpu;;;;mtr;;;;mun;;;;nle;;;;oaa;;;;oas;;;;ocu;;;;oga;;;;oni;;;;opr;;;;osa;;;;pan;;;;pfa;;;;pha;;;;pma;;;;pop;;;;ppp;;;;ppy;;;;ptr;;;;rno;;;;san;;;;sbi;;;;sbq;;;;shr;;;;spu;;;;ssc;;;;str;;;;tgu;;;;tma;;;;tng;;;;tru;;;;tsy;;;;ttr;;;;vvi;;;;xtr;;;;zma;;;;;;dre;;;;
5;3;(AAC);;31;7;(AAC);;10;2;(AAC);;15;3;(AAC);;14;9;(AAC);;16;5;(AAC);;6;6;(AAA);;25;7;(AAC);;33;3;(AAC);;19;4;(AAC);;6;4;(AAC);;13;9;(AAC);;1;1;(AAA);;7;4;(AAC);;3;3;(AAA);;2;2;(AAA);;;;;;11;6;(AAC);;6;2;(AAC);;12;8;(AAC);;7;2;(AAC);;7;2;(AAC);;12;5;(AAC);;7;4;(AAC);;1;1;(AAA);;21;12;(AAC);;2;2;(AAC);;7;5;(AAC);;9;7;(AAC);;6;6;(AAA);;22;7;(AAC);;12;11;(AAC);;10;6;(AAC);;1;1;(AAA);;3;3;(AAC);;2;1;(AAC);;10;7;(AAC);;9;3;(AAC);;1;1;(AAA);;3;3;(AAC);;5;2;(AAC);;4;2;(AAC);;8;6;(AAC);;8;5;(AAC);;1;1;(AAA);;4;3;(AAC);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;12;8;(AAC);;1;1;(AAA);;8;2;(AAC);;7;5;(AAC);;18;7;(AAC);;1;1;(AAA);;1;1;(AAC);;9;4;(AAC);;2;2;(AAA);;6;5;(AAA);;2;2;(AAA);;10;6;(AAC);;11;5;(AAC);;1;1;(AAA);;;;;;16;7;(AAC);;6;4;(AAC);;8;1;(AAC);;2;2;(AAA);;10;6;(AAC);;1;1;(AAA);;2;2;(AAA);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;6;5;(AAC);;8;7;(AAC);;2;2;(AAA);;2;2;(AAA);;1;1;(AAA);;;;10;10;(AAA);;
4;2;(AAG);;5;2;(AAG);;7;5;(AAG);;12;3;(AAG);;6;2;(AAG);;14;7;(AAG);;20;13;(AAC);;26;5;(AAG);;32;3;(AAG);;20;6;(AAG);;4;1;(AAG);;5;2;(AAG);;23;4;(AAC);;8;4;(AAG);;22;16;(AAC);;16;15;(AAC);;6;2;(AAC);;6;3;(AAG);;4;1;(AAG);;5;2;(AAG);;5;1;(AAG);;5;1;(AAG);;7;2;(AAG);;6;2;(AAG);;8;4;(AAC);;49;18;(AAG);;4;3;(AAG);;3;3;(AAG);;9;5;(AAG);;21;13;(AAC);;16;1;(AAG);;5;3;(AAG);;9;4;(AAG);;41;34;(AAC);;4;3;(AAG);;3;1;(AAG);;9;7;(AAC);;8;3;(AAG);;8;3;(AAC);;1;1;(AAG);;3;2;(AAG);;5;2;(AAG);;5;3;(AAG);;6;2;(AAG);;17;6;(AAC);;3;3;(AAG);;11;7;(AAC);;23;16;(AAC);;7;4;(AAC);;5;3;(AAG);;6;3;(AAC);;14;9;(AAG);;5;3;(AAG);;15;4;(AAG);;9;5;(AAC);;1;1;(AAG);;9;5;(AAG);;166;70;(AAC);;17;4;(AAC);;13;3;(AAC);;16;10;(AAG);;11;6;(AAG);;8;5;(AAC);;7;2;(AAC);;15;4;(AAG);;7;3;(AAG);;9;3;(AAG);;20;3;(AAC);;8;3;(AAG);;18;14;(AAC);;9;8;(AAC);;11;8;(AAC);;10;7;(AAC);;19;11;(AAC);;6;3;(AAG);;6;1;(AAG);;15;7;(AAC);;55;19;(AAC);;22;11;(AAC);;;;232;86;(AAC);;
6;2;(AAT);;12;2;(AAT);;12;5;(AAT);;17;2;(AAT);;12;6;(AAT);;20;7;(AAT);;11;5;(AAG);;21;4;(AAT);;33;2;(AAT);;21;2;(AAT);;9;5;(AAT);;13;3;(AAT);;26;4;(AAG);;13;8;(AAT);;20;14;(AAG);;2;2;(AAG);;5;2;(AAG);;13;6;(AAT);;10;2;(AAT);;12;6;(AAT);;9;3;(AAT);;10;2;(AAT);;20;7;(AAT);;9;2;(AAT);;6;1;(AAG);;101;17;(AAT);;6;2;(AAT);;7;1;(AAT);;14;9;(AAT);;33;22;(AAG);;31;19;(AAT);;8;3;(AAT);;15;10;(AAT);;22;18;(AAG);;7;6;(AAT);;3;1;(AAT);;12;8;(AAT);;13;1;(AAT);;5;3;(AAG);;3;2;(AAT);;10;4;(AAT);;4;2;(AAT);;12;5;(AAT);;10;4;(AAT);;9;6;(AAG);;5;2;(AAT);;10;6;(AAG);;8;5;(AAG);;6;3;(AAG);;11;5;(AAT);;4;1;(AAG);;25;13;(AAT);;8;2;(AAT);;18;4;(AAT);;8;4;(AAG);;1;1;(AAT);;12;7;(AAT);;112;56;(AAG);;49;36;(AAG);;6;1;(AAG);;16;9;(AAT);;17;11;(AAT);;1;1;(AAG);;6;2;(AAG);;17;3;(AAT);;11;5;(AAT);;11;1;(AAT);;18;13;(AAG);;13;1;(AAT);;6;3;(AAG);;2;2;(AAG);;8;5;(AAG);;15;13;(AAG);;11;8;(AAG);;8;3;(AAT);;11;6;(AAT);;10;5;(AAG);;38;18;(AAG);;29;10;(AAG);;;;270;146;(AAG);;
4;2;(ACG);;10;1;(ACG);;8;3;(ACG);;11;7;(ACG);;2;2;(ACA);;16;4;(ACG);;18;4;(AAT);;22;5;(ACG);;2;2;(ACA);;18;4;(ACG);;6;5;(ACG);;1;1;(ACC);;26;6;(AAT);;6;2;(ACG);;31;23;(AAT);;11;9;(AAT);;10;3;(AAT);;10;6;(ACG);;10;1;(ACG);;24;24;(ACC);;9;1;(ACG);;12;1;(ACG);;10;4;(ACG);;6;3;(ACG);;10;2;(AAT);;49;12;(ACG);;6;5;(ACG);;8;4;(ACG);;1;1;(ACA);;26;21;(AAT);;13;2;(ACG);;4;4;(ACC);;7;2;(ACG);;43;30;(AAT);;5;5;(ACA);;4;1;(ACG);;2;2;(ACA);;4;4;(ACA);;6;2;(AAT);;2;2;(ACG);;6;5;(ACG);;1;1;(ACA);;1;1;(ACA);;6;3;(ACG);;23;9;(AAT);;3;2;(ACG);;13;9;(AAT);;27;17;(AAT);;6;3;(AAT);;7;3;(ACG);;10;4;(AAT);;1;1;(ACA);;7;3;(ACG);;1;1;(ACA);;14;9;(AAT);;1;1;(AGA);;2;2;(ACA);;110;63;(AAT);;20;6;(AAT);;12;3;(AAT);;7;3;(ACG);;1;1;(ACA);;12;7;(AAT);;15;8;(AAT);;15;4;(ACG);;1;1;(ACA);;4;4;(ACG);;69;12;(AAT);;1;1;(ACA);;14;8;(AAT);;40;35;(AAT);;13;8;(AAT);;18;10;(AAT);;12;3;(AAT);;1;1;(ACA);;6;5;(ACA);;15;6;(AAT);;63;18;(AAT);;69;37;(AAT);;;;258;129;(AAT);;
5;1;(AGA);;6;2;(AGA);;2;2;(ACT);;37;11;(AGA);;12;11;(ACC);;11;3;(AGA);;143;134;(ACA);;17;3;(AGA);;32;4;(ACG);;1;1;(ACT);;10;5;(AGA);;6;3;(ACG);;21;4;(ACG);;9;4;(AGA);;1;1;(ACA);;5;5;(ACA);;7;3;(ACG);;13;5;(AGA);;8;3;(AGA);;10;5;(ACG);;8;3;(AGA);;9;3;(AGA);;12;4;(AGA);;7;2;(AGA);;1;1;(ACA);;52;14;(AGA);;2;1;(AGA);;9;5;(AGA);;7;4;(ACG);;31;23;(ACG);;15;5;(AGA);;5;3;(ACG);;9;4;(AGA);;1;1;(ACA);;4;2;(ACG);;1;1;(AGA);;6;3;(ACG);;5;5;(ACG);;7;5;(ACG);;5;3;(AGA);;6;2;(AGA);;6;4;(ACG);;2;2;(ACC);;8;3;(AGA);;1;1;(ACA);;4;4;(AGA);;1;1;(ACA);;2;2;(ACC);;16;16;(ACA);;10;3;(AGA);;6;4;(ACG);;16;4;(ACG);;7;2;(AGA);;24;7;(ACG);;4;4;(ACA);;1;1;(AGC);;7;4;(ACG);;1;1;(ACC);;1;1;(ACA);;1;1;(ACC);;11;8;(AGA);;7;2;(ACG);;6;3;(ACG);;9;5;(ACG);;11;3;(AGA);;6;2;(ACG);;10;3;(AGA);;29;9;(ACG);;7;2;(ACG);;7;7;(ACC);;1;1;(ACA);;5;5;(ACA);;14;4;(ACG);;16;3;(ACG);;6;3;(ACG);;19;18;(ACC);;1;1;(ACA);;2;2;(ACA);;1;1;(ACA);;;;9;9;(ACA);;
12;6;(AGC);;17;4;(AGC);;10;4;(AGA);;16;3;(AGC);;9;6;(ACG);;19;3;(AGC);;20;20;(ACC);;29;7;(AGC);;20;4;(AGA);;15;4;(AGA);;14;11;(AGC);;6;1;(AGA);;19;5;(AGA);;15;13;(AGC);;2;2;(ACC);;7;5;(ACG);;8;2;(AGA);;23;16;(AGC);;12;2;(AGC);;10;3;(AGA);;9;1;(AGC);;18;4;(AGC);;27;16;(AGC);;14;10;(AGC);;2;2;(ACC);;53;22;(AGC);;16;7;(AGC);;24;11;(AGC);;11;5;(AGA);;1;1;(ACT);;24;3;(AGC);;2;2;(ACT);;26;16;(AGC);;4;4;(ACC);;3;3;(AGA);;2;1;(AGC);;9;4;(AGA);;12;6;(AGA);;8;2;(AGA);;7;3;(AGC);;8;5;(AGC);;7;6;(AGA);;6;3;(ACG);;15;13;(AGC);;1;1;(ACC);;9;2;(AGC);;7;3;(ACG);;12;8;(ACG);;5;5;(ACC);;21;14;(AGC);;2;2;(ACT);;2;2;(ACT);;15;11;(AGC);;12;5;(AGA);;7;3;(ACG);;1;1;(AGG);;9;3;(AGA);;85;30;(ACG);;12;8;(ACG);;8;3;(ACG);;22;19;(AGC);;3;3;(ACT);;1;1;(ACT);;8;4;(AGA);;27;13;(AGC);;9;3;(AGA);;18;8;(AGC);;26;9;(ACT);;10;4;(AGA);;6;3;(ACG);;1;1;(ACC);;9;9;(ACC);;1;1;(ACT);;11;6;(AGA);;7;4;(AGA);;7;5;(ACG);;11;10;(ACG);;33;13;(ACG);;35;10;(ACG);;;;11;11;(ACC);;
3;1;(AGG);;7;5;(AGG);;17;14;(AGC);;16;5;(AGG);;10;7;(AGA);;15;4;(AGG);;13;6;(ACG);;6;4;(AGG);;35;2;(AGC);;22;6;(AGC);;8;1;(AGG);;22;17;(AGC);;31;8;(AGC);;7;1;(AGG);;9;5;(ACG);;3;3;(ACT);;28;24;(AGC);;10;2;(AGG);;7;1;(AGG);;23;16;(AGC);;6;1;(AGG);;6;1;(AGG);;10;1;(AGG);;10;2;(AGG);;9;4;(ACG);;63;5;(AGG);;4;1;(AGG);;7;1;(AGG);;23;20;(AGC);;30;18;(AGA);;21;5;(AGG);;7;5;(AGA);;9;2;(AGG);;14;10;(ACG);;5;2;(AGC);;2;1;(AGG);;22;18;(AGC);;15;6;(AGC);;13;9;(AGC);;7;2;(AGG);;6;1;(AGG);;11;8;(AGC);;10;5;(AGA);;9;1;(AGG);;12;7;(ACG);;3;3;(AGG);;10;7;(AGA);;18;11;(ACT);;2;2;(ACG);;9;1;(AGG);;6;4;(AGA);;10;4;(AGA);;8;1;(AGG);;20;4;(AGC);;10;4;(AGA);;1;1;(CAA);;19;16;(AGC);;22;8;(AGA);;1;1;(ACT);;13;3;(AGA);;11;3;(AGG);;12;6;(AGA);;11;9;(AGA);;10;8;(AGC);;14;5;(AGG);;15;12;(AGC);;10;2;(AGG);;32;11;(AGC);;23;18;(AGC);;15;9;(AGA);;6;4;(ACG);;8;5;(ACG);;14;9;(AGA);;12;5;(AGC);;12;10;(AGC);;12;9;(AGA);;13;9;(AGA);;40;17;(AGA);;13;5;(AGA);;;;203;56;(ACG);;
4;3;(AGT);;8;1;(AGT);;9;2;(AGG);;10;3;(AGT);;20;18;(AGC);;9;7;(AGT);;4;4;(ACT);;22;2;(AGT);;25;12;(AGG);;6;4;(AGG);;8;6;(AGT);;7;1;(AGG);;9;2;(AGG);;10;9;(AGT);;26;14;(AGA);;24;22;(AGA);;8;2;(AGG);;10;7;(AGT);;9;3;(AGT);;7;1;(AGG);;8;1;(AGT);;8;1;(AGT);;9;7;(AGT);;9;7;(AGT);;2;2;(ACT);;99;50;(AGT);;5;3;(AGT);;4;4;(AGT);;10;5;(AGG);;55;31;(AGC);;9;6;(AGT);;46;45;(AGC);;9;6;(AGT);;3;3;(ACT);;12;10;(AGG);;3;1;(AGT);;8;2;(AGG);;11;1;(AGG);;7;3;(AGG);;4;4;(AGT);;5;3;(AGT);;7;1;(AGG);;23;19;(AGC);;10;8;(AGT);;12;5;(AGA);;5;4;(AGT);;19;17;(AGC);;83;51;(AGC);;2;1;(AGA);;8;6;(AGT);;13;8;(AGC);;18;7;(AGC);;7;6;(AGT);;14;4;(AGG);;20;16;(AGC);;1;1;(CAC);;7;2;(AGG);;106;44;(AGC);;14;6;(AGA);;19;9;(AGC);;12;8;(AGT);;31;26;(AGC);;36;31;(AGC);;8;1;(AGG);;12;9;(AGT);;9;4;(AGG);;9;5;(AGT);;19;5;(AGG);;9;1;(AGG);;256;252;(AGC);;3;2;(ACT);;5;5;(ACT);;20;13;(AGC);;10;3;(AGG);;7;2;(AGG);;19;14;(AGC);;11;2;(AGC);;67;17;(AGC);;66;32;(AGC);;;;14;11;(ACT);;
2;1;(CAA);;4;4;(CAA);;10;6;(AGT);;12;6;(CAA);;7;2;(AGG);;1;1;(ATA);;13;5;(AGA);;11;10;(CAA);;31;5;(AGT);;17;3;(AGT);;2;2;(ATC);;8;7;(AGT);;24;7;(AGT);;1;1;(ATA);;75;56;(AGC);;11;10;(AGC);;10;10;(AGT);;1;1;(ATC);;4;4;(CAA);;11;10;(AGT);;4;4;(CAA);;1;1;(ATT);;1;1;(ATA);;6;6;(CAA);;8;3;(AGA);;1;1;(ATT);;1;1;(ATT);;3;3;(CAA);;9;7;(AGT);;55;30;(AGG);;2;2;(ATT);;13;9;(AGG);;1;1;(ATA);;29;20;(AGA);;11;8;(AGT);;1;1;(CAA);;10;7;(AGT);;12;6;(AGT);;8;5;(AGT);;2;2;(CAA);;5;5;(ATG);;3;3;(AGT);;8;3;(AGG);;1;1;(ATG);;25;10;(AGC);;3;3;(CAA);;9;4;(AGG);;19;6;(AGG);;18;11;(AGC);;1;1;(ATC);;7;1;(AGG);;14;4;(AGG);;4;4;(CAA);;11;3;(AGT);;9;4;(AGG);;1;1;(CAG);;10;6;(AGT);;54;18;(AGG);;20;2;(AGC);;13;2;(AGG);;2;2;(ATA);;11;7;(AGG);;33;23;(AGG);;8;6;(AGT);;1;1;(ATA);;9;7;(AGT);;3;3;(CAA);;27;13;(AGT);;13;7;(AGT);;12;5;(AGG);;3;1;(AGA);;14;10;(AGA);;13;9;(AGG);;18;11;(AGT);;9;7;(AGT);;7;3;(AGG);;15;6;(AGG);;60;18;(AGG);;15;4;(AGG);;;;336;176;(AGA);;
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2;2;(TAC);;8;1;(TCC);;11;6;(GTC);;29;8;(GTC);;1;1;(GGA);;3;1;(GGT);;63;55;(GCC);;24;16;(TAT);;28;8;(GTA);;5;4;(TAC);;21;13;(GTT);;17;9;(GTT);;7;5;(TAC);;8;5;(GCT);;2;2;(GAG);;11;6;(GCC);;10;4;(GTC);;10;2;(GTG);;1;1;(TCA);;21;9;(GTC);;5;2;(TCC);;2;1;(TAG);;11;3;(GTG);;3;3;(TAG);;10;3;(GCC);;12;8;(TAA);;11;11;(TAA);;3;3;(TAC);;2;2;(GGA);;41;27;(GCT);;22;10;(GTT);;7;7;(GTA);;4;4;(TAA);;33;26;(GCC);;19;16;(GTC);;1;1;(TAG);;8;4;(GCT);;2;2;(TAA);;14;4;(GTT);;1;1;(TAG);;3;3;(TAC);;2;2;(TAC);;4;4;(GGC);;12;8;(GTT);;15;9;(GCT);;1;1;(TAC);;4;3;(GGA);;1;1;(GGT);;7;6;(GCT);;9;1;(GTG);;12;4;(GTT);;23;14;(GTG);;5;5;(TAG);;8;3;(GGT);;11;7;(GCT);;1;1;(TTG);;15;13;(GTA);;65;31;(GCT);;18;16;(GTA);;9;3;(GCT);;8;4;(GCT);;33;24;(GCA);;15;7;(GTT);;12;4;(GTT);;3;3;(GGA);;15;15;(GTA);;4;4;(TAG);;8;6;(TAG);;10;3;(GTG);;1;1;(GGA);;5;5;(GGT);;23;18;(GCC);;13;11;(GTA);;24;6;(GTC);;13;7;(GTC);;11;8;(GCT);;17;6;(GCC);;3;3;(GCG);;22;12;(GGA);;;;4;2;(GAG);;
3;3;(TAG);;8;4;(TCG);;8;1;(GTG);;12;6;(GTG);;14;14;(GTA);;17;14;(GTA);;7;7;(GCG);;42;9;(TCC);;34;3;(GTC);;3;1;(TAG);;4;4;(TAA);;4;4;(TAA);;6;4;(TAG);;2;2;(GGC);;15;10;(GCA);;20;19;(GCT);;8;2;(GTG);;14;4;(GTT);;6;2;(TCC);;10;4;(GTG);;5;3;(TCG);;2;2;(TAT);;17;8;(GTT);;4;4;(TAT);;9;9;(GCG);;12;8;(TAC);;1;1;(TAC);;2;2;(TAG);;2;2;(GGC);;1;1;(GGC);;9;5;(TAA);;10;6;(GTC);;5;4;(TAC);;76;69;(GCT);;5;3;(GTG);;1;1;(TAT);;2;2;(GGA);;5;4;(TAC);;3;3;(TAA);;1;1;(TAT);;2;2;(TAG);;2;2;(TAG);;1;1;(GGG);;4;4;(TAA);;3;2;(GGA);;1;1;(TAT);;1;1;(GGC);;28;26;(GTA);;3;3;(GGA);;26;15;(GTT);;3;3;(TAA);;9;1;(GTT);;4;4;(TAT);;20;17;(GTA);;1;1;(GGA);;35;35;1.00;;10;4;(GTC);;19;11;(GGT);;34;5;(GTC);;8;7;(GTA);;2;2;(GGA);;13;7;(GCC);;3;3;(TAA);;4;4;(TAA);;11;7;(GGC);;11;5;(GTC);;4;4;(TAT);;22;16;(TAT);;18;8;(GTT);;31;30;(GGC);;13;10;(GTA);;36;34;(GCT);;19;13;(GTC);;19;9;(GTG);;10;5;(GTG);;2;2;(GGC);;9;2;(GCT);;99;59;(GCT);;13;5;(GGT);;;;10;9;(GAT);;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4057;3737;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;6;(TTG);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3778;3620;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;20;14;(TTT);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;225;97;(TTC);;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;43;38;(TTT);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;613;452;1.36;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;105;46;(TTG);;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;13732;10330;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;525;250;(TTT);;
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0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;(ATA)
0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;;;(ATC)
0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATT);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATT);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATG);;(ATG)
0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;(ATT)
0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(CTA);;;;;;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;;;;;;;;;;;(CTA)
0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAG);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;(GAC)
0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;;;;;;;(GAG)
0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;;;;;;;(GAT)
0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;;;(GCG)
0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;(GGA)
0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;(GGC)
;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;;;(GGG)
0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;;;;;;;;;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;;;;;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;;;;;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;;;;;0;0;(GGT);;;;;;;;0;0;(GGT);;(GGT)
0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;;;(TTA)

C42

modifier

C42 liste

modifier 
tRNAs;KEGG;Génome
181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4
242;aor;Aspergillus oryzae RIB40
212;bfu;Botrytis cinerea B05.10
125;cal;Candida albicans WO-1
207;cgr;Candida glabrata CBS 138
82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125
143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99
191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988
214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767
46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1
53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656
273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780
270;fgr5;Fusarium graminearum CS3005
305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084
285;fvr;Fusarium verticillioides 7600
266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517
158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797
162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140
123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435
258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651
229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340
190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15
288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064
192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464
270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309
396;ncr;Neurospora crassa OR74A
80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1
192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18
275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011)
205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri
170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054
168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-
96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2
328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284
206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417
154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126
192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146
111;uma;Ustilago maydis 521
156;vma*;Valsa mali 03-8
225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17
510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122
272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732

C42 décomptes

modifier 
ani;;;;aor;;;;bfu;;;;cal;;;;cgr;;;;cjd;;;;cneg;;;;cot;;;;dha;;;;ecu;;;;ede;;;;fgr;;;;fgr5;;;;fve;;;;fvr;;;;kaf;;;;kpa;;;;kla;;;;kna;;;;lkl;;;;lth;;;;mfa;;;;mgr;;;;mth;;;;ncr;;;;ncs;;;;opa;;;;pch;;;;pic;;;;sas;;;;sce;;;;spo;;;;sre;;;;tbl;;;;tdl;;;;tpf;;;;ttt;;;;uma;;;;vda;;;;vma;;;;yli;;;;zro;;
8;2;(AAC);;10;2;(AAC);;8;8;(AAC);;6;3;(AAC);;10;1;(AAC);;9;2;(AAC);;7;6;(AAC);;4;2;(AAC);;10;2;(AAC);;1;1;(AAC);;2;2;(AAC);;19;8;(AAC);;16;6;(AAC);;2;2;(AAA);;13;2;(AAC);;13;2;(AAC);;5;2;(AAC);;7;1;(AAC);;7;1;(AAC);;14;1;(AAC);;11;2;(AAC);;12;2;(AAC);;6;6;(AAC);;7;3;(AAC);;19;1;(AAC);;13;3;(AAC);;3;1;(AAC);;9;5;(AAC);;7;3;(AAC);;7;2;(AAC);;14;2;(AAC);;9;2;(AAC);;4;4;(AAC);;18;3;(AAC);;12;2;(AAC);;10;1;(AAC);;6;3;(AAC);;4;3;(AAC);;11;9;(AAC);;7;7;(AAC);;24;3;(AAC);;12;2;(AAC)
6;6;(AAG);;10;5;(AAT);;6;5;(AAG);;2;2;(AAG);;9;1;(AAT);;4;1;(AAG);;6;4;(AAG);;1;1;(AAG);;2;2;(AAG);;1;1;(AAG);;1;1;(AAG);;13;2;(AAG);;6;1;(AAG);;7;2;(AAC);;12;5;(AAG);;2;2;(AAG);;2;2;(AAG);;7;1;(AAT);;1;1;(AAG);;12;2;(AAT);;10;1;(AAT);;4;2;(AAG);;7;6;(AAG);;7;7;(AAG);;17;15;(AAG);;2;2;(AAG);;1;1;(AAG);;6;1;(AAG);;3;1;(AAG);;9;1;(AAT);;13;1;(AAT);;5;2;(AAG);;4;4;(AAG);;17;4;(AAT);;8;1;(AAT);;10;1;(AAT);;5;4;(AAG);;4;3;(AAG);;8;2;(AAG);;5;2;(AAG);;21;12;(AAG);;11;2;(AAT)
7;5;(AAT);;1;1;(ACA);;8;8;(AAT);;6;6;(AAT);;4;1;(ACG);;6;1;(AAT);;6;5;(AAT);;4;1;(AAT);;9;1;(AAT);;1;1;(AAT);;2;2;(AAT);;13;5;(AAT);;11;5;(AAT);;6;4;(AAG);;11;7;(AAT);;13;1;(AAT);;5;1;(AAT);;3;1;(ACG);;7;1;(AAT);;5;1;(ACG);;4;2;(ACG);;12;2;(AAT);;8;8;(AAT);;8;8;(AAT);;17;17;(AAT);;12;1;(AAT);;4;1;(AAT);;10;3;(AAT);;7;1;(AAT);;4;1;(ACG);;6;2;(ACG);;8;2;(AAT);;4;4;(AAT);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;3;1;(ACG);;6;6;(AAT);;4;2;(AAT);;9;1;(AAT);;7;7;(AAT);;26;12;(AAT);;5;2;(ACG)
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0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA)
0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC)
0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG)
0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT)
0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA)

B42

modifier

B42 liste

modifier 
tRNAs;KEGG;Génome
75;bae;Bacillus atrophaeus 1942
91;bcef;Bacillus cereus FT9
84;bcoh*;Bacillus coagulans HM-08
39;bbd;Belliella baltica
111;blr;Brevibacillus laterosporus LMG 15441
81;cbl;Clostridium botulinum A3 Loch Maree
88;dzc;Dickeya zeae EC1
85;eclx;Enterobacter cloacae 34399
83;eno;Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01
85;eal;Escherichia albertii KF1
87;eco;Escherichia coli K-12 MG1655
91;gmc;Geobacillus sp Y41MC1
109;hmo;Heliobacterium modesticaldum Ice1 ATCC 51547
49;hmr;Hippea maritima
78;ksk;Kitasatospora setae KM-6054
86;kpn;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578
81;ksa;Kosakonia sacchari SP1
73;lpl;Lactobacillus plantarum WCFS1
81;mme;Marinomonas mediterranea MMB-1
131;mvs;Moritella viscosa
109;ppoy;Paenibacillus polymyxa Sb3-1
83;pdi;Parabacteroides distasonis ATCC 8503
90;pdix;Peptoclostridium difficile 630 cultivar NCTC_13307_/strain
84;pge;Pluralibacter gergoviae FB2
106;pha;Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125
88;pse;Pseudogulbenkiania sp NH8B
85;sbz;Salmonella bongori N268-08
79;sty;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi CT18
108;sbn;Shewanella baltica OS195
97;sfr;Shewanella frigidimarina NCIMB 400
147;spl;Shewanella pealeana ATCC 700345
61;sep;Singulisphaera acidiphila
71;saci;Staphylococcus epidermidis ATCC 12228
71;sma;Streptomyces avermitilis MA-4680
73;sho;Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01
105;vag;Vibrio alginolyticus NBRC 15630 ATCC 17749
93;vau;Vibrio anguillarum NB10
121;vha;Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 BB120
130;vpf;Vibrio parahaemolyticus O1_Kuk str.FDA_R31
112;vvm;Vibrio vulnificus MO6-24/O
70;ype;Yersinia pestis CO92 (biovar Orientalis)
82;yrb;Yersinia ruckeri Big Creek 74

B42 décomptes

modifier 
cbl;;;;spl;;;;pdi;;;;ppoy;;;;sbn;;;;eal;;;;eco;;;;sbz;;;;eno;;;;kpn;;;;bcef;;;;bcoh;;;;blr;;;;dzc;;;;eclx;;;;gmc;;;;ksa;;;;mme;;;;mvs;;;;pge;;;;pha;;;;pse;;;;sfr;;;;vag;;;;vau;;;;vha;;;;vvm;;;;yrb;;;;bae;;;;saci;;;;sep;;;;hmr;;;;bbd;;;;lpl;;;;sty;;;;sma;;;;sho;;;;ksk;;;;ype;;;;pdix;;;;hmo;;;;vpf;;
1;1;(ACG);;2;2;(ACC);;3;3;(ACG);;4;1;(ACG);;1;1;(AAA);;3;1;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;3;2;(ACG);;3;1;(ACG);;5;2;(ACG);;3;1;(ACG);;4;2;(ACG);;4;3;(ACG);;4;1;(ACG);;3;1;(ACG);;5;2;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;3;2;(ACG);;4;2;(ACG);;6;1;(ACG);;5;3;(ACG);;7;1;(ACG);;6;2;(ACG);;3;1;(ACG);;2;1;(ACG);;1;1;(ACA);;2;2;(ACG);;2;2;(CAA);;1;1;(ACG);;1;1;(AAG);;4;2;(ACG);;1;1;(ACG);;1;1;(ACG);;2;1;(ACG);;2;2;(ACG);;1;1;(ACG);;1;1;(AAA);;7;1;(ACG)
1;1;(CAA);;7;2;(ACG);;1;1;(CAA);;3;2;(CAA);;6;1;(ACG);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(AGG);;3;2;(CAA);;1;1;(CAA);;2;2;(CAA);;1;1;(ATA);;1;1;(CAA);;2;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(ATA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(ACG);;1;1;(CAA);;1;1;(CAC);;1;1;(CAA);;2;1;(ACG);;1;1;(CAA);;1;1;(AGA);;2;2;(ATC);;1;1;(AGT);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;3;1;(ACG);;2;2;(CAA)
7;5;(CAT);;2;2;(ATG);;2;1;(CAG);;3;2;(CAG);;1;1;(CAA);;4;2;(CAG);;4;3;(CAG);;4;2;(CAG);;4;3;(CAG);;4;2;(CAG);;8;6;(CAT);;2;1;(CAA);;1;1;(CAG);;8;2;(CAG);;4;3;(CAG);;1;1;(CAA);;4;4;(CAG);;11;8;(CAT);;11;3;(CAT);;4;1;(CAG);;7;3;(CAT);;2;1;(CAC);;1;1;(CAA);;7;3;(CAT);;8;4;(CAT);;10;5;(CAT);;10;4;(CAT);;4;2;(CAG);;6;3;(CAT);;2;2;(CAA);;4;3;(CAT);;1;1;(CAG);;3;3;(CAT);;1;1;(AGT);;4;2;(CAG);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;2;2;(CAG);;10;5;(CAT);;1;1;(CAA);;11;4;(CAT)
1;1;(CCA);;1;1;(CAA);;4;3;(CAT);;7;6;(CAT);;2;2;(CAG);;9;5;(CAT);;8;5;(CAT);;6;3;(CAT);;6;3;(CAT);;7;3;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CAG);;8;5;(CAT);;6;4;(CAT);;8;4;(CAT);;1;1;(CAG);;6;3;(CAT);;1;1;(CCA);;2;1;(CCA);;7;3;(CAT);;2;1;(CCA);;3;1;(CAG);;1;1;(CAG);;2;1;(CCA);;2;1;(CCA);;2;1;(CCA);;2;1;(CCA);;7;3;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CAC);;1;1;(CCA);;3;3;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CAA);;6;3;(CAT);;4;4;(CAC);;2;1;(CAC);;2;1;(CAC);;6;3;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CAC);;2;1;(CCA)
1;1;(CCC);;13;5;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CCA);;10;6;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;6;3;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;6;4;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;4;3;(CAT);;9;5;(CAT);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;2;2;(CAG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCT);;1;1;(CAG);;1;1;(CCA);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CCA);;3;1;(GAA);;4;3;(CAG);;1;1;(CCG)
1;1;(CCT);;2;1;(CCA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;2;2;(CCC);;1;1;(CCC);;3;2;(GAA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCC);;1;1;(CCT);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCC);;2;2;(CCT);;6;2;(CAT);;1;1;(CGT);;1;1;(CCC);;1;1;(GAA);;5;4;(CAT);;1;1;(CCC);;6;3;(CAT);;8;5;(CAT);;5;3;(CAT);;1;1;(CCC);;1;1;(GAT);;8;4;(CAT);;1;1;(CCT)
1;1;(CTC);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CGA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(GAG);;1;1;(CCC);;3;2;(GAA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCC);;1;1;(CCG);;2;1;(GAA);;4;1;(GAA);;1;1;(CCG);;3;2;(GAA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCG);;4;2;(GAA);;3;2;(GAA);;4;2;(GAA);;4;2;(GAA);;1;1;(CCG);;3;2;(GAA);;1;1;(CCA);;2;2;(GAA);;1;1;(CCG);;1;1;(GAG);;2;2;(CCA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;2;1;(GCA);;2;2;(CCA);;4;2;(GAA)
1;1;(CTG);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CGT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;2;2;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;4;1;(GAT);;1;1;(CCG);;2;2;(GAC);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCG);;1;1;(CCT);;1;1;(GAC);;2;2;(GAC);;1;1;(CCT);;2;2;(GAC);;1;1;(CCG);;1;1;(CCT);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;1;1;(CCT);;1;1;(GAC);;1;1;(CCC);;1;1;(GAG);;1;1;(CCT);;1;1;(GAT);;1;1;(CCC);;2;2;(CCT);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;2;2;(CCC);;1;1;(CCT);;2;1;(GCC);;1;1;(CCC);;2;2;(GAC)
2;2;(CTT);;4;1;(GAA);;1;1;(CGA);;1;1;(CTT);;3;1;(GAA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGT);;1;1;(CGA);;1;1;(GCA);;1;1;(CCT);;1;1;(GAG);;1;1;(CGA);;1;1;(CGT);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(GAG);;1;1;(GAG);;1;1;(CGA);;1;1;(GAG);;1;1;(CCT);;2;1;(GAA);;2;2;(GAG);;1;1;(GAG);;2;1;(GAG);;2;1;(GAG);;1;1;(CGA);;1;1;(GAG);;1;1;(CCG);;2;1;(GAT);;1;1;(CGA);;1;1;(GCA);;1;1;(CCG);;2;2;(CGA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CTG);;2;1;(GCT);;2;2;(CCG);;2;1;(GAG)
3;1;(GAA);;2;1;(GAC);;1;1;(CGC);;3;1;(GAA);;2;1;(GAC);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;2;2;(CTG);;1;1;(CGG);;4;2;(GCC);;1;1;(CGA);;4;2;(GAT);;1;1;(CGG);;2;2;(CTG);;1;1;(CGC);;1;1;(CGG);;3;1;(GAT);;11;1;(GAT);;1;1;(CGG);;2;1;(GAT);;1;1;(CGA);;2;1;(GAC);;7;1;(GAT);;3;1;(GAT);;5;1;(GAT);;8;1;(GAT);;1;1;(CTG);;3;2;(GAT);;1;1;(CCT);;1;1;(GCA);;1;1;(CGC);;1;1;(GCC);;1;1;(CCT);;1;1;(CGG);;2;2;(CCT);;2;2;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CTT);;1;1;(GGA);;1;1;(CCT);;3;1;(GAT)
1;1;(GAG);;1;1;(GAG);;1;1;(CGG);;1;1;(GAC);;1;1;(GAG);;1;1;(CGT);;2;2;(CGT);;1;1;(CGT);;2;1;(GAA);;1;1;(CGT);;2;1;(GCT);;1;1;(CGC);;2;2;(GCA);;1;1;(CGT);;2;1;(GAA);;1;1;(CGG);;1;1;(CGT);;2;1;(GCA);;3;1;(GCA);;1;1;(CGT);;2;1;(GCA);;1;1;(CGC);;1;1;(GAG);;4;1;(GCA);;2;2;(GCA);;5;3;(GCA);;3;2;(GCA);;1;1;(CTT);;1;1;(GCA);;2;2;(CGA);;2;1;(GCC);;1;1;(CGG);;1;1;(GCT);;1;1;(CGA);;1;1;(CGT);;4;4;(CGA);;2;2;(CGA);;1;1;(CGA);;2;1;(GAA);;3;1;(GTA);;1;1;(CGA);;4;2;(GCA)
2;2;(GAT);;3;1;(GAT);;1;1;(CGT);;2;2;(GAG);;3;1;(GAT);;2;1;(CTG);;2;1;(CTG);;2;1;(CTG);;2;2;(GAC);;2;1;(CTG);;1;1;(GGA);;1;1;(CGG);;5;1;(GCC);;2;1;(CTG);;2;2;(GAC);;1;1;(CGT);;2;2;(CTG);;4;1;(GCC);;5;1;(GCC);;3;1;(CTG);;6;2;(GCC);;2;1;(CGG);;4;2;(GAT);;9;1;(GCC);;7;2;(GCC);;10;1;(GCC);;8;1;(GCC);;2;1;(GAA);;2;1;(GCC);;3;2;(CGC);;1;1;(GCT);;1;1;(CGT);;1;1;(GGA);;1;1;(CGC);;1;1;(CTG);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;2;2;(GAC);;4;2;(GTC);;1;1;(CGC);;11;1;(GCC)
2;2;(GCA);;4;1;(GCA);;1;1;(CTC);;3;2;(GAT);;2;1;(GCA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;1;1;(GAG);;2;1;(GAA);;1;1;(GGT);;1;1;(CGT);;2;1;(GCT);;1;1;(CTT);;1;1;(GAG);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;1;1;(GCT);;2;1;(GCT);;1;1;(CTT);;2;1;(GCT);;1;1;(CGT);;2;2;(GCA);;2;1;(GCT);;2;1;(GCT);;2;1;(GCT);;2;1;(GCT);;3;1;(GAC);;2;1;(GCT);;1;1;(CGT);;1;1;(GGA);;1;1;(CTC);;1;1;(GGC);;1;1;(CGG);;2;1;(GAA);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(GAG);;2;1;(GTG);;2;2;(CGG);;2;1;(GCT)
3;1;(GCC);;8;1;(GCC);;2;1;(CTG);;2;2;(GCA);;6;1;(GCC);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;3;1;(GAT);;3;3;(GAC);;3;1;(GTA);;1;1;(CTT);;2;2;(GGA);;2;1;(GAA);;3;1;(GAT);;1;1;(GAC);;2;2;(GAC);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;2;2;(GAA);;1;1;(GGA);;1;1;(CTT);;5;2;(GCC);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GAG);;1;1;(GGA);;1;1;(CTC);;2;1;(GTA);;1;1;(CTG);;1;1;(GGG);;1;1;(CGT);;2;2;(GAC);;1;1;(CGT);;1;1;(CGT);;2;2;(CGT);;3;1;(GAT);;4;2;(GTT);;1;1;(CGT);;1;1;(GGA)
2;1;(GCT);;3;1;(GCT);;2;2;(CTT);;5;2;(GCC);;2;1;(GCT);;1;1;(GAG);;1;1;(GAG);;1;1;(GAG);;1;1;(GCA);;1;1;(GAG);;6;1;(GTC);;3;3;(GAA);;1;1;(GGC);;2;2;(GAC);;1;1;(GCA);;1;1;(GAG);;1;1;(GAG);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;3;3;(GAC);;1;1;(GGC);;2;1;(GAA);;2;1;(GCT);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGG);;3;1;(GAT);;1;1;(GGC);;1;1;(CTG);;3;3;(GTC);;1;1;(CTT);;1;1;(GGT);;2;2;(CTA);;1;1;(GAG);;3;1;(CTC);;3;2;(CTC);;3;1;(CTC);;1;1;(GCA);;5;2;(TAA);;3;2;(GAA);;1;1;(GGC)
1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;2;2;(GAA);;3;2;(GCT);;1;1;(GGA);;3;1;(GAT);;3;1;(GAT);;3;1;(GAT);;4;1;(GCC);;3;1;(GAT);;1;1;(GTG);;1;1;(GAC);;1;1;(GGG);;1;1;(GAG);;4;1;(GCC);;4;3;(GAT);;3;1;(GAT);;1;1;(GGG);;1;1;(GGT);;1;1;(GAG);;1;1;(GGG);;1;1;(GAC);;1;1;(GGA);;2;2;(GGT);;1;1;(GGG);;2;2;(GGT);;2;2;(GGT);;1;1;(GCA);;1;1;(GGT);;1;1;(CTT);;2;2;(GTG);;1;1;(GAA);;1;1;(GTA);;1;1;(CTC);;3;1;(GAT);;2;2;(CTG);;2;2;(CTG);;2;2;(CTG);;2;1;(GCC);;6;4;(TAC);;4;1;(GAC);;2;2;(GGT)
1;1;(GGT);;2;1;(GGC);;1;1;(GAC);;3;1;(GGA);;2;1;(GGC);;1;1;(GCA);;1;1;(GCA);;1;1;(GCA);;1;1;(GCT);;1;1;(GCA);;5;2;(GTT);;1;1;(GAG);;2;2;(GGT);;3;1;(GAT);;1;1;(GCT);;2;2;(GCA);;1;1;(GCA);;1;1;(GGT);;5;1;(GTA);;3;1;(GAT);;1;1;(GGT);;1;1;(GAG);;2;2;(GGC);;3;1;(GTA);;2;2;(GGT);;5;1;(GTA);;4;1;(GTA);;4;1;(GCC);;2;1;(GTA);;1;1;(GAA);;3;2;(GTT);;1;1;(GAC);;3;2;(GTC);;1;1;(CTG);;1;1;(GCA);;3;1;(CTT);;3;1;(CTT);;4;1;(CTT);;1;1;(GCT);;3;2;(TAG);;2;1;(GAG);;7;2;(GTA)
2;1;(GTA);;1;1;(GGG);;1;1;(GAG);;1;1;(GGC);;1;1;(GGG);;3;1;(GCC);;4;1;(GCC);;4;1;(GCC);;2;1;(GGA);;4;1;(GCC);;2;1;(TAA);;3;2;(GAT);;4;1;(GTA);;1;1;(GCA);;2;1;(GGA);;5;3;(GCC);;4;1;(GCC);;2;1;(GTA);;5;1;(GTC);;1;1;(GCA);;3;1;(GTA);;8;1;(GAT);;1;1;(GGG);;6;1;(GTC);;5;1;(GTA);;6;1;(GTC);;7;1;(GTC);;1;1;(GCT);;4;1;(GTC);;3;2;(GAC);;2;1;(TAA);;1;1;(GAG);;1;1;(GTG);;1;1;(CTT);;3;1;(GCC);;1;1;(GAA);;1;1;(GAA);;1;1;(GAA);;2;2;(GGA);;1;1;(TCA);;4;1;(GAT);;7;1;(GTC)
4;2;(GTC);;1;1;(GGT);;7;1;(GAT);;1;1;(GGG);;2;2;(GGT);;1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;2;1;(GGC);;1;1;(GCT);;5;1;(TAC);;1;1;(GCA);;6;2;(GTC);;4;1;(GCC);;2;2;(GGC);;2;2;(GCT);;1;1;(GCT);;7;2;(GTC);;4;3;(GTG);;4;1;(GCC);;11;1;(GTC);;1;1;(GCA);;1;1;(GGT);;2;2;(GTG);;5;1;(GTC);;2;1;(GTG);;2;1;(GTG);;2;2;(GGA);;2;1;(GTG);;2;2;(GAG);;3;2;(TAC);;2;1;(GAT);;1;1;(GTT);;2;1;(GAA);;1;1;(GCT);;3;3;(GAC);;3;2;(GAC);;4;3;(GAC);;2;1;(GGC);;5;1;(TCC);;3;3;(GCA);;2;1;(GTG)
2;1;(GTG);;6;1;(GTA);;2;2;(GCA);;1;1;(GGT);;4;1;(GTA);;2;1;(GGA);;2;1;(GGA);;2;1;(GGA);;1;1;(GGG);;2;1;(GGA);;2;1;(TAG);;4;1;(GCC);;3;2;(GTG);;1;1;(GCT);;1;1;(GGG);;1;1;(GGA);;2;2;(GGA);;1;1;(GTG);;6;1;(GTT);;1;1;(GCT);;2;2;(GTG);;2;1;(GCC);;4;1;(GTA);;5;1;(GTT);;2;1;(GTG);;5;3;(GTT);;5;1;(GTT);;2;1;(GGC);;4;2;(GTT);;2;2;(GAT);;1;1;(TAG);;1;1;(GCA);;1;1;(TAA);;3;1;(GAT);;2;1;(GGA);;2;1;(GAG);;2;2;(GAG);;2;1;(GAG);;1;1;(GGG);;4;2;(TCT);;7;5;(GCC);;5;3;(GTT)
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0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA)
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0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG)
0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT)
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0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA)

C42 Les introns

modifier 
Génome;KEGG;tRNA;total;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
Aspergillus nidulans FGSC A4;ani;181;93;2;6;0;0;2;0;2;1;0;4;2;0;1;0;3;4;2;0;5;0;2;0;1;6;2;0;2;0;2;0;3;6;2;8;1;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;0;6;0;0;1;0;2;0;0;3;0;0;1;5;2;0
Aspergillus oryzae RIB40;aor;242;114;3;0;11;0;2;0;2;0;2;6;2;0;2;0;4;0;4;7;0;0;3;0;0;9;0;0;1;0;1;0;4;0;3;13;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;1;3;0;0;13;0;0;1;0;3;0;0;4;0;1;0;7;0;0
Botrytis cinerea B05.10;bfu;212;161;1;6;8;0;2;0;0;3;5;5;0;0;1;0;4;8;0;4;0;0;8;0;1;4;4;0;0;4;1;0;1;6;6;9;9;0;5;0;2;0;0;8;2;0;2;0;2;8;0;6;0;0;4;0;2;0;0;5;1;0;2;7;5;0
Candida albicans WO-1;cal;125;67;1;3;2;0;0;0;1;0;0;2;1;0;1;0;0;6;5;3;0;0;4;0;0;1;0;0;1;2;0;0;0;2;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;2;2;0;5;5;6;0
Candida glabrata CBS 138;cgr;207;45;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;5;0;0;6;8;0
Candida orthopsilosis Co 90-125;cot;82;35;0;0;3;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;2;0;3;1;1;0;3;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;3;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;3;0;1;0
Cryptococcus neoformans var. grubii H99;cneg*;143;136;1;4;7;0;1;0;1;5;1;2;3;0;1;0;6;6;2;2;0;0;1;0;1;6;5;0;1;3;0;0;1;6;3;2;10;0;1;0;2;8;1;5;2;0;0;0;2;7;0;4;0;0;1;0;1;6;0;3;3;0;1;5;3;0
Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;cjd*;191;25;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;2;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0
Debaryomyces hansenii CBS767;dha;214;54;7;0;10;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;4;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;8;0;0
Encephalitozoon cuniculi GB-M1;ecu;46;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;ede*;53;47;1;1;0;0;0;0;0;2;0;1;1;0;1;0;2;2;1;2;1;0;1;0;1;0;2;0;1;1;1;1;0;1;1;2;0;0;1;0;1;2;0;2;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;1;1;1;0;0;1;1;1;0
Flammulina velutipes KACC42780;fve*;273;201;6;12;11;1;2;0;0;5;0;0;6;0;2;0;6;0;4;7;6;0;4;0;2;4;5;0;2;11;2;0;2;6;4;7;10;1;8;0;1;2;3;10;7;0;2;0;3;0;0;6;0;0;2;0;3;3;0;1;3;0;1;12;4;2
Fusarium graminearum CS3005;fgr5;270;187;2;9;12;0;0;0;0;0;2;8;1;0;3;0;5;11;5;7;0;0;3;0;2;10;9;0;0;0;2;0;5;6;4;0;13;0;3;0;3;12;4;15;1;0;1;0;1;0;0;6;0;0;2;0;2;0;1;0;4;0;1;9;3;0
Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;fgr;305;209;2;9;16;0;0;0;0;0;2;8;1;0;3;0;6;13;5;7;0;0;3;0;2;10;9;0;0;0;2;0;5;13;4;0;19;0;3;0;2;13;4;14;1;0;1;0;1;0;0;8;0;0;2;0;2;0;1;0;4;0;1;10;3;0
Fusarium verticillioides 7600;fvr;285;197;2;8;15;1;0;0;0;4;1;7;0;0;1;0;5;11;4;6;0;0;0;0;2;10;7;0;0;0;2;0;5;12;5;0;16;1;3;0;3;14;2;14;0;0;1;0;1;0;0;8;0;0;2;0;3;0;0;0;5;0;2;10;4;0
Kazachstania africana CBS 2517;kaf;266;53;8;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;0;9;2;0
Kazachstania naganishii CBS 8797;kna*;158;40;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;6;5;0
Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;kla;162;39;4;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;7;0
Komagataella pastoris CBS 7435;kpa*;123;29;3;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;3;0;0;5;3;0
Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;lkl*;258;72;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;10;0;0;0;0;0;0;5;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;1;11;0;0;5;0;0;8;11;0
Lachancea thermotolerans CBS 6340;lth;229;57;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;4;3;0;3;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;2;0;0;0;5;0;0;7;8;0
Magnaporthe oryzae 70-15;mgr;190;157;0;6;6;0;2;0;2;4;1;3;3;0;1;0;4;8;2;0;6;0;2;0;2;5;2;0;0;6;1;0;4;7;1;0;9;0;3;0;2;9;3;14;3;0;1;0;2;6;0;5;0;0;2;0;3;4;0;3;0;0;1;7;2;0
Millerozyma farinosa CBS 7064;mfa*;288;68;6;0;10;0;0;0;0;0;0;6;0;0;4;0;6;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;2;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0
Myceliophthora thermophila ATCC 42464;mth*;192;127;0;0;9;0;2;0;2;2;1;5;2;0;1;0;4;8;2;4;3;0;2;0;3;6;0;0;2;5;1;0;4;7;0;8;8;0;2;0;3;7;0;0;2;0;1;0;3;0;0;6;0;0;2;0;0;0;0;0;2;0;1;5;2;0
Naumovozyma castellii CBS 4309;ncs;270;63;8;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;1;0;0;0;7;0;0;10;9;0
Neurospora crassa OR74A;ncr;396;232;2;1;5;0;3;0;3;2;1;6;5;0;1;1;7;17;3;9;11;0;1;0;4;11;1;0;0;0;2;0;6;16;1;18;24;0;3;0;5;19;0;0;6;0;2;0;1;0;0;10;1;0;2;0;4;0;0;0;0;0;1;12;5;0
Ogataea parapolymorpha DL-1;opa*;80;7;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0
Penicillium chrysogenum P2niaD18;pch*;192;100;1;1;0;0;2;0;1;6;0;4;1;0;2;0;10;0;3;11;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;1;3;6;1;8;0;0;0;0;2;0;4;0;1;0;1;0;3;8;1;5;0;0;1;0;2;3;1;3;0;0;2;0;0;0
Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);sce;275;61;7;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;0;10;10;0
Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;sas*;205;52;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;4;0;7;0;0;0;0;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;3;0;0;0;5;0;0;6;7;0
Scheffersomyces stipitis CBS 6054;pic;170;42;3;0;9;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;6;0;0;1;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;5;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;6;0;0
Schizosaccharomyces pombe 972h-;spo;168;44;0;0;9;0;0;0;0;0;0;3;1;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;4;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;2;0;4;0
Sporisorium reilianum SRZ2;sre*;96;91;1;0;5;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;0;4;4;3;3;2;0;1;0;1;3;2;0;0;4;1;0;2;4;2;3;4;0;1;0;1;3;1;6;1;0;1;0;1;4;0;2;0;0;1;0;2;2;1;2;2;0;1;4;0;0
Tetrapisispora blattae CBS 6284;tbl;328;71;9;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;2;0;0;0;7;0;0;12;9;0
Tetrapisispora phaffii CBS 4417;tpf;206;42;6;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;9;2;0
Thielavia terrestris NRRL 8126;ttt;154;117;1;3;6;0;1;0;2;4;0;3;2;0;1;0;2;6;2;3;4;0;2;0;3;4;1;0;1;6;1;0;4;5;0;6;7;0;2;0;3;7;1;0;2;0;1;0;3;0;0;4;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;7;5;1;0
Torulaspora delbrueckii CBS 1146;tdl;192;45;5;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;6;8;0
Ustilago maydis 521;uma;111;101;1;0;5;0;1;0;1;0;1;2;1;0;1;0;4;4;2;2;3;0;1;0;1;4;3;0;0;4;1;0;2;4;2;5;4;0;1;0;1;5;2;6;1;0;1;0;1;4;0;3;0;0;1;0;3;3;2;2;2;0;1;3;0;0
Valsa mali 03-8;vma*;156;130;0;3;9;0;3;0;2;3;0;3;2;0;1;0;3;7;2;4;3;0;2;0;1;1;2;0;2;5;3;0;4;5;2;3;8;0;2;0;2;7;0;8;1;1;1;0;2;5;0;4;0;0;1;0;2;2;0;0;3;0;0;4;2;0
Verticillium dahliae VdLs.17;vda;225;115;2;6;0;0;3;0;3;0;2;2;1;0;0;0;4;0;2;6;0;0;3;0;0;8;0;0;0;4;1;0;0;8;2;5;0;0;2;0;1;11;2;0;1;0;1;0;2;8;0;6;0;0;3;1;1;0;1;1;3;0;1;7;1;0
Yarrowia lipolytica CLIB122;yli;510;316;4;16;34;0;3;0;1;0;0;6;0;0;1;0;0;26;3;4;14;0;0;0;2;21;25;0;0;0;2;0;11;21;0;28;27;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;3;0;0;14;0;0;2;0;4;0;0;0;13;0;0;17;3;0
Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;zro;272;54;7;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;3;0;2;0;0;0;6;0;0;8;10;0
  ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;;;;131;94;202;2;30;0;25;42;20;144;36;0;59;1;104;141;59;92;65;0;168;0;31;125;80;0;17;91;68;2;71;143;50;125;170;2;43;0;36;119;42;102;33;1;25;1;37;59;1;250;1;0;43;1;66;35;9;30;124;1;35;261;151;2
;;;;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
zéros;;;;6;26;21;40;27;42;27;29;30;4;24;42;1;41;18;26;22;23;27;42;9;42;24;22;26;42;30;20;10;40;22;21;24;27;26;40;26;42;24;28;28;31;26;41;21;41;22;33;41;0;41;42;18;41;5;33;35;30;12;41;23;7;10;41
42−zér;;;;36;16;21;2;15;0;15;13;12;38;18;0;41;1;24;16;20;19;15;0;33;0;18;20;16;0;12;22;32;2;20;21;18;15;16;2;16;0;18;14;14;11;16;1;21;1;20;9;1;42;1;0;24;1;37;9;7;12;30;1;19;35;32;1

E79 Les introns

modifier 
génome;KEGG;tRNA;total;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);aml;1463;96;3;1;45;0;0;0;0;0;5;0;2;0;5;0;0;0;3;0;3;0;1;0;1;0;3;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0
Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);acs;211;11;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0
Anopheles gambiae;aga;414;27;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);ath;684;83;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;70;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);bacu;7080;50;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;1;1;0;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0
Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);bta;4040;57;0;0;1;0;0;0;1;0;6;0;0;0;5;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;3;1;5;2;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;6;0
Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);bdi;639;36;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;1;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);cbr*;1095;52;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;1;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;14;0
Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);cbr;743;34;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0
Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);cel;596;34;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0
Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);cja*;827;35;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0
Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);cjc;408;29;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;5;0
Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);cmk;13727;177;35;0;0;0;0;0;0;3;12;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;13;3;8;12;22;0;0;0;1;0;1;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;34;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;9;0
Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);cfa;906;68;2;0;33;0;0;0;0;0;4;0;1;0;5;0;0;0;3;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);cpo*;383;28;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0
Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);csi*;518;27;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0
Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);cpic;554;36;0;0;0;0;0;0;0;0;10;1;0;0;12;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0
Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);cge;498;23;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);dno*;1119;31;0;0;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;2;0;1;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0
Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);dme;289;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);dsi;256;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);dya;326;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Equus caballus (horse) (Sep 2007);ecb;494;32;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0
Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);eeu*;485;30;0;0;2;0;0;0;0;1;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0
Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);fca;3729;487;4;2;214;1;0;0;1;0;5;0;9;0;6;0;0;0;75;2;7;0;7;1;1;0;102;0;2;0;0;0;0;0;0;0;7;0;1;0;1;0;2;0;1;1;0;0;0;0;3;10;4;0;4;0;0;0;2;0;2;0;3;0;7;0
Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);gmo*;1492;105;1;0;0;0;2;0;0;0;19;0;0;0;16;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;50;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;2
Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);gga;283;22;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);gac*;2489;146;0;0;0;0;0;0;0;0;62;0;0;0;58;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;5;0
Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);gfr;203;14;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0
Glycine max (soybean) (Wm82.a2);gmx;738;39;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;18;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;20;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);ggo;435;34;0;0;0;0;0;0;2;0;4;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;13;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0
Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);hgl;367;22;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;0
Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);hsa;622;34;0;0;0;0;0;0;1;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;1;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;5;0
Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);lcm;373;21;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0
Leishmania major;lma;82;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);lav;2002;60;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;17;0
Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);mcc;458;34;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0
Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);meu*;353;26;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0
Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);mtr;582;40;2;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;4;0;13;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0
Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);mgp;155;10;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0
Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);mun*;191;12;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);mmr*;258;18;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);mdo;481;30;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Mus musculus (mm10 Dec 2011);mmu;469;25;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;4;0
Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);mpu*;749;66;1;1;25;1;0;0;0;0;8;0;1;0;5;0;0;0;2;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;9;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0
Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);mlu*;252;21;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;0;0;0;0;1;1;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);nle;421;31;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;1
Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);opr*;338;22;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);oni*;674;76;0;0;0;0;0;0;0;2;22;0;0;0;24;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0
Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);oaa;856;54;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;1;10;0
Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);ocu;506;27;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Oryza sativa;osa;738;36;0;0;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;1;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0
Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);oga*;326;41;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;10;9;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;1
Ovis aries (sheep) (Feb 2010);oas;1176;29;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);ptr;503;34;0;0;0;0;0;0;1;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;13;1;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;5;0
Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);pan*;476;35;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0
Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);pha*;411;31;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0
Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);pma*;2485;133;6;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;9;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;2;86;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0
Physcomitrella patens ;ppp;418;21;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Plasmodium falciparum;pfa;35;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);ppy*;517;40;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;6;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;5;0
Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;pop;618;74;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;35;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6
Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);rno;407;15;0;0;0;0;0;0;0;1;5;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);sbq;334;26;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0
Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);shr;446;22;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);san*;374;25;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;9;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;0
Sorghum bicolor (Version 1.0);sbi;578;32;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);str*;804;24;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0
Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;spu;1065;38;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);ssc;807;56;0;1;0;1;0;0;0;0;6;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;1;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;16;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0
Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);tgu;230;18;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0
Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);tru;575;43;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0
Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);tsy*;455;114;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;60;0;0;1;26;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;8;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0
Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);tng;540;58;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;11;0;3;0;20;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0
Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);tma*;2017;41;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0
Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);ttr*;5845;47;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;7;1;1;0;0;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0
Vitis vinifera (Grapevine 12X);vvi;499;32;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;11;0;0;0;2;0;0;0;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);xtr;2639;275;0;0;0;0;0;0;0;0;103;0;0;0;43;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;105;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;19;0
Zea mays (Version 5b.60);zma;1198;37;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
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total;;;;54;8;321;4;5;0;7;10;469;9;14;2;454;14;149;5;148;11;17;6;50;5;11;18;131;3;4;0;2;1;7;45;28;18;13;4;2;1;4;4;21;7;15;4;5;0;6;3;8;1239;13;24;13;23;2;2;3;14;5;2;18;2;400;11
;;;;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
zéros;;;;71;74;72;75;76;79;73;72;21;73;74;77;10;74;68;76;71;70;71;76;72;76;75;73;72;76;77;79;77;78;72;69;71;77;73;76;77;78;75;75;70;75;72;76;74;79;73;77;76;0;69;62;70;75;78;77;77;69;75;77;71;77;14;74
79−zér;;;;8;5;7;4;3;0;6;7;58;6;5;2;69;5;11;3;8;9;8;3;7;3;4;6;7;3;2;0;2;1;7;10;8;2;6;3;2;1;4;4;9;4;7;3;5;0;6;2;3;79;10;17;9;4;1;2;2;10;4;2;8;2;65;5
  ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009);dre;;;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
intron;;;813;3;;;;;;;;247;;;;61;;2;1;;;;;;;;7;;;;;8;;;4;;1;;;;;;;2;;3;;;;;2;;225;;4;;;;;;;;;8;;234;1
tRNAs;;12258;;525;1,045;953;24;290;10;66;359;252;424;104;14;75;10;522;258;105;387;266;10;205;2;180;315;107;24;59;203;244;4;300;270;225;150;245;1;368;4;112;92;47;836;268;11;230;6;227;232;0;236;0;5;209;2;80;336;14;136;44;9;73;197;241;10

A10

modifier

A10 liste

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introns;tRNAs;KEGG;Génome
2;49;fpl;Ferroglobus placidus DSM 10642
3;52;hbo;Halogeometricum borinquense DSM 11551 PR 3
2;59;mru;Methanobrevibacter ruminantium M1
6;55;mmet;Methanococcoides methylutens MM1
4;58;mac;Methanosarcina acetivorans C2A
4;62;mbw;Methanosarcina barkeri str. Wiesmoor
4;60;mhor;Methanosarcina horonobensis HB-1 JCM 15518
4;57;mls;Methanosarcina lacustris Z-7289
3;56;mpl;Methanosphaerula palustris E1-9c
3;54;nou;Natronococcus occultus SP4
;;;
71;46;pcl;Pyrobaculum calidifontis JCM 11548

A10 décomptes

modifier 
fpl;;;;hbo;;;;mac;;;;mbw;;;;mhor;;;;mls;;;;mmet;;;;mpl;;;;mru;;;;nou;;
1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;2;2;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(ACG);;1;1;(CAA)
1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;1;1;(CAC);;2;2;(CAA);;1;1;(CAC)
1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;2;2;(CAG);;2;2;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;3;3;(CAT);;1;1;(CAG)
3;3;(CAT);;3;3;(CAT);;4;3;(CAT);;5;3;(CAT);;4;4;(CAT);;4;3;(CAT);;4;3;(CAT);;3;3;(CAT);;2;2;(CCA);;4;4;(CAT)
1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCT);;1;1;(CCA)
1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CTG);;1;1;(CCC)
1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CTT);;1;1;(CCG)
1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;2;2;(GAA);;1;1;(CCT)
1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGC);;1;1;(CGA);;2;2;(GAC);;1;1;(CGA)
1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGG);;1;1;(CGC);;1;1;(GAG);;1;1;(CGC)
1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGT);;1;1;(CGG);;2;2;(GAT);;1;1;(CGG)
1;1;(CGT);;1;1;(CGT);;1;1;(CGT);;1;1;(CGT);;1;1;(CGT);;1;1;(CGT);;1;1;(CTC);;1;1;(CGT);;1;1;(GCA);;1;1;(CGT)
1;1;(CTC);;1;1;(CTC);;1;1;(CTC);;1;1;(CTC);;1;1;(CTC);;1;1;(CTC);;1;1;(CTG);;1;1;(CTC);;1;1;(GCC);;1;1;(CTC)
2;2;(CTG);;1;1;(CTG);;1;1;(CTG);;1;1;(CTG);;1;1;(CTG);;1;1;(CTG);;2;1;(CTT);;1;1;(CTG);;1;1;(GCG);;1;1;(CTG)
1;1;(CTT);;1;1;(CTT);;1;1;(CTT);;1;1;(CTT);;1;1;(CTT);;1;1;(CTT);;2;2;(GAA);;1;1;(CTT);;2;2;(GCT);;1;1;(CTT)
1;1;(GAA);;1;1;(GAA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;1;1;(GAC);;1;1;(GAA);;2;2;(GGA);;1;1;(GAA)
1;1;(GAC);;1;1;(GAC);;2;1;(GAC);;2;1;(GAC);;2;1;(GAC);;2;1;(GAC);;2;1;(GAG);;1;1;(GAC);;1;1;(GGC);;1;1;(GAC)
2;2;(GAG);;1;1;(GAG);;2;2;(GAG);;2;1;(GAG);;2;2;(GAG);;2;2;(GAG);;1;1;(GAT);;1;1;(GAG);;1;1;(GGT);;1;1;(GAG)
1;1;(GAT);;1;1;(GAT);;2;1;(GAT);;2;1;(GAT);;2;2;(GAT);;2;1;(GAT);;4;3;(GCA);;1;1;(GAT);;2;2;(GTA);;1;1;(GAT)
1;1;(GCA);;1;1;(GCA);;3;3;(GCA);;4;3;(GCA);;4;4;(GCA);;3;3;(GCA);;1;1;(GCC);;8;6;(GCA);;2;2;(GTC);;1;1;(GCA)
1;1;(GCC);;2;1;(GCC);;3;1;(GCC);;3;2;(GCC);;3;2;(GCC);;2;2;(GCC);;1;1;(GCG);;1;1;(GCC);;1;1;(GTG);;2;1;(GCC)
1;1;(GCG);;2;1;(GCG);;1;1;(GCG);;1;1;(GCG);;1;1;(GCG);;1;1;(GCG);;1;1;(GCT);;1;1;(GCG);;2;2;(GTT);;1;1;(GCG)
1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;1;1;(GCT);;1;1;(GGA);;1;1;(GCT);;2;2;(TAA);;1;1;(GCT)
1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGA);;1;1;(GGC);;1;1;(GGA);;2;1;(TAC);;1;1;(GGA)
1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGC);;1;1;(GGG);;1;1;(GGC);;2;2;(TAG);;1;1;(GGC)
1;1;(GGG);;1;1;(GGG);;1;1;(GGG);;1;1;(GGG);;1;1;(GGG);;1;1;(GGG);;1;1;(GGT);;1;1;(GGG);;2;2;(TCC);;1;1;(GGG)
1;1;(GGT);;1;1;(GGT);;1;1;(GGT);;1;1;(GGT);;1;1;(GGT);;1;1;(GGT);;1;1;(GTA);;1;1;(GGT);;1;1;(TCG);;2;2;(GGT)
1;1;(GTA);;2;1;(GTA);;1;1;(GTA);;1;1;(GTA);;1;1;(GTA);;1;1;(GTA);;2;1;(GTC);;1;1;(GTA);;2;2;(TCT);;1;1;(GTA)
1;1;(GTC);;2;1;(GTC);;1;1;(GTC);;1;1;(GTC);;1;1;(GTC);;1;1;(GTC);;1;1;(GTG);;1;1;(GTC);;2;2;(TGA);;2;2;(GTC)
1;1;(GTG);;1;1;(GTG);;1;1;(GTG);;1;1;(GTG);;1;1;(GTG);;1;1;(GTG);;1;1;(GTT);;1;1;(GTG);;3;2;(TGC);;1;1;(GTG)
1;1;(GTT);;1;1;(GTT);;2;1;(GTT);;2;1;(GTT);;2;1;(GTT);;2;1;(GTT);;1;1;(TAA);;1;1;(GTT);;2;2;(TGG);;1;1;(GTT)
1;1;(TAA);;1;1;(TAA);;1;1;(TAA);;3;3;(TAA);;1;1;(TAA);;1;1;(TAA);;1;1;(TAC);;1;1;(TAA);;1;1;(TGT);;1;1;(TAA)
1;1;(TAC);;1;1;(TAC);;1;1;(TAC);;1;1;(TAC);;1;1;(TAC);;1;1;(TAC);;1;1;(TAG);;1;1;(TAC);;2;2;(TTC);;1;1;(TAC)
1;1;(TAG);;1;1;(TAG);;1;1;(TAG);;1;1;(TAG);;1;1;(TAG);;1;1;(TAG);;1;1;(TCC);;1;1;(TAG);;2;2;(TTG);;1;1;(TAG)
1;1;(TCC);;2;2;(TCC);;1;1;(TCC);;1;1;(TCC);;1;1;(TCC);;1;1;(TCC);;1;1;(TCG);;1;1;(TCC);;2;2;(TTT);;1;1;(TCC)
2;2;(TCG);;1;1;(TCG);;1;1;(TCG);;1;1;(TCG);;1;1;(TCG);;1;1;(TCG);;1;1;(TCT);;1;1;(TCG);;0;0;(CAC);;1;1;(TCG)
1;1;(TCT);;1;1;(TCT);;1;1;(TCT);;1;1;(TCT);;1;1;(TCT);;1;1;(TCT);;1;1;(TGA);;1;1;(TCT);;0;0;(CAG);;1;1;(TCT)
1;1;(TGA);;1;1;(TGA);;1;1;(TGA);;1;1;(TGA);;1;1;(TGA);;1;1;(TGA);;3;1;(TGC);;1;1;(TGA);;0;0;(CCC);;1;1;(TGA)
1;1;(TGC);;2;1;(TGC);;1;1;(TGC);;1;1;(TGC);;1;1;(TGC);;1;1;(TGC);;1;1;(TGG);;1;1;(TGC);;0;0;(CCG);;4;1;(TGC)
1;1;(TGG);;1;1;(TGG);;1;1;(TGG);;1;1;(TGG);;1;1;(TGG);;1;1;(TGG);;1;1;(TGT);;1;1;(TGG);;0;0;(CGA);;1;1;(TGG)
1;1;(TGT);;1;1;(TGT);;1;1;(TGT);;2;2;(TGT);;1;1;(TGT);;1;1;(TGT);;1;1;(TTC);;4;2;(TGT);;0;0;(CGC);;1;1;(TGT)
1;1;(TTC);;1;1;(TTC);;2;1;(TTC);;2;1;(TTC);;2;1;(TTC);;2;1;(TTC);;1;1;(TTG);;1;1;(TTC);;0;0;(CGG);;1;1;(TTC)
1;1;(TTG);;1;1;(TTG);;2;2;(TTG);;1;1;(TTG);;1;1;(TTG);;1;1;(TTG);;1;1;(TTT);;1;1;(TTG);;0;0;(CGT);;1;1;(TTG)
1;1;(TTT);;1;1;(TTT);;1;1;(TTT);;1;1;(TTT);;1;1;(TTT);;1;1;(TTT);;0;0;(CGA);;1;1;(TTT);;0;0;(CTC);;1;1;(TTT)
49;49;;;52;47;;;58;50;;;62;52;;;60;55;;;57;51;;;55;48;;;56;52;;;59;57;;;53;49;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA);;0;0;(AAA)
0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC);;0;0;(AAC)
0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG);;0;0;(AAG)
0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT);;0;0;(AAT)
0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA);;0;0;(ACA)
0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC);;0;0;(ACC)
0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT);;0;0;(ACT)
0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA);;0;0;(AGA)
0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC);;0;0;(AGC)
0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG);;0;0;(AGG)
0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT);;0;0;(AGT)
0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA)
0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC)
0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG)
0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT)
0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;0;0;(ACG);;;;;;0;0;(ACG)
0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA)
0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA)
0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA);;0;0;(TCA)
0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT);;0;0;(TAT)

Tableaux des effectifs

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E79 effectifs

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dre;;;;;E79;acs;;aga;;aml;;ath;;bacu;;bdi;;bta;;cbr;;cbre;;cel;;cfa;;cge;;cjap;;cjc;;cmk;;cpic;;cpo;;csi;;dme;;dno;;dsi;;dya;;ecb;;eeu;;fca;;gac;;gfr;;gga;;ggo;;gmo;;gmx;;hgl;;hsa-18;;lav;;lcm;;lma;;mcc;;mdo;;meu;;mgp;;mlu;;mmr;;mmu;;mpu;;mtr;;mun;;nle;;oaa;;oas;;ocu;;oga;;oni;;opr;;osa;;pan;;pfa;;pha;;pma;;pop;;ppp;;ppy;;ptr;;rno;;san;;sbi;;sbq;;shr;;spu;;ssc;;str;;tgu;;tma;;tng;;tru;;tsy;;ttr;;vvi;;xtr;;zma;
tot;diff;;aa;gène;tRNA;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff
10;10;;Phe;ttt;AAA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;3;3;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;2;2;6;5;2;2;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;2;2;2;2;1;1
232;86;;Val;gtt;AAC;5;3;31;7;10;2;15;3;14;9;16;5;20;13;25;7;33;3;19;4;6;4;13;9;23;4;7;4;22;16;16;15;6;2;11;6;6;2;12;8;7;2;7;2;12;5;7;4;8;4;21;12;2;2;7;5;9;7;21;13;22;7;12;11;10;6;41;34;3;3;2;1;10;7;9;3;8;3;3;3;5;2;4;2;8;6;8;5;17;6;4;3;11;7;23;16;7;4;12;8;6;3;8;2;7;5;18;7;9;5;1;1;9;4;166;70;17;4;13;3;10;6;11;5;8;5;7;2;16;7;6;4;8;1;20;3;10;6;18;14;9;8;11;8;10;7;19;11;6;5;8;7;15;7;55;19;22;11
270;146;;Leu;ctt;AAG;4;2;5;2;7;5;12;3;6;2;14;7;11;5;26;5;32;3;20;6;4;1;5;2;26;4;8;4;20;14;2;2;5;2;6;3;4;1;5;2;5;1;5;1;7;2;6;2;6;1;49;18;4;3;3;3;9;5;33;22;16;1;5;3;9;4;22;18;4;3;3;1;9;7;8;3;5;3;1;1;3;2;5;2;5;3;6;2;9;6;3;3;10;6;8;5;6;3;5;3;4;1;14;9;5;3;15;4;8;4;1;1;9;5;112;56;49;36;6;1;16;10;11;6;1;1;6;2;15;4;7;3;9;3;18;13;8;3;6;3;2;2;8;5;15;13;11;8;6;3;6;1;10;5;38;18;29;10
258;129;;Ile;att;AAT;6;2;12;2;12;5;17;2;12;6;20;7;18;4;21;4;33;2;21;2;9;5;13;3;26;6;13;8;31;23;11;9;10;3;13;6;10;2;12;6;9;3;10;2;20;7;9;2;10;2;101;17;6;2;7;1;14;9;26;21;31;19;8;3;15;10;43;30;7;6;3;1;12;8;13;1;6;2;3;2;10;4;4;2;12;5;10;4;23;9;5;2;13;9;27;17;6;3;11;5;10;4;25;13;8;2;18;4;14;9;1;1;12;7;110;63;20;6;12;3;16;9;17;11;12;7;15;8;17;3;11;5;11;1;69;12;13;1;14;8;40;35;13;8;18;10;12;3;8;3;11;6;15;6;63;18;69;37
9;9;;Cys;tgt;ACA;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;143;134;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;5;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;5;5;0;0;2;2;4;4;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;16;16;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;4;4;0;0;2;2;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;5;5;0;0;0;0;1;1;6;5;1;1;2;2;1;1
11;11;;Gly;ggt;ACC;0;0;0;0;0;0;0;0;12;11;0;0;20;20;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;24;24;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;4;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;1;1;0;0;0;0;2;2;5;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;7;1;1;9;9;0;0;0;0;0;0;19;18;0;0;0;0;0;0
203;56;;Arg;cgt;ACG;4;2;10;1;8;3;11;7;9;6;16;4;13;6;22;5;32;4;18;4;6;5;6;3;21;4;6;2;9;5;7;5;7;3;10;6;10;1;10;5;9;1;12;1;10;4;6;3;9;4;49;12;6;5;8;4;7;4;31;23;13;2;5;3;7;2;14;10;4;2;4;1;6;3;5;5;7;5;2;2;6;5;6;4;6;3;6;3;12;7;3;2;7;3;12;8;2;2;7;3;6;4;16;4;7;3;24;7;7;3;0;0;7;4;85;30;12;8;8;3;7;3;7;2;6;3;9;5;15;4;6;2;4;4;29;9;7;2;6;3;6;4;8;5;14;4;16;3;6;3;7;5;11;10;33;13;35;10
14;11;;Ser;agt;ACT;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;4;4;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;18;11;0;0;0;0;2;2;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;3;3;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;26;9;0;0;0;0;3;2;5;5;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
336;176;;Ser;tct;AGA;5;1;6;2;10;4;37;11;10;7;11;3;13;5;17;3;20;4;15;4;10;5;6;1;19;5;9;4;26;14;24;22;8;2;13;5;8;3;10;3;8;3;9;3;12;4;7;2;8;3;52;14;2;1;9;5;11;5;30;18;15;5;7;5;9;4;29;20;3;3;1;1;9;4;12;6;8;2;5;3;6;2;7;6;10;5;8;3;12;5;4;4;10;7;0;0;2;1;10;3;6;4;10;4;7;2;12;5;10;4;1;1;9;3;22;8;14;6;13;3;11;8;12;6;11;9;8;4;11;3;9;3;10;3;0;0;10;4;15;9;3;1;14;10;14;9;11;6;7;4;12;9;13;9;40;17;13;5
92;26;;Ala;gct;AGC;12;6;17;4;17;14;16;3;20;18;19;3;31;19;29;7;35;2;22;6;14;11;22;17;31;8;15;13;75;56;11;10;28;24;23;16;12;2;23;16;9;1;18;4;27;16;14;10;18;14;53;22;16;7;24;11;23;20;55;31;24;3;46;45;26;16;54;40;5;2;2;1;22;18;15;6;13;9;7;3;8;5;11;8;23;19;15;13;25;10;9;2;19;17;83;51;18;11;21;14;13;8;18;7;15;11;20;4;20;16;1;1;19;16;106;44;20;2;19;9;22;19;31;26;36;31;10;8;27;13;15;12;18;8;32;11;23;18;256;252;18;10;20;16;20;13;12;5;12;10;19;14;11;2;67;17;66;32
315;138;;Pro;cct;AGG;3;1;7;5;9;2;16;5;7;2;15;4;13;2;6;4;25;12;6;4;8;1;7;1;9;2;7;1;12;11;12;8;8;2;10;2;7;1;7;1;6;1;6;1;10;1;10;2;8;2;63;5;4;1;7;1;10;5;55;30;21;5;13;9;9;2;16;7;12;10;2;1;8;2;11;1;7;3;7;2;6;1;7;1;8;3;9;1;7;1;3;3;9;4;19;6;4;1;9;1;7;1;14;4;8;1;14;4;9;4;1;1;7;2;54;18;14;2;13;2;11;3;11;7;33;23;8;1;14;5;9;4;10;2;19;5;9;1;12;5;6;3;11;4;13;9;10;3;7;2;7;3;15;6;60;18;15;4
359;182;;Thr;act;AGT;4;3;8;1;10;6;10;3;13;9;9;7;14;10;22;2;31;5;17;3;8;6;8;7;24;7;10;9;24;17;17;16;10;10;10;7;9;3;11;10;8;1;8;1;9;7;9;7;9;6;99;50;5;3;4;4;9;7;30;20;9;6;15;15;9;6;14;13;11;8;3;1;10;7;12;6;8;5;4;4;5;3;3;3;11;9;10;8;10;2;5;4;12;9;23;16;5;5;8;6;9;8;18;12;7;6;11;3;11;7;0;0;10;6;62;33;7;5;10;2;12;8;10;8;9;7;8;6;12;9;9;7;9;5;27;13;13;7;34;32;8;6;16;15;26;17;18;11;9;7;9;7;10;6;151;75;20;13
5;4;;Tyr;tat;ATA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;11;11;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;2;2;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;3;3;0;0;2;2;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;5;5;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;4;4;1;1;0;0;1;1;4;4;0;0;0;0
11;7;;Asp;gat;ATC;0;0;0;0;1;1;0;0;20;19;0;0;6;6;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;1;1;6;6;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;1;1;2;2;0;0;1;1;1;1;1;1;2;1;0;0;2;2;1;1;0;0;0;0;10;9;6;6;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;10;10;3;3;0;0;1;1
0;0;;His;cat;ATG;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;4;4;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;5;5;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1
24;15;;Asn;aat;ATT;0;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;5;5;1;1;1;1;0;0;2;2;2;2;2;2;0;0;0;0;4;4;3;3;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;6;48;44;0;0;3;3;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;2;1;2;2;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;3;3;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;0;0
241;118;;Leu;ttg;CAA;2;1;4;4;9;7;12;6;8;8;16;7;14;14;11;10;14;12;7;7;5;5;4;4;7;7;7;7;31;30;7;6;6;6;6;6;4;4;8;7;4;4;4;4;6;6;6;6;8;8;7;6;2;2;3;3;9;9;15;15;18;8;5;5;7;7;17;14;4;4;1;1;9;8;4;3;8;8;2;2;3;3;3;3;4;4;6;6;14;9;3;3;6;6;10;10;7;7;3;3;5;5;7;7;4;4;19;5;9;9;1;1;7;6;42;24;3;3;6;3;7;7;7;7;0;0;4;4;9;5;7;7;3;3;18;12;6;5;10;10;4;4;10;10;12;12;10;10;4;4;7;7;14;10;22;16;20;8
227;96;;Val;gtg;CAC;3;1;29;8;9;2;8;2;32;24;11;3;39;27;6;3;15;8;6;2;8;3;9;6;13;5;11;7;1540;1503;6;6;6;3;15;11;7;2;81;76;6;2;11;3;15;6;4;2;9;3;18;11;3;2;7;5;11;6;28;19;13;2;6;3;13;6;35;26;4;3;2;1;12;8;9;3;7;4;3;3;5;1;5;2;12;8;7;4;7;5;4;2;13;9;10;5;9;7;14;4;5;2;9;2;7;2;11;4;12;6;1;1;12;6;71;25;11;5;11;9;18;11;14;10;7;5;7;4;11;3;8;6;10;4;0;0;12;5;39;36;1;1;16;13;16;9;29;13;6;4;22;19;11;5;53;28;16;3
300;139;;Leu;ctg;CAG;4;2;10;2;7;5;3;1;7;4;8;1;6;3;7;5;8;5;5;2;7;3;10;5;12;7;12;9;25;20;6;4;6;2;4;2;8;1;10;4;9;1;8;1;3;2;6;4;5;3;9;3;7;5;7;5;5;4;47;34;7;1;5;4;9;2;10;6;8;8;2;1;6;4;11;6;6;5;4;3;5;2;7;3;10;4;5;3;4;2;6;6;9;6;18;13;2;2;16;6;9;4;16;8;11;3;10;2;12;6;1;1;6;5;75;38;7;2;5;2;11;8;9;7;5;3;13;10;11;4;5;3;9;4;5;3;5;2;4;2;7;4;5;4;37;19;21;7;7;4;6;5;7;3;32;15;13;3
522;174;;Met;atg;CAT;12;8;18;5;24;13;32;16;21;13;56;31;35;19;23;5;29;5;19;3;23;17;16;9;30;5;20;13;94;74;16;11;15;10;26;15;12;4;30;20;12;4;15;4;25;13;16;6;24;15;286;65;6;4;14;6;17;7;154;112;36;14;14;8;20;9;50;34;11;8;4;2;19;14;25;11;14;7;11;4;14;6;14;6;19;11;20;14;41;23;9;3;17;10;32;18;18;14;18;10;13;8;27;7;15;4;60;29;19;11;2;2;15;6;278;91;26;8;24;9;22;13;23;14;13;6;15;8;39;30;15;7;22;8;73;30;23;11;14;7;5;3;21;14;20;12;36;12;12;5;17;11;26;20;138;39;79;48
44;22;;Trp;tgg;CCA;7;4;6;1;10;7;16;5;256;243;18;6;178;173;13;1;22;3;12;3;6;6;6;4;18;4;11;10;30;20;10;9;8;7;8;4;8;2;15;12;9;2;8;2;7;4;7;5;23;22;74;27;3;3;6;3;9;7;29;19;18;3;6;5;7;5;23;17;15;13;1;1;9;6;9;6;8;7;5;3;4;2;6;4;8;6;11;9;14;7;4;3;10;10;14;9;47;45;10;7;6;6;12;5;6;4;18;7;10;6;0;0;8;5;9;8;14;2;9;1;10;9;8;5;8;7;6;5;13;3;8;7;8;5;18;13;7;4;7;4;3;3;13;11;12;7;17;10;6;4;217;208;10;1;33;12;27;7
268;181;;Gly;ggg;CCC;2;1;0;0;7;5;5;1;2148;2045;9;1;1295;1266;5;5;25;14;3;1;9;7;7;5;2;2;5;4;81;74;2;1;6;5;9;6;0;0;326;322;0;0;1;1;8;5;5;3;6;5;4;3;4;3;4;2;9;5;18;14;9;3;3;2;5;3;72;70;2;1;1;1;8;5;8;2;5;3;3;2;3;2;2;2;7;5;4;3;3;2;1;1;10;9;9;5;341;339;16;11;3;1;9;7;5;2;9;5;9;6;0;0;8;5;6;2;7;1;11;8;13;11;16;14;5;4;2;1;6;2;4;4;6;3;4;3;6;4;20;19;4;4;90;88;6;5;4;3;7;6;1766;1696;6;3;105;35;11;2
59;35;;Arg;cgg;CCG;1;1;0;0;7;5;4;3;21;20;6;4;16;13;0;0;24;11;1;1;4;3;3;3;1;1;4;3;2;2;3;3;3;3;4;2;0;0;5;5;0;0;0;0;4;2;3;2;24;24;2;2;0;0;2;2;5;3;10;7;5;4;4;4;4;2;3;3;1;1;1;1;4;2;4;3;3;3;2;2;2;2;2;2;3;3;5;3;3;2;1;1;3;2;14;11;6;6;4;3;3;3;6;6;4;3;8;5;4;2;0;0;4;2;10;6;6;5;5;3;7;3;5;3;3;3;3;2;7;3;3;2;3;3;1;1;3;1;3;3;0;0;7;6;2;2;4;4;3;2;12;12;6;6;8;6;6;3
104;29;;Arg;agg;CCT;3;3;2;2;45;44;8;4;67;67;10;6;116;114;2;1;11;7;4;3;29;28;6;5;3;1;5;4;12;7;10;10;5;4;7;7;3;1;47;46;3;2;4;2;7;6;7;6;53;52;26;5;2;2;3;3;6;5;28;21;13;3;5;4;5;5;16;14;8;8;1;1;7;6;5;4;4;4;3;2;5;5;3;3;5;4;21;21;6;4;4;3;5;4;9;7;33;32;6;5;5;5;18;6;6;5;11;5;5;4;0;0;5;4;50;25;11;4;10;5;9;7;5;4;8;6;6;4;10;3;5;4;4;3;19;12;4;4;6;5;2;2;13;13;11;5;10;5;4;4;54;53;8;4;27;9;11;6
80;44;;Ser;tcg;CGA;2;2;8;1;4;4;7;4;4;4;5;1;7;7;8;4;9;6;6;3;8;7;3;3;15;5;4;4;48;48;10;9;4;3;4;4;4;1;6;6;3;1;5;1;4;4;3;3;5;5;29;6;1;1;2;1;5;5;14;13;6;2;3;3;4;4;4;3;3;3;1;1;4;4;3;3;2;2;1;1;2;2;3;3;3;3;4;4;2;1;2;2;5;5;8;7;3;3;5;4;3;3;6;5;4;3;9;6;3;3;1;1;3;3;35;17;5;4;7;2;6;5;4;4;3;3;4;4;10;6;3;3;3;3;6;5;4;4;6;6;1;1;4;3;3;2;5;5;3;3;4;4;3;1;23;10;6;3
112;26;;Ala;gcg;CGC;3;3;6;2;5;4;7;3;20;19;11;2;16;14;7;5;6;4;4;4;4;4;6;5;8;1;4;3;3858;3758;4;4;5;5;6;5;3;1;17;16;5;2;5;3;8;7;4;4;7;6;56;15;2;2;4;4;5;5;26;20;8;3;6;5;4;4;15;15;3;2;2;1;5;4;6;4;5;3;3;3;3;3;3;3;10;7;5;4;3;3;2;2;5;4;11;8;7;6;4;4;3;2;12;8;4;3;13;5;5;4;1;1;5;4;24;6;5;3;8;2;4;3;5;5;4;4;3;2;11;2;5;4;4;2;7;3;7;6;18;17;3;3;6;5;4;4;6;6;3;2;21;20;5;2;36;21;22;11
180;91;;Pro;ccg;CGG;2;1;13;6;5;2;5;3;4;2;8;3;4;1;4;2;9;5;4;1;4;2;3;1;8;1;4;1;41;41;2;2;3;1;4;2;5;3;4;3;5;3;5;2;3;2;3;1;7;5;18;5;1;1;3;2;4;1;22;12;5;2;3;2;4;2;3;1;4;4;2;1;3;1;3;1;2;1;1;1;3;1;3;1;3;1;2;1;1;1;2;2;4;1;7;3;1;1;4;1;3;1;4;2;4;1;9;6;4;1;1;1;4;1;21;9;4;2;5;5;5;2;5;2;3;1;2;1;8;4;4;1;3;1;9;5;3;1;3;1;2;1;3;1;5;4;6;4;4;3;4;2;4;3;36;17;9;4
66;42;;Thr;acg;CGT;1;1;6;3;10;10;6;4;4;4;6;4;7;7;9;4;10;4;7;5;5;5;4;4;11;3;4;4;137;133;5;5;3;3;5;5;3;1;7;7;4;2;5;1;3;3;4;4;9;9;23;9;1;1;2;2;6;5;30;23;4;2;4;4;5;5;10;10;2;2;2;1;4;4;3;3;3;3;0;0;3;3;2;2;4;4;5;5;1;1;0;0;5;5;10;8;3;3;5;5;3;3;8;7;7;7;5;2;7;7;1;1;6;6;23;12;4;2;6;3;7;7;6;6;4;4;5;5;6;3;5;5;2;2;9;5;4;4;7;7;2;2;4;4;13;10;8;7;4;4;3;3;3;2;29;14;6;2
9;6;;Stp;tag;CTA;0;0;0;0;10;10;0;0;9;9;0;0;13;13;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;3;3;4;4;2;2;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;12;0;0;0;0;0;0;3;3;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;5;0;0;0;0;5;5;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;2;2;4;4;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;8;0;0;1;1;4;4
245;87;;Glu;gag;CTC;5;4;15;3;37;34;13;4;468;447;19;3;164;161;30;9;37;3;24;5;22;16;20;14;40;9;15;9;428;406;5;3;5;1;77;73;15;5;45;38;10;4;14;3;51;48;9;4;44;41;53;25;6;2;7;2;9;7;50;30;24;7;4;1;8;2;24;18;8;6;2;1;6;4;13;3;7;2;6;3;6;1;8;4;14;6;19;15;11;3;1;1;17;10;27;14;60;57;19;5;8;2;15;2;11;4;25;11;10;3;1;1;4;1;11;3;21;8;15;8;11;6;13;7;8;3;14;5;26;9;10;7;10;2;29;10;13;8;7;4;3;2;19;19;13;5;21;7;10;7;395;387;26;14;51;19;30;14
266;123;;Gln;cag;CTG;5;3;11;6;25;21;9;5;20;16;11;3;40;32;10;4;11;5;7;3;20;16;11;6;16;5;13;8;18;10;11;10;8;5;12;8;8;4;10;7;8;4;8;5;12;6;8;6;47;45;81;20;3;2;5;3;21;16;45;23;13;5;6;3;13;7;28;23;9;7;3;1;14;10;11;3;7;6;1;1;7;5;12;5;12;7;17;14;5;3;5;5;17;14;19;14;9;6;15;7;9;4;11;4;12;6;10;7;14;10;1;1;11;7;108;48;11;7;10;2;24;20;21;14;10;6;7;3;13;8;11;8;10;3;21;11;12;8;6;2;6;2;10;6;18;5;14;6;6;3;15;8;11;8;40;10;13;7
953;463;;Lys;aag;CTT;6;3;17;2;772;760;19;5;29;24;18;2;40;25;40;4;49;4;30;6;408;398;86;75;37;7;16;12;36;25;9;7;26;19;22;16;13;1;43;30;11;1;16;4;16;8;149;121;887;879;97;23;7;6;6;2;19;14;43;23;22;2;15;11;15;10;36;22;13;9;4;2;16;9;19;9;11;3;3;2;11;7;6;2;26;19;271;266;16;3;13;10;20;14;25;15;16;11;29;20;9;5;43;21;11;7;20;5;17;11;0;0;12;6;23;10;17;2;16;5;27;19;26;18;19;9;13;7;22;7;10;7;32;23;42;12;16;9;12;5;6;5;16;9;21;11;20;7;7;7;19;16;16;11;97;23;127;91
197;87;;Phe;ttc;GAA;5;1;9;1;11;3;21;5;13;9;18;5;30;18;22;6;24;6;15;5;10;6;8;4;24;5;8;4;35;25;22;20;8;3;13;6;8;1;12;7;8;3;9;1;12;4;8;3;12;8;35;12;6;2;10;5;13;8;36;24;22;5;6;2;10;5;32;19;7;6;2;1;10;5;12;4;10;7;6;4;5;2;8;2;7;3;11;5;26;6;6;4;17;13;24;18;6;4;14;8;6;2;23;14;10;6;20;7;14;5;1;1;12;3;57;23;18;3;14;3;18;13;16;11;8;4;10;5;21;5;10;5;13;7;0;0;21;10;10;4;10;4;11;8;19;10;23;13;6;5;12;8;23;12;58;18;25;8
6;4;;Val;gtc;GAC;0;0;0;0;0;0;2;1;1;1;4;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;16;16;0;0;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;3;3;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;4;2;2;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;3;3;1;1;0;0;0;0;1;1;3;3;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;1;1;0;0;12;1
4;2;;Leu;ctc;GAG;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0
10;9;;Ile;atc;GAT;0;0;0;0;0;0;2;1;1;1;2;2;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;0;0;0;0;6;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;1;1;9;9;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;2;2;0;0;1;1;0;0;6;3;3;3;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;0;0;6;6;5;5;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;5;5;0;0
136;38;;Cys;tgc;GCA;12;4;5;1;25;12;18;14;24;19;15;9;338;313;16;2;21;5;13;2;21;12;41;17;15;3;32;23;15;10;18;14;34;16;24;20;7;4;22;13;7;3;8;3;25;15;34;20;32;19;107;35;10;5;11;5;35;30;27;19;14;1;23;18;29;23;28;23;17;14;1;1;28;20;46;15;29;10;5;3;27;10;20;9;60;28;25;10;10;3;5;5;23;14;37;19;61;56;25;16;21;11;42;34;10;4;17;9;30;18;0;0;28;15;68;30;14;6;7;5;34;25;33;24;40;14;25;12;13;7;21;11;8;6;31;11;23;13;48;19;9;4;22;20;15;8;15;10;25;19;22;20;11;6;92;46;25;15
836;445;;Gly;ggc;GCC;7;2;15;1;10;2;25;9;64;51;28;9;63;55;21;5;39;14;14;4;11;3;14;5;34;10;15;6;19;7;11;6;11;5;10;2;14;2;19;9;15;2;16;2;10;1;14;4;10;3;12;2;8;1;7;2;13;8;30;13;29;3;10;4;14;5;33;26;7;5;4;1;15;9;24;5;16;9;5;1;8;2;11;3;15;6;9;2;23;4;10;6;13;8;40;23;30;27;21;3;12;5;13;5;17;6;28;9;20;10;0;0;13;7;54;25;26;5;16;3;14;6;13;7;11;4;22;11;24;6;12;5;19;3;42;16;19;10;13;6;12;5;23;18;14;9;18;3;14;5;43;37;17;6;85;15;33;3
24;7;;Arg;cgc;GCG;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;7;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;9;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;3;3;0;0
424;263;;Ser;agc;GCT;5;3;6;2;13;10;16;9;13;10;18;6;19;11;9;3;14;5;9;3;8;6;9;6;15;3;8;5;33;23;20;19;10;7;13;6;6;2;10;7;3;2;8;4;12;7;7;3;12;8;30;16;6;3;7;4;8;4;0;0;28;12;7;5;8;6;76;69;8;7;2;2;8;4;9;2;10;4;6;5;5;3;7;5;8;6;12;8;15;9;8;8;9;6;18;12;7;6;10;3;7;5;10;5;7;3;20;6;11;7;1;1;9;5;65;31;16;6;9;3;8;4;9;6;12;7;8;4;13;6;7;4;8;2;17;3;10;4;7;5;5;3;36;34;11;6;19;13;9;7;11;8;9;2;99;59;14;4
2;2;;Ser;tcc;GGA;0;0;0;0;0;0;3;2;1;1;4;3;32;28;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;41;27;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;3;2;1;1;4;3;4;4;3;3;0;0;0;0;0;0;0;0;4;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;4;3;0;0;0;0;3;3;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;23;18;0;0;0;0;0;0;1;1;3;2;22;12
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12;8;;Pro;ccc;GGG;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;6;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;2;2;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0
0;0;;Thr;acc;GGT;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;3;1;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;12;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;2;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;8;3;0;0;0;0;0;0;19;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;5;5;5;5;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;13;5
236;100;;Tyr;tac;GTA;6;6;22;21;11;10;83;33;14;14;17;14;39;38;19;6;28;8;19;12;9;9;11;11;24;2;35;25;36;29;5;5;15;11;11;11;9;9;14;11;10;10;9;9;14;10;13;13;10;9;17;13;12;8;16;13;23;22;50;47;21;20;7;7;13;13;19;19;8;8;3;2;31;31;15;13;8;8;6;4;5;5;8;8;11;11;9;9;13;11;7;5;19;19;28;26;16;16;12;12;8;7;18;18;10;10;20;17;24;23;1;1;15;13;90;50;18;16;8;7;29;28;31;29;2;2;9;9;14;14;15;15;11;10;24;17;17;14;9;9;13;10;15;15;13;11;15;14;10;10;18;17;19;19;107;48;21;18
150;43;;Asp;gac;GTC;8;2;20;2;11;6;29;8;45;38;26;5;42;33;34;7;34;3;27;7;13;4;15;5;41;9;14;6;49;35;14;10;10;4;13;7;14;3;21;9;6;1;17;3;10;5;13;4;9;2;184;49;5;4;10;3;15;8;30;15;33;8;10;6;13;3;20;14;19;16;3;1;15;9;24;12;13;12;3;1;8;3;5;2;16;4;8;4;30;14;9;5;13;8;27;14;8;6;23;6;13;4;10;4;14;3;31;11;15;7;1;1;10;4;90;34;34;5;11;3;13;6;17;10;15;3;19;10;24;4;11;5;19;7;82;20;97;83;8;3;7;4;15;11;19;13;24;6;13;7;49;44;23;12;59;13;42;12
387;163;;His;cac;GTG;5;2;21;5;8;1;12;6;11;4;21;7;19;5;21;3;26;5;19;6;9;2;14;3;17;5;9;4;37;27;10;8;8;2;10;2;5;1;10;4;6;2;5;1;11;3;5;1;16;8;52;19;4;4;6;4;7;1;26;16;18;3;7;2;9;1;27;13;5;3;2;1;14;4;9;1;7;1;3;3;7;3;6;3;10;3;7;2;18;8;4;4;11;4;24;20;8;5;9;1;8;1;23;14;5;1;26;10;10;1;0;0;10;1;27;12;13;4;9;3;11;4;10;2;10;1;7;1;15;7;9;4;9;1;26;9;10;3;6;2;5;3;12;5;12;8;19;9;10;5;9;5;14;9;42;18;26;8
1045;470;;Asn;aac;GTT;10;4;12;2;28;18;19;9;24;7;16;6;30;14;23;3;33;5;20;3;21;13;17;9;23;3;27;18;48;32;17;12;18;9;14;4;10;1;23;6;6;1;11;1;17;8;7;2;28;21;123;41;6;5;11;6;29;20;34;18;22;10;9;4;25;17;51;37;9;7;3;1;27;21;13;4;14;4;4;2;9;2;9;5;13;5;12;8;30;16;9;5;21;14;21;11;13;5;26;15;12;4;9;1;14;5;30;13;29;20;1;1;18;10;168;68;24;13;14;5;41;30;33;24;15;7;12;4;16;7;12;7;13;1;39;9;18;8;9;2;8;5;23;18;17;11;23;13;15;9;13;6;21;14;47;19;49;18
73;54;;Leu;tta;TAA;2;2;6;5;5;4;6;3;13;12;4;2;10;10;6;4;7;3;4;3;4;4;4;4;5;5;11;11;13;12;13;13;4;4;5;5;4;4;8;8;3;3;5;4;4;4;3;3;19;19;12;8;11;11;3;3;9;8;16;15;9;5;4;4;4;4;15;14;11;11;1;1;16;15;2;2;3;3;1;1;2;2;3;3;7;5;4;4;8;5;4;3;8;8;10;7;5;5;6;5;3;3;12;12;3;3;4;3;10;10;1;1;7;7;5;3;7;6;2;1;8;8;11;9;3;3;4;4;4;4;9;9;6;6;14;9;4;4;3;3;4;3;6;6;5;4;7;7;42;13;6;6;9;7;46;35;5;3
230;59;;Val;gta;TAC;2;2;3;1;7;7;7;3;18;18;5;3;21;19;6;4;8;5;5;4;5;5;5;4;7;5;6;5;145;116;5;5;3;2;7;7;2;1;16;16;2;1;2;1;6;6;6;6;6;6;12;8;1;1;3;3;8;8;9;9;9;4;4;3;5;4;50;39;7;7;1;1;7;6;5;4;1;1;2;2;3;3;2;2;3;1;6;6;7;5;1;1;6;6;15;13;8;8;8;5;3;2;9;7;4;4;4;1;7;5;1;1;7;5;26;19;8;3;2;1;7;5;10;10;3;2;5;5;4;2;5;4;4;3;11;6;11;9;5;4;2;2;26;26;4;3;9;7;4;3;16;16;5;4;36;19;4;2
244;134;;Leu;cta;TAG;3;3;3;2;5;5;11;5;4;4;10;4;5;5;5;2;8;2;3;1;4;4;4;4;6;4;4;4;20;18;4;4;3;3;4;3;2;1;3;3;2;1;2;1;5;5;3;3;33;33;17;12;0;0;2;2;5;5;24;20;10;3;5;5;3;3;11;11;5;4;1;1;5;5;6;6;4;3;1;1;2;2;2;2;4;4;4;4;10;4;0;0;4;4;7;5;3;3;4;4;3;3;7;6;5;5;10;5;3;3;1;1;3;3;40;14;0;0;6;5;3;3;4;4;1;1;2;2;9;6;4;4;4;4;8;6;5;3;3;3;1;1;5;5;6;6;4;4;5;4;4;4;11;7;25;10;9;5
75;53;;Ile;ata;TAT;1;1;2;2;6;6;5;2;8;8;4;3;8;8;24;16;26;13;7;4;5;5;5;5;7;5;5;5;23;19;13;13;5;5;5;5;2;2;6;6;0;0;2;2;5;5;4;4;9;9;61;15;2;2;2;2;6;6;18;16;8;3;3;3;5;5;7;7;7;7;1;1;7;7;7;7;6;6;1;1;3;3;3;2;5;5;5;5;14;7;1;1;5;5;10;8;5;5;7;7;11;11;25;20;4;4;5;3;7;7;1;1;4;4;10;7;9;3;5;3;6;6;5;5;3;3;5;5;5;4;6;6;4;4;22;16;5;4;4;4;1;1;8;8;5;5;6;6;4;4;5;5;9;6;51;25;5;4
14;12;;SeC;tga;TCA;1;1;0;0;2;2;0;0;17;17;0;0;29;29;0;0;3;2;2;2;1;1;2;2;1;1;2;2;3;3;4;4;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;4;4;2;2;18;18;1;1;0;0;1;1;3;3;2;2;0;0;7;4;2;2;24;24;4;4;0;0;2;2;0;0;7;4;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;5;5;4;4;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;3;3;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;2;2;1;1;2;2;1;1;3;3;2;2;0;0;0;0;1;1;1;1;18;18;1;1;1;1;1;1;21;21;1;1;1;1;0;0
47;23;;Gly;gga;TCC;8;3;8;1;7;4;13;2;987;962;9;3;391;385;42;9;66;5;34;6;11;4;6;1;47;11;9;3;66;44;24;14;6;4;4;2;6;2;34;24;5;2;7;2;4;2;7;2;48;46;61;21;4;2;7;4;5;4;39;21;18;2;4;3;9;4;619;616;5;5;1;1;5;3;11;7;10;4;4;2;6;2;7;2;8;2;9;7;15;6;11;6;6;2;15;9;133;132;14;2;9;6;12;6;7;2;10;5;8;2;1;1;4;2;17;4;17;7;9;4;8;5;7;5;9;3;12;7;10;3;6;4;9;3;33;14;10;8;5;3;7;3;1073;1068;16;11;12;5;6;4;833;814;19;12;80;27;11;3
107;50;;Arg;cga;TCG;3;3;8;4;84;82;6;2;9;8;5;1;12;11;10;6;17;6;8;4;15;15;6;4;11;5;4;4;25;22;5;4;4;4;5;4;10;4;8;7;5;3;7;2;4;3;5;4;1201;1194;79;14;2;2;2;2;6;5;17;15;9;3;4;4;6;6;18;14;4;4;1;1;5;5;5;3;5;3;1;1;5;4;3;2;5;4;29;28;5;2;1;1;7;7;7;5;6;6;5;3;4;4;7;7;6;5;4;2;5;5;1;1;6;5;26;9;7;2;7;5;6;5;6;6;5;4;5;5;4;1;4;4;5;3;19;10;5;3;5;5;3;3;12;12;7;7;7;7;5;5;7;7;6;3;33;8;7;4
252;139;;Arg;aga;TCT;3;3;2;2;17;17;10;9;55;55;9;7;44;44;10;3;13;3;8;3;9;9;5;5;12;3;6;6;14;14;26;25;5;5;6;6;3;3;9;9;4;4;3;3;5;5;5;5;54;54;68;25;3;3;4;4;5;5;21;19;18;8;6;6;6;6;90;90;9;9;1;1;6;6;6;6;7;6;3;3;5;4;5;5;6;6;16;15;8;6;4;4;7;7;6;6;22;22;6;6;4;4;27;26;5;5;12;6;6;6;1;1;6;6;18;10;11;6;7;3;8;6;6;6;6;6;6;6;8;6;6;6;5;5;18;9;7;6;5;5;4;4;123;122;10;10;13;12;6;6;48;48;6;3;105;53;9;6
209;117;;Ser;tca;TGA;1;1;2;1;6;6;12;6;5;5;10;5;7;7;8;5;14;7;9;7;5;5;3;3;7;3;5;4;54;51;15;15;3;2;5;3;2;2;6;5;2;2;2;2;4;4;3;3;14;13;62;19;3;3;4;3;5;5;18;15;11;5;3;3;4;4;7;7;6;6;1;1;20;16;6;5;4;2;3;3;2;2;2;2;3;2;4;4;8;4;5;4;6;6;6;6;4;4;4;4;3;2;10;9;3;3;17;7;9;9;1;1;5;5;20;10;9;5;5;3;8;8;9;9;4;4;3;3;13;6;6;5;5;5;15;9;5;5;7;7;4;4;6;6;9;9;8;8;5;5;6;6;8;3;41;19;11;5
368;103;;Ala;gca;TGC;6;6;3;2;9;7;10;3;42;42;13;6;35;31;14;1;11;4;9;2;11;8;15;14;11;5;6;5;5898;3009;15;12;9;7;13;12;2;2;66;64;0;0;2;1;11;9;10;10;10;9;53;17;5;5;7;4;7;6;24;20;17;5;5;4;8;7;53;47;20;19;1;1;11;11;9;6;6;6;6;4;1;1;5;5;11;8;8;7;16;8;5;5;11;11;17;11;12;12;9;9;7;5;11;6;7;6;10;1;10;10;1;1;9;9;31;10;21;8;9;2;9;7;10;9;9;6;8;7;13;5;8;7;7;4;17;7;14;12;39;39;7;5;40;37;11;9;8;5;4;4;36;36;37;21;47;18;15;7
205;97;;Pro;cca;TGG;3;1;8;2;11;8;47;6;5;3;18;10;9;3;41;11;54;6;31;8;8;7;6;2;43;10;6;3;51;44;4;3;4;2;7;3;5;1;7;2;5;2;8;1;7;3;5;2;68;64;29;7;5;4;4;3;7;4;21;15;27;7;5;4;7;3;14;12;10;7;1;1;10;7;8;3;4;1;2;2;3;3;4;3;8;5;7;6;11;3;4;3;5;3;12;9;6;4;5;3;4;3;11;5;4;3;14;9;6;4;1;1;6;4;43;14;23;10;8;2;9;6;10;6;6;2;6;4;11;5;5;3;6;1;21;6;4;2;7;5;1;1;8;5;14;10;9;5;32;32;5;3;16;8;53;17;31;18
290;139;;Thr;aca;TGT;3;2;2;1;9;8;9;5;8;7;10;8;10;8;10;4;15;3;11;2;4;3;4;3;12;5;7;7;206;157;18;17;4;3;8;6;6;2;8;7;5;2;6;2;7;5;6;6;13;12;35;16;4;4;4;3;6;5;30;24;10;5;4;4;6;6;22;17;9;8;1;1;6;6;7;2;6;3;2;2;5;3;3;3;4;3;7;6;10;7;2;2;6;6;18;16;5;4;7;6;6;5;25;22;6;5;16;7;8;8;1;1;7;7;19;9;11;6;5;4;4;4;6;5;5;4;5;5;12;8;7;6;7;3;21;10;8;5;6;4;4;3;18;17;12;9;7;6;4;4;6;5;8;6;91;43;14;6
6;5;;Stp;taa;TTA;0;0;1;1;1;1;1;1;24;24;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;37;36;0;0;0;0;0;0;2;1;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;32;30;1;1;3;3;3;3;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;1;1;2;1;1;1;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;3;3;20;20;1;1;2;2;0;0
225;97;;Glu;gaa;TTC;7;2;11;3;11;7;16;9;2368;2321;15;7;435;424;19;4;36;9;17;3;15;11;7;5;20;4;21;18;66;59;17;17;6;4;11;7;6;1;20;15;5;3;7;2;11;6;8;5;15;11;46;24;4;4;9;7;16;13;51;39;16;4;6;4;8;5;114;107;11;9;1;1;12;10;14;4;12;6;5;4;5;4;9;6;8;3;7;6;22;9;3;3;14;12;16;13;139;136;18;9;5;4;14;8;7;4;16;6;13;6;1;1;13;7;12;9;14;1;7;2;24;15;18;12;10;5;10;9;13;5;21;17;15;5;26;8;235;205;5;3;2;2;114;112;16;13;13;9;9;7;1901;1872;15;10;84;24;22;10
105;46;;Gln;caa;TTG;3;3;4;2;43;42;10;4;10;8;15;8;20;18;24;5;40;11;20;5;43;42;5;4;14;3;7;7;7;6;16;15;4;2;5;3;4;2;5;3;4;2;4;1;6;4;4;3;782;777;60;13;2;2;2;2;11;10;11;8;13;3;3;3;6;4;14;11;10;9;1;1;16;15;7;7;4;3;1;1;3;3;4;3;7;6;37;35;20;10;2;1;10;8;11;8;7;7;5;3;5;4;6;5;5;3;21;12;14;12;1;1;6;4;44;21;11;1;10;7;13;13;20;17;6;5;5;3;11;8;8;8;45;29;17;7;9;6;4;2;2;2;8;6;9;5;10;7;64;51;16;12;10;7;28;8;22;14
525;250;;Lys;aaa;TTT;5;3;8;5;55;50;16;6;86;82;12;9;78;68;16;5;29;9;14;1;34;28;15;10;30;7;16;11;43;38;36;32;11;7;15;11;6;2;18;14;4;2;6;3;15;8;11;5;50;45;61;31;4;2;6;4;14;11;63;46;20;5;8;5;12;8;60;46;20;13;1;1;19;13;13;4;10;7;4;2;3;2;5;2;14;6;31;25;20;13;3;2;23;15;32;25;22;17;12;8;11;7;16;7;9;6;12;8;19;13;0;0;12;6;24;7;18;5;8;4;23;15;20;14;1;1;8;3;11;8;18;14;14;6;57;20;38;23;10;5;4;1;31;26;15;11;20;13;10;6;74;70;11;6;72;21;82;68
12273;5704;;;;total;211;119;422;138;1474;1302;699;268;7113;6771;648;267;4057;3737;743;213;1095;278;596;180;912;773;498;325;827;220;492;346;13732;10330;557;483;384;244;519;358;293;98;1119;929;258;97;332;104;494;300;485;322;3778;3620;2489;795;203;140;283;169;508;379;1497;1045;738;237;367;282;433;269;2004;1751;377;318;83;49;530;398;481;222;353;209;155;105;252;142;258;153;470;285;756;632;684;365;201;149;508;383;859;583;1179;1100;506;281;327;203;674;401;338;188;750;312;531;357;35;35;412;256;2488;1087;647;260;430;181;613;438;613;452;407;247;375;229;628;294;396;279;448;218;1066;427;808;572;804;658;279;201;2019;1908;614;409;616;345;458;323;5873;5642;583;347;2642;1054;1202;601

C42 effectifs

modifier
  • Lien tableaux: tableaux
  • Légende:
    − 6*6*, pour mgr aac, les décomptes à partir du fichier fasta donne 140 au total (tot) et 13 séquences différentes (diff). Le nombre total de tRNAs représenté dans le tableau récapitulatif de la base gtRNAdb [1] donne seulement 6 pour aac au lieu de 140. Ceci est du aux nombreux pseudo-gènes de ce génome. En comparaison avec les décomptes des autres tRNAs de ce génome, la plupart ont tot=diff. Aussi j'ai décidé d'attribuer au codon acc tot=diff=6.
C42;;;ani;;aor;;bfu;;cal;;cgr;;cjd;;cneg;;cot;;dha;;ecu;;ede;;fgr;;fgr5;;fve;;fvr;;kaf;;kpa;;kla;;kna;;lkl;;lth;;mfa;;mgr;;mth;;ncr;;ncs;;opa;;pch;;pic;;sas;;sce;;spo;;sre;;tbl;;tdl;;tpf;;ttt;;uma;;vda;;vma;;yli;;zro;
aa;gène;tRNA;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff
Phe;ttt;AAA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Val;gtt;AAC;8;2;10;2;8;8;6;3;10;1;9;2;7;6;4;2;10;2;1;1;2;2;19;8;16;6;7;2;13;2;13;2;5;2;7;1;7;1;14;1;11;2;12;2;6;6;7;3;19;1;13;3;3;1;9;5;7;3;7;2;14;2;9;2;4;4;18;3;12;2;10;1;6;3;4;3;11;9;7;7;24;3;12;2
Leu;ctt;AAG;6;6;0;0;6;5;2;2;0;0;4;1;6;4;1;1;2;2;1;1;1;1;13;2;6;1;6;4;12;5;2;2;2;2;0;0;1;1;;;0;0;4;2;7;6;7;7;17;15;2;2;1;1;6;1;3;1;0;0;0;0;5;2;4;4;0;0;0;0;0;0;5;4;4;3;8;2;5;2;21;12;0;0
Ile;att;AAT;7;5;10;5;8;8;6;6;9;1;6;1;6;5;4;1;9;1;1;1;2;2;13;5;11;5;11;2;11;7;13;1;5;1;7;1;7;1;12;2;10;1;12;2;8;8;8;8;17;17;12;1;4;1;10;3;7;1;9;1;13;1;8;2;4;4;17;4;8;1;10;1;6;6;4;2;9;1;7;7;26;12;11;2
Cys;tgt;ACA;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Gly;ggt;ACC;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0
Arg;cgt;ACG;9;3;12;2;6;5;2;2;4;1;6;3;3;3;2;2;5;2;1;1;2;2;10;2;10;2;13;11;10;2;4;2;2;2;3;1;3;2;5;1;4;2;4;3;6;6;7;7;21;2;5;2;2;2;10;1;3;1;4;1;6;2;8;1;4;4;4;1;4;1;3;1;6;6;4;4;9;5;6;6;1;1;5;2
Ser;agt;ACT;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Ser;tct;AGA;5;1;7;3;7;1;4;1;9;1;7;1;6;5;2;2;6;1;1;1;1;1;11;6;11;6;7;4;10;4;11;3;4;1;6;1;7;1;11;7;9;1;10;3;4;4;5;4;14;2;12;2;2;1;7;4;6;1;7;1;11;2;7;1;2;2;16;3;7;1;8;1;3;1;3;3;6;3;5;3;21;4;12;1
Ala;gct;AGC;8;1;10;2;8;1;6;1;10;1;6;1;8;8;3;1;7;1;1;1;2;2;14;9;13;9;13;3;14;13;12;1;5;1;7;1;7;3;13;2;10;1;12;2;9;9;7;7;19;13;12;2;3;1;8;1;7;1;7;1;11;1;6;1;3;3;19;3;8;1;9;2;7;7;5;4;11;9;7;7;30;2;12;1
Pro;cct;AGG;6;5;9;6;4;4;1;1;1;1;0;0;6;6;1;1;1;1;1;1;0;0;10;6;10;6;4;4;10;9;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;1;5;4;6;6;12;4;1;1;0;0;0;0;1;1;1;1;2;1;6;1;3;3;1;1;1;1;1;1;4;4;4;4;8;4;1;1;21;6;3;2
Thr;act;AGT;6;2;10;2;6;4;4;2;9;1;6;1;5;5;4;1;8;2;1;1;2;2;11;4;11;4;7;7;11;7;11;3;5;2;6;1;7;1;12;3;9;2;10;1;6;5;6;5;12;3;11;1;3;1;12;6;7;1;7;2;11;1;7;2;4;4;15;4;9;2;9;3;4;4;4;1;8;2;4;4;22;1;10;1
Tyr;tat;ATA;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0
Asp;gat;ATC;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
His;cat;ATG;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Asn;aat;ATT;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Leu;ttg;CAA;2;2;0;0;5;5;6;5;8;5;7;1;3;3;1;1;4;1;1;1;1;1;3;3;3;3;4;4;4;4;2;2;3;3;7;3;5;3;11;7;8;7;14;2;2;2;2;2;5;5;9;9;3;1;0;0;8;1;7;3;10;5;4;1;0;0;9;6;8;5;2;1;1;1;0;0;2;2;3;3;3;3;10;10
Val;gtg;CAC;2;2;3;3;2;2;1;1;1;1;3;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;3;3;3;2;3;3;1;1;1;1;2;2;2;2;3;1;3;1;4;2;2;2;3;3;4;4;2;1;1;1;3;1;1;1;4;3;2;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;3;3;1;1;2;2;2;2;8;5;4;1
Leu;ctg;CAG;3;3;4;4;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;5;3;5;3;2;1;5;4;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;3;3;2;1;4;4;4;4;6;6;0;0;1;1;3;3;1;1;1;1;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;0;0;4;4;2;2;4;4;4;4;13;7;0;0
Met;atg;CAT;7;5;8;8;8;5;4;2;7;2;7;4;7;6;4;4;10;9;2;2;2;2;6;6;5;5;15;7;8;6;9;4;4;3;6;3;4;2;10;2;8;4;10;5;8;6;8;7;17;8;9;2;4;2;11;10;6;5;10;6;10;2;7;4;4;4;11;6;7;2;8;4;5;5;4;4;9;5;8;5;18;7;9;2
Trp;tgg;CCA;3;1;4;1;6;2;2;2;5;5;4;1;3;3;1;1;4;1;1;1;0;0;4;4;4;4;4;4;5;5;6;2;3;2;4;3;4;4;5;4;5;3;6;1;4;1;4;3;7;2;7;7;2;2;0;0;4;1;5;2;6;1;3;1;2;2;7;6;4;1;4;3;4;3;2;2;3;3;3;3;13;8;6;4
Gly;ggg;CCC;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;2;2;0;0;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;8;7;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;1;2;2;2;1;3;3;2;2;6;6;2;1;0;0;1;1;1;1;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;3;3;2;2;0;0;2;2
Arg;cgg;CCG;2;2;3;3;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;2;2;2;3;2;2;2;1;1;2;1;1;1;2;1;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;3;2;0;0;2;2;2;2;0;0;1;1
Arg;agg;CCT;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;0;0;3;3;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;3;3;6;4;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;3;3;2;2;5;4;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;2;2;3;3;1;1;2;1
Ser;tcg;CGA;2;2;3;3;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;2;2;3;3;3;3;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;2;1;3;3;3;2;4;3;1;1;1;1;2;2;2;2;3;3;1;1;1;1;2;2;2;2;1;1;1;1;3;3;3;3;4;3;3;3;4;3;2;2
Ala;gcg;CGC;3;1;4;3;2;2;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;1;1;1;1;1;1;2;2;3;3;5;2;3;2;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;2;1;2;2;3;3;5;5;0;0;0;0;2;2;0;0;2;2;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;3;3;1;1;4;2;2;2;2;1;0;0
Pro;ccg;CGG;2;2;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;1;1;2;2;2;2;2;2;2;2;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;3;3;4;4;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;3;3;1;1;2;2;1;1;2;2;0;0
Thr;acg;CGT;2;2;2;2;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;2;3;2;4;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;2;3;3;3;3;2;2;1;1;2;2;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;3;3;2;2;2;2;2;2
Stp;tag;CTA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Glu;gag;CTC;8;3;11;3;9;9;1;1;3;1;9;1;10;10;1;1;1;1;1;1;2;2;19;7;13;5;12;11;16;12;2;1;4;1;2;1;3;1;3;2;11;3;8;2;9;9;8;8;24;12;1;1;3;2;10;1;2;1;8;1;2;1;6;1;4;4;1;1;4;2;1;1;7;6;5;5;12;2;9;9;27;16;4;1
Gln;cag;CTG;5;4;7;4;2;2;1;1;2;1;2;2;3;1;1;1;1;1;1;1;1;1;7;1;7;1;6;6;8;2;1;1;2;2;1;1;2;2;1;1;5;1;4;1;6;6;5;5;11;10;1;1;1;1;5;1;2;2;4;3;1;1;2;1;2;2;1;1;2;1;1;1;4;4;3;3;6;3;4;4;15;15;3;2
Lys;aag;CTT;8;1;11;3;10;9;2;2;12;1;8;1;7;2;3;3;10;4;1;1;0;0;16;4;12;4;11;9;15;5;12;1;5;2;9;2;7;1;14;1;15;2;10;2;9;7;9;9;24;4;14;1;3;1;9;1;9;3;9;1;14;1;9;3;5;5;15;2;10;3;9;2;6;6;5;5;12;1;9;7;34;24;14;1
Phe;ttc;GAA;5;3;7;6;7;5;5;4;6;1;8;4;5;5;2;2;9;4;1;1;1;1;11;8;9;7;15;15;10;9;9;7;5;1;5;1;6;5;8;4;7;7;10;1;7;5;5;4;12;4;10;7;3;1;5;2;6;2;7;4;10;5;5;2;4;4;12;7;6;4;9;3;5;5;3;2;7;5;4;3;17;11;8;4
Val;gtc;GAC;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
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Ile;atc;GAT;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1
Cys;tgc;GCA;3;2;4;4;5;5;2;2;3;1;3;2;3;3;0;0;4;1;1;1;1;1;5;3;5;3;4;4;5;4;5;1;2;1;3;1;4;3;5;2;4;2;4;2;3;3;3;2;7;2;4;1;1;1;3;3;3;1;3;2;4;1;3;2;2;2;0;0;3;1;4;1;3;2;2;2;5;4;3;2;8;1;4;1
Gly;ggc;GCC;11;1;15;1;8;8;5;1;12;1;11;1;9;5;2;1;11;1;1;1;2;2;14;12;15;13;11;11;14;3;17;1;5;2;7;1;9;2;15;1;15;2;16;1;14;14;11;2;26;2;13;1;4;1;11;1;10;1;11;1;16;1;8;1;6;5;23;1;11;1;13;1;10;3;6;6;13;1;9;9;30;1;17;2
Arg;cgc;GCG;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Ser;agc;GCT;4;4;6;5;5;5;2;2;3;2;3;1;2;2;1;1;3;2;1;1;1;1;8;7;8;7;4;1;7;6;4;2;2;2;2;2;3;1;4;4;3;3;6;3;3;3;5;5;6;6;4;3;2;1;4;3;2;2;4;3;4;2;3;1;0;0;6;6;3;1;3;3;3;3;2;1;5;3;3;3;6;6;5;5
Ser;tcc;GGA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0
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Pro;ccc;GGG;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
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Tyr;tac;GTA;6;5;13;11;6;5;4;4;6;1;6;4;4;4;3;2;6;3;1;1;1;1;8;4;6;3;6;6;8;7;9;3;4;4;5;1;5;4;7;7;6;5;10;2;5;5;6;4;10;6;9;2;2;2;5;3;5;4;5;3;8;2;4;3;2;2;9;7;7;4;6;2;4;4;3;1;6;6;5;3;14;10;7;1
Asp;gac;GTC;8;6;13;8;9;6;6;1;9;1;8;3;2;2;5;1;10;2;1;1;2;2;14;1;10;1;7;7;14;1;13;1;6;1;8;1;8;2;13;1;10;1;14;1;10;5;10;10;18;8;14;1;3;1;9;2;8;1;11;2;16;2;8;1;3;3;19;3;9;1;12;2;6;6;5;3;10;6;6;5;28;25;14;4
His;cac;GTG;5;2;8;7;4;4;3;3;6;2;6;2;4;4;1;1;6;2;1;1;2;2;7;5;7;5;7;7;6;5;6;1;3;1;4;1;4;1;6;1;5;3;8;1;4;1;4;4;9;6;8;1;2;1;11;5;4;1;6;3;7;1;4;1;2;2;7;1;4;1;5;1;3;3;1;1;6;1;6;6;12;5;6;2
Asn;aac;GTT;6;6;8;4;6;5;3;3;9;3;7;2;4;4;3;1;9;2;2;2;1;1;9;6;9;5;12;8;8;5;10;1;4;1;6;1;6;1;9;1;7;1;12;4;6*;6*;6;2;12;3;10;2;2;1;6;2;7;2;8;2;10;1;6;2;4;4;11;1;7;2;9;2;3;3;4;3;6;6;5;5;16;9;9;2
Leu;tta;TAA;1;1;3;3;2;2;5;2;3;1;1;1;1;1;3;1;10;2;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;14;3;1;1;3;2;3;1;3;1;2;1;4;2;1;1;1;1;1;1;7;2;1;1;2;2;3;1;3;2;7;1;2;2;0;0;12;2;3;1;9;1;7;7;0;0;1;1;0;0;1;1;4;1
Val;gta;TAC;1;1;2;2;2;2;1;1;2;2;2;2;0;0;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;2;2;3;3;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;2;2;2;2;2;2;0;0;1;1;2;2;3;2;2;1;2;1;1;1;2;2;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;2
Leu;cta;TAG;2;2;1;1;1;1;0;0;4;1;3;2;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;1;1;2;2;3;2;3;3;3;3;0;0;1;1;1;1;2;2;3;3;1;1;0;0;0;0;4;3;3;2;1;1;1;1;2;2;4;4;2;2;1;1;2;2;1;1;3;3;2;2;5;5
Ile;ata;TAT;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;3;3;3;3;2;2;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;4;3;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;1;1;2;1;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1
SeC;tga;TCA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;0;0;0;0
Gly;gga;TCC;3;3;4;2;7;4;2;1;2;1;4;2;3;2;1;1;5;3;1;1;1;1;6;6;5;5;9;5;5;2;4;3;3;3;2;2;1;1;2;1;3;1;6;2;3;3;4;3;4;2;3;1;2;2;5;4;3;2;2;1;3;1;3;3;2;2;3;2;2;1;2;2;2;2;2;2;3;3;3;1;11;10;5;1
Arg;cga;TCG;2;2;2;1;4;3;0;0;0;0;0;0;5;1;0;0;0;0;1;1;2;2;9;7;9;7;8;4;7;6;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;2;2;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;3;3;2;2;2;1;25;11;0;0
Arg;aga;TCT;2;1;2;2;5;5;5;1;9;1;7;2;1;1;2;1;10;3;1;1;0;0;3;3;3;3;2;2;2;2;11;2;4;2;7;2;6;2;12;2;9;3;10;1;1;1;1;1;5;4;10;1;3;1;0;0;7;2;7;2;11;1;2;2;1;1;13;3;7;2;8;2;1;1;1;1;3;3;1;1;4;1;8;1
Ser;tca;TGA;1;1;1;1;4;3;3;2;2;1;3;3;1;1;2;2;4;3;1;1;1;1;2;2;2;2;2;2;2;2;4;1;2;1;2;1;1;1;2;1;2;1;4;1;2;2;3;3;3;3;4;2;1;1;1;1;2;1;3;3;3;1;2;2;1;1;4;1;2;1;2;1;1;1;1;1;3;3;1;1;2;2;3;3
Ala;gca;TGC;2;2;3;2;5;5;2;2;5;1;3;2;1;1;2;1;5;2;1;1;1;1;4;4;3;3;9;6;3;2;5;2;2;1;3;1;1;1;4;1;3;3;8;2;3;3;2;2;3;3;5;2;2;1;2;2;3;1;6;5;5;1;2;1;1;1;5;2;4;1;3;1;2;2;1;1;2;2;2;2;4;1;9;3
Pro;cca;TGG;2;2;3;3;8;8;4;4;7;2;7;1;1;1;3;3;7;5;1;1;1;1;3;3;3;3;4;3;3;3;10;9;4;1;7;6;6;4;10;5;8;7;8;6;2;2;2;2;4;3;10;8;3;2;0;0;6;4;8;5;10;7;2;2;1;1;13;13;6;2;7;7;2;2;1;1;3;3;2;2;3;1;10;1
Thr;aca;TGT;2;2;2;2;3;3;2;1;3;1;3;2;1;1;2;1;3;3;1;1;1;1;4;3;4;3;3;3;4;3;3;1;1;1;2;1;2;2;2;1;2;2;4;1;2;2;2;2;3;3;3;2;1;1;3;3;2;1;3;3;4;2;2;2;1;1;3;2;2;1;2;2;1;1;1;1;3;3;3;3;3;3;2;1
Stp;taa;TTA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Glu;gaa;TTC;3;3;6;5;6;6;6;5;9;1;5;2;3;3;2;2;9;2;1;1;1;1;5;4;4;3;6;5;5;5;15;1;5;2;8;1;6;2;13;1;6;2;8;2;3;2;2;2;5;2;13;2;2;1;3;3;8;1;4;2;14;2;4;1;2;2;16;5;8;1;11;3;2;2;2;2;2;2;3;3;6;3;10;2
Gln;caa;TTG;2;2;4;3;6;4;5;5;6;1;6;1;2;2;3;3;7;2;1;1;1;1;5;5;5;5;4;4;4;4;9;2;3;1;6;3;4;1;10;2;5;3;8;2;2;2;2;2;3;3;9;1;2;1;3;3;5;2;4;1;9;3;4;2;3;3;10;3;6;2;7;2;2;2;2;2;2;2;2;2;3;3;10;1
Lys;aaa;TTT;2;2;3;3;3;3;5;2;3;1;5;3;1;1;4;1;8;3;1;1;1;1;3;3;2;2;6;6;2;2;8;7;3;3;4;2;4;3;5;4;4;2;6;4;2;1;3;2;2;2;8;6;2;2;1;1;3;3;4;3;7;2;3;2;1;1;9;3;5;3;6;2;2;2;1;1;2;2;0;0;4;4;7;2
;;total;181;112;246;143;214;175;125;85;207;57;193;71;148;126;81;55;219;89;46;46;55;55;308;182;273;170;286;214;287;183;267;86;123;67;162;62;159;74;258;87;230;98;288;80;190;168;193;165;401;207;270;95;80;47;197;97;170;66;212;96;275;70;168;68;96;95;328;118;193;66;206;71;156;139;109;94;229;137;165;147;510;247;272;87

B42 effectifs

modifier 
B42;;;cbl;;spl;;pdi;;ppoy;;sbn;;eal;;eco;;sbz;;eno;;kpn;;bcef;;bcoh;;blr;;dzc;;eclx;;gmc;;ksa;;mme;;mvs;;pge;;pha;;pse;;sfr;;vag;;vau;;vha;;vvm;;yrb;;bae;;saci;;sep;;hmr;;bbd;;lpl;;sty;;sma;;sho;;ksk;;ype;;pdix;;hmo;;vpf;
aa;tRNA;gène;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff
Phe;AAA;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0
Val;AAC;gtt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Leu;AAG;ctt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Ile;AAT;att;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Cys;ACA;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Gly;ACC;ggt;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Arg;ACG;cgt;1;1;7;2;3;3;4;1;6;1;3;1;4;1;4;1;4;1;4;1;3;2;3;1;5;2;3;1;4;2;4;3;4;1;3;1;5;2;4;1;4;1;3;2;4;2;6;1;5;3;7;1;6;2;3;1;2;1;1;1;2;2;0;0;1;1;2;1;4;2;1;1;1;1;2;1;2;2;1;1;3;1;7;1
Ser;ACT;agt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
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Leu;TAA;tta;2;1;4;1;1;1;1;1;3;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;2;2;2;1;1;1;1;2;1;1;1;2;1;5;2;1;1;3;1;1;1;3;2;3;2;2;1;3;1;2;2;1;1;2;2;1;1;2;1;1;1;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;5;2;1;1;3;2
Val;TAC;gta;5;1;11;1;3;1;6;2;4;1;4;3;5;1;4;1;4;2;5;1;5;1;4;3;5;1;8;1;4;2;4;2;4;1;6;1;7;1;4;1;7;2;5;2;6;2;2;1;2;1;4;1;1;1;3;1;3;1;1;1;3;2;1;1;2;1;3;1;3;2;1;1;1;1;1;1;3;1;6;4;2;1;4;1
Leu;TAG;cta;2;1;5;1;1;1;2;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;2;4;1;1;1;1;1;2;2;1;1;2;1;5;1;1;1;4;2;1;1;2;2;3;2;4;3;5;2;7;3;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;2;1;1;11;3
Ile;TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
SeC;TCA;tga;1;1;1;1;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0
Gly;TCC;gga;4;1;1;1;2;1;4;2;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;4;2;2;1;4;1;1;1;1;1;3;2;1;1;1;1;4;3;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;1;4;2;2;1;1;1;3;2;1;1;5;4;1;1;1;1;3;2;1;1;3;3;2;2;1;1;1;1;5;1;1;1;2;1
Arg;TCG;cga;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;0;0;0;0;0;0
Arg;TCT;aga;3;1;1;1;1;1;2;1;1;1;2;2;1;1;2;2;1;1;1;1;0;0;1;1;2;1;1;1;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;4;2;1;1;1;1
Ser;TGA;tca;2;1;4;2;2;2;1;1;4;2;1;1;1;1;2;2;2;2;1;1;3;3;2;2;3;1;1;1;2;1;2;1;1;1;1;1;8;2;1;1;4;2;1;1;3;1;4;1;3;1;4;1;3;1;2;2;2;2;1;1;3;2;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;2;2;3;1;1;1;4;1
Ala;TGC;gca;3;1;3;1;7;2;5;3;3;1;3;1;3;1;3;1;3;1;3;1;5;2;4;2;4;2;3;1;3;1;5;2;3;1;3;1;11;1;3;1;3;1;8;1;3;1;8;1;4;2;7;2;9;3;3;1;3;2;2;2;3;1;2;1;1;1;2;1;3;1;1;1;1;1;1;1;3;1;5;1;2;1;5;1
Pro;TGG;cca;3;1;3;1;1;1;4;2;3;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;3;2;2;2;4;2;1;1;2;1;3;1;1;1;2;1;4;1;1;1;3;1;1;1;4;1;3;1;3;1;3;1;3;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;3;1;1;1;3;1
Thr;TGT;aca;4;3;4;1;3;1;4;2;3;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;2;2;2;6;1;1;1;1;1;3;2;1;1;4;2;4;1;1;1;3;1;1;1;2;1;5;1;4;2;5;1;4;1;2;1;3;3;1;1;3;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;5;1;2;2;5;1
Stp;TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Glu;TTC;gaa;3;2;13;1;2;2;6;1;7;1;4;2;4;1;4;1;4;1;4;1;7;2;4;2;6;1;4;1;4;1;5;1;4;1;3;1;0;0;4;2;7;2;5;4;6;1;3;1;4;1;5;1;1;1;4;1;6;2;2;1;3;3;1;1;2;1;2;1;4;1;1;1;1;1;1;1;3;1;5;1;6;2;6;1
Gln;TTG;caa;2;1;5;1;1;1;4;1;3;2;2;1;2;1;2;1;2;1;2;1;5;2;3;3;4;2;1;1;2;1;4;3;2;1;3;1;4;1;1;1;4;1;1;1;3;1;1;1;2;2;2;2;5;1;2;1;4;3;3;3;2;2;1;1;1;1;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;1;4;1;6;2
Lys;TTT;aaa;4;1;12;1;2;2;6;2;10;4;4;1;6;1;5;1;5;1;6;1;6;2;4;2;6;1;3;1;5;1;4;2;5;1;4;1;7;1;5;1;8;2;2;1;6;1;2;1;2;1;4;1;1;1;5;1;3;1;0;0;3;2;1;1;2;1;2;1;4;2;1;1;1;1;1;1;4;2;5;1;5;1;4;1
;;total;81;47;147;44;83;56;109;55;108;49;85;52;87;50;85;49;83;48;86;45;92;47;84;64;113;53;89;47;86;52;91;61;82;49;81;42;132;41;85;48;106;44;89;52;97;50;105;41;93;49;121;47;112;46;83;47;75;48;71;61;61;48;49;47;40;36;70;50;81;53;77;63;74;59;77;58;70;48;90;39;109;65;131;47

A10 effectifs

modifier 
A10;;;fpl;;hbo;;mac;;mbw;;mhor;;mls;;mmet;;mpl;;mru;;nou;
aa;tRNA;gène;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff
Phe;AAA;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Val;AAC;gtt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Leu;AAG;ctt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Ile;AAT;att;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Cys;ACA;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Gly;ACC;ggt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Arg;ACG;cgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0
Ser;ACT;agt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Ser;AGA;tct;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Ala;AGC;gct;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Pro;AGG;cct;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Thr;AGT;act;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Tyr;ATA;tat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Asp;ATC;gat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
His;ATG;cat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Asn;ATT;aat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Leu;CAA;ttg;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Val;CAC;gtg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Leu;CAG;ctg;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;2;2;1;1;1;1;0;0;1;1
Met;CAT;atg;3;3;3;3;4;3;5;3;4;4;4;3;4;3;3;3;3;3;4;4
Trp;CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Gly;CCC;ggg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Arg;CCG;cgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Arg;CCT;agg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1
Ser;CGA;tcg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1
Ala;CGC;gcg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Pro;CGG;ccg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Thr;CGT;acg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Stp;CTA;tag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Glu;CTC;gag;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Gln;CTG;cag;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1
Lys;CTT;aag;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1
Phe;GAA;ttc;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;2;2;1;1;2;2;1;1
Val;GAC;gtc;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Leu;GAG;ctc;2;2;1;1;2;2;2;1;2;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1
Ile;GAT;atc;1;1;1;1;2;1;2;1;2;2;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Cys;GCA;tgc;1;1;1;1;3;3;4;3;4;4;3;3;4;3;8;6;1;1;1;1
Gly;GCC;ggc;1;1;2;1;3;1;3;2;3;2;2;2;1;1;1;1;1;1;2;1
Arg;GCG;cgc;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1
Ser;GCT;agc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Ser;GGA;tcc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Ala;GGC;gcc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1
Pro;GGG;ccc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1
Thr;GGT;acc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2
Tyr;GTA;tac;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Asp;GTC;gac;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;2;2;2;2
His;GTG;cac;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1
Asn;GTT;aac;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Leu;TAA;tta;1;1;1;1;1;1;3;3;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Val;TAC;gta;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1
Leu;TAG;cta;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Ile;TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
SeC;TCA;tga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Gly;TCC;gga;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Arg;TCG;cga;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1
Arg;TCT;aga;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Ser;TGA;tca;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Ala;TGC;gca;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;1;1;1;3;2;4;1
Pro;TGG;cca;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Thr;TGT;aca;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;4;2;1;1;1;1
Stp;TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
Glu;TTC;gaa;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Gln;TTG;caa;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
Lys;TTT;aaa;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1
;;total;49;49;52;47;58;50;62;52;60;55;57;51;55;48;56;52;59;57;53;49

Tableaux des codons, corrélations et indice double

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E79-Codons. Correlations et indices des doublons

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E79;;Lys;;Asn;;Lys;;Asn;;Thr;;Thr;;Thr;;Thr;;Arg;;Ser;;Arg;;Ser;;Ile;;Ile;;Met;;Ile;;Gln;;His;;Gln;;His;;Pro;;Pro;;Pro;;Pro;;Arg;;Arg;;Arg;;Arg;;Leu;;Leu;;Leu;;Leu;;Glu;;Asp;;Glu;;Asp;;Ala;;Ala;;Ala;;Ala;;Gly;;Gly;;Gly;;Gly;;Val;;Val;;Val;;Val;;Stp;;Tyr;;Stp;;Tyr;;Ser;;Ser;;Ser;;Ser;;SeC;;Cys;;Trp;;Cys;;Leu;;Phe;;Leu;;Phe;
;;TTT;;GTT;;CTT;;ATT;;TGT;;GGT;;CGT;;AGT;;TCT;;GCT;;CCT;;ACT;;TAT;;GAT;;CAT;;AAT;;TTG;;GTG;;CTG;;ATG;;TGG;;GGG;;CGG;;AGG;;TCG;;GCG;;CCG;;ACG;;TAG;;GAG;;CAG;;AAG;;TTC;;GTC;;CTC;;ATC;;TGC;;GGC;;CGC;;AGC;;TCC;;GCC;;CCC;;ACC;;TAC;;GAC;;CAC;;AAC;;TTA;;GTA;;CTA;;ATA;;TGA;;GGA;;CGA;;AGA;;TCA;;GCA;;CCA;;ACA;;TAA;;GAA;;CAA;;AAA;
;;double;aaa;double;aac;double;aag;double;aat;double;aca;double;acc;double;acg;double;act;double;aga;double;agc;double;agg;double;agt;double;ata;double;atc;double;atg;double;att;double;caa;double;cac;double;cag;double;cat;double;cca;double;ccc;double;ccg;double;cct;double;cga;double;cgc;double;cgg;double;cgt;double;cta;double;ctc;double;ctg;double;ctt;double;gaa;double;gac;double;gag;double;gat;double;gca;double;gcc;double;gcg;double;gct;double;gga;double;ggc;double;ggg;double;ggt;double;gta;double;gtc;double;gtg;double;gtt;double;taa;double;tac;double;tag;double;tat;double;tca;double;tcc;double;tcg;double;tct;double;tga;double;tgc;double;tgg;double;tgt;double;tta;double;ttc;double;ttg;double;ttt
;acs;2;2;6;3;3;2;0;−;1;1;0;−;0;0;1;2;0;2;2;2;0;2;0;−;0;0;0;−;4;7;4;1;0;2;3;1;2;2;0;−;2;0;0;0;1;0;2;0;0;2;0;−;0;0;2;1;0;2;0;−;2;1;2;1;5;1;6;1;1;3;0;−;0;5;0;−;0;2;6;5;5;2;5;1;1;0;0;−;0;1;0;−;2;0;2;2;0;−;0;5;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;4;0;0;0;8;3;3;3;0;−;0;1;4;0;1;0;0;−
;aga;3;4;10;1;15;1;0;−;1;0;0;−;3;2;7;0;0;1;4;1;0;1;0;−;0;1;0;−;13;4;10;1;2;1;16;4;5;5;0;−;6;1;0;−;7;5;2;4;4;3;0;−;0;−;9;0;1;1;0;−;8;1;3;1;8;2;18;1;12;2;0;−;1;1;0;−;4;1;13;3;7;0;14;0;0;−;0;−;2;0;0;−;21;7;24;6;0;0;1;20;0;−;0;−;1;0;0;−;7;0;4;1;0;−;4;0;5;0;0;−;1;4;8;0;0;3;0;−
;aml;5;49;10;17;12;759;0;5;1;7;0;−;0;9;4;5;0;16;3;9;1;43;0;1;0;5;0;−;11;12;7;4;1;41;7;0;4;20;0;−;3;7;0;−;3;1;7;1;2;81;0;0;2;4;5;2;0;4;0;−;2;4;2;4;4;6;5;5;3;33;0;0;2;6;0;−;1;3;3;13;3;3;8;1;2;4;0;−;0;6;0;−;7;1;8;1;0;0;1;9;0;9;0;−;0;5;0;−;0;3;6;3;0;1;13;11;3;6;0;−;1;3;8;2;2;6;0;−
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;double;aaa;double;aac;double;aag;double;aat;double;aca;double;acc;double;acg;double;act;double;aga;double;agc;double;agg;double;agt;double;ata;double;atc;double;atg;double;att;double;caa;double;cac;double;cag;double;cat;double;cca;double;ccc;double;ccg;double;cct;double;cga;double;cgc;double;cgg;double;cgt;double;cta;double;ctc;double;ctg;double;ctt;double;gaa;double;gac;double;gag;double;gat;double;gca;double;gcc;double;gcg;double;gct;double;gga;double;ggc;double;ggg;double;ggt;double;gta;double;gtc;double;gtg;double;gtt;double;taa;double;tac;double;tag;double;tat;double;tca;double;tcc;double;tcg;double;tct;double;tga;double;tgc;double;tgg;double;tgt;double;tta;double;ttc;double;ttg;double;ttt
;dre;275;249;575;469;490;462;9;14;151;138;0;−;24;41;177;181;113;138;161;262;75;28;3;10;22;52;1;8;348;173;129;128;59;45;224;162;143;122;0;−;108;96;4;7;89;90;177;137;57;49;17;6;24;34;147;55;110;133;2;1;161;138;124;145;128;96;107;42;158;86;4;6;265;102;1;2;86;25;66;25;24;22;391;444;87;180;0;10;171;58;2;3;131;95;146;85;1;4;136;99;3;5;1;3;92;116;0;1;36;43;160;175;2;11;98;37;22;21;0;8;19;53;110;86;123;117;0;9
E79 Repérage des effectifs supérieurs à 49
modifier
  • Lien aux tableaux: E79 Repérage des effectifs supérieurs à 49
  • Méthode: Recherche dans calc, des cellules du tableau des corrélations et indices de doublons, contenant un nombre inférieur à 40 (ou bien le caractère −); les colorer. Avec la fonction concat() de calc les cellules non colorées ont leur nombre préfixé par * astérisque. Avec toujours la même fonction les codons faibles xyc/t, taa, tag et tga à effectif supérieur à 6 est préfixé par &. Ces préfixes aident à les changer sous writer en bgcolor="#xxxxxx"|.
  • Légende:
    aaa1, aaa2, respectivement doublons et gènes différents des gènes tRNAs du codon aaa
    Rouge pour effectif supérieur à 49, Sauf pour les codons faibles xyc/t, taa, tag, tga.
    Cyan pour effectif supérieur à 39, Sauf pour les codons faibles xyc/t, taa, tag, tga. Après le changement d'astérisque en rouge (bgcolor="#ff3300"|) rechercher (bgcolor="#ff3300"|4) et le remplacer par (bgcolor="#66ffff"|4). Cependant il faut rechercher 3 effectifs supérieurs à 400 et leur réattribuer le rouge.
    Jaune pour les codons faibles xyc/t, taa, tag, tga dont l'effectif est supérieur à 6.
    Som− pour somme des tirets qui correspondent au nombre −1 pour les codons à effectif nul lors des décomptes directs( colonne diff et tot). Ce qui permet de calculer ici la ligne diff.
    db,diff: db pour doublon et diff pour différent, tout 2 issus des décomptes directs. diff est calculé ici comme suite: total de la colonne + 79 − "Som−".
    total total des codons correspondant au "tot" du décompte direct, db+diff.
    db+dif: somme de db et des "diff−1".
  • Duplications des gènes de tRNAs. E79-codons. Effectifs supérieurs à 49
KEGG;aaa1;aaa2;aac1;aac2;aag1;aag2;aat1;aat2;aca1;aca2;acc1;acc2;acg1;acg2;act1;act2;aga1;aga2;agc1;agc2;agg1;agg2;agt1;agt2;ata1;ata2;atc1;atc2;atg1;atg2;att1;att2;caa1;caa2;cac1;cac2;cag1;cag2;cat1;cat2;cca1;cca2;ccc1;ccc2;ccg1;ccg2;cct1;cct2;cga1;cga2;cgc1;cgc2;cgg1;cgg2;cgt1;cgt2;cta1;cta2;ctc1;ctc2;ctg1;ctg2;ctt1;ctt2;gaa1;gaa2;gac1;gac2;gag1;gag2;gat1;gat2;gca1;gca2;gcc1;gcc2;gcg1;gcg2;gct1;gct2;gga1;gga2;ggc1;ggc2;ggg1;ggg2;ggt1;ggt2;gta1;gta2;gtc1;gtc2;gtg1;gtg2;gtt1;gtt2;taa1;taa2;tac1;tac2;tag1;tag2;tat1;tat2;tca1;tca2;tcc1;tcc2;tcg1;tcg2;tct1;tct2;tga1;tga2;tgc1;tgc2;tgg1;tgg2;tgt1;tgt2;tta1;tta2;ttc1;ttc2;ttg1;ttg2;ttt1;ttt2
acs;2;2;6;3;3;2;0;−;1;1;0;−;0;0;1;2;0;2;2;2;0;2;0;−;0;0;0;−;4;7;4;1;0;2;3;1;2;2;0;−;2;0;0;0;1;0;2;0;0;2;0;−;0;0;2;1;0;2;0;−;2;1;2;1;5;1;6;1;1;3;0;−;0;5;0;−;0;2;6;5;5;2;5;1;1;0;0;−;0;1;0;−;2;0;2;2;0;−;0;5;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;4;0;0;0;8;3;3;3;0;−;0;1;4;0;1;0;0;−
aga;3;4;10;1;15;1;0;−;1;0;0;−;3;2;7;0;0;1;4;1;0;1;0;−;0;1;0;−;13;4;10;1;2;1;16;4;5;5;0;−;6;1;0;−;7;5;2;4;4;3;0;−;0;−;9;0;1;1;0;−;8;1;3;1;8;2;18;1;12;2;0;−;1;1;0;−;4;1;13;3;7;0;14;0;0;−;0;−;2;0;0;−;21;7;24;6;0;0;1;20;0;−;0;−;1;0;0;−;7;0;4;1;0;−;4;0;5;0;0;−;1;4;8;0;0;3;0;−
aml;5;*49;10;17;12;*759;0;5;1;7;0;−;0;9;4;5;0;16;3;9;1;*43;0;1;0;5;0;−;11;12;7;4;1;*41;7;0;4;20;0;−;3;7;0;−;3;1;7;1;2;*81;0;0;2;4;5;2;0;4;0;−;2;4;2;4;4;6;5;5;3;33;0;0;2;6;0;−;1;3;3;13;3;3;8;1;2;4;0;−;0;6;0;−;7;1;8;1;0;0;1;9;0;&9;0;−;0;5;0;−;0;3;6;3;0;1;13;11;3;6;0;−;1;3;8;2;2;6;0;−
ath;10;5;10;8;14;4;0;−;4;4;0;0;2;3;7;2;1;8;7;8;4;3;0;−;3;1;1;0;16;15;15;1;6;3;6;5;4;4;0;−;*41;5;0;−;2;2;11;4;4;1;0;−;1;2;4;6;6;4;0;0;2;0;9;2;7;8;21;7;9;3;0;−;7;2;0;−;4;2;13;2;11;1;16;8;4;0;0;−;4;2;1;0;6;1;12;2;0;0;*50;32;0;−;0;−;6;5;1;1;3;3;26;10;0;−;4;13;11;4;0;−;3;2;16;4;6;5;0;−
bacu;4;*81;17;6;5;23;0;−;1;6;0;−;0;3;4;8;0;*54;3;9;0;*66;0;−;0;7;0;0;8;12;6;5;2;7;7;3;4;15;0;−;2;2;0;−;2;1;5;1;1;7;0;−;1;19;3;5;0;3;0;−;3;3;4;1;*47;*2320;7;37;21;*446;1;&18;0;*41;0;−;1;18;2;17;25;*961;13;*50;*103;*2044;1;&10;0;17;0;0;8;23;5;8;0;&23;0;13;0;&8;0;−;0;4;0;0;0;3;3;6;0;&16;5;18;13;*242;0;1;1;11;4;8;0;7;0;−
bdi;3;8;10;5;16;1;0;−;2;7;2;0;2;3;2;6;2;6;12;5;4;5;0;−;1;2;0;1;25;30;13;6;7;7;14;6;8;2;0;2;8;9;0;−;5;2;11;3;4;0;0;0;2;3;12;3;6;3;0;−;7;0;7;6;8;6;21;4;16;2;0;−;7;5;0;−;9;1;16;2;6;2;19;8;8;0;0;−;2;2;2;1;8;2;11;4;0;−;3;13;0;−;0;0;5;4;1;2;4;0;8;2;0;−;6;8;12;5;0;−;2;1;13;4;9;6;0;−
bta;10;*67;16;13;15;24;0;−;2;7;0;0;0;6;4;9;0;*43;8;10;2;*113;0;3;0;7;0;−;16;18;14;3;2;17;14;4;8;31;0;3;6;2;0;−;3;0;11;1;1;10;0;6;3;12;7;5;0;4;0;−;3;2;6;4;11;*423;9;32;3;*160;0;5;4;30;0;1;2;13;12;18;6;*384;8;*54;29;*1265;0;&19;2;18;0;−;12;26;7;12;0;3;1;37;0;&12;0;&10;0;6;4;&27;0;6;8;4;0;&28;25;*312;5;*172;&9;&133;0;9;12;17;0;13;0;5
cbr;11;4;20;2;36;3;0;−;6;3;0;−;5;3;20;1;7;2;6;2;1;0;0;−;8;15;0;−;18;4;17;3;19;4;18;2;6;3;0;−;30;10;0;−;2;1;2;3;4;5;0;−;0;−;17;4;3;1;0;−;2;4;21;4;15;3;27;6;21;8;0;−;13;0;0;−;2;4;22;6;33;8;16;4;0;4;0;−;2;3;0;−;3;2;18;6;0;−;13;5;0;−;0;−;3;4;0;−;4;3;14;2;0;−;14;1;12;0;0;−;2;3;16;5;1;9;0;−
cbre;20;8;28;4;*45;3;0;−;12;2;0;0;6;3;26;4;10;2;9;4;4;6;0;−;13;12;0;0;24;4;31;1;29;10;21;4;6;4;0;0;*48;5;1;0;4;4;13;11;11;5;0;−;13;10;28;3;6;1;0;−;3;4;29;2;27;8;31;2;34;2;0;−;7;3;0;−;2;3;33;1;*61;4;25;13;11;13;0;−;3;4;0;−;7;7;30;2;0;−;20;7;0;−;0;1;7;6;0;−;3;5;16;3;1;1;16;4;19;2;0;1;4;2;18;5;2;11;0;−
cel;13;0;17;2;24;5;0;−;9;1;0;−;2;4;14;2;5;2;6;2;1;2;0;0;3;3;0;−;16;2;19;1;15;4;13;5;4;2;0;−;23;7;0;−;3;0;2;3;4;3;0;−;0;0;14;3;2;0;0;−;3;1;14;5;14;2;20;6;19;4;0;−;7;1;0;−;0;3;16;5;28;5;10;3;2;0;0;−;1;3;0;−;4;1;15;3;0;−;7;11;0;−;0;−;2;6;0;−;3;2;11;3;0;1;11;1;9;2;0;−;1;2;10;4;0;6;0;−
cfa;6;27;8;12;10;*397;0;0;1;2;0;−;0;4;2;5;0;8;2;5;1;27;0;−;0;4;0;−;6;16;4;4;1;*41;7;1;4;15;0;−;1;6;0;−;2;1;7;0;0;14;0;−;1;2;1;4;0;3;0;−;4;2;3;0;4;10;9;3;6;15;0;1;3;7;0;−;0;3;3;10;7;3;8;2;2;6;0;−;0;4;0;−;5;2;2;3;0;2;0;8;0;2;0;−;0;4;0;−;1;6;5;4;0;0;9;11;0;5;0;−;0;3;4;5;0;4;0;−
cge;5;9;8;8;11;*74;0;−;1;2;0;0;0;3;1;6;0;4;3;5;1;4;0;−;0;4;0;−;7;8;10;2;1;3;11;2;5;5;0;−;4;1;0;−;2;0;6;0;2;3;0;−;0;2;3;2;0;3;0;−;5;4;3;1;2;4;10;4;6;13;0;−;1;13;0;0;1;4;5;16;5;0;9;4;2;4;0;0;1;3;0;−;3;5;4;8;0;−;0;10;0;−;0;−;0;2;0;−;0;2;5;0;0;1;24;16;2;3;0;−;0;3;4;3;0;3;0;−
cjap;23;6;20;2;30;6;0;−;7;4;0;−;8;2;17;6;9;2;12;2;2;0;0;−;2;4;0;−;25;4;20;5;11;2;12;4;11;4;0;−;33;9;0;−;7;0;7;1;6;4;0;−;0;0;17;3;2;3;0;−;5;6;22;3;16;3;32;8;31;8;0;−;6;4;0;−;7;0;23;7;36;10;24;9;0;1;0;−;2;4;0;−;8;4;19;3;0;−;22;1;0;−;0;−;4;2;0;−;10;4;14;4;0;0;12;2;14;3;0;−;0;4;19;4;0;6;0;0
cjc;5;10;9;17;4;11;0;−;0;6;0;0;0;3;1;8;0;5;3;4;1;3;0;−;0;4;0;2;7;12;5;7;0;6;5;3;5;7;0;0;3;2;0;−;3;0;6;0;0;3;2;0;1;2;4;1;0;3;0;−;3;8;4;3;3;17;8;5;6;8;0;0;1;4;0;1;1;2;2;12;6;2;9;5;1;3;0;−;1;4;0;2;4;6;3;3;0;0;10;24;0;2;0;0;1;3;0;−;0;3;5;3;0;1;9;22;1;9;0;−;0;10;4;3;0;6;0;−
cmk;5;37;16;31;11;24;0;1;*49;*156;0;&11;4;*132;7;16;0;13;10;22;5;6;0;−;4;18;0;−;20;*73;8;22;1;5;10;26;8;9;0;0;7;*43;0;5;0;*40;1;10;3;21;0;−;0;1;4;4;2;17;0;1;5;19;6;13;7;*58;14;34;22;*405;0;5;*2889;*3008;3;&164;*100;*3757;19;*55;22;*43;12;6;7;*73;0;1;29;*115;0;*15;37;*1502;6;15;0;0;7;28;0;3;0;0;3;*50;0;0;0;*47;12;13;0;2;5;9;10;19;0;0;1;11;10;24;1;29;0;2
cpic;4;31;5;11;2;6;0;0;1;16;0;−;0;4;1;15;1;24;1;18;0;9;0;2;0;12;0;0;5;10;2;8;1;14;2;7;1;9;0;−;1;2;0;0;0;1;4;7;1;3;0;−;0;2;2;4;0;3;0;0;2;3;0;1;0;16;4;9;2;2;0;−;3;11;0;0;0;3;1;9;10;13;5;5;1;0;0;−;0;4;0;−;0;5;1;14;0;0;0;4;0;1;0;0;0;14;0;−;1;8;2;21;0;3;4;13;1;8;0;4;0;12;2;19;1;5;0;1
cpo;4;6;9;8;7;18;0;−;1;2;0;−;0;2;0;9;0;4;3;6;1;3;0;−;0;4;0;−;5;9;7;2;2;1;6;1;3;4;0;−;2;1;0;−;2;0;6;1;0;3;0;−;0;2;4;2;0;2;0;−;4;1;3;1;2;3;6;3;4;0;0;0;2;6;0;3;0;4;4;23;2;3;6;4;1;4;0;−;1;1;0;0;3;2;4;1;0;−;4;10;0;0;0;−;1;1;0;−;1;2;6;1;0;0;18;15;1;6;0;−;0;3;5;2;0;5;0;−
csi;4;10;10;3;6;15;0;1;2;5;0;−;0;4;3;6;0;5;7;5;0;6;0;−;0;4;0;−;11;14;7;5;2;2;8;1;4;7;0;−;4;2;0;−;2;1;8;1;1;3;0;−;2;1;4;5;1;2;0;−;2;1;3;2;4;6;6;6;4;*72;0;0;1;11;0;−;1;4;7;15;2;1;8;1;3;5;0;−;0;6;0;0;4;10;5;5;0;−;0;10;0;0;0;−;2;2;0;−;0;3;8;4;0;0;4;19;4;3;0;−;0;4;7;5;0;5;0;−
dme;4;1;9;0;12;0;0;−;4;1;0;−;2;0;6;2;0;2;4;1;2;0;0;−;0;1;0;−;8;3;8;1;2;1;4;0;4;3;0;−;4;0;0;−;2;2;6;0;6;3;0;−;0;−;9;0;1;0;0;−;7;0;3;0;5;0;11;2;10;4;0;−;0;1;0;−;2;0;10;1;4;1;12;1;0;−;0;−;1;0;0;−;5;1;4;1;0;−;0;8;0;−;0;−;0;1;0;−;3;0;5;2;0;0;3;3;6;1;0;−;0;3;7;0;0;3;0;−
dno;4;13;17;5;13;29;0;−;1;6;0;−;0;6;1;9;0;8;3;6;1;*45;0;−;0;5;0;0;10;19;6;5;2;2;6;3;3;6;0;0;5;1;0;−;1;2;6;0;1;6;0;−;0;4;5;4;0;2;0;−;6;3;3;1;5;14;12;8;7;37;0;−;2;*63;0;1;1;15;7;15;10;23;10;8;4;*321;0;&23;0;15;0;0;5;*75;4;7;0;−;3;10;0;−;0;−;1;4;0;−;0;5;7;2;0;0;9;12;3;11;0;−;0;7;5;6;1;6;0;−
dsi;2;1;5;0;10;0;0;−;3;1;0;−;2;1;7;0;0;3;1;1;1;1;0;−;0;−;0;−;8;3;6;2;2;1;4;1;4;3;0;−;3;1;0;−;2;2;5;0;2;2;0;−;0;−;8;0;1;0;0;−;8;0;4;0;2;2;5;0;6;3;0;−;0;−;0;−;3;1;8;0;3;1;13;1;0;−;0;−;1;0;0;−;4;1;5;1;0;−;0;9;0;−;0;−;0;1;0;−;2;0;5;2;0;0;4;2;7;1;0;−;0;2;5;2;0;3;0;−
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vvi;5;5;7;13;5;10;0;0;2;5;0;1;1;1;4;5;3;2;7;1;4;3;0;−;3;5;0;1;6;19;9;5;3;6;5;8;3;7;0;0;8;7;0;−;1;2;9;5;3;2;0;−;0;5;1;9;4;6;0;−;4;2;5;4;5;9;11;11;12;13;0;2;16;20;0;−;3;1;9;1;7;11;11;5;3;2;0;−;1;3;0;0;6;4;8;6;0;0;0;18;0;−;0;3;5;2;0;0;2;0;4;8;0;0;5;5;9;0;0;0;2;6;11;11;4;9;0;1
xtr;*51;20;28;18;*74;22;0;0;*48;*42;0;−;15;13;*76;*74;*52;*52;*40;*58;18;8;0;−;26;24;0;4;*99;38;*45;17;20;7;24;17;30;9;0;0;36;16;0;0;19;16;*42;17;25;7;0;2;2;5;20;12;15;9;1;0;17;14;20;17;*60;23;*46;12;32;18;0;−;29;17;0;−;15;20;*50;16;*53;26;*70;14;*70;34;0;−;17;18;0;−;25;27;36;18;0;1;*59;*47;0;0;0;−;22;18;1;1;13;9;23;16;0;0;*46;*45;21;11;0;1;11;34;*40;17;6;15;0;1
zma;14;*67;31;17;36;*90;0;−;8;5;&8;4;4;1;7;12;3;5;10;3;5;5;0;−;1;3;0;−;31;*47;32;36;8;13;18;7;6;6;0;0;13;17;0;−;5;3;11;3;3;3;0;−;3;2;25;9;4;4;0;−;10;2;19;9;12;9;30;11;16;13;0;0;8;6;0;−;11;10;34;31;8;2;30;2;9;1;0;−;2;1;&11;0;13;2;11;10;0;−;3;17;0;3;0;−;6;4;&10;&11;3;2;8;4;0;−;10;14;20;6;0;0;2;2;17;7;12;7;0;0
;aaa1;aaa2;aac1;aac2;aag1;aag2;aat1;aat2;aca1;aca2;acc1;acc2;acg1;acg2;act1;act2;aga1;aga2;agc1;agc2;agg1;agg2;agt1;agt2;ata1;ata2;atc1;atc2;atg1;atg2;att1;att2;caa1;caa2;cac1;cac2;cag1;cag2;cat1;cat2;cca1;cca2;ccc1;ccc2;ccg1;ccg2;cct1;cct2;cga1;cga2;cgc1;cgc2;cgg1;cgg2;cgt1;cgt2;cta1;cta2;ctc1;ctc2;ctg1;ctg2;ctt1;ctt2;gaa1;gaa2;gac1;gac2;gag1;gag2;gat1;gat2;gca1;gca2;gcc1;gcc2;gcg1;gcg2;gct1;gct2;gga1;gga2;ggc1;ggc2;ggg1;ggg2;ggt1;ggt2;gta1;gta2;gtc1;gtc2;gtg1;gtg2;gtt1;gtt2;taa1;taa2;tac1;tac2;tag1;tag2;tat1;tat2;tca1;tca2;tcc1;tcc2;tcg1;tcg2;tct1;tct2;tga1;tga2;tgc1;tgc2;tgg1;tgg2;tgt1;tgt2;tta1;tta2;ttc1;ttc2;ttg1;ttg2;ttt1;ttt2
Som−;;1;;0;;1;;46;;0;;56;;2;;1;;0;;1;;1;;61;;1;;52;;0;;0;;0;;1;;0;;57;;0;;61;;0;;0;;0;;65;;8;;1;;3;;70;;0;;0;;0;;0;;0;;44;;1;;55;;0;;0;;0;;1;;4;;61;;0;;42;;1;;0;;41;;0;;53;;52;;0;;52;;0;;2;;16;;1;;1;;48;;0;;1;;1;;52
db, diff;589;1168;942;846;950;3320;5;108;295;674;25;62;118;491;477;724;193;978;443;632;212;823;25;55;153;473;6;68;1387;1231;850;618;360;1436;631;397;515;687;0;36;531;523;1;28;211;233;650;331;241;1697;2;32;84;285;543;377;122;364;1;10;368;417;491;445;601;5790;1070;794;697;2154;3;93;3200;3813;8;242;308;4178;822;1319;682;4453;916;647;444;6221;2;115;148;582;27;72;494;2108;594;559;5;164;307;1157;1;107;0;63;178;482;42;127;134;348;506;414;7;230;887;1387;430;1155;10;206;97;495;645;550;114;543;1;50
total;;1757;;1788;;4270;;113;;969;;87;;609;;1201;;1171;;1075;;1035;;80;;626;;74;;2618;;1468;;1796;;1028;;1202;;36;;1054;;29;;444;;981;;1938;;34;;369;;920;;486;;11;;785;;936;;6391;;1864;;2851;;96;;7013;;250;;4486;;2141;;5135;;1563;;6665;;117;;730;;99;;2602;;1153;;169;;1464;;108;;63;;660;;169;;482;;920;;237;;2274;;1585;;216;;592;;1195;;657;;51
db+dif;;1679;;1709;;4192;;80;;890;;64;;532;;1123;;1092;;997;;957;;62;;548;;47;;2539;;1389;;1717;;950;;1123;;14;;975;;11;;365;;902;;1859;;20;;298;;842;;410;;2;;706;;857;;6312;;1785;;2772;;61;;6935;;226;;4407;;2062;;5056;;1485;;6590;;99;;651;;62;;2524;;1074;;131;;1385;;82;;36;;581;;142;;403;;843;;174;;2196;;1507;;185;;513;;1117;;579;;24
Méthode d'estimation des duplications pour les codons excessifs
modifier 
aga.1;double;aga;;aga.2;double;aga;;aga.3;double;aga
lma;0;0;;lma;0;0;;mmu;0;0
pfa;0;0;;pfa;0;0;;gmx;0;0
aga;0;1;;aga;0;1;;pfa;0;1
acs;0;2;;acs;0;2;;lma;0;2
dme;0;2;;dme;0;2;;tgu;0;2
dya;0;2;;dya;0;2;;cpo;0;2
gfr;0;2;;gfr;0;2;;opr;0;2
mgp;0;2;;mgp;0;2;;pha;0;2
dsi;0;3;;vvi;3;2;;lav;3;2
gga;0;3;;ppp;4;2;;ath;4;2
mun;0;3;;cel;5;2;;ppp;5;2
oga;0;3;;cbr;7;2;;mgp;7;2
tgu;0;3;;cjap;9;2;;cjap;9;2
cge;0;4;;cbre;10;2;;vvi;10;2
cpo;0;4;;dsi;0;3;;cge;0;3
ecb;0;4;;gga;0;3;;shr;0;3
eeu;0;4;;mun;0;3;;meu;0;3
ggo;0;4;;oga;0;3;;zma;0;3
mmr;0;4;;tgu;0;3;;gac;0;3
opr;0;4;;mlu;1;3;;ptr;1;3
shr;0;4;;cge;0;4;;cbr;0;4
str;0;4;;cpo;0;4;;mun;0;4
cjc;0;5;;ecb;0;4;;ecb;0;4
csi;0;5;;eeu;0;4;;eeu;0;4
hgl;0;5;;ggo;0;4;;str;0;4
hsa-18;0;5;;mmr;0;4;;rno;0;4
mcc;0;5;;opr;0;4;;osa;0;4
mdo;0;5;;shr;0;4;;aml;0;4
mmu;0;5;;str;0;4;;cpic;0;4
oaa;0;5;;cjc;0;5;;cbre;0;5
ocu;0;5;;csi;0;5;;oga;0;5
pan;0;5;;hgl;0;5;;hgl;0;5
pha;0;5;;hsa-18;0;5;;hsa-18;0;5
ptr;0;5;;mcc;0;5;;oaa;0;5
rno;0;5;;mdo;0;5;;ocu;0;5
san;0;5;;mmu;0;5;;san;0;5
sbq;0;5;;oaa;0;5;;mtr;0;5
tsy;0;5;;ocu;0;5;;sbi;0;5
nle;0;6;;pan;0;5;;bdi;0;5
cfa;0;8;;pha;0;5;;cfa;0;5
dno;0;8;;ptr;0;5;;tng;0;5
lcm;0;8;;rno;0;5;;pma;0;5
tng;0;9;;san;0;5;;tru;0;5
cmk;0;13;;sbq;0;5;;mpu;0;5
aml;0;16;;tsy;0;5;;fca;0;5
oas;0;21;;meu;1;5;;pan;1;5
bta;0;43−11,6;;ssc;1;5;;oas;1;5
ttr;0;47−11,6;;mtr;2;5;;tsy;2;5
fca;0;53−11,6;;ppy;2;5;;spu;2;5
bacu;0;54−11,6;;sbi;2;5;;cmk;2;5
lav;0;89−11,6;;zma;3;5;;bta;3;5
mlu;1;3;;pop;5;5;;lcm;5;5
meu;1;5;;osa;6;5;;nle;6;5
ssc;1;5;;nle;0;6;;ssc;0;6
ath;1;8;;bdi;2;6;;dya;2;6
tru;1;11;;gmx;10;7;;csi;10;7
mpu;1;14;;cfa;0;8;;cel;0;8
cpic;1;24;;dno;0;8;;mlu;0;8
oni;1;25;;lcm;0;8;;mdo;0;8
tma;1;121−15,6;;ath;1;8;;acs;1;8
mtr;2;5;;spu;9;8;;gmo;9;8
ppy;2;5;;tng;0;9;;ttr;0;9
sbi;2;5;;pma;8;9;;dno;8;9
bdi;2;6;;tru;1;11;;xtr;1;11
gmo;2;18;;cmk;0;13;;dsi;0;13
vvi;3;2;;mpu;1;14;;sbq;1;14
zma;3;5;;aml;0;16;;aga;0;16
ppp;4;2;;gmo;2;18;;cjc;2;18
cel;5;2;;oas;0;21;;ppy;0;21
pop;5;5;;cpic;1;24;;gga;1;24
osa;6;5;;gac;43−1,1;24;;mmr;43;24
cbr;7;2;;oni;1;25;;pop;1;25
pma;8;9;;tma;1;121−15,6;;gfr;0;43
cjap;9;2;;bta;0;43−11,6;;bacu;0;47
spu;9;8;;ttr;0;47−11,6;;tma;52;52
cbre;10;2;;xtr;52−1!9;52−23!5;;ggo;0;53
gmx;10;7;;fca;0;53−11,6;;dme;0;54
gac;43−1,1;24;;bacu;0;54−11,6;;mcc;0;89
xtr;52−1!9;52−23!5;;lav;0;89−11,6;;oni;1;121
max;10;25;;;;;;;;
Estimations des effectifs de base. Codons a,c.
modifier
  • Lien aux tableaux: Estimations des effectifs de base. Codons a,c.
  • Méthode
  • Légende: copier au tableur avec le séparateur : (2 points)
  • Les couleurs: pour travailler sans les couleurs supprimer dans le tableur, avec ctrl+h, les caractères spéciaux * $ § ? &_emsp;
:*double:*aaa:moyn:estim::*double:*aca:moyn:estim::*double:*aga:moyn:estim::*double:*ata:moyn:estim
x/R2:*1.05:*45:::x/R2:*0.96:*35::−:x/R2:*0.86:*11::−:x/R2:*1.48:*37::−
max:*37:*45:::max:*19:*23::−:max:*10:*25::−:max:*13:*24::−
aml:5:$49:22,13:17:cmk:$49−13:$156−8:−:13−8:bacu:0:$54:11,6:8:gac:§46:14:5,6:5
bacu:4:$81:12,11:11:xtr:§48−13:§42−8:−:13−8:bta:0:§43:11,6:8:xtr:§26:24:6,5:5
bta:10:$67:4,4:4: :::::fca:0:$53:11,6:8: ::::
gmo:17:§45:10,9:9: :::::gac:§43:$24:1:1: ::::
ttr:4:$69:12,11:11: :::::lav:0:$89:11,6:8: ::::
xtr:$51:20:16:16: :::::tma:1:$121:15,6:10: ::::
zma:14:$67:19,13:16: :::::ttr:0:§47:11,6:8: ::::
 ::::: :::::xtr:$52−9:$52−5:−:9−5: ::::
:*double:*aac:moyn:estim::*double:*acc:−:estim::*double:*agc:moyn:estim::*double:*atc:−:estim
x/R2:*0.98:*42:::x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.78:*40::−:x/R2:*−:*−::−
max:*31:*40:::max:*5:*4::−:max:*16:*33::−:max:*3:*5::−
gac:$82:40:12:12:cmk:0:?11::4:lav:7:$68:7,5:6:oga:0:?8::5
pma:$100−29:$67−12:−:29−12:pma:?8:?10::5−4:pma:§34:30:7:7: ::::
 :::::zma:?8:4::5:xtr:§40−14:$58−8:−:14−8: ::::
:*double:*aag:moyn:estim::*double:*acg:moyn:estim::*double:*agg:moyn:estim::*double:*atg:moyn:estim
x/R2:*0.52:*36:::x/R2:*0.89:*35::−:x/R2:*0.78:*16::−:x/R2:*1.12:*62::−
max:*45:*29:::max:*15:*22::−:max:*25:*45::−:max:*43:*111::−
aml:12:$759:3,10:6:cmk:4:$132:3,3:3:bacu:0:$66:8,6:7:gac:$99:38:27:27
cfa:10:$397:13,10:11: :::::bta:2:$113:6,6:6:pma:$221:§64:27:27
cge:11:$74:8,9:8: :::::fca:1:$51:22,6:14:xtr:$187:§90:23:23
eeu:28:$120:11,9:10: :::::ttr:1:$52:22,6:14: ::::
fca:8:$878:19,11:15: ::::: ::::: ::::
gac:$74:22:11,12:11: ::::: ::::: ::::
mpu:5:$265:12,9:10: ::::: ::::: ::::
xtr:$74:22:11,12:11: ::::: ::::: ::::
zma:36:$90:6:6: ::::: ::::: ::::
:*double:*aat:−:estim::*double:*act:moyn:estim::*double:*agt:−:estim::*double:*att:moyn:estim
x/R2:*−:*−:::x/R2:*0.77:*37::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.57:*39::−
max:*4:*5:::max:*29:*32::−:max:*1:*4::−:max:*32:*36::−
mtr:4:?43::5:gac:$49−23:$49−11:−:23−11:oaa:?7:?10::1−4:pma:§47−25:$62−11:−:25−11
 :::::xtr:$76−23:$74−11:−:23−11:spu:?17:?8::1−4:xtr:§45:17:10:10
 ::::: ::::: :::::spu:$57:11:9,9:9
 ::::: ::::: :::::gac:$84:16:10,10:10
:::::::::::::::::::
:*double:*caa:moyn:estim::*double:*cca:moyn:estim::*double:*cga:moyn:estim::*double:*cta:moyn:estim
x/R2:*0.72:*21::−:x/R2:*0.35:*26::−:x/R2:*0.58:*17::−:x/R2:*0.68:*21::−
max:*29:*41::−:max:*48:*43::−:max:*25:*27::−:max:*26:*32::−
fca:5:$776:6,7:6:fca:4:$63:4,4:4:aml:2:$81:5,5:5:rien::::
gac:§47:12:4,4:4: :::::fca:7:$1193:5,4:4: ::::
tsy:13:$50:11,7:9: :::::gac:$65:13:1,2:1: ::::
:*double:*cac:moyn:estim::*double:*ccc:−:estim::*double:*cgc:−:estim::*double:*ctc:−:estim
x/R2:*0.47:*52::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*−:*−::−
max:*33:*26::−:max:*0:*5::−:max:*2:*2::−:max:*1:*1::−
rien:::::rien:::::bta:0:?6::2:rien::::
 ::::: :::::fca:0:?8::2: ::::
:*double:*cag:moyn:estim::*double:*ccg:moyn:estim::*double:*cgg:moyn:estim::*double:*ctg:moyn:estim
x/R2:*0.92:*38::−:x/R2:*0.6:*69::−:x/R2:*1.1:*23::−:x/R2:*0.66:*51::−
max:*30:*47::−:max:*19:*16::−:max:*13:*23::−:max:*18:*19::−
gac:$61:19:4,7:5:cmk:0:§40:2,1:1:rien:::::gmo:13:§33:7:7
pma:$60:§47:9:9: ::::: :::::pma:§37−15:§37−11:−:15−11
:*double:*cat:−:estim::*double:*cct:moyn:estim::*double:*cgt:moyn:estim::*double:*ctt:moyn:estim
x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.45:*48::−:x/R2:*0.35:*45::−:x/R2:*0.52:*40::−
max:*0:*4::−:max:*36:*29::−:max:*37:*29::−:max:*31:*35::−
rien:::::gac:$58:4:13,8:10:pma:$55:29:22,16:19:pma:$56−26:$55−6:−:26−6
 :::::xtr:§42:17:17:17: ::::: ::::
Estimations des effectifs de base. Codons g,t.
modifier 
:*double:*gaa:moyn:estim::*double:*gca:moyn:estim::*double:*gga:moyn:estim::*double:*gta:moyn:estim
x/R2:*0.72:*41::−:x/R2:*0.72:*17::−:x/R2:*0.44:*27::−:x/R2:*1.71:*40::−
max:*47:*38::−:max:*36:*46::−:max:*36:*45::−:max:*29:*38::−
bacu:11:$423:5,9:7:cmk:$2889−25:$3008−15:−:25−15:bacu:25:$961:11:11:cmk:29:$115:20:20
cbre:29:$1871:10:10:dno:2:$63:7,8:7:bta:6:$384:4,3:3: ::::
cel:$60:23:10,8:9: :::::cbre:$61:4:5,6:5: ::::
cjap:7:$106:5,7:6: :::::cmk:22:§43:11:11: ::::
gac:3:$135:10,7:8: :::::gac:§40:20:12:12: ::::
spu:2:$111:7,7:7: :::::lav:3:$615:3,4:3: ::::
ssc:§47:$2320:10:10: :::::oas:1:$131:2,4:3: ::::
ttr:30:$204:10:10: :::::tma:5:$1067:4,3:3: ::::
xtr:7:$58:5,7:6: :::::ttr:19:$813:11:11: ::::
 ::::: :::::xtr:$53:26:12:12: ::::
:*double:*gac:moyn:estim::*double:*gcc:−:estim::*double:*ggc:moyn:estim::*double:*gtc:−:estim
x/R2:*0.43:*30::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.44:*39::−:x/R2:*−:*−::−
max:*46:*48::−:max:*4:*6::−:max:*30:*36::−:max:*2:*3::−
gac:$135:§48:9:9:cmk:3:?164::6:bacu:13:$50:1,2:1:cmk:0:?15::3
pma:$56:33:8:8:str:1:?29::6:bta:8:$54:3,4:3:osa:?13:3::2
spu:$62:19:10:10: :::::xtr:$70:14:18:18:zma:?11:0::2
ssc:14:$82:16,15:15: ::::: ::::: ::::
:*double:*gag:moyn:estim::*double:*gcg:moyn:estim::*double:*ggg:moyn:estim::*double:*gtg:moyn:estim
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:::::::::::::::::::
:::::::::::::::::::
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 ::::: :::::oas:0:?15::4: ::::
E79 codons. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
modifier 
;aaa1;aaa2;aac1;aac2;aag1;aag2;aat1;aat2;;aca1;aca2;acc1;acc2;acg1;acg2;act1;act2;;aga1;aga2;agc1;agc2;agg1;agg2;agt1;agt2;;ata1;ata2;atc1;atc2;atg1;atg2;att1;att2;;caa1;caa2;cac1;cac2;cag1;cag2;cat1;cat2;;cca1;cca2;ccc1;ccc2;ccg1;ccg2;cct1;cct2;;cga1;cga2;cgc1;cgc2;cgg1;cgg2;cgt1;cgt2;;cta1;cta2;ctc1;ctc2;ctg1;ctg2;ctt1;ctt2;;gaa1;gaa2;gac1;gac2;gag1;gag2;gat1;gat2;;gca1;gca2;gcc1;gcc2;gcg1;gcg2;gct1;gct2;;gga1;gga2;ggc1;ggc2;ggg1;ggg2;ggt1;ggt2;;gta1;gta2;gtc1;gtc2;gtg1;gtg2;gtt1;gtt2;;taa1;taa2;tac1;tac2;tag1;tag2;tat1;tat2;;tca1;tca2;tcc1;tcc2;tcg1;tcg2;tct1;tct2;;tga1;tga2;tgc1;tgc2;tgg1;tgg2;tgt1;tgt2;;tta1;tta2;ttc1;ttc2;ttg1;ttg2;ttt1;ttt2
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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E79fr-tg;;résonance;;différents;;excès − (mtr+1);;;E79br-tg;;résonance;;doublons;;excès − (mtr+1);;;E79r-tg;;résonance;;total;;excès − (mtr+1);
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Zebra codons. Les carrés
modifier 
E79fz-tg;;db,dif;;différents;;;;;E79bz-tg;;db,dif;;doublons;;;;;E79zi;;indice;;doublons/différents;;;
ttt;9;tct;175;tat;3;tgt;8;;ttt;0;tct;160;tat;1;tgt;0;;ttt;0;tct;0.91;tat;0.33;tgt;0
atc;8;act;181;aat;14;agt;10;;atc;1;act;177;aat;9;agt;3;;atc;0.13;act;0.98;aat;0.64;agt;0.30
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ctg;138;ccg;90;cag;122;cgg;34;;ctg;161;ccg;89;cag;143;cgg;24;;ctg;1.17;ccg;0.99;cag;1.17;cgg;0.71
gtg;95;gcg;25;gag;86;ggg;180;;gtg;131;gcg;86;gag;158;ggg;87;;gtg;1.38;gcg;3.44;gag;1.84;ggg;0.48

C42-Codons. Correlations et indices des doublons

modifier 
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C42-Codons. Les carrés

modifier 
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ata;16;aca;36;aaa;62;aga;33;;ata;2;aca;22;aaa;52;aga;134;;ata;18;aca;58;aaa;114;aga;167
cta;32;cca;108;caa;57;cga;40;;cta;7;cca;56;caa;97;cga;30;;cta;39;cca;164;caa;154;cga;70
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ttg;88;tcg;33;tag;0;tgg;69;;ttg;64;tcg;5;tag;0;tgg;64;;ttg;152;tcg;38;tag;0;tgg;133
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gtg;31;gcg;23;gag;121;ggg;25;;gtg;21;gcg;11;gag;133;ggg;5;;gtg;52;gcg;34;gag;254;ggg;30
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
C42f-tg;;db,diff;;différents;;;;;C42b-tg;;db,diff;;doubles;;;;;C42-tg;;db,diff;;total;;;
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atc;6;act;111;aat;2;agt;0;;atc;0;act;221;aat;0;agt;0;;atc;6;act;332;aat;2;agt;0
ctt;104;cct;104;cat;0;cgt;112;;ctt;66;cct;51;cat;0;cgt;126;;ctt;170;cct;155;cat;0;cgt;238
gtt;125;gct;141;gat;2;ggc;127;;gtt;276;gct;248;gat;0;ggc;360;;gtt;401;gct;389;gat;2;ggc;487
ttc;185;tcc;1;tac;161;tgc;82;;ttc;111;tcc;0;tac;91;tgc;61;;ttc;296;tcc;1;tac;252;tgc;143
att;147;acc;0;aac;127;agc;124;;att;231;acc;0;aac;170;agc;31;;att;378;acc;0;aac;297;agc;155
ctc;13;ccc;1;cac;108;cgc;0;;ctc;5;ccc;0;cac;112;cgc;0;;ctc;18;ccc;1;cac;220;cgc;0
gtc;1;gcc;0;gac;142;ggt;2;;gtc;0;gcc;0;gac;267;ggt;0;;gtc;1;gcc;0;gac;409;ggt;2
tta;61;tca;68;taa;1;tga;12;;tta;71;tca;24;taa;0;tga;0;;tta;132;tca;92;taa;1;tga;12
ata;57;aca;78;aaa;103;aga;73;;ata;2;aca;22;aaa;52;aga;134;;ata;59;aca;100;aaa;155;aga;207
cta;68;cca;149;caa;99;cga;62;;cta;7;cca;56;caa;97;cga;30;;cta;75;cca;205;caa;196;cga;92
gta;58;gca;83;gaa;102;gga;100;;gta;6;gca;58;gaa;150;gga;46;;gta;64;gca;141;gaa;252;gga;146
ttg;126;tcg;75;tag;1;tgg;109;;ttg;64;tcg;5;tag;0;tgg;64;;ttg;190;tcg;80;tag;1;tgg;173
atg;192;acg;61;aag;147;agg;64;;atg;132;acg;5;aag;279;agg;5;;atg;324;acg;66;aag;426;agg;69
ctg;76;ccg;36;cag;105;cgg;50;;ctg;13;ccg;0;cag;44;cgg;5;;ctg;89;ccg;36;cag;149;cgg;55
gtg;73;gcg;49;gag;163;ggg;64;;gtg;21;gcg;11;gag;133;ggg;5;;gtg;94;gcg;60;gag;296;ggg;69
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
C42z-tg;;zéros;−;;;;;;C42ei-tg;;indice;;doubles/différents;;;;;C42ec-tg;;corel;;corrélation;;;
ttt;41;tct;0;tat;40;tgt;41;;ttt;0.00;tct;3.70;tat;−;tgt;−;;ttt;−;tct;-0.05;tat;−;tgt;−
atc;36;act;0;aat;40;agt;42;;atc;−;act;3.20;aat;−;agt;−;;atc;−;act;-0.35;aat;−;agt;−
ctt;11;cct;4;cat;42;cgt;0;;ctt;0.90;cct;0.77;cat;−;cgt;1.80;;ctt;0.18;cct;0.39;cat;−;cgt;-0.24
gtt;0;gct;0;gat;40;ggc;0;;gtt;3.33;gct;2.51;gat;−;ggc;4.24;;gtt;-0.31;gct;-0.36;gat;−;ggc;-0.53
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att;0;acc;42;aac;0;agc;1;;att;2.20;acc;−;aac;2.00;agc;0.37;;att;-0.35;acc;−;aac;-0.31;agc;-0.29
ctc;30;ccc;41;cac;0;cgc;42;;ctc;5.00;ccc;−;cac;1.70;cgc;−;;ctc;0.97;ccc;−;cac;-0.31;cgc;−
gtc;41;gcc;42;gac;0;ggt;40;;gtc;−;gcc;−;gac;2.67;ggt;−;;gtc;−;gcc;−;gac;-0.33;ggt;−
tta;3;tca;0;taa;41;tga;31;;tta;3.23;tca;0.92;taa;−;tga;0.00;;tta;0.10;tca;-0.27;taa;−;tga;−
ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2;;ata;0.13;aca;0.61;aaa;0.84;aga;4.06;;ata;0.22;aca;-0.31;aaa;0.04;aga;-0.04
cta;6;cca;1;caa;0;cga;20;;cta;0.22;cca;0.52;caa;1.70;cga;0.75;;cta;-0.06;cca;-0.09;caa;-0.36;cga;0.75
gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;0.33;gca;1.41;gaa;2.50;gga;0.79;;gta;-0.22;gca;-0.05;gaa;-0.29;gga;-0.03
ttg;4;tcg;0;tag;41;tgg;2;;ttg;0.73;tcg;0.15;tag;−;tgg;0.93;;ttg;-0.11;tcg;0.27;tag;−;tgg;-0.28
atg;0;acg;1;aag;1;agg;1;;atg;0.88;acg;0.25;aag;2.63;agg;0.22;;atg;-0.07;acg;0.15;aag;-0.19;agg;0.43
ctg;11;ccg;21;cag;0;cgg;4;;ctg;0.29;ccg;0.00;cag;0.70;cgg;0.42;;ctg;0.48;ccg;−;cag;-0.15;cgg;0.06
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B42-Codons. Correlations et indices des doublons

modifier 
B42;double;aaa;double;aac;double;aag;double;aat;B42;double;aca;double;acc;double;acg;double;act;B42;double;aga;double;agc;double;agg;double;agt;B42;double;ata;double;atc;double;atg;double;att;B42;double;caa;double;cac;double;cag;double;cat;B42;double;cca;double;ccc;double;ccg;double;cct;B42;double;cga;double;cgc;double;cgg;double;cgt;B42;double;cta;double;ctc;double;ctg;double;ctt;B42;double;gaa;double;gac;double;gag;double;gat;B42;double;gca;double;gcc;double;gcg;double;gct;B42;double;gga;double;ggc;double;ggg;double;ggt;B42;double;gta;double;gtc;double;gtg;double;gtt;B42;double;taa;double;tac;double;tag;double;tat;B42;double;tca;double;tcc;double;tcg;double;tct;B42;double;tga;double;tgc;double;tgg;double;tgt;B42;double;tta;double;ttc;double;ttg;double;ttt
'''bae;2;0;2;1;0;−;0;−;'''bae;0;2;0;0;0;−;0;−;'''bae;0;0;1;0;0;1;0;−;'''bae;0;−;1;1;3;2;0;−;'''bae;1;2;1;0;0;−;0;−;'''bae;0;0;0;−;0;−;0;−;'''bae;0;−;0;−;0;0;1;0;'''bae;1;0;0;0;0;−;0;−;'''bae;4;1;3;0;0;−;0;−;'''bae;1;1;0;0;0;−;0;−;'''bae;1;1;1;0;0;−;0;−;'''bae;2;0;0;0;0;−;0;−;'''bae;0;−;1;0;0;−;0;−;'''bae;0;1;0;0;0;−;0;−;'''bae;0;−;0;0;0;1;0;−;'''bae;0;1;1;1;0;0;0;−
'''bbd;1;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;0;0;−;'''bbd;0;−;0;0;0;2;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;1;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;0;0;−;0;−;0;0;'''bbd;0;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;1;0;1;1;0;−;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;1;0;0;−;0;−;0;−;'''bbd;0;−;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;−;0;−;'''bbd;0;−;0;0;0;0;0;−;'''bbd;0;0;0;0;0;0;0;−
'''bcef;4;1;3;1;0;−;0;−;'''bcef;1;1;0;0;0;−;0;−;'''bcef;0;−;1;0;0;−;0;−;'''bcef;0;−;3;0;2;5;0;−;'''bcef;3;1;0;0;0;−;0;−;'''bcef;1;1;0;−;0;−;0;−;'''bcef;0;−;0;−;0;0;1;1;'''bcef;1;0;0;0;0;−;0;−;'''bcef;5;1;5;0;0;−;0;−;'''bcef;3;1;0;−;0;−;0;−;'''bcef;2;1;2;1;0;−;0;−;'''bcef;4;0;0;−;0;−;0;−;'''bcef;0;−;2;0;0;−;0;−;'''bcef;0;2;0;0;0;−;0;−;'''bcef;0;−;0;0;0;1;0;−;'''bcef;1;0;1;1;0;0;0;−
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B42-Codons. Les carrés

modifier 
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ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0
ctt;0;cct;0;cat;1;cgc;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;0;cct;0;cat;1;cgc;0
gtt;0;gct;0;gat;1;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;1;ggt;1
ttc;15;tcc;6;tac;12;tgc;19;;ttc;44;tcc;12;tac;68;tgc;17;;ttc;59;tcc;18;tac;80;tgc;36
atc;9;acc;18;aac;21;agc;5;;atc;93;acc;7;aac;100;agc;18;;atc;102;acc;25;aac;121;agc;23
ctc;4;ccc;2;cac;9;cgt;17;;ctc;6;ccc;6;cac;17;cgt;87;;ctc;10;ccc;8;cac;26;cgt;104
gtc;27;gcc;4;gac;18;ggc;14;;gtc;11;gcc;26;gac;113;ggc;127;;gtc;38;gcc;30;gac;131;ggc;141
tta;9;tca;15;taa;0;tga;0;;tta;25;tca;35;taa;0;tga;0;;tta;34;tca;50;taa;0;tga;0
ata;0;aca;12;aaa;12;aga;6;;ata;0;aca;50;aaa;122;aga;7;;ata;0;aca;62;aaa;134;aga;13
cta;14;cca;6;caa;16;cga;1;;cta;36;cca;39;caa;48;cga;2;;cta;50;cca;45;caa;64;cga;3
gta;16;gca;13;gaa;14;gga;14;;gta;108;gca;104;gaa;115;gga;28;;gta;124;gca;117;gaa;129;gga;42
ttg;6;tcg;6;tag;1;tgg;6;;ttg;4;tcg;0;tag;0;tgg;8;;ttg;10;tcg;6;tag;1;tgg;14
atg;123;acg;2;aag;2;agg;5;;atg;138;acg;0;aag;7;agg;0;;atg;261;acg;2;aag;9;agg;5
ctg;21;ccg;1;cag;6;cgg;1;;ctg;27;ccg;1;cag;8;cgg;0;;ctg;48;ccg;2;cag;14;cgg;1
gtg;3;gcg;1;gag;1;ggg;2;;gtg;3;gcg;1;gag;5;ggg;0;;gtg;6;gcg;2;gag;6;ggg;2
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
B42f-tg;;db,diff;;différents;;;;;B42b-tg;;db,diff;;doubles;;;;;B42-tg;;db,diff;;total;;;
ttt;2;tct;1;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;2;tct;1;tat;2;tgt;1
att;0;act;2;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;2;aat;0;agt;0
ctt;1;cct;1;cat;2;cgc;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;1;cct;1;cat;2;cgc;2
gtt;0;gct;0;gat;2;ggt;2;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;2;ggt;2
ttc;57;tcc;48;tac;54;tgc;61;;ttc;44;tcc;12;tac;68;tgc;17;;ttc;101;tcc;60;tac;122;tgc;78
atc;51;acc;58;aac;63;agc;47;;atc;93;acc;7;aac;100;agc;18;;atc;144;acc;65;aac;163;agc;65
ctc;44;ccc;32;cac;51;cgt;58;;ctc;6;ccc;6;cac;17;cgt;87;;ctc;50;ccc;38;cac;68;cgt;145
gtc;63;gcc;40;gac;60;ggc;56;;gtc;11;gcc;26;gac;113;ggc;127;;gtc;74;gcc;66;gac;173;ggc;183
tta;51;tca;57;taa;0;tga;18;;tta;25;tca;35;taa;0;tga;0;;tta;76;tca;92;taa;0;tga;18
ata;0;aca;54;aaa;53;aga;47;;ata;0;aca;50;aaa;122;aga;7;;ata;0;aca;104;aaa;175;aga;54
cta;56;cca;48;caa;58;cga;7;;cta;36;cca;39;caa;48;cga;2;;cta;92;cca;87;caa;106;cga;9
gta;58;gca;55;gaa;55;gga;56;;gta;108;gca;104;gaa;115;gga;28;;gta;166;gca;159;gaa;170;gga;84
ttg;48;tcg;27;tag;2;tgg;48;;ttg;4;tcg;0;tag;0;tgg;8;;ttg;52;tcg;27;tag;2;tgg;56
atg;165;acg;25;aag;17;agg;41;;atg;138;acg;0;aag;7;agg;0;;atg;303;acg;25;aag;24;agg;41
ctg;48;ccg;19;cag;26;cgg;40;;ctg;27;ccg;1;cag;8;cgg;0;;ctg;75;ccg;20;cag;34;cgg;40
gtg;10;gcg;12;gag;9;ggg;26;;gtg;3;gcg;1;gag;5;ggg;0;;gtg;13;gcg;13;gag;14;ggg;26
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
B42z-tg;;zéros;−;;;;;;B42ei-tg;;indice;;doubles/différents;;;;;B42ec-tg;;corel;;corrélation;;;
ttt;40;tct;41;tat;40;tgt;41;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−
att;42;act;40;aat;42;agt;42;;att;−;act;−;aat;−;agt;−;;att;−;act;−;aat;−;agt;−
ctt;41;cct;41;cat;41;cgc;40;;ctt;−;cct;−;cat;0.00;cgc;−;;ctt;−;cct;−;cat;−;cgc;−
gtt;42;gct;42;gat;41;ggt;41;;gtt;−;gct;−;gat;0.00;ggt;0.00;;gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−
ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0;;ttc;2.93;tcc;2.00;tac;5.67;tgc;0.89;;ttc;-0.10;tcc;-0.23;tac;-0.22;tgc;-0.03
atc;0;acc;2;aac;0;agc;0;;atc;10.33;acc;0.39;aac;4.76;agc;3.60;;atc;-0.27;acc;-0.28;aac;-0.28;agc;-0.16
ctc;2;ccc;12;cac;0;cgt;1;;ctc;1.50;ccc;3.00;cac;1.89;cgt;5.12;;ctc;-0.14;ccc;0.15;cac;-0.07;cgt;-0.17
gtc;6;gcc;6;gac;0;ggc;0;;gtc;0.41;gcc;6.50;gac;6.28;ggc;9.07;;gtc;-0.28;gcc;0.01;gac;-0.35;ggc;-0.15
tta;0;tca;0;taa;42;tga;24;;tta;2.78;tca;2.33;taa;−;tga;−;;tta;0.23;tca;0.02;taa;−;tga;−
ata;42;aca;0;aaa;1;aga;1;;ata;−;aca;4.17;aaa;10.17;aga;1.17;;ata;−;aca;-0.10;aaa;0.10;aga;0.14
cta;0;cca;0;caa;0;cga;36;;cta;2.57;cca;6.50;caa;3.00;cga;2.00;;cta;0.51;cca;-0.04;caa;-0.12;cga;-0.20
gta;0;gca;0;gaa;1;gga;0;;gta;6.75;gca;8.00;gaa;8.21;gga;2.00;;gta;-0.12;gca;0.14;gaa;-0.19;gga;0.17
ttg;0;tcg;21;tag;41;tgg;0;;ttg;0.67;tcg;0.00;tag;0.00;tgg;1.33;;ttg;0.33;tcg;−;tag;−;tgg;-0.20
atg;0;acg;19;aag;27;agg;6;;atg;1.12;acg;0.00;aag;3.50;agg;0.00;;atg;0.09;acg;−;aag;-0.19;agg;−
ctg;15;ccg;24;cag;22;cgg;3;;ctg;1.29;ccg;1.00;cag;1.33;cgg;0.00;;ctg;0.13;ccg;-0.06;cag;-0.45;cgg;−
gtg;35;gcg;31;gag;34;ggg;18;;gtg;1.00;gcg;1.00;gag;5.00;ggg;0.00;;gtg;-0.35;gcg;1.00;gag;0.17;ggg;−

Total des génomes par codon, corrélations et indices des doublons

modifier 
;;;;;;;;;;;;mtri dif;;;;mtri diff;;;;total;;
A10tg;;néant;;B42tg;;2 diags;;C42tg;;2 diags;;E79e-tg;;2 diags;;E79t-tg;;néant;;E79-tg;;néant
A10-tg;Ab-tg;Af-tg;;B42-tg;Bb-tg;Bf-tg;;C42o-tg;Cb-tg;Cf-tg;;Ee-tg;Ebe-tg;Efe-tg;;Et-tg;Ebt-tg;Eft-tg;;E79-tg;Eb-tg;Ef-tg
ttt;0;0;;ttt;0;0;;tgt;0;0;;cat;0;14;;cat;0;36;;cat;0;14
gtt;0;0;;gtt;0;0;;ggt;0;0;;tat;0;30;;tat;0;57;;tat;0;36
ctt;0;0;;ctt;0;0;;agt;0;0;;ccc;1;10;;ctc;1;10;;ctc;1;1
att;0;0;;att;0;0;;tat;0;0;;ctc;1;1;;ccc;1;28;;ccc;1;10
tgt;0;0;;tgt;0;0;;gat;0;0;;tag;1;54;;ttt;1;50;;ttt;1;23
ggt;0;0;;agt;0;0;;cat;0;0;;ttt;1;23;;tag;1;80;;tag;1;81
cgt;0;0;;tct;0;0;;aat;0;0;;cgc;2;8;;cgc;2;22;;cgc;2;18
agt;0;0;;gct;0;0;;tag;0;0;;ggt;2;60;;tgt;2;66;;ggt;2;97
tct;0;0;;cct;0;0;;gtc;0;0;;tgt;2;35;;ggt;2;78;;gat;3;58
gct;0;0;;act;0;0;;atc;0;0;;gat;3;38;;gat;3;73;;aat;5;75
cct;0;0;;tat;0;0;;cgc;0;0;;aat;5;37;;aat;5;70;;taa;5;126
act;0;0;;aat;0;0;;tcc;0;0;;taa;5;32;;taa;5;70;;atc;6;41
tat;0;0;;cgc;0;0;;gcc;0;0;;atc;6;38;;atc;6;65;;tga;7;167
gat;0;0;;ata;0;0;;ccc;0;0;;gtc;7;23;;gtc;7;60;;gcc;8;218
cat;0;0;;tga;0;0;;acc;0;0;;tga;7;70;;tga;7;133;;tgt;10;175
aat;0;0;;taa;0;0;;taa;0;0;;gcc;8;37;;gcc;8;61;;agt;25;37
gtg;0;0;;ggt;0;1;;ttt;0;1;;acc;19;26;;acc;19;49;;acc;25;39
ggg;0;0;;gat;0;1;;tga;0;1;;agt;25;37;;agt;25;55;;gtc;27;35
cgg;0;0;;cat;0;1;;ctc;5;1;;tcc;28;31;;tcc;28;58;;tcc;42;100
agg;0;0;;tag;0;1;;cgg;5;12;;cgg;84;214;;cgg;84;285;;cgg;84;214
tcg;0;0;;cgg;0;1;;ccg;0;15;;ata;91;395;;ata;91;473;;tta;97;416
gcg;0;0;;ggg;0;2;;ata;2;16;;tta;97;416;;tta;97;495;;ttg;114;465
ccg;0;0;;acg;0;2;;gta;6;18;;aga;108;495;;aga;108;574;;acg;118;414
acg;0;0;;agg;0;5;;acg;5;20;;ttg;114;465;;ttg;114;543;;cta;122;288
tag;0;0;;tcg;0;6;;tta;71;22;;acg;118;285;;acg;118;362;;tcg;134;269
gag;0;0;;gcg;1;1;;agg;5;23;;cta;122;288;;cta;122;364;;gta;148;503
gcc;0;0;;ccg;1;1;;gcg;11;23;;tcg;134;225;;tcg;134;304;;ata;153;395
ccc;0;0;;cga;2;1;;ggg;5;25;;tca;142;358;;tca;142;437;;tca;178;403
cac;0;0;;gtg;3;3;;tca;24;26;;gta;148;408;;gta;148;487;;aga;193;899
ata;0;0;;ttg;4;6;;gtg;21;31;;tac;167;1064;;tac;167;1,143;;ccg;211;154
tga;0;0;;gag;5;1;;cta;7;32;;cga;177;353;;cga;177;432;;agg;212;745
taa;0;0;;ccc;6;2;;tcg;5;33;;gcg;181;351;;gcg;181;430;;cga;241;1618
tgg;0;1;;ctc;6;4;;aga;134;33;;ccg;211;115;;ccg;211;194;;aca;295;595
cag;0;1;;aag;7;2;;aca;22;36;;agg;212;504;;agg;212;582;;tac;307;1078
agc;0;1;;aga;7;6;;cga;30;40;;ggg;221;286;;ggg;221;361;;gcg;308;4099
tcc;0;1;;acc;7;18;;gca;58;41;;aca;224;413;;aca;224;492;;caa;360;1357
acc;0;1;;tgg;8;6;;tgc;61;42;;caa;317;546;;caa;317;625;;ctg;368;338
cta;0;1;;cag;8;6;;ctg;13;45;;gca;336;686;;gca;336;764;;tgg;430;1077
cga;0;1;;gtc;11;27;;caa;97;57;;ctg;346;286;;ctg;346;365;;agc;443;554
aga;0;1;;tcc;12;6;;tct;211;57;;tgg;389;469;;tgg;389;547;;ggg;444;6146
tca;0;1;;cac;17;9;;gga;46;58;;agc;390;442;;agc;390;520;;act;477;646
cca;0;1;;tgc;17;19;;gaa;150;60;;act;398;545;;act;398;623;;ctt;491;366
aaa;0;1;;agc;18;5;;aaa;52;62;;cag;408;608;;cag;408;687;;gtg;494;2030
ttg;0;2;;tta;25;9;;cag;44;63;;gtg;456;468;;gtg;456;546;;tct;506;337
ctg;0;2;;gcc;26;4;;cct;51;66;;ctt;461;317;;ctt;461;396;;cag;515;608
gga;0;2;;ctg;27;21;;cac;112;66;;tct;506;337;;tct;506;414;;cca;531;444
caa;0;2;;gga;28;14;;tgg;64;69;;cgt;507;299;;cgt;507;377;;cgt;543;299
tta;0;3;;tca;35;15;;act;221;69;;gtt;525;418;;gtt;525;497;;aaa;589;1090
aag;1;0;;cta;36;14;;cgt;126;70;;cca;531;385;;cca;531;464;;gtt;594;480
cgc;1;0;;cca;39;6;;ctt;66;73;;gaa;550;547;;gaa;550;626;;gaa;601;5711
gta;1;0;;ttc;44;15;;agc;31;83;;aaa;554;781;;aaa;554;859;;cac;631;319
tac;1;1;;caa;48;16;;gtt;276;83;;gga;557;405;;gga;557;484;;ttc;645;472
gac;2;2;;aca;50;12;;aac;170;85;;cct;577;252;;cct;577;331;;cct;650;252
aca;2;2;;tac;68;12;;ggc;360;85;;cac;631;319;;cac;631;397;;gga;682;4374
ctc;2;4;;cgt;87;17;;ttg;64;88;;ttc;645;472;;ttc;645;550;;gag;697;2075
atc;3;2;;atc;93;9;;gct;248;99;;att;671;488;;att;671;567;;gct;822;1240
gtc;4;1;;aac;100;21;;gac;267;100;;gag;697;625;;gag;697;704;;att;850;539
aac;4;1;;gca;104;13;;att;231;105;;gct;731;923;;gct;731;1,002;;tgc;887;1309
gaa;4;1;;gta;108;16;;aag;279;106;;aac;801;712;;aac;801;791;;ggc;916;569
ttc;4;2;;gac;113;18;;cca;56;108;;tgc;822;945;;tgc;822;1,023;;aac;942;767
tgc;4;16;;gaa;115;14;;tac;91;119;;aag;824;725;;aag;824;803;;aag;950;3242
atg;*5;*22;;aaa;122;12;;gag;133;121;;gac;844;648;;gac;844;727;;gac;1070;715
ggc;6;3;;ggc;127;14;;ttc;111;143;;ggc;864;469;;ggc;864;547;;atg;1387;1152
gca;7;1;;atg;138;123;;atg;132;150;;atg;957;1152;;atg;957;1,231;;gca;3200;3735
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
correl.;0.42;0.27;;;0.66;0.55;;;0.71;0.60;;;0.75;0.52;;;0.76;0.52;;;0.45;0.32
total;46;58;;;1535;415;;;4179;2781;;;18969;22508;;;18969;26546;;;24801;56149
Indice db;0.79;;;;3.70;;;;1.50;;;;0.84;;;;0.71;;;;0.44;

Comparaisons croisées par les corrélations entre totaux

modifier
Les corrélations diff, intra groupe
modifier 
;db;diff;;;db;diff;;;db;diff
ccF;0.518;;;ccF;0.614;;;ccF;0.572;
cTc;0.759;;;cTc;0.702;;;cTc;0.704;
E79t;Ebt-tg;Eft-tg;;C42t;Cbt-tg;Cft-tg;;B42t;Bbt-tg;Bft-tg
cat;0;36;;acc;0;0;;aat;0;0
tat;0;57;;agt;0;0;;agt;0;0
ctc;1;10;;cat;0;0;;ata;0;0
ccc;1;28;;cgc;0;0;;att;0;0
ttt;1;50;;gcc;0;0;;gct;0;0
tag;1;80;;ccc;0;1;;gtt;0;0
cgc;2;22;;gtc;0;1;;taa;0;0
tgt;2;66;;taa;0;1;;cct;0;1
ggt;2;78;;tag;0;1;;ctt;0;1
gat;3;73;;tcc;0;1;;tct;0;1
aat;5;70;;tgt;0;1;;tgt;0;1
taa;5;70;;aat;0;2;;act;0;2
atc;6;65;;gat;0;2;;cat;0;2
gtc;7;60;;ggt;0;2;;cgc;0;2
tga;7;133;;tat;0;2;;gat;0;2
gcc;8;61;;ttt;0;2;;ggt;0;2
acc;19;49;;atc;0;6;;tag;0;2
agt;25;55;;tga;0;12;;tat;0;2
tcc;28;58;;ctc;5;13;;ttt;0;2
cgg;84;285;;ccg;0;36;;tga;0;18
ata;91;473;;gcg;11;49;;acg;0;25
tta;97;495;;cgg;5;50;;ggg;0;26
aga;108;574;;ata;2;57;;tcg;0;27
ttg;114;543;;gta;6;58;;cgg;0;40
acg;118;362;;acg;5;61;;agg;0;41
cta;122;364;;tta;71;61;;gcg;1;12
tcg;134;304;;cga;30;62;;ccg;1;19
tca;142;437;;agg;5;64;;cga;2;7
gta;148;487;;ggg;5;64;;gtg;3;10
tac;167;1,143;;cta;7;68;;ttg;4;48
cga;177;432;;tca;24;68;;gag;5;9
gcg;181;430;;gtg;21;73;;ccc;6;32
ccg;211;194;;aga;134;73;;ctc;6;44
agg;212;582;;tcg;5;75;;aag;7;17
ggg;221;361;;ctg;13;76;;aga;7;47
aca;224;492;;aca;22;78;;acc;7;58
caa;317;625;;tgc;61;82;;cag;8;26
gca;336;764;;gca;58;83;;tgg;8;48
ctg;346;365;;caa;97;99;;gtc;11;63
tgg;389;547;;tct;211;99;;tcc;12;48
agc;390;520;;gga;46;100;;cac;17;51
act;398;623;;gaa;150;102;;tgc;17;61
cag;408;687;;aaa;52;103;;agc;18;47
gtg;456;546;;cct;51;104;;tta;25;51
ctt;461;396;;ctt;66;104;;gcc;26;40
tct;506;414;;cag;44;105;;ctg;27;48
cgt;507;377;;cac;112;108;;gga;28;56
gtt;525;497;;tgg;64;109;;tca;35;57
cca;531;464;;act;221;111;;cta;36;56
gaa;550;626;;cgt;126;112;;cca;39;48
aaa;554;859;;agc;31;124;;ttc;44;57
gga;557;484;;gtt;276;125;;caa;48;58
cct;577;331;;ttg;64;126;;aca;50;54
cac;631;397;;aac;170;127;;tac;68;54
ttc;645;550;;ggc;360;127;;cgt;87;58
att;671;567;;gct;248;141;;atc;93;51
gag;697;704;;gac;267;142;;aac;100;63
gct;731;1,002;;att;231;147;;gca;104;55
aac;801;791;;aag;279;147;;gta;108;58
tgc;822;1,023;;cca;56;149;;gac;113;60
aag;824;803;;tac;91;161;;gaa;115;55
gac;844;727;;gag;133;163;;aaa;122;53
ggc;864;547;;ttc;111;185;;ggc;127;56
atg;957;1,231;;atg;132;192;;atg;138;165
Les corrélations diff, entre groupes
modifier 
;db;diff;db;diff;;;db;diff;db;diff;;;db;diff;db;diff;;;db+diff;db+diff;db+diff
ccF;0.684;0.719;0.374;0.592;;ccF;0.353;0.378;0.236;0.432;;ccF;0.436;0.456;0.357;0.477;;ccF;0.404;0.548;0.718
cTc;0.768;0.851;0.580;0.851;;cTc;0.492;0.553;0.494;0.760;;cTc;0.585;0.597;0.665;0.766;;cTc;0.641;0.741;0.852
Eet-Ct;Ebet-tg;Efet-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Bt-Ct;Bbt-tg;Bft-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Eet-Bt;Bbt-tg;Bft-tg;Ebet-tg;Efet-tg;;total;B42t;C42t;E79t
cat;0;36;0;0;;agt;0;0;0;0;;aat;0;0;5;70;;§ctc;1;18;11
tat;0;57;0;2;;§gcc;0;0;0;0;;taa;0;0;5;70;;cgc;2;0;24
ctc;1;10;5;13;;§gtc;0;0;0;1;;§atc;0;0;6;65;;§ccc;1;1;29
ccc;1;28;0;1;;taa;0;0;0;1;;§gtc;0;0;7;60;;cat;2;0;36
ttt;1;50;0;2;;aat;0;0;0;2;;§gcc;0;0;8;61;;ttt;2;2;51
tag;1;80;0;1;;§atc;0;0;0;6;;agt;0;0;25;55;;tat;2;2;57
cgc;2;22;0;0;;§ccc;0;1;0;1;;§ctc;0;1;1;10;;§gtc;0;1;67
tgt;2;66;0;1;;§tcc;0;1;0;1;;§ccc;0;1;1;28;;§acc;2;0;68
ggt;2;78;0;2;;tgt;0;1;0;1;;tgt;0;1;2;66;;tgt;1;1;68
gat;3;73;0;2;;§ctc;0;1;5;13;;§tcc;0;1;28;58;;gcc;0;0;69
taa;5;70;0;1;;§acc;0;2;0;0;;cat;0;2;0;36;;atc;0;6;71
aat;5;70;0;2;;cat;0;2;0;0;;tat;0;2;0;57;;taa;0;1;75
atc;6;65;0;6;;cgc;0;2;0;0;;ttt;0;2;1;50;;aat;0;2;75
gtc;7;60;0;1;;tag;0;2;0;1;;tag;0;2;1;80;;gat;2;2;76
tga;7;133;0;12;;gat;0;2;0;2;;cgc;0;2;2;22;;agt;0;0;80
gcc;8;61;0;0;;ggt;0;2;0;2;;ggt;0;2;2;78;;ggt;2;2;80
acc;19;49;0;0;;tat;0;2;0;2;;gat;0;2;3;73;;tag;2;1;81
agt;25;55;0;0;;ttt;0;2;0;2;;§acc;0;2;19;49;;§tcc;1;1;86
tcc;28;58;0;1;;tga;0;18;0;12;;tga;0;18;7;133;;tga;18;12;140
cgg;84;285;5;50;;acg;0;25;5;61;;acg;0;25;118;362;;cgg;40;55;369
ata;91;473;2;57;;ggg;0;26;5;64;;ggg;0;26;221;361;;ccg;20;36;405
tta;97;495;71;61;;tcg;0;27;5;75;;tcg;0;27;134;304;;tcg;27;80;438
aga;108;574;134;73;;cgg;0;40;5;50;;cgg;0;40;84;285;;acg;25;66;480
ttg;114;543;64;126;;agg;0;41;5;64;;agg;0;41;212;582;;cta;92;75;486
acg;118;362;5;61;;gcg;1;12;11;49;;gcg;1;12;181;430;;ata;*0;59;564
cta;122;364;7;68;;ccg;1;19;0;36;;ccg;1;19;211;194;;tca;92;92;579
tcg;134;304;5;75;;cga;2;7;30;62;;cga;2;7;177;432;;ggg;26;69;582
tca;142;437;24;68;;gtg;3;10;21;73;;gtg;3;10;456;546;;tta;76;132;592
gta;148;487;6;58;;ttg;4;48;64;126;;ttg;4;48;114;543;;cga;9;92;609
tac;167;1,143;91;161;;gag;5;9;133;163;;gag;5;9;697;704;;gcg;13;60;611
cga;177;432;30;62;;§cct;6;32;51;104;;§cct;6;32;577;331;;gta;166;64;635
gcg;181;430;11;49;;§ctt;6;44;66;104;;§ctt;6;44;461;396;;ttg;52;190;657
ccg;211;194;0;36;;aag;7;17;279;147;;aag;7;17;824;803;;aga;54;207;682
agg;212;582;5;64;;aga;7;47;134;73;;aga;7;47;108;574;;ctg;75;89;711
ggg;221;361;5;64;;§act;7;58;221;111;;§act;7;58;398;623;;aca;104;100;716
aca;224;492;22;78;;cag;8;26;44;105;;cag;8;26;408;687;;agg;41;69;794
caa;317;625;97;99;;tgg;8;48;64;109;;tgg;8;48;389;547;;§ctt;50;170;857
gca;336;764;58;83;;§gtt;11;63;276;125;;§gtt;11;63;525;497;;cgt;145;238;884
ctg;346;365;13;76;;§tct;12;48;211;99;;§tct;12;48;506;414;;§cct;38;155;908
tgg;389;547;64;109;;cac;17;51;112;108;;cac;17;51;631;397;;agc;65;155;910
agc;390;520;31;124;;tgc;17;61;61;82;;tgc;17;61;822;1,023;;§tct;60;310;920
act;398;623;221;111;;agc;18;47;31;124;;agc;18;47;390;520;;tgg;56;173;936
cag;408;687;44;105;;tta;25;51;71;61;;tta;25;51;97;495;;caa;106;196;942
gtg;456;546;21;73;;§gct;26;40;248;141;;§gct;26;40;731;1,002;;cca;87;205;995
ctt;461;396;66;104;;ctg;27;48;13;76;;ctg;27;48;346;365;;gtg;13;94;1002
tct;506;414;211;99;;gga;28;56;46;100;;gga;28;56;557;484;;§act;65;332;1021
cgt;507;377;126;112;;tca;35;57;24;68;;tca;35;57;142;437;;§gtt;74;401;1022
gtt;525;497;276;125;;cta;36;56;7;68;;cta;36;56;122;364;;cac;68;220;1028
cca;531;464;56;149;;cca;39;48;56;149;;cca;39;48;531;464;;gga;84;146;1041
gaa;550;626;150;102;;ttc;44;57;111;185;;ttc;44;57;645;550;;cag;34;149;1095
aaa;554;859;52;103;;caa;48;58;97;99;;caa;48;58;317;625;;gca;159;141;1100
gga;557;484;46;100;;aca;50;54;22;78;;aca;50;54;224;492;;gaa;170;252;1176
cct;577;331;51;104;;tac;68;54;91;161;;tac;68;54;167;1,143;;ttc;101;296;1195
cac;631;397;112;108;;cgt;87;58;126;112;;cgt;87;58;507;377;;§att;144;378;1238
ttc;645;550;111;185;;§att;93;51;231;147;;§att;93;51;671;567;;tac;122;252;1310
att;671;567;231;147;;aac;100;63;170;127;;aac;100;63;801;791;;gag;14;296;1401
gag;697;704;133;163;;gca;104;55;58;83;;gca;104;55;336;764;;ggc;183;487;1411
gct;731;1,002;248;141;;gta;108;58;6;58;;gta;108;58;148;487;;aaa;175;155;1413
aac;801;791;170;127;;gac;113;60;267;142;;gac;113;60;844;727;;gac;173;409;1571
tgc;822;1,023;61;82;;gaa;115;55;150;102;;gaa;115;55;550;626;;aac;163;297;1592
aag;824;803;279;147;;aaa;122;53;52;103;;aaa;122;53;554;859;;aag;24;426;1627
gac;844;727;267;142;;ggc;127;56;360;127;;ggc;127;56;864;547;;§gct;66;389;1733
ggc;864;547;360;127;;atg;138;165;132;192;;atg;138;165;957;1,231;;tgc;78;143;1845
atg;957;1,231;132;192;;ata;*0;*0;*2;*57;;ata;*0;*0;91;473;;atg;303;324;2188
Tableau synthétique des corrélations diff et dif
modifier 
colonnes;;a;b;c;d;;a;b;c;d;;a;b;c;d;;a;b;c
corrélation;;a-c;a-d;b-c;b-d;;a-c;a-d;b-c;b-d;;a-c;a-d;b-c;b-d;;a-b;a-c;b-c
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
dif;;E/C;;db;dif;;B/C;;db;dif;;E/B;;db;dif;;total;;db+dif
groupes;;Ebe-tg;Efe-tg;Cb-tg;Cf-tg;;Bb-tg;Bf-tg;Cb-tg;Cf-tg;;Bb-tg;Bf-tg;Ebe-tg;Efe-tg;;Be;Ce;Ee
ccF;;0.684;0.717;0.374;0.571;;0.353;0.358;0.175;0.410;;0.436;0.455;0.393;0.504;;0.391;0.572;0.713
cTc;;0.768;0.845;0.577;0.789;;0.492;0.537;0.310;0.513;;0.585;0.599;0.502;0.568;;0.549;0.673;0.821
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
diff;;E/C;;db;diff;;B/C;;db;diff;;E/B;;db;diff;;total;;db+diff
groupes;;Ebet-tg;Efet-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Bbt-tg;Bft-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Bbt-tg;Bft-tg;Ebet-tg;Efet-tg;;B42t;C42t;E79t
ccF;;0.684;0.719;0.374;0.592;;0.353;0.378;0.236;0.432;;0.436;0.456;0.357;0.477;;0.404;0.548;0.718
cTc;;0.768;0.851;0.580;0.851;;0.492;0.553;0.494;0.760;;0.585;0.597;0.665;0.766;;0.641;0.741;0.852
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
100x(diff − dif);;E/C;;;;;B/C;;;;;E/B;;;;;total;;
ccF;;0.0;0.2;0.1;2.1;;0.0;2.0;6.1;2.2;;0.0;0.1;-3.6;-2.7;;1.3;-2.4;0.5
cTc;;0.0;0.6;0.3;6.2;;0.0;1.6;18.4;24.7;;0.0;-0.2;16.4;19.7;;9.3;6.8;3.1

Comparaison par les indices de multiplicité

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Bactéries de la base gtRNAdb et E79t diff
modifier

Légende: 

E79tm. Multiplicité de E79t-tg;;;;;;;;;E79tm9. E79tm / 8.91;;;;;;;
ttt;&0.65;tcc;@1.09;tat;&0.72;tgt;&0.86;;ttt;&0.07;tcc;@0.12;tat;&0.08;tgt;&0.10
atc;@0.90;acc;@0.86;aat;&0.95;agt;&1.01;;atc;@0.10;acc;@0.10;aat;&0.11;agt;&0.11
ctc;@0.14;ccc;@0.37;cat;&0.46;cgc;@0.30;;ctc;@0.02;ccc;@0.04;cat;&0.05;cgc;@0.03
gtc;@0.85;gcc;@0.87;gat;&0.96;ggt;&1.01;;gtc;@0.10;gcc;@0.10;gat;&0.11;ggt;&0.11
ttc;*15.13;tct;§11.65;tac;*16.58;tgc;$23.35;;ttc;*1.70;tct;§1.31;tac;*1.86;tgc;$2.62
att;*15.67;act;?12.92;aac;$20.15;agc;§11.52;;att;*1.76;act;?1.45;aac;$2.26;agc;§1.29
ctt;§10.85;cct;§11.49;cac;?13.01;cgt;§11.19;;ctt;§1.22;cct;§1.29;cac;?1.46;cgt;§1.26
gtt;?12.94;gct;$21.94;gac;$19.89;ggc;*17.86;;gtt;?1.45;gct;$2.46;gac;$2.23;ggc;*2.00
tta;°7.49;tca;°7.33;taa;ù0.95;tga;ù1.77;;tta;°0.84;tca;°0.82;taa;ù−;tga;ù0.20
ata;°7.14;aca;§9.06;aaa;*17.89;aga;§8.63;;ata;°0.8;aca;§1.02;aaa;*2.01;aga;§0.97
cta;£6.15;cca;?12.59;caa;§11.92;cga;°7.71;;cta;£0.69;cca;?1.41;caa;§1.34;cga;°0.87
gta;°8.04;gca;*13.92;gaa;*14.89;gga;?13.18;;gta;°0.9;gca;*1.56;gaa;*1.67;gga;?1.48
ttg;°8.32;tcg;£5.54;tag;ù1.03;tgg;§11.85;;ttg;°0.93;tcg;£0.62;tag;ù−;tgg;§1.33
atg;$27.7;acg;£6.08;aag;$20.59;agg;§10.05;;atg;$3.11;acg;£0.68;aag;$2.31;agg;§1.13
ctg;§9;ccg;£5.13;cag;*13.86;cgg;£4.67;;ctg;§1.01;ccg;£0.58;cag;*1.56;cgg;£0.52
gtg;?12.68;gcg;°7.73;gag;*17.73;ggg;°7.37;;gtg;?1.42;gcg;°0.87;gag;*1.99;ggg;°0.83
;;;;;;;;;;;;;;;;
I 1;B4032m. Multiplicité des bactéries;;;;;;;;Sensibilité relative en %.  -10, 521.;;;;;;;
ttt;&0.25;tct;&0.12;tat;&0.10;tgt;&0.07;;ttt;27;tcc;93;tat;77;tgt;123
att;&0.12;act;&2.55;aat;&0.12;agt;&0.02;;atc;77;acc;3;aat;81;agt;436
ctt;&9.15;cct;&0.25;cat;&0.10;cgc;@8.26;;ctc;-1;ccc;15;cat;48;cgc;-1
gtt;&0.22;gct;&0.05;gat;&0;ggt;&0.02;;gtc;40;gcc;187;gat;−;ggt;436
ttc;*1.51;tcc;§1.12;tac;*1.59;tgc;§1.11;;ttc;&12;tct;&17;tac;&17;tgc;*136
atc;$2.28;acc;§1.12;aac;$2.17;agc;§1.10;;att;&-23;act;&30;aac;&4;agc;&18
ctc;§0.95;ccc;£0.68;cac;*1.17;cgt;$1.85;;ctt;&28;cct;?90;cac;&25;cgt;&-32.3
gtc;§1.10;gcc;§1.03;gac;$2.24;ggc;$2.30;;gtt;&32.1;gct;*138;gac;&0;ggc;&-13
tta;*1.18;tca;*1.31;taa;ù−;tga;ù0.33;;tta;&-29;tca;§-37.4;taa;−;tga;-39
ata;ù0.01;aca;*1.46;aaa;$2.26;aga;*1.19;;ata;−;aca;§-30;aaa;&-11;aga;&-19
cta;*1.23;cca;*1.35;caa;*1.58;cga;£0.22;;cta;§-44;cca;&5;caa;&-16;cga;*293
gta;$2.2;gca;$2.53;gaa;$2.4;gga;*1.37;;gta;?-59;gca;§-38;gaa;&-30;gga;&8
ttg;§0.99;tcg;£0.65;tag;ù−;tgg;§1.08;;ttg;&-6;tcg;&-4;tag;−;tgg;&23
atg;$4.47;acg;£0.68;aag;£0.6;agg;§0.86;;atg;&-30;acg;&0;aag;*284;agg;&31.8
ctg;*1.29;ccg;£0.54;cag;£0.59;cgg;§0.83;;ctg;&-21;ccg;&6;cag;*163;cgg;§-37
gtg;£0.33;gcg;£0.3;gag;£0.34;ggg;£0.56;;gtg;*337;gcg;*186;gag;*478;ggg;§47
Bactéries de la base gtRNAdb et champignons C42t diff
modifier

Légende: 

C42tm. Multiplicité de C42t-tg;;;;;;;;;C42tm4. C42tm / 4.17;;;;;;;
ttt;&0.05;tcc;@0.02;tat;&0.05;tgt;&0.02;;ttt;&0.01;tcc;@0;tat;&0.01;tgt;&0
atc;@0.14;acc;@0;aat;&0.05;agt;&0;;atc;@0.03;acc;@0;aat;&0.01;agt;&0
ctc;@0.43;ccc;@0.02;cat;&0;cgc;@0;;ctc;@0.1;ccc;@0;cat;&0;cgc;@0
gtc;@0.02;gcc;@0;gat;&0.05;ggt;&0.05;;gtc;@0;gcc;@0;gat;&0.01;ggt;&0.01
ttc;$7.05;tct;$7.38;tac;*6.00;tgc;§3.4;;ttc;$1.69;tct;$1.77;tac;*1.44;tgc;§0.82
att;$9.00;act;$7.90;aac;$7.07;agc;§3.69;;att;$2.16;act;$1.89;aac;$1.7;agc;§0.88
ctt;*4.05;cct;§3.69;cac;*5.24;cgt;*5.67;;ctt;*0.97;cct;§0.88;cac;*1.26;cgt;*1.36
gtt;$9.55;gct;$9.26;gac;$9.74;ggc;$11.6;;gtt;$2.29;gct;$2.22;gac;$2.34;ggc;$2.78
tta;§3.14;tca;§2.19;taa;ù0.02;tga;ù0.29;;tta;§0.75;tca;§0.53;taa;ù0;tga;ù0.07
ata;£1.4;aca;§2.38;aaa;§3.69;aga;*4.93;;ata;£0.34;aca;§0.57;aaa;§0.88;aga;*1.18
cta;£1.79;cca;*4.88;caa;*4.67;cga;§2.19;;cta;£0.43;cca;*1.17;caa;*1.12;cga;§0.53
gta;£1.52;gca;*3.36;gaa;*6.00;gga;§3.48;;gta;£0.36;gca;§0.81;gaa;*1.44;gga;§0.83
ttg;*4.52;tcg;£1.9;tag;ù0.02;tgg;*4.12;;ttg;*1.08;tcg;£0.46;tag;ù0;tgg;*0.99
atg;$7.71;acg;£1.57;aag;$10.14;agg;£1.64;;atg;$1.85;acg;£0.38;aag;$2.43;agg;£0.39
ctg;§2.12;ccg;£0.86;cag;§3.55;cgg;£1.31;;ctg;§0.51;ccg;£0.21;cag;§0.85;cgg;£0.31
gtg;§2.24;gcg;£1.43;gag;$7.05;ggg;£1.64;;gtg;§0.54;gcg;£0.34;gag;$1.69;ggg;£0.39
;;;;;;;;;;;;;;;;
I 1;B4032m. Multiplicité des bactéries;;;;;;;;Sensibilité relative en %.  -16.1, 263.;;;-123;320;;;
ttt;&0.25;tct;&0.12;tat;&0.1;tgt;&0.07;;ttt;4;tcc;3;tat;12;tgt;6
att;&0.12;act;&2.55;aat;&0.12;agt;&0.02;;atc;29;acc;-1;aat;10;agt;-1
ctt;&9.15;cct;&0.25;cat;&0.1;cgc;@8.26;;ctc;0;ccc;1;cat;-1;cgc;-1
gtt;&0.22;gct;&0.05;gat;&0;ggt;&0.02;;gtc;1;gcc;-1;gat;-;ggt;52
ttc;*1.51;tcc;§1.12;tac;*1.59;tgc;§1.11;;ttc;&12;tct;?58;tac;&-10;tgc;&-27
atc;$2.28;acc;§1.12;aac;$2.17;agc;§1.10;;att;&-5;act;?69;aac;&-22;agc;&-19
ctc;§0.95;ccc;£0.68;cac;*1.17;cgt;$1.85;;ctt;&2;cct;&30;cac;&7;cgt;&-27
gtc;§1.10;gcc;§1.03;gac;$2.24;ggc;$2.3;;gtt;*108;gct;*115;gac;&4;ggc;&21
tta;*1.18;tca;*1.31;taa;ù−;tga;ù0.33;;tta;§-36;tca;?-60;taa;−;tga;-79
ata;ù0.01;aca;*1.46;aaa;$2.26;aga;*1.19;;ata;−;aca;?-61;aaa;?-61;aga;&-1
cta;*1.23;cca;*1.35;caa;*1.58;cga;£0.22;;cta;?-65;cca;&-13;caa;&-29;cga;*139
gta;$2.2;gca;$2.53;gaa;$2.4;gga;*1.37;;gta;?-83;gca;?-68;gaa;§-40;gga;§-39
ttg;§0.99;tcg;£0.65;tag;ù−;tgg;§1.08;;ttg;&9;tcg;&-30;tag;−;tgg;&-9
atg;$4.47;acg;£0.68;aag;£0.60;agg;§0.86;;atg;?-59;acg;§-45;aag;*304;agg;?-54
ctg;*1.29;ccg;£0.54;cag;£0.59;cgg;§0.83;;ctg;?-60;ccg;?-62;cag;§44;cgg;?-62
gtg;£0.33;gcg;£0.3;gag;£0.34;ggg;£0.56;;gtg;?65;gcg;&13;gag;*391;ggg;&-30

Tableaux des génomes, corrélations et indice double

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E79-Genomes. Correlations et indices des doublons

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E79;;;acs;;aga;;aml;;ath;;bacu;;bdi;;bta;;cbr;;cbre;;cel;;cfa;;cge;;cjap;;cjc;;cmk;;cpic;;cpo;;csi;;dme;;dno;;dsi;;dya;;ecb;;eeu;;fca;;gac;;gfr;;gga;;ggo;;gmo;;gmx;;hgl;;homo-18;;lav;;lcm;;lma;;mcc;;mdo;;meu;;mgp;;mlu;;mmr;;mmu;;mpu;;mtr;;mun;;nle;;oaa;;oas;;ocu;;oga;;oni;;opr;;osa;;pan;;pfa;;pha;;pma;;pop;;ppp;;ppy;;ptr;;rno;;san;;sbi;;sbq;;shr;;spu;;ssc;;str;;tgu;;tma;;tng;;tru;;tsy;;ttr;;vvi;;xtr;;zma;;;dre;
;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;;double;dif
Phe;AAA;ttt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;2;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;1;1;4;0;1;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;1;0;1;0;0;;0;9
Val;AAC;gtt;2;2;24;6;8;1;12;2;5;8;11;4;7;12;18;6;30;2;15;3;2;3;4;8;19;3;3;3;6;15;1;14;4;1;5;5;4;1;4;7;5;1;5;1;7;4;3;3;4;3;9;11;0;1;2;4;2;6;8;12;15;6;1;10;4;5;7;33;0;2;1;0;3;6;6;2;5;2;0;2;3;1;2;1;2;5;3;4;11;5;1;2;4;6;7;15;3;3;4;7;3;2;6;1;2;4;11;6;4;4;0;0;5;3;96;69;13;3;10;2;4;5;6;4;3;4;5;1;9;6;2;3;7;0;17;2;4;5;4;13;1;7;3;7;3;6;8;10;1;4;1;6;8;6;36;18;11;10;;146;85
Leu;AAG;ctt;2;1;3;1;2;4;9;2;4;1;7;6;6;4;21;4;29;2;14;5;3;0;3;1;22;3;4;3;6;13;0;1;3;1;3;2;3;0;3;1;4;0;4;0;5;1;4;1;5;0;31;17;1;2;0;2;4;4;11;21;15;0;2;2;5;3;4;17;1;2;2;0;2;6;5;2;2;2;0;0;1;1;3;1;2;2;4;1;3;5;0;2;4;5;3;4;3;2;2;2;3;0;5;8;2;2;11;3;4;3;0;0;4;4;56;55;13;35;5;0;6;9;5;5;0;0;4;1;11;3;4;2;6;2;5;12;5;2;3;2;0;1;3;4;2;12;3;7;3;2;5;0;5;4;20;17;19;9;;124;145
Ile;AAT;att;4;1;10;1;7;4;15;1;6;5;13;6;14;3;17;3;31;1;19;1;4;4;10;2;20;5;5;7;8;22;2;8;7;2;7;5;8;1;6;5;6;2;8;1;13;6;7;1;8;1;84;16;4;1;6;0;5;8;5;20;12;18;5;2;5;9;13;29;1;5;2;0;4;7;12;0;4;1;1;1;6;3;2;1;7;4;6;3;14;8;3;1;4;8;10;16;3;2;6;4;6;3;12;12;6;1;14;3;5;8;0;0;5;6;47;62;14;5;9;2;7;8;6;10;5;6;7;7;14;2;6;4;10;0;57;11;12;0;6;7;5;34;5;7;8;9;9;2;5;2;5;5;9;5;45;17;32;36;;129;128
Cys;ACA;tgt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;9;133;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;4;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;4;0;−;0;1;0;3;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;15;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;3;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;4;0;−;0;−;0;0;1;4;0;0;0;1;0;0;;0;8
Gly;ACC;ggt;0;−;0;−;0;−;0;−;1;10;0;−;0;19;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;23;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;3;0;−;0;3;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;1;0;4;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;6;0;0;0;8;0;−;0;−;0;−;1;17;0;−;0;−;0;−;;0;10
Arg;ACG;cgt;2;1;9;0;5;2;4;6;3;5;12;3;7;5;17;4;28;3;14;3;1;4;3;2;17;3;4;1;4;4;2;4;4;2;4;5;9;0;5;4;8;0;11;0;6;3;3;2;5;3;37;11;1;4;4;3;3;3;8;22;11;1;2;2;5;1;4;9;2;1;3;0;3;2;0;4;2;4;0;1;1;4;2;3;3;2;3;2;5;6;1;1;4;2;4;7;0;1;4;2;2;3;12;3;4;2;17;6;4;2;0;−;3;3;55;29;4;7;5;2;4;2;5;1;3;2;4;4;11;3;4;1;0;3;20;8;5;1;3;2;2;3;3;4;10;3;13;2;3;2;2;4;1;9;20;12;25;9;;147;55
Ser;ACT;agt;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;3;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;7;10;0;−;0;−;0;1;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;2;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;17;8;0;−;0;−;1;1;0;4;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;;3;10
Ser;AGA;tct;4;0;4;1;6;3;26;10;3;6;8;2;8;4;14;2;16;3;11;3;5;4;5;0;14;4;5;3;12;13;2;21;6;1;8;4;5;2;7;2;5;2;6;2;8;3;5;1;5;2;38;13;1;0;4;4;6;4;12;17;10;4;2;4;5;3;9;19;0;2;0;0;5;3;6;5;6;1;2;2;4;1;1;5;5;4;5;2;7;4;0;3;3;6;0;−;1;0;7;2;2;3;6;3;5;1;7;4;6;3;0;0;6;2;14;7;8;5;10;2;3;7;6;5;2;8;4;3;8;2;6;2;7;2;0;−;6;3;6;8;2;0;4;9;5;8;5;5;3;3;3;8;4;8;23;16;8;4;;160;175
Ala;AGC;gct;6;5;13;3;3;13;13;2;2;17;16;2;12;18;22;6;33;1;16;5;3;10;5;16;23;7;2;12;19;55;1;9;4;23;7;15;10;1;7;15;8;0;14;3;11;15;4;9;4;13;31;21;9;6;13;10;3;19;24;30;21;2;1;44;10;15;14;39;3;1;1;0;4;17;9;5;4;8;4;2;3;4;3;7;4;18;2;12;15;9;7;1;2;16;32;50;7;10;7;13;5;7;11;6;4;10;16;3;4;15;0;0;3;15;62;43;18;1;10;8;3;18;5;25;5;30;2;7;14;12;3;11;10;7;21;10;5;17;4;251;8;9;4;15;7;12;7;4;2;9;5;13;9;1;50;16;34;31;;66;25
Pro;AGG;cct;2;0;2;4;7;1;11;4;5;1;11;3;11;1;2;3;13;11;2;3;7;0;6;0;7;1;6;0;1;10;4;7;6;1;8;1;6;0;6;0;5;0;5;0;9;0;8;1;6;1;58;4;3;0;6;0;5;4;25;29;16;4;4;8;7;1;9;6;2;9;1;0;6;1;10;0;4;2;5;1;5;0;6;0;5;2;8;0;6;0;0;2;5;3;13;5;3;0;8;0;6;0;10;3;7;0;10;3;5;3;0;0;5;1;36;17;12;1;11;1;8;2;4;6;10;22;7;0;9;4;5;3;8;1;14;4;8;0;7;4;3;2;7;3;4;8;7;2;5;1;4;2;9;5;42;17;11;3;;177;137
Thr;AGT;act;1;2;7;0;4;5;7;2;4;8;2;6;4;9;20;1;26;4;14;2;2;5;1;6;17;6;1;8;7;16;1;15;0;9;3;6;6;2;1;9;7;0;7;0;2;6;2;6;3;5;49;49;2;2;0;3;2;6;10;19;3;5;0;14;3;5;1;12;3;7;2;0;3;6;6;5;3;4;0;3;2;2;0;2;2;8;2;7;8;1;1;3;3;8;7;15;0;4;2;5;1;7;6;11;1;5;8;2;4;6;0;−;4;5;29;32;2;4;8;1;4;7;2;7;2;6;2;5;3;8;2;6;4;4;14;12;6;6;2;31;2;5;1;14;9;16;7;10;2;6;2;6;4;5;76;74;7;12;;177;181
Tyr;ATA;tat;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;10;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;3;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;1;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;2;0;−;0;1;0;3;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;4;0;−;0;−;0;0;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;3;0;0;0;−;0;0;0;3;0;−;0;−;;1;3
Asp;ATC;gat;0;−;0;−;0;0;0;−;1;18;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;0;0;5;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;1;0;−;0;0;0;1;0;−;0;0;0;0;0;0;1;0;0;−;0;1;0;0;0;−;0;−;1;8;0;5;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;9;0;2;0;−;0;0;;4;6
His;ATG;cat;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;2;0;3;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;4;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;;0;−
Asn;ATT;aat;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;4;0;0;0;0;0;−;0;1;0;1;0;1;0;−;0;−;0;3;0;2;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;5;4;43;0;−;0;2;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;1;0;0;1;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;2;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−;;9;14
Leu;CAA;ttg;1;0;0;3;2;6;6;5;0;7;9;6;0;13;1;9;2;11;0;6;0;4;0;3;0;6;0;6;1;29;1;5;0;5;0;5;0;3;1;6;0;3;0;3;0;5;0;5;0;7;1;5;0;1;0;2;0;8;0;14;10;7;0;4;0;6;3;13;0;3;0;0;1;7;1;2;0;7;0;1;0;2;0;2;0;3;0;5;5;8;0;2;0;5;0;9;0;6;0;2;0;4;0;6;0;3;14;4;0;8;0;0;1;5;18;23;0;2;3;2;0;6;0;6;0;−;0;3;4;4;0;6;0;2;6;11;1;4;0;9;0;3;0;9;0;11;0;9;0;3;0;6;4;9;6;15;12;7;;123;117
Val;CAC;gtg;2;0;21;7;7;1;6;1;8;23;8;2;12;26;3;2;7;7;4;1;5;2;3;5;8;4;4;6;37;1502;0;5;3;2;4;10;5;1;5;75;4;1;8;2;9;5;2;1;6;2;7;10;1;1;2;4;5;5;9;18;11;1;3;2;7;5;9;25;1;2;1;0;4;7;6;2;3;3;0;2;4;0;3;1;4;7;3;3;2;4;2;1;4;8;5;4;2;6;10;3;3;1;7;1;5;1;7;3;6;5;0;0;6;5;46;24;6;4;2;8;7;10;4;9;2;4;3;3;8;2;2;5;6;3;0;−;7;4;3;35;0;0;3;12;7;8;16;12;2;3;3;18;6;4;25;27;13;2;;131;95
Leu;CAG;ctg;2;1;8;1;2;4;2;0;3;3;7;0;3;2;2;4;3;4;3;1;4;2;5;4;5;6;3;8;5;19;2;3;4;1;2;1;7;0;6;3;8;0;7;0;1;1;2;3;2;2;6;2;2;4;2;4;1;3;13;33;6;0;1;3;7;1;4;5;0;7;1;0;2;3;5;5;1;4;1;2;3;1;4;2;6;3;2;2;2;1;0;5;3;5;5;12;0;1;10;5;5;3;8;7;8;2;8;1;6;5;0;0;1;4;37;37;5;1;3;1;3;7;2;6;2;2;3;9;7;3;2;2;5;3;2;2;3;1;2;1;3;3;1;3;18;18;14;6;3;3;1;4;4;2;17;14;10;2;;161;138
Met;CAT;atg;4;7;13;4;11;12;16;15;8;12;25;30;16;18;18;4;24;4;16;2;6;16;7;8;25;4;7;12;20;73;5;10;5;9;11;14;8;3;10;19;8;3;11;3;12;12;10;5;9;14;221;64;2;3;8;5;10;6;42;111;22;13;6;7;11;8;16;33;3;7;2;1;5;13;14;10;7;6;7;3;8;5;8;5;8;10;6;13;18;22;6;2;7;9;14;17;4;13;8;9;5;7;20;6;11;3;31;28;8;10;0;1;9;5;187;90;18;7;15;8;9;12;9;13;7;5;7;7;9;29;8;6;14;7;43;29;12;10;7;6;2;2;7;13;8;11;24;11;7;4;6;10;6;19;99;38;31;47;;348;173
Trp;CCA;tgg;3;3;5;0;3;6;11;4;13;242;12;5;5;172;12;0;19;2;9;2;0;5;2;3;14;3;1;9;10;19;1;8;1;6;4;3;6;1;3;11;7;1;6;1;3;3;2;4;1;21;47;26;0;2;3;2;2;6;10;18;15;2;1;4;2;4;6;16;2;12;0;0;3;5;3;5;1;6;2;2;2;1;2;3;2;5;2;8;7;6;1;2;0;9;5;8;2;44;3;6;0;5;7;4;2;3;11;6;4;5;0;−;3;4;1;7;12;1;8;0;1;8;3;4;1;6;1;4;10;2;1;6;3;4;5;12;3;3;3;3;0;2;2;10;5;6;7;9;2;3;9;207;9;0;21;11;20;6;;22;21
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Ser;CGA;tcg;0;1;7;0;0;3;3;3;0;3;4;0;0;6;4;3;3;5;3;2;1;6;0;2;10;4;0;3;0;47;1;8;1;2;0;3;3;0;0;5;2;0;4;0;0;3;0;2;0;4;23;5;0;0;1;0;0;4;1;12;4;1;0;2;0;3;1;2;0;2;0;0;0;3;0;2;0;1;0;0;0;1;0;2;0;2;0;3;1;0;0;1;0;4;1;6;0;2;1;3;0;2;1;4;1;2;3;5;0;2;0;0;0;2;18;16;1;3;5;1;1;4;0;3;0;2;0;3;4;5;0;2;0;2;1;4;0;3;0;5;0;0;1;2;1;1;0;4;0;2;0;3;2;0;13;9;3;2;;36;43
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Pro;CGG;ccg;1;0;7;5;3;1;2;2;2;1;5;2;3;0;2;1;4;4;3;0;2;1;2;0;7;0;3;0;0;40;0;1;2;0;2;1;2;2;1;2;2;2;3;1;1;1;2;0;2;4;13;4;0;0;1;1;3;0;10;11;3;1;1;1;2;1;2;0;0;3;1;0;2;0;2;0;1;0;0;0;2;0;2;0;2;0;1;0;0;0;0;1;3;0;4;2;0;0;3;0;2;0;2;1;3;0;3;5;3;0;0;0;3;0;12;8;2;1;0;4;3;1;3;1;2;0;1;0;4;3;3;0;2;0;4;4;2;0;2;0;1;0;2;0;1;3;2;3;1;2;2;1;1;2;19;16;5;3;;89;90
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Cys;GCA;tgc;8;3;4;0;13;11;4;13;5;18;6;8;25;312;14;1;16;4;11;1;9;11;24;16;12;2;9;22;5;9;4;13;18;15;4;19;3;3;9;12;4;2;5;2;10;14;14;19;13;18;72;34;5;4;6;4;5;29;8;18;13;0;5;17;6;22;5;22;3;13;0;0;8;19;31;14;19;9;2;2;17;9;11;8;32;27;15;9;7;2;0;4;9;13;18;18;5;55;9;15;10;10;8;33;6;3;8;8;12;17;0;−;13;14;38;29;8;5;2;4;9;24;9;23;26;13;13;11;6;6;10;10;2;5;20;10;10;12;29;18;5;3;2;19;7;7;5;9;6;18;2;19;5;5;46;45;10;14;;98;37
Gly;GCC;ggc;5;1;14;0;8;1;16;8;13;50;19;8;8;54;16;4;25;13;10;3;8;2;9;4;24;9;9;5;12;6;5;5;6;4;8;1;12;1;10;8;13;1;14;1;9;0;10;3;7;2;10;1;7;0;5;1;5;7;17;12;26;2;6;3;9;4;7;25;2;4;3;0;6;8;19;4;7;8;4;0;6;1;8;2;9;5;7;1;19;3;4;5;5;7;17;22;3;26;18;2;7;4;8;4;11;5;19;8;10;9;0;−;6;6;29;24;21;4;13;2;8;5;6;6;7;3;11;10;18;5;7;4;16;2;26;15;9;9;7;5;7;4;5;17;5;8;15;2;9;4;6;36;11;5;70;14;30;2;;391;444
Arg;GCG;cgc;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;6;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;2;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;8;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;2;0;−;;17;6
Ser;GCT;agc;2;2;4;1;3;9;7;8;3;9;12;5;8;10;6;2;9;4;6;2;2;5;3;5;12;2;3;4;10;22;1;18;3;6;7;5;4;1;3;6;1;1;4;3;5;6;4;2;4;7;14;15;3;2;3;3;4;3;0;−;16;11;2;4;2;5;7;68;1;6;0;1;4;3;7;1;6;3;1;4;2;2;2;4;2;5;4;7;6;8;0;7;3;5;6;11;1;5;7;2;2;4;5;4;4;2;14;5;4;6;0;0;4;4;34;30;10;5;6;2;4;3;3;5;5;6;4;3;7;5;3;3;6;1;14;2;6;3;2;4;2;2;2;33;5;5;6;12;2;6;3;7;7;1;40;58;10;3;;161;262
Ser;GGA;tcc;0;−;0;−;0;−;1;1;0;0;1;2;4;27;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;14;26;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;1;1;0;0;1;2;0;3;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;3;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;1;2;0;−;0;−;0;2;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;5;17;0;−;0;−;0;−;0;0;1;1;10;11;;0;1
Ala;GGC;gcc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;3;164;0;0;0;3;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;3;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;1;0;−;4;6;0;−;0;−;0;−;0;−;1;29;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;;1;2
Pro;GGG;ccc;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;1;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;5;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;1;0;3;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;;4;7
Thr;GGT;acc;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;2;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;11;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;2;1;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;5;2;0;−;0;−;0;−;8;10;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;4;0;4;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;1;0;−;8;4;;0;−
Tyr;GTA;tac;0;5;1;20;1;9;50;32;0;13;3;13;1;37;13;5;20;7;7;11;0;8;0;10;22;1;10;24;7;28;0;4;4;10;0;10;0;8;3;10;0;9;0;8;4;9;0;12;1;8;4;12;4;7;3;12;1;21;3;46;1;19;0;6;0;12;0;18;0;7;1;1;0;30;2;12;0;7;2;3;0;4;0;7;0;10;0;8;2;10;2;4;0;18;2;25;0;15;0;11;1;6;0;17;0;9;3;16;1;22;0;0;2;12;40;49;2;15;1;6;1;27;2;28;0;1;0;8;0;13;0;14;1;9;7;16;3;13;0;8;3;9;0;14;2;10;1;13;0;9;1;16;0;18;59;47;3;17;;136;99
Asp;GTC;gac;6;1;18;1;5;5;21;7;7;37;21;4;9;32;27;6;31;2;20;6;9;3;10;4;32;8;8;5;14;34;4;9;6;3;6;6;11;2;12;8;5;0;14;2;5;4;9;3;7;1;135;48;1;3;7;2;7;7;15;14;25;7;4;5;10;2;6;13;3;15;2;0;6;8;12;11;1;11;2;0;5;2;3;1;12;3;4;3;16;13;4;4;5;7;13;13;2;5;17;5;9;3;6;3;11;2;20;10;8;6;0;0;6;3;56;33;29;4;8;2;7;5;7;9;12;2;9;9;20;3;6;4;12;6;62;19;14;82;5;2;3;3;4;10;6;12;18;5;6;6;5;43;11;11;46;12;30;11;;107;42
His;GTG;cac;3;1;16;4;7;0;6;5;7;3;14;6;14;4;18;2;21;4;13;5;7;1;11;2;12;4;5;3;10;26;2;7;6;1;8;1;4;0;6;3;4;1;4;0;8;2;4;0;8;7;33;18;0;3;2;3;6;0;10;15;15;2;5;1;8;0;14;12;2;2;1;0;10;3;8;0;6;0;0;2;4;2;3;2;7;2;5;1;10;7;0;3;7;3;4;19;3;4;8;0;7;0;9;13;4;0;16;9;9;0;0;−;9;0;15;11;9;3;6;2;7;3;8;1;9;0;6;0;8;6;5;3;8;0;17;8;7;2;4;1;2;2;7;4;4;7;10;8;5;4;4;4;5;8;24;17;18;7;;224;162
Asn;GTT;aac;6;3;10;1;10;17;10;8;17;6;10;5;16;13;20;2;28;4;17;2;8;12;8;8;20;2;9;17;16;31;5;11;9;8;10;3;9;0;17;5;5;0;10;0;9;7;5;1;7;20;82;40;1;4;5;5;9;19;16;17;12;9;5;3;8;16;14;36;2;6;2;0;6;20;9;3;10;3;2;1;7;1;4;4;8;4;4;7;14;15;4;4;7;13;10;10;8;4;11;14;8;3;8;0;9;4;17;12;9;19;0;0;8;9;100;67;11;12;9;4;11;29;9;23;8;6;8;3;9;6;5;6;12;0;30;8;10;7;7;1;3;4;5;17;6;10;10;12;6;8;7;5;7;13;28;18;31;17;;575;469
Leu;TAA;tta;0;1;1;4;1;3;3;2;1;11;2;1;0;9;2;3;4;2;1;2;0;3;0;3;0;4;0;10;1;11;0;12;0;3;0;4;0;3;0;7;0;2;1;3;0;3;0;2;0;18;4;7;0;10;0;2;1;7;1;14;4;4;0;3;0;3;1;13;0;10;0;0;1;14;0;1;0;2;0;0;0;1;0;2;2;4;0;3;3;4;1;2;0;7;3;6;0;4;1;4;0;2;0;11;0;2;1;2;0;9;0;0;0;6;2;2;1;5;1;0;0;7;2;8;0;2;0;3;0;3;0;8;0;5;5;8;0;3;0;2;1;2;0;5;1;3;0;6;29;12;0;5;2;6;11;34;2;2;;19;53
Val;TAC;gta;0;1;2;0;0;6;4;2;0;17;2;2;2;18;2;3;3;4;1;3;0;4;1;3;2;4;1;4;29;115;0;4;1;1;0;6;1;0;0;15;1;0;1;0;0;5;0;5;0;5;4;7;0;0;0;2;0;7;0;8;5;3;1;2;1;3;11;38;0;6;0;0;1;5;1;3;0;0;0;1;0;2;0;1;2;0;0;5;2;4;0;0;0;5;2;12;0;7;3;4;1;1;2;6;0;3;3;0;2;4;0;0;2;4;7;18;5;2;1;0;2;4;0;9;1;1;0;4;2;1;1;3;1;2;5;5;2;8;1;3;0;1;0;25;1;2;2;6;1;2;0;15;1;3;17;18;2;1;;171;58
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Arg;TCG;cga;0;2;4;3;2;81;4;1;1;7;4;0;1;10;4;5;11;5;4;3;0;14;2;3;6;4;0;3;3;21;1;3;0;3;1;3;6;3;1;6;2;2;5;1;1;2;1;3;7;1193;65;13;0;1;0;1;1;4;2;14;6;2;0;3;0;5;4;13;0;3;0;0;0;4;2;2;2;2;0;0;1;3;1;1;1;3;1;27;3;1;0;0;0;6;2;4;0;5;2;2;0;3;0;6;1;4;2;1;0;4;0;0;1;4;17;8;5;1;2;4;1;4;0;5;1;3;0;4;3;0;0;3;2;2;9;9;2;2;0;4;0;2;0;11;0;6;0;6;0;4;0;6;3;2;25;7;3;3;;57;49
Arg;TCT;aga;0;2;0;1;0;16;1;8;0;54;2;6;0;43;7;2;10;2;5;2;0;8;0;4;9;2;0;5;0;13;1;24;0;4;0;5;0;2;0;8;0;3;0;2;0;4;0;4;0;53;43;24;0;2;0;3;0;4;2;18;10;7;0;5;0;5;0;89;0;8;0;0;0;5;0;5;1;5;0;2;1;3;0;4;0;5;1;14;2;5;0;3;0;6;0;5;0;21;0;5;0;3;1;25;0;4;6;5;0;5;0;0;0;5;8;9;5;5;4;2;2;5;0;5;0;5;0;5;2;5;0;5;0;4;9;8;1;5;0;4;0;3;1;121;0;9;1;11;0;5;0;47;3;2;52;52;3;5;;113;138
Ser;TGA;tca;0;0;1;0;0;5;6;5;0;4;5;4;0;6;3;4;7;6;2;6;0;4;0;2;4;2;1;3;3;50;0;14;1;1;2;2;0;1;1;4;0;1;0;1;0;3;0;2;1;12;43;18;0;2;1;2;0;4;3;14;6;4;0;2;0;3;0;6;0;5;0;0;4;15;1;4;2;1;0;2;0;1;0;1;1;1;0;3;4;3;1;3;0;5;0;5;0;3;0;3;1;1;1;8;0;2;10;6;0;8;0;0;0;4;10;9;4;4;2;2;0;7;0;8;0;3;0;2;7;5;1;4;0;4;6;8;0;4;0;6;0;3;0;5;0;8;0;7;0;4;0;5;5;2;22;18;6;4;;92;116
Ala;TGC;gca;0;5;1;1;2;6;7;2;0;41;7;5;4;30;13;0;7;3;7;1;3;7;1;13;6;4;1;4;2889;3008;3;11;2;6;1;11;0;1;2;63;0;−;1;0;2;8;0;9;1;8;36;16;0;4;3;3;1;5;4;19;12;4;1;3;1;6;6;46;1;18;0;0;0;10;3;5;0;5;2;3;0;0;0;4;3;7;1;6;8;7;0;4;0;10;6;10;0;11;0;8;2;4;5;5;1;5;9;0;0;9;0;0;0;8;21;9;13;7;7;1;2;6;1;8;3;5;1;6;8;4;1;6;3;3;10;6;2;11;0;38;2;4;3;36;2;8;3;4;0;3;0;35;16;20;29;17;8;6;;265;102
Pro;TGG;cca;2;0;6;1;3;7;41;5;2;2;8;9;6;2;30;10;48;5;23;7;1;6;4;1;33;9;3;2;7;43;1;2;2;1;4;2;4;0;5;1;3;1;7;0;4;2;3;1;4;63;22;6;1;3;1;2;3;3;6;14;20;6;1;3;4;2;2;11;3;6;0;0;3;6;5;2;3;0;0;1;0;2;1;2;3;4;1;5;8;2;1;2;2;2;3;8;2;3;2;2;1;2;6;4;1;2;5;8;2;3;0;0;2;3;29;13;13;9;6;1;3;5;4;5;4;1;2;3;6;4;2;2;5;0;15;5;2;1;2;4;0;0;3;4;4;9;4;4;0;31;2;2;8;7;36;16;13;17;;108;96
Thr;TGT;aca;1;1;1;0;1;7;4;4;1;6;2;7;2;7;6;3;12;2;9;1;1;2;1;2;7;4;0;6;49;156;1;16;1;2;2;5;4;1;1;6;3;1;4;1;2;4;0;5;1;11;19;15;0;3;1;2;1;4;6;23;5;4;0;3;0;5;5;16;1;7;0;0;0;5;5;1;3;2;0;1;2;2;0;2;1;2;1;5;3;6;0;1;0;5;2;15;1;3;1;5;1;4;3;21;1;4;9;6;0;7;0;0;0;6;10;8;5;5;1;3;0;3;1;4;1;3;0;4;4;7;1;5;4;2;11;9;3;4;2;3;1;2;1;16;3;8;1;5;0;3;1;4;2;5;48;42;8;5;;151;138
Stp;TTA;taa;0;−;0;0;0;0;0;0;0;23;0;−;0;3;0;−;0;−;0;−;0;2;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;1;35;0;−;0;−;0;−;1;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;1;2;29;0;0;0;2;0;2;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;2;0;−;0;0;1;0;0;0;0;−;0;0;0;1;0;−;0;−;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;2;0;19;0;0;0;1;0;−;;1;4
Glu;TTC;gaa;5;1;8;2;4;6;7;8;47;2320;8;6;11;423;15;3;27;8;14;2;4;10;2;4;16;3;3;17;7;58;0;16;2;3;4;6;5;0;5;14;2;2;5;1;5;5;3;4;4;10;22;23;0;3;2;6;3;12;12;38;12;3;2;3;3;4;7;106;2;8;0;0;2;9;10;3;6;5;1;3;1;3;3;5;5;2;1;5;13;8;0;2;2;11;3;12;3;135;9;8;1;3;6;7;3;3;10;5;7;5;0;0;6;6;3;8;13;0;5;1;9;14;6;11;5;4;1;8;8;4;4;16;10;4;18;7;30;204;2;2;0;1;2;111;3;12;4;8;2;6;29;1871;5;9;60;23;12;9;;128;96
Gln;TTG;caa;0;2;2;1;1;41;6;3;2;7;7;7;2;17;19;4;29;10;15;4;1;41;1;3;11;2;0;6;1;5;1;14;2;1;2;2;2;1;2;2;2;1;3;0;2;3;1;2;5;776;47;12;0;1;0;1;1;9;3;7;10;2;0;2;2;3;3;10;1;8;0;0;1;14;0;6;1;2;0;0;0;2;1;2;1;5;2;34;10;9;1;0;2;7;3;7;0;6;2;2;1;3;1;4;2;2;9;11;2;11;0;0;2;3;23;20;10;0;3;6;0;12;3;16;1;4;2;2;3;7;0;7;16;28;10;6;3;5;2;1;0;1;2;5;4;4;3;6;13;50;4;11;3;6;20;7;8;13;;59;45
Lys;TTT;aaa;2;2;3;4;5;49;10;5;4;81;3;8;10;67;11;4;20;8;13;0;6;27;5;9;23;6;5;10;5;37;4;31;4;6;4;10;4;1;4;13;2;1;3;2;7;7;6;4;5;44;30;30;2;1;2;3;3;10;17;45;15;4;3;4;4;7;14;45;7;12;0;0;6;12;9;3;3;6;2;1;1;1;3;1;8;5;6;24;7;12;1;1;8;14;7;24;5;16;4;7;4;6;9;6;3;5;4;7;6;12;0;−;6;5;17;6;13;4;4;3;8;14;6;13;0;0;5;2;3;7;4;13;8;5;37;19;15;22;5;4;3;0;5;25;4;10;7;12;4;5;4;69;5;5;51;20;14;67;;275;249
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
corrélation;;;0.23;;0.10;;0.35;;0.68;;0.88;;0.44;;0.57;;0.25;;0.09;;0.35;;0.36;;0.38;;0.67;;0.56;;0.61;;0.37;;0.43;;0.15;;-0.11;;0.06;;-0.27;;0.02;;0.20;;0.77;;0.30;;0.81;;0.20;;0.44;;0.38;;0.76;;0.17;;0.06;;0.27;;0.06;;0.44;;0.17;;0.31;;0.40;;0.25;;0.30;;0.42;;0.30;;0.67;;0.13;;0.30;;0.29;;0.43;;0.77;;0.14;;0.26;;0.14;;0.14;;-0.11;;0.63;;0.34;;−;;0.35;;0.91;;0.22;;0.23;;0.53;;0.56;;0.44;;0.43;;0.25;;0.26;;0.36;;0.63;;0.76;;0.07;;0.43;;0.19;;0.52;;0.32;;0.40;;0.88;;0.53;;0.71;;0.60;;;0.91;
total;;;92;72;284;94;172;1250;431;217;342;6717;381;215;320;3678;530;169;817;226;416;133;139;723;173;276;607;173;146;290;3402;10269;74;426;140;194;161;308;195;54;190;878;161;55;228;58;194;250;163;276;158;3561;1694;747;63;94;114;122;129;324;452;990;501;189;85;230;164;221;253;1695;59;266;34;4;132;341;259;175;144;160;50;60;110;96;105;107;185;230;124;582;319;308;52;102;125;327;276;529;79;1045;225;231;124;153;273;351;150;142;438;260;174;301;0;1;156;203;1401;1032;387;208;249;128;175;381;161;392;160;198;146;181;334;237;117;226;230;171;639;381;236;522;146;602;78;148;111;1851;205;357;271;294;135;271;231;5586;236;290;1588;997;601;548;;6569;5642
idble;;;1.28;;3.02;;0.14;;1.99;;0.05;;1.77;;0.09;;3.14;;3.62;;3.13;;0.19;;0.63;;3.51;;0.50;;0.33;;0.17;;0.72;;0.52;;3.61;;0.22;;2.93;;3.93;;0.78;;0.59;;0.04;;2.27;;0.67;;0.93;;0.40;;0.46;;2.65;;0.37;;0.74;;0.15;;0.22;;8.50;;0.39;;1.48;;0.90;;0.83;;1.15;;0.98;;0.80;;0.21;;1.04;;0.51;;0.38;;0.52;;0.08;;0.97;;0.81;;0.78;;1.06;;1.68;;0.58;;0.00;;0.77;;1.36;;1.86;;1.95;;0.46;;0.41;;0.81;;0.81;;1.41;;0.52;;1.35;;1.68;;0.45;;0.24;;0.53;;0.06;;0.57;;0.92;;0.50;;0.04;;0.81;;1.59;;1.10;;;1.16;
total tRNAs;;;164;;378;;1422;;648;;7059;;596;;3998;;699;;1043;;549;;862;;449;;780;;436;;13671;;500;;334;;469;;249;;1068;;216;;286;;444;;439;;3719;;2441;;157;;236;;453;;1442;;690;;315;;385;;1948;;325;;38;;473;;434;;304;;110;;206;;212;;415;;706;;627;;154;;452;;805;;1124;;456;;277;;624;;292;;698;;475;;1;;359;;2433;;595;;377;;556;;553;;358;;327;;571;;343;;401;;1020;;758;;748;;226;;1962;;562;;565;;406;;5817;;526;;2585;;1149;;;;
;;;acs;;aga;;aml;;ath;;bacu;;bdi;;bta;;cbr;;cbre;;cel;;cfa;;cge;;cjap;;cjc;;cmk;;cpic;;cpo;;csi;;dme;;dno;;dsi;;dya;;ecb;;eeu;;fca;;gac;;gfr;;gga;;ggo;;gmo;;gmx;;hgl;;hsa-18;;lav;;lcm;;lma;;mcc;;mdo;;meu;;mgp;;mlu;;mmr;;mmu;;mpu;;mtr;;mun;;nle;;oaa;;oas;;ocu;;oga;;oni;;opr;;osa;;pan;;pfa;;pha;;pma;;pop;;ppp;;ppy;;ptr;;rno;;san;;sbi;;sbq;;shr;;spu;;ssc;;str;;tgu;;tma;;tng;;tru;;tsy;;ttr;;vvi;;xtr;;zma;;;dre;
;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;;double;dif
E79 génomes. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
modifier
  • Lien au tableaux: E79 génomes. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
  • Méthode: remplacement manuel. S'il faut recalculer les corrélations et les totaux par colonne, il suffit de copier le "lien tableur" de ce tableau dans un tableur puis remplacer tout "*" et ":" par rien (ctrl+H), récupérer les résultats et non le tableau. S'il nécessaire de republier le tableau, reprendre "le lien tableur" sans supprimer les "*" et les ":", puis faire les modifications nécessaires avant de publier.
  • Légende:
    Couleurs pour effectif supérieur à 49 remplacé par la méthode des 4 proches voisins (ref.).
  • Total des codons par génome:Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
E79;double;acs;double;aga;double;aml;double;ath;double;bacu;double;bdi;double;bta;double;cbr;E79;double;cbre;double;cel;double;cfa;double;cge;double;cjap;double;cjc;double;cmk;double;cpic;E79;double;cpo;double;csi;double;dme;double;dno;double;dsi;double;dya;double;ecb;double;eeu;E79;double;fca;double;gac;double;gfr;double;gga;double;ggo;double;gmo;double;gmx;double;hgl;E79;double;hsa-18;double;lav;double;lcm;double;lma;double;mcc;double;mdo;double;meu;double;mgp;E79;double;mlu;double;mmr;double;mmu;double;mpu;double;mtr;double;mun;double;nle;double;oaa;E79;double;oas;double;ocu;double;oga;double;oni;double;opr;double;osa;double;pan;double;pfa;E79;double;pha;double;pma;double;pop;double;ppp;double;ppy;double;ptr;double;rno;double;san;E79;double;sbi;double;sbq;double;shr;double;spu;double;ssc;double;str;double;tgu;double;tma;E79;double;tng;double;tru;double;tsy;double;ttr;double;vvi;double;xtr;double;zma
'''aaa;2;2;3;4;5;*17;10;5;4;*11;3;8;10;*5;11;4;'''aaa;20;8;13;0;6;27;5;9;23;6;5;10;5;37;4;31;'''aaa;4;6;4;10;4;1;4;13;2;1;3;2;7;7;6;4;'''aaa;5;44;30;30;2;1;2;3;3;10;17;§9;15;4;3;4;'''aaa;4;7;14;45;7;12;0;0;6;12;9;3;3;6;2;1;'''aaa;1;1;3;1;8;5;6;24;7;12;1;1;8;14;7;24;'''aaa;5;16;4;7;4;6;9;6;3;5;4;7;6;12;0;−;'''aaa;6;5;17;6;13;4;4;3;8;14;6;13;0;0;5;2;'''aaa;3;7;4;13;8;5;37;19;15;22;5;4;3;0;5;25;'''aaa;4;10;7;12;4;5;4;*11;5;5;*16;20;14;*16
'''aac;6;3;10;1;10;17;10;8;17;6;10;5;16;13;20;2;'''aac;28;4;17;2;8;12;8;8;20;2;9;17;16;31;5;11;'''aac;9;8;10;3;9;0;17;5;5;0;10;0;9;7;5;1;'''aac;7;20;*12;40;1;4;5;5;9;19;16;17;12;9;5;3;'''aac;8;16;14;36;2;6;2;0;6;20;9;3;10;3;2;1;'''aac;7;1;4;4;8;4;4;7;14;15;4;4;7;13;10;10;'''aac;8;4;11;14;8;3;8;0;9;4;17;12;9;19;0;0;'''aac;8;9;*29;*12;11;12;9;4;11;29;9;23;8;6;8;3;'''aac;9;6;5;6;12;0;30;8;10;7;7;1;3;4;5;17;'''aac;6;10;10;12;6;8;7;5;7;13;28;18;31;17
'''aag;3;2;15;1;12;*6;14;4;5;23;16;1;15;24;36;3;'''aag;45;3;24;5;10;*11;11;*8;30;6;4;11;11;24;2;6;'''aag;7;18;6;15;12;0;13;29;10;0;12;3;8;7;28;*10;'''aag;8;*15;*11;22;1;5;4;1;5;13;20;22;20;1;4;10;'''aag;5;9;14;21;4;8;2;1;7;8;10;8;8;2;1;1;'''aag;4;6;4;1;7;18;5;*10;13;2;3;9;6;13;10;14;'''aag;5;10;9;19;4;4;22;20;4;6;15;4;6;10;0;−;'''aag;6;5;13;9;15;1;11;4;8;18;8;17;10;8;6;6;'''aag;15;6;3;6;9;22;30;11;7;8;7;4;1;4;7;8;'''aag;10;10;13;6;0;6;3;15;5;10;*11;22;36;*6
'''aat;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;'''aat;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;'''aat;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;'''aat;0;4;0;0;0;0;0;−;0;1;0;1;0;1;0;−;'''aat;0;−;0;3;0;2;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;'''aat;0;−;0;−;0;−;0;5;4;$5;0;−;0;2;0;−;'''aat;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;'''aat;0;0;0;−;0;−;0;0;1;0;0;1;0;−;0;−;'''aat;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;2;0;0;'''aat;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−
'''aca;1;1;1;0;1;7;4;4;1;6;2;7;2;7;6;3;'''aca;12;2;9;1;1;2;1;2;7;4;0;6;*13;*8;1;16;'''aca;1;2;2;5;4;1;1;6;3;1;4;1;2;4;0;5;'''aca;1;11;19;15;0;3;1;2;1;4;6;23;5;4;0;3;'''aca;0;5;5;16;1;7;0;0;0;5;5;1;3;2;0;1;'''aca;2;2;0;2;1;2;1;5;3;6;0;1;0;5;2;15;'''aca;1;3;1;5;1;4;3;21;1;4;9;6;0;7;0;0;'''aca;0;6;10;8;5;5;1;3;0;3;1;4;1;3;0;4;'''aca;4;7;1;5;4;2;11;9;3;4;2;3;1;2;1;16;'''aca;3;8;1;5;0;3;1;4;2;5;§13;§8;8;5
'''acc;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;2;0;0;0;0;−;'''acc;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;$4;0;−;'''acc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;'''acc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;1;'''acc;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;'''acc;0;−;0;−;0;−;0;−;2;1;0;−;0;−;0;0;'''acc;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;5;2;0;−;0;−;'''acc;0;−;$5;$4;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;'''acc;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;4;0;4;0;0;'''acc;0;−;0;−;0;−;0;0;0;1;0;−;5;4
'''acg;0;0;3;2;0;9;2;3;0;3;2;3;0;6;5;3;'''acg;6;3;2;4;0;4;0;3;8;2;0;3;4;*3;0;4;'''acg;0;2;0;4;2;0;0;6;2;1;4;0;0;2;0;3;'''acg;0;8;14;8;0;0;0;1;1;4;7;22;2;1;0;3;'''acg;0;4;0;9;0;1;1;0;0;3;0;2;0;2;0;−;'''acg;0;2;0;1;0;3;0;4;0;0;0;−;0;4;2;7;'''acg;0;2;0;4;0;2;1;6;0;6;3;1;0;6;0;0;'''acg;0;5;11;11;2;1;3;2;0;6;0;5;0;3;0;4;'''acg;3;2;0;4;0;1;4;4;0;3;0;6;0;1;0;3;'''acg;3;9;1;6;0;3;0;2;1;1;15;13;4;1
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C42-Genomes. Correlations et indices des doublons

modifier 
C42;;;ani;;aor;;bfu;;cal;;cgr;;cjd;;cneg;;cot;;dha;;ecu;;ede;;fgr;;fgr5;;fve;;fvr;;kaf;;kpa;;kla;;kna;;lkl;;lth;;mfa;;mgr;;mth;;ncr;;ncs;;opa;;pch;;pic;;sas;;sce;;spo;;sre;;tbl;;tdl;;tpf;;ttt;;uma;;vda;;vma;;yli;;zro;
;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif
Phe;AAA;ttt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
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Ile;AAT;att;2;4;5;4;0;7;0;5;8;0;5;0;1;4;3;0;8;0;0;0;0;1;8;4;6;4;9;1;4;6;12;0;4;0;6;0;6;0;10;1;9;0;10;1;0;7;0;7;0;16;11;0;3;0;7;2;6;0;8;0;12;0;6;1;0;3;13;3;7;0;9;0;0;5;2;1;8;0;0;6;14;11;9;1
Cys;ACA;tgt;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
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Arg;ACG;cgt;6;2;10;1;1;4;0;1;3;0;3;2;0;2;0;1;3;1;0;0;0;1;8;1;8;1;2;10;8;1;2;1;0;1;2;0;1;1;4;0;2;1;1;2;0;5;0;6;19;1;3;1;0;1;9;0;2;0;3;0;4;1;7;0;0;3;3;0;3;0;2;0;0;5;0;3;4;4;0;5;0;0;3;1
Ser;ACT;agt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Ser;AGA;tct;4;0;4;2;6;0;3;0;8;0;6;0;1;4;0;1;5;0;0;0;0;0;5;5;5;5;3;3;6;3;8;2;3;0;5;0;6;0;4;6;8;0;7;2;0;3;1;3;12;1;10;1;1;0;3;3;5;0;6;0;9;1;6;0;0;1;13;2;6;0;7;0;2;0;0;2;3;2;2;2;17;3;11;0
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Arg;CCT;agg;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;−;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;2;2;3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;2;0;1;1;3;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;2;0;0;1;0
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Pro;CGG;ccg;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;2;0;3;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;2;0;0;0;1;0;0;0;1;0;−
Thr;CGT;acg;0;1;0;1;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;2;0;2;0;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;2;0;1;0;1;0;1
Stp;CTA;tag;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
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Phe;GAA;ttc;2;2;1;5;2;4;1;3;5;0;4;3;0;4;0;1;5;3;0;0;0;0;3;7;2;6;0;14;1;8;2;6;4;0;4;0;1;4;4;3;0;6;9;0;2;4;1;3;8;3;3;6;2;0;3;1;4;1;3;3;5;4;3;1;0;3;5;6;2;3;6;2;0;4;1;1;2;4;1;2;6;10;4;3
Val;GAC;gtc;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Leu;GAG;ctc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;1;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;4;1;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0
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Ala;GGC;gcc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Pro;GGG;ccc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Thr;GGT;acc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
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SeC;TCA;tga;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;−;0;−;0;−
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Arg;TCG;cga;0;1;1;0;1;2;0;−;0;−;0;−;4;0;0;−;0;−;0;0;0;1;2;6;2;6;4;3;1;5;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;1;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;2;0;1;1;0;14;10;0;−
Arg;TCT;aga;1;0;0;1;0;4;4;0;8;0;5;1;0;0;1;0;7;2;0;0;0;−;0;2;0;2;0;1;0;1;9;1;2;1;5;1;4;1;10;1;6;2;9;0;0;0;0;0;1;3;9;0;2;0;0;−;5;1;5;1;10;0;0;1;0;0;10;2;5;1;6;1;0;0;0;0;0;2;0;0;3;0;7;0
Ser;TGA;tca;0;0;0;0;1;2;1;1;1;0;0;2;0;0;0;1;1;2;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;3;0;1;0;1;0;0;0;1;0;1;0;3;0;0;1;0;2;0;2;2;1;0;0;0;0;1;0;0;2;2;0;0;1;0;0;3;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;2
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Thr;TGT;aca;0;1;0;1;0;2;1;0;2;0;1;1;0;0;1;0;0;2;0;0;0;0;1;2;1;2;0;2;1;2;2;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;1;3;0;0;1;0;1;0;2;1;1;0;0;0;2;1;0;0;2;2;1;0;1;0;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;0;0;2;0;2;0;2;1;0
Stp;TTA;taa;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Glu;TTC;gaa;0;2;1;4;0;5;1;4;8;0;3;1;0;2;0;1;7;1;0;0;0;0;1;3;1;2;1;4;0;4;14;0;3;1;7;0;4;1;12;0;4;1;6;1;1;1;0;1;3;1;11;1;1;0;0;2;7;0;2;1;12;1;3;0;0;1;11;4;7;0;8;2;0;1;0;1;0;1;0;2;3;2;8;1
Gln;TTG;caa;0;1;1;2;2;3;0;4;5;0;5;0;0;1;0;2;5;1;0;0;0;0;0;4;0;4;0;3;0;3;7;1;2;0;3;2;3;0;8;1;2;2;6;1;0;1;0;1;0;2;8;0;1;0;0;2;3;1;3;0;6;2;2;1;0;2;7;2;4;1;5;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;2;9;0
Lys;TTT;aaa;0;1;0;2;0;2;3;1;2;0;2;2;0;0;3;0;5;2;0;0;0;0;0;2;0;1;0;5;0;1;1;6;0;2;2;1;1;2;1;3;2;1;2;3;1;0;1;1;0;1;2;5;0;1;0;0;0;2;1;2;5;1;1;1;0;0;6;2;2;2;4;1;0;1;0;0;0;1;0;−;0;3;5;1
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
corrélation;;;-0.16;;-0.04;;-0.15;;-0.18;;-0.15;;-0.07;;0.03;;-0.24;;0.09;;−;;−;;0.19;;0.17;;-0.03;;0.02;;-0.15;;-0.18;;-0.10;;-0.11;;-0.09;;-0.19;;-0.05;;0.02;;-0.12;;-0.03;;-0.27;;-0.19;;-0.03;;-0.12;;-0.14;;0.00;;0.05;;0.33;;-0.01;;0.08;;0.03;;-0.04;;-0.04;;-0.10;;0.00;;0.08;;-0.23;
total;;;69;67;103;98;39;130;40;44;150;16;122;29;22;83;26;16;130;44;0;2;0;12;126;136;103;124;72;166;104;136;181;45;56;23;100;21;85;32;171;45;132;55;208;38;22;123;28;118;194;160;175;54;33;8;100;55;104;25;116;51;205;29;100;23;1;53;210;78;127;25;135;30;17;94;15;51;92;90;18;103;263;204;185;45
idble;;;1.03;;1.05;;0.30;;0.91;;9.38;;4.21;;0.27;;1.63;;2.95;;0.00;;0.00;;0.93;;0.83;;0.43;;0.76;;4.02;;2.43;;4.76;;2.66;;3.80;;2.40;;5.47;;0.18;;0.24;;1.21;;3.24;;4.13;;1.82;;4.16;;2.27;;7.07;;4.35;;0.02;;2.69;;5.08;;4.50;;0.18;;0.29;;1.02;;0.17;;1.29;;4.11;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;ani;;aor;;bfu;;cal;;cgr;;cjd;;cneg;;cot;;dha;;ecu;;ede;;fgr;;fgr5;;fve;;fvr;;kaf;;kapa;;kla;;kna;;lkl;;lth;;mfa;;mgr;;mth;;ncr;;ncs;;opa;;pch;;pic;;sas;;sce;;spo;;sre;;tbl;;tdl;;tpf;;ttt;;uma;;vda;;vma;;yli;;zro;
;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif

B42-Genomes. Correlations et indices des doublons

modifier 
B42;;;cbl;;spl;;pdi;;ppoy;;sbn;;eal;;eco;;sbz;;eno;;kpn;;bcef;;bcoh;;blr;;dzc;;eclx;;gmc;;ksa;;mme;;mvs;;pge;;pha;;pse;;sfr;;vag;;vau;;vha;;vvm;;yrb;;bae;;saci;;sep;;hmr;;bbd;;lpl;;sty;;sma;;sho;;ksk;;ype;;pdix;;hmo;;vpf;
;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif
Phe;AAA;ttt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−
Val;AAC;gtt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Leu;AAG;ctt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Ile;AAT;att;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Cys;ACA;tgt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Gly;ACC;ggt;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Arg;ACG;cgt;0;0;5;1;0;2;3;0;5;0;2;0;3;0;3;0;3;0;3;0;1;1;2;0;3;1;2;0;2;1;1;2;3;0;2;0;3;1;3;0;3;0;1;1;2;1;5;0;2;2;6;0;4;1;2;0;1;0;0;0;0;1;0;−;0;0;1;0;2;1;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;2;0;6;0
Ser;ACT;agt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Ser;AGA;tct;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Ala;AGC;gct;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Pro;AGG;cct;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Thr;AGT;act;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−
Tyr;ATA;tat;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Asp;ATC;gat;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
His;ATG;cat;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Asn;ATT;aat;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Leu;CAA;ttg;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
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Leu;CAG;ctg;0;−;0;−;1;0;1;1;0;1;2;1;1;2;2;1;1;2;2;1;0;−;0;0;0;0;6;1;1;2;0;0;0;3;0;−;0;−;3;0;0;−;2;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;2;1;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;−;1;2;0;−
Met;CAT;atg;2;4;8;4;1;2;1;5;4;5;4;4;3;4;3;2;3;2;4;2;2;5;3;2;3;4;2;3;4;3;2;3;3;2;3;7;8;2;4;2;4;2;1;2;4;4;4;2;4;3;5;4;6;3;4;2;3;2;4;1;1;2;0;2;0;2;1;3;3;2;3;2;3;4;2;2;3;2;5;4;4;3;7;3
Trp;CCA;tgg;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0
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Ser;CGA;tcg;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;0;0;1;0;3;0;1;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−
Ala;CGC;gcg;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;1;1;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−
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Thr;CGT;acg;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;−;0;−;0;0;0;−
Stp;CTA;tag;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
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Leu;GAG;ctc;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;−;1;0;1;0
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Cys;GCA;tgc;0;1;3;0;0;1;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;1;3;0;0;1;2;2;1;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;3;0;0;1;0;0;2;2;1
Gly;GCC;ggc;2;0;7;0;2;0;3;1;5;0;2;0;3;0;3;0;3;0;3;0;2;1;3;0;4;0;3;0;3;0;2;2;3;0;3;0;4;0;3;0;4;1;1;0;3;1;8;0;5;1;9;0;7;0;3;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;1;0;2;0;1;1;2;0;2;1;1;0;1;0;2;4;10;0
Arg;GCG;cgc;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Ser;GCT;agc;1;0;2;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0
Ser;GGA;tcc;0;0;0;0;1;0;2;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0
Ala;GGC;gcc;0;−;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;−;0;0;0;0;5;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;−;1;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−;1;0;1;0;1;0;2;1;1;0;0;−;4;0;0;0
Pro;GGG;ccc;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;1;0;−;1;0;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;2;0;2;0;0;0;0;0;0;−;1;1;0;−
Thr;GGT;acc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;1;0;0;1;0;−;1;1;0;1
Tyr;GTA;tac;1;0;5;0;2;0;3;0;3;0;1;1;1;1;1;1;1;1;2;0;2;0;0;1;3;0;1;0;0;2;1;0;1;1;1;0;4;0;1;1;2;0;1;0;3;0;2;0;4;0;4;0;3;0;2;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;2;0;2;1;5;1
Asp;GTC;gac;2;1;5;0;1;1;4;0;3;0;2;0;2;0;2;0;2;0;2;0;5;0;0;3;4;1;2;0;2;0;1;2;2;0;5;1;4;0;2;0;10;0;5;1;2;1;5;0;4;0;5;0;6;0;1;1;3;0;1;0;0;2;0;0;1;1;2;0;2;0;1;0;1;0;1;0;1;1;2;1;2;1;6;0
His;GTG;cac;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;2;0;0;0;1;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0
Asn;GTT;aac;1;1;6;0;1;1;5;0;4;0;3;0;3;0;3;0;3;0;3;0;3;1;2;1;3;1;2;0;3;1;1;2;3;0;1;0;5;0;3;0;3;0;2;0;2;2;4;0;3;0;2;2;4;0;2;0;2;1;1;0;1;1;0;0;0;0;2;2;3;1;1;0;1;0;0;1;2;0;2;1;3;0;2;2
Leu;TAA;tta;1;0;3;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;3;1;0;0;2;0;0;0;1;1;1;1;1;0;2;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;1;1
Val;TAC;gta;4;0;10;0;2;0;4;1;3;0;1;2;4;0;3;0;2;1;4;0;4;0;1;2;4;0;7;0;2;1;2;1;3;0;5;0;6;0;3;0;5;1;3;1;4;1;1;0;1;0;3;0;0;0;2;0;2;0;0;0;1;1;0;0;1;0;2;0;1;1;0;0;0;0;0;0;2;0;2;3;1;0;3;0
Leu;TAG;cta;1;0;4;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;4;0;0;0;2;1;0;0;0;1;1;1;1;2;3;1;4;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;8;2
Ile;TAT;ata;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
SeC;TCA;tga;0;0;0;0;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−
Gly;TCC;gga;3;0;0;0;1;0;2;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;1;0;3;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;2;1;1;0;0;0;1;1;0;0;1;3;0;0;0;0;1;1;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;4;0;0;0;1;0
Arg;TCG;cga;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;2;0;0;−;0;−;0;−;0;−
Arg;TCT;aga;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;−;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0
Ser;TGA;tca;1;0;2;1;0;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;2;0;1;2;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;6;1;0;0;2;1;0;0;2;0;3;0;2;0;3;0;2;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;2;0;0;0;3;0
Ala;TGC;gca;2;0;2;0;5;1;2;2;2;0;2;0;2;0;2;0;2;0;2;0;3;1;2;1;2;1;2;0;2;0;3;1;2;0;2;0;10;0;2;0;2;0;7;0;2;0;7;0;2;1;5;1;6;2;2;0;1;1;0;1;2;0;1;0;0;0;1;0;2;0;0;0;0;0;0;0;2;0;4;0;1;0;4;0
Pro;TGG;cca;2;0;2;0;0;0;2;1;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;1;2;1;0;0;1;0;2;0;0;0;1;0;3;0;0;0;2;0;0;0;3;0;2;0;2;0;2;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;2;0;0;0;2;0
Thr;TGT;aca;1;2;3;0;2;0;2;1;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;1;5;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;1;3;0;0;0;2;0;0;0;1;0;4;0;2;1;4;0;3;0;1;0;0;2;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0;0;1;4;0
Stp;TTA;taa;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−
Glu;TTC;gaa;1;1;12;0;0;1;5;0;6;0;2;1;3;0;3;0;3;0;3;0;5;1;2;1;5;0;3;0;3;0;4;0;3;0;2;0;0;−;2;1;5;1;1;3;5;0;2;0;3;0;4;0;0;0;3;0;4;1;1;0;0;2;0;0;1;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;0;2;0;4;0;4;1;5;0
Gln;TTG;caa;1;0;4;0;0;0;3;0;1;1;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;3;1;0;2;2;1;0;0;1;0;1;2;1;0;2;0;3;0;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;4;0;1;0;1;2;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;3;0;4;1
Lys;TTT;aaa;3;0;11;0;0;1;4;1;6;3;3;0;5;0;4;0;4;0;5;0;4;1;2;1;5;0;2;0;4;0;2;1;4;0;3;0;6;0;4;0;6;1;1;0;5;0;1;0;1;0;3;0;0;0;4;0;2;0;0;−;1;1;0;0;1;0;1;0;2;1;0;0;0;0;0;0;2;1;4;0;4;0;3;0
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
corrélation;;;0.08;;0.19;;0.00;;0.03;;0.31;;0.42;;0.15;;0.04;;0.07;;0.19;;0.12;;0.18;;-0.08;;0.16;;0.26;;0.36;;-0.01;;0.31;;0.05;;0.18;;0.32;;0.14;;0.33;;-0.16;;0.19;;0.09;;0.29;;0.17;;0.21;;0.14;;0.11;;-0.05;;0.11;;0.22;;0.33;;0.04;;0.43;;0.20;;0.20;;0.35;;0.18;;0.25;
total;;;34;12;103;8;27;14;54;19;59;13;33;12;37;10;36;9;35;10;41;5;45;19;20;24;60;20;42;6;34;14;30;23;33;9;39;9;91;10;37;7;62;11;37;10;47;15;64;9;44;16;74;15;66;14;36;8;27;16;10;17;13;19;2;3;4;4;20;9;28;13;14;19;15;14;19;13;22;10;51;12;44;23;84;15
indice doublons;;;2.83;;12.88;;1.93;;2.84;;4.54;;2.75;;3.70;;4.00;;3.50;;8.20;;2.37;;0.83;;3.00;;7.00;;2.43;;1.30;;3.67;;4.33;;9.10;;5.29;;5.64;;3.70;;3.13;;7.11;;2.75;;4.93;;4.71;;4.50;;1.69;;0.59;;0.68;;0.67;;1.00;;2.22;;2.15;;0.74;;1.07;;1.46;;2.20;;4.25;;1.91;;5.60;

Total des codons par génome, corrélations et indices des doublons

modifier 
A10-tc;;néant;;B42-tc;;1 diag;;C42-tc;;1 diag;;E79e-tc;;1 diag;;E79o-tc;;néant;;E79-tc;;néant
A10-tc;Ab-tc;Af-tc;;B42-tc;Bb-tc;Bf-tc;;C42-tc;Cb-tc;Cf-tc;;Ee-tc;Ebe-tc;Efe-tc;;Eo-tc;Ebo-tc;Efo-tc;;E-tc;Eb-tc;Ef-tc
fpl;0;5;;hmr;2;3;;ecu;0;2;;acs;91;77;;acs;91;124;;acs;92;72
hbo;5;3;;bbd;4;4;;ede;0;12;;aga;288;101;;aga;288;145;;aga;284;94
mac;8;6;;saci;10;17;;sre;1;53;;aml;171;383;;aml;171;435;;aml;172;1250
mbw;10;8;;sep;13;19;;uma;15;51;;ath;404;217;;ath;404;268;;ath;431;217
mhor;5;11;;sma;14;19;;ttt;17;94;;bacu;211;471;;bacu;211;525;;bacu;342;6717
mls;6;7;;sho;15;14;;vma;18;103;;bdi;377;219;;bdi;377;271;;bdi;381;215
mmet;7;5;;ksk;19;13;;cneg;22;83;;bta;306;555;;bta;306;614;;bta;320;3678
mpl;4;8;;lpl;20;9;;mgr;22;123;;cbr;527;204;;cbr;527;248;;cbr;530;169
mru;2;22;;bcoh;20;24;;cot;26;16;;cbre;763;228;;cbre;763;280;;cbre;817;226
nou;4;5;;ype;22;10;;mth;28;118;;cel;411;154;;cel;411;201;;cel;416;133
;;;;pdi;27;14;;opa;33;8;;cfa;142;332;;cfa;142;382;;cfa;139;723
;;;;bae;27;16;;bfu;39;130;;cge;172;209;;cge;172;258;;cge;173;276
;;;;sty;28;13;;cal;40;44;;cjap;598;176;;cjap;598;223;;cjap;607;173
;;;;gmc;30;23;;kpa;56;23;;cjc;153;277;;cjc;153;333;;cjc;146;290
;;;;ksa;33;9;;ani;69;67;;cmk;413;769;;cmk;413;830;;cmk;3402;10269
;;;;eal;33;12;;fve;72;166;;cpic;79;411;;cpic;79;468;;cpic;74;426
;;;;cbl;34;12;;kna;85;32;;cpo;152;193;;cpo;152;243;;cpo;140;194
;;;;eclx;34;14;;vda;92;90;;csi;162;241;;csi;162;291;;csi;161;308
;;;;eno;35;10;;kla;100;21;;dme;192;60;;dme;192;104;;dme;195;54
;;;;yrb;36;8;;spo;100;23;;dno;187;413;;dno;187;464;;dno;190;878
;;;;sbz;36;9;;pch;100;55;;dsi;164;55;;dsi;164;97;;dsi;161;55
;;;;pge;37;7;;aor;103;98;;dya;227;63;;dya;227;109;;dya;228;58
;;;;eco;37;10;;fgr5;103;124;;ecb;207;252;;ecb;207;302;;ecb;194;250
;;;;pse;37;10;;pic;104;25;;eeu;175;165;;eeu;175;211;;eeu;163;276
;;;;mme;39;9;;fvr;104;136;;fca;164;535;;fca;164;594;;fca;158;3561
;;;;kpn;41;5;;sas;116;51;;gac;632;694;;gac;632;742;;gac;1694;747
;;;;dzc;42;6;;cjd;122;29;;gfr;63;92;;gfr;63;138;;gfr;63;94
;;;;vau;44;16;;fgr;126;136;;gga;113;119;;gga;113;166;;gga;114;122
;;;;hmo;44;23;;tdl;127;25;;ggo;129;316;;ggo;129;371;;ggo;129;324
;;;;bcef;45;19;;dha;130;44;;gmo;435;883;;gmo;435;938;;gmo;452;990
;;;;sfr;47;15;;lth;132;55;;gmx;498;200;;gmx;498;248;;gmx;501;189
;;;;pdix;51;12;;tpf;135;30;;hgl;83;230;;hgl;83;282;;hgl;85;230
;;;;ppoy;54;19;;cgr;150;16;;hsa-18;177;220;;hsa-18;177;268;;hsa-18;164;221
;;;;sbn;59;13;;lkl;171;45;;lav;248;760;;lav;248;816;;lav;253;1695
;;;;blr;60;20;;ncs;175;54;;lcm;59;261;;lcm;59;313;;lcm;59;266
;;;;pha;62;11;;kaf;181;45;;lma;34;4;;lma;34;49;;lma;34;4
;;;;vag;64;9;;zro;185;45;;mcc;132;335;;mcc;132;392;;mcc;132;341
;;;;vvm;66;14;;ncr;194;160;;mdo;252;184;;mdo;252;231;;mdo;259;175
;;;;vha;74;15;;sce;205;29;;meu;141;163;;meu;141;212;;meu;144;160
;;;;vpf;84;15;;mfa;208;38;;mgp;54;58;;mgp;54;103;;mgp;50;60
;;;;mvs;91;10;;tbl;210;78;;mlu;114;94;;mlu;114;140;;mlu;110;96
;;;;spl;103;8;;yli;263;204;;mmr;104;106;;mmr;104;152;;mmr;105;107
;;;;;;;;;;;;mmu;188;234;;mmu;188;289;;mmu;185;230
;;;;;;;;;;;;mpu;125;324;;mpu;125;374;;mpu;124;582
;;;;;;;;;;;;mtr;328;259;;mtr;328;316;;mtr;319;308
;;;;;;;;;;;;mun;65;100;;mun;65;147;;mun;52;102
;;;;;;;;;;;;nle;126;319;;nle;126;375;;nle;125;327
;;;;;;;;;;;;oaa;278;492;;oaa;278;546;;oaa;276;529
;;;;;;;;;;;;oas;77;359;;oas;77;414;;oas;79;1045
;;;;;;;;;;;;ocu;218;234;;ocu;218;284;;ocu;225;231
;;;;;;;;;;;;oga;123;149;;oga;123;199;;oga;124;153
;;;;;;;;;;;;oni;274;352;;oni;274;402;;oni;273;351
;;;;;;;;;;;;opr;159;142;;opr;159;188;;opr;150;142
;;;;;;;;;;;;osa;420;267;;osa;420;319;;osa;438;260
;;;;;;;;;;;;pan;180;304;;pan;180;360;;pan;174;301
;;;;;;;;;;;;pfa;0;1;;pfa;0;35;;pfa;0;1
;;;;;;;;;;;;pha;154;205;;pha;154;258;;pha;156;203
;;;;;;;;;;;;pma;742;765;;pma;742;820;;pma;1401;1032
;;;;;;;;;;;;pop;377;225;;pop;377;277;;pop;387;208
;;;;;;;;;;;;ppp;250;133;;ppp;250;186;;ppp;249;128
;;;;;;;;;;;;ppy;172;378;;ppy;172;435;;ppy;175;381
;;;;;;;;;;;;ptr;164;389;;ptr;164;449;;ptr;161;392
;;;;;;;;;;;;rno;161;201;;rno;161;250;;rno;160;198
;;;;;;;;;;;;san;147;175;;san;147;223;;san;146;181
;;;;;;;;;;;;sbi;330;243;;sbi;330;300;;sbi;334;237
;;;;;;;;;;;;sbq;115;216;;sbq;115;269;;sbq;117;226
;;;;;;;;;;;;shr;223;179;;shr;223;226;;shr;230;171
;;;;;;;;;;;;spu;523;381;;spu;523;427;;spu;639;381
;;;;;;;;;;;;ssc;253;258;;ssc;253;308;;ssc;236;522
;;;;;;;;;;;;str;152;342;;str;152;398;;str;146;602
;;;;;;;;;;;;tgu;83;147;;tgu;83;200;;tgu;78;148
;;;;;;;;;;;;tma;119;473;;tma;119;530;;tma;111;1851
;;;;;;;;;;;;tng;210;335;;tng;210;387;;tng;205;357
;;;;;;;;;;;;tru;273;291;;tru;273;342;;tru;271;294
;;;;;;;;;;;;tsy;134;227;;tsy;134;279;;tsy;135;271
;;;;;;;;;;;;ttr;170;466;;ttr;170;522;;ttr;231;5586
;;;;;;;;;;;;vvi;232;289;;vvi;232;346;;vvi;236;290
;;;;;;;;;;;;xtr;848;763;;xtr;848;820;;xtr;1588;997
;;;;;;;;;;;;zma;572;412;;zma;572;465;;zma;601;548
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;-0.26;−;;;0.00;−;;;0.14;−;;;0.46;−;;;0.46;−;;;0.58;−
;51;80;;;1673;538;;;4179;2781;;;18969;22508;;;18969;26546;;;24801;56149
;0.6375;;;;3.11;;;;1.50;;;;0.84;;;;0.71;;;;0.44;

Distribution des fréquences des champignons C42 et des 79 eucaryotes E79

modifier

Distribution des simples des eucaryotes E79

modifier 
Simples 79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe
;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
acs;3;4;3;0;2;0;1;3;3;3;3;0;1;0;8;2;3;2;3;0;1;1;1;1;3;0;1;2;3;0;2;2;2;2;4;0;6;0;3;6;3;2;1;0;2;0;1;3;0;6;0;0;1;0;2;1;1;4;4;0;2;1;1;0
aga;5;2;2;0;1;0;3;1;2;2;2;0;2;0;5;2;2;5;6;0;2;0;6;5;4;0;0;1;2;0;2;2;3;2;3;0;2;0;2;4;1;1;0;0;1;0;8;7;1;21;0;0;1;0;1;2;0;1;1;0;5;1;4;0
aml;50;18;760;6;8;0;10;6;17;10;44;2;6;0;13;5;42;1;21;0;8;0;2;2;82;1;5;3;5;0;5;5;7;6;34;1;7;0;4;14;4;2;5;0;7;0;2;2;1;10;10;0;6;0;4;4;2;12;7;0;4;3;7;0
ath;6;9;5;0;5;1;4;3;9;9;4;0;2;1;16;2;4;6;5;0;6;0;3;5;2;0;3;7;5;1;1;3;9;8;4;0;3;0;3;3;2;9;1;0;3;1;2;3;1;33;0;0;6;2;4;11;0;14;5;0;3;5;6;0
bacu;82;7;24;0;7;0;4;9;55;10;67;0;8;1;13;6;8;4;16;0;3;0;2;2;8;0;20;6;4;0;4;2;2321;38;447;19;42;0;19;18;962;51;2045;11;18;1;24;9;24;14;9;0;5;1;4;7;17;19;243;2;12;9;8;0
bdi;9;6;2;0;8;1;4;7;7;6;6;0;3;2;31;7;8;7;3;3;10;0;3;4;1;1;4;4;4;0;1;7;7;5;3;0;6;0;2;3;3;9;1;0;3;2;3;5;0;14;0;1;5;3;1;3;0;9;6;0;2;5;7;0
bta;68;14;25;0;8;1;7;10;44;11;114;4;8;0;19;4;18;5;32;4;3;0;1;2;11;7;13;6;5;0;3;5;424;33;161;6;31;2;14;19;385;55;1266;20;19;0;27;13;4;38;13;11;7;28;7;5;29;313;173;134;10;18;14;6
cbr;5;3;4;0;4;0;4;2;3;3;1;0;16;0;5;4;5;3;4;0;11;0;2;4;6;0;0;5;2;0;5;5;4;7;9;0;1;0;5;7;9;5;5;0;4;0;3;7;0;6;0;0;5;0;4;3;0;2;1;0;4;6;10;0
cbre;9;5;4;0;3;1;4;5;3;5;7;0;13;1;5;2;11;5;5;1;6;1;5;12;6;0;11;4;2;0;5;3;9;3;3;0;4;0;4;2;5;14;14;0;5;0;8;3;0;8;0;2;7;0;6;4;2;5;3;2;3;6;12;0
cel;1;3;6;0;2;0;5;3;3;3;3;1;4;0;3;2;5;6;3;0;8;0;1;4;4;0;1;4;1;0;2;6;3;7;5;0;2;0;4;6;6;4;1;0;4;0;2;4;0;12;0;0;7;0;3;4;2;2;3;0;3;5;7;0
cfa;28;13;398;1;3;0;5;6;9;6;28;0;5;0;17;5;42;2;16;0;7;0;2;1;15;0;3;5;4;0;3;1;11;4;16;2;8;0;4;11;4;3;7;0;5;0;3;4;3;9;3;0;5;0;7;5;1;12;6;0;4;6;5;0
cge;10;9;75;0;3;1;4;7;5;6;5;0;5;0;9;3;4;3;6;0;2;0;1;1;4;0;3;3;4;0;5;2;5;5;14;0;14;1;5;17;1;5;5;1;4;0;6;9;0;11;0;0;3;0;3;1;2;17;4;0;4;4;4;0
cjap;7;3;7;0;5;0;3;7;3;3;1;0;5;0;5;6;3;5;5;0;10;0;1;2;5;0;1;4;4;0;7;4;4;9;9;0;5;0;1;8;11;10;2;0;5;0;5;4;0;2;0;0;3;0;5;5;1;3;4;0;5;5;7;1
cjc;11;18;12;0;7;1;4;9;6;5;4;0;5;3;13;8;7;4;8;1;3;0;1;1;4;1;3;2;4;0;9;4;18;6;9;1;5;2;3;13;3;6;4;0;5;3;7;4;1;25;3;1;4;0;4;4;2;23;10;0;11;4;7;0
cmk;38;32;25;2;157;12;133;17;14;23;7;0;19;0;74;23;6;27;10;1;44;6;41;11;22;0;2;5;18;2;20;14;59;35;406;6;3009;165;3758;56;44;7;74;2;116;16;1503;16;1;29;4;1;51;1;48;14;3;10;20;1;12;25;30;3
cpic;32;12;7;1;17;0;5;16;25;19;10;3;13;1;11;9;15;8;10;0;3;1;2;8;4;0;3;5;4;1;4;2;17;10;3;0;12;1;4;10;14;6;1;0;5;0;6;15;1;5;2;1;15;0;9;22;4;14;9;5;13;20;6;2
cpo;7;9;19;0;3;0;3;10;5;7;4;0;5;0;10;3;2;2;5;0;2;0;1;2;4;0;3;3;3;0;2;2;4;4;1;1;7;4;5;24;4;5;5;0;2;1;3;2;0;11;1;0;2;0;3;2;1;16;7;0;4;3;6;0
csi;11;4;16;2;6;0;5;7;6;6;7;0;5;0;15;6;3;2;8;0;3;0;2;2;4;0;2;6;3;0;2;3;7;7;73;1;12;0;5;16;2;2;6;0;7;1;11;6;0;11;1;0;3;0;4;5;1;20;4;0;5;6;6;0
dme;2;1;1;0;2;0;1;3;3;2;1;0;2;0;4;2;2;1;4;0;1;0;3;1;4;0;0;1;1;0;1;1;1;3;5;0;2;0;1;2;2;2;0;0;1;0;2;2;0;9;0;0;2;0;1;3;1;4;2;0;4;1;4;0
dno;14;6;30;0;7;0;7;10;9;7;46;0;6;1;20;6;3;4;7;1;2;0;3;1;7;0;5;5;3;0;4;2;15;9;38;0;64;2;16;16;24;9;322;24;16;1;76;8;0;11;0;0;5;0;6;3;1;13;12;0;8;7;7;0
dsi;2;1;1;0;2;0;2;1;4;2;2;0;0;0;4;3;2;2;4;0;2;0;3;1;3;0;0;1;1;0;1;1;3;1;4;0;0;0;2;1;2;2;0;0;1;0;2;2;0;10;0;0;2;0;1;3;1;3;2;0;3;3;4;0
dya;3;1;4;1;2;0;1;1;3;4;2;0;2;0;4;2;1;1;5;0;1;0;2;1;2;0;0;1;1;0;1;1;2;3;3;0;1;0;3;4;2;2;1;0;1;0;3;2;0;9;0;0;2;0;1;3;1;3;2;0;4;1;4;0
ecb;8;8;8;1;5;0;3;7;5;7;6;0;5;0;13;7;4;3;6;1;3;0;2;1;3;0;2;4;5;0;2;2;6;5;48;0;9;0;7;16;2;1;5;0;6;3;6;5;0;10;0;1;4;0;4;4;4;15;4;0;4;4;6;0
eeu;5;2;121;0;6;0;4;7;5;3;6;0;4;0;6;2;3;1;6;0;2;0;1;2;4;0;2;3;3;0;4;2;5;4;4;0;10;0;4;10;2;4;3;0;6;0;2;4;0;13;0;0;3;0;3;2;2;20;5;0;3;3;6;0
fca;45;21;879;5;12;0;9;6;54;8;52;2;9;0;15;2;777;8;45;2;64;1;5;2;1194;9;24;4;33;0;3;1;11;2;41;1;9;1;6;14;46;3;5;2;6;0;3;4;36;9;12;0;13;1;5;3;18;19;22;1;19;8;8;1
gac;31;41;23;1;16;0;9;50;25;16;5;0;15;0;65;17;13;19;20;0;7;0;5;5;14;0;2;12;12;0;3;18;24;49;25;0;17;0;15;22;21;2;3;0;8;1;11;12;0;13;0;0;19;0;6;14;1;35;27;0;8;12;6;0
gfr;2;5;6;1;4;0;1;3;3;3;2;0;2;1;4;2;2;4;2;0;4;0;1;1;2;0;0;5;0;0;5;3;4;4;2;0;5;0;2;7;2;1;3;0;1;1;2;2;0;8;0;0;3;0;1;1;0;5;3;0;11;2;2;0
gga;4;6;2;0;3;0;2;4;4;4;3;0;2;0;6;1;2;4;3;0;3;0;2;1;2;0;2;4;2;0;5;3;7;3;2;0;4;0;4;11;4;2;2;0;3;1;5;5;0;13;0;0;3;0;1;5;1;5;3;0;3;5;3;0
ggo;11;20;14;2;5;0;5;7;5;4;5;0;6;3;7;9;10;1;16;0;4;0;1;5;5;0;3;4;5;0;4;5;13;8;7;0;6;2;5;20;4;8;5;0;8;1;6;7;1;22;3;4;5;2;5;5;3;30;7;1;8;8;9;0
gmo;46;18;23;2;24;0;23;20;19;0;21;1;16;0;112;21;8;16;23;1;15;1;12;30;15;2;7;23;20;0;34;22;39;15;30;1;20;0;20;31;21;13;14;0;9;0;19;13;1;47;4;0;15;27;13;18;2;19;19;0;15;24;15;6
gmx;5;10;2;2;5;1;2;6;8;12;3;0;3;0;14;19;3;3;5;0;7;0;2;5;3;0;4;2;3;0;1;1;4;8;7;0;5;0;3;3;2;3;3;0;4;1;2;7;0;20;0;0;5;0;2;5;0;1;3;0;5;5;8;0
hgl;5;4;11;0;4;2;4;15;6;5;4;2;3;0;8;3;3;2;3;0;4;0;2;9;4;0;4;3;5;0;4;3;4;6;1;2;4;6;5;45;3;4;2;4;3;1;3;11;0;7;0;0;3;0;3;5;4;18;5;0;4;2;5;0
hsa-18;8;17;10;0;6;0;5;6;6;6;5;0;5;1;9;10;4;1;7;0;3;0;2;2;6;0;2;2;3;0;2;4;5;3;2;0;7;0;4;16;4;5;3;0;4;0;6;6;0;13;0;1;4;0;4;4;2;23;5;0;4;5;7;0
lav;46;37;22;4;17;1;10;13;90;69;14;3;7;0;34;30;11;13;23;3;12;0;1;7;14;0;3;10;11;0;6;18;107;14;18;0;47;0;15;40;616;26;70;4;39;1;26;34;2;19;0;1;7;0;3;20;24;23;17;1;14;19;14;1
lcm;13;7;9;3;8;0;2;8;9;7;8;0;7;0;8;6;9;3;7;0;7;0;4;10;4;0;1;2;4;0;8;3;9;16;6;1;19;0;2;2;5;5;1;0;7;0;3;3;1;8;2;2;6;0;3;3;4;14;13;5;11;6;4;0
lma;1;1;2;0;1;0;1;1;1;2;1;0;1;0;2;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;0;2;0;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0
mcc;13;21;9;2;6;0;4;7;6;4;6;0;7;6;14;8;15;4;10;0;7;1;1;2;5;0;2;3;5;0;4;7;10;9;4;1;11;1;4;18;3;9;5;0;6;3;8;7;2;31;2;1;16;2;4;4;2;20;6;2;15;5;8;0
mdo;4;4;9;0;2;0;3;6;6;2;4;0;7;0;11;1;7;1;3;0;3;0;1;1;3;0;3;5;6;0;6;3;4;12;3;1;6;0;4;6;7;5;2;0;4;0;3;3;0;13;0;0;5;0;3;6;0;15;6;4;2;4;3;0
meu;7;4;3;0;3;0;3;5;6;4;4;0;6;0;7;2;3;1;6;1;1;0;1;3;3;0;3;5;3;0;5;3;6;12;2;0;6;0;3;9;4;9;3;0;1;0;4;3;0;8;0;1;2;0;2;2;4;10;7;0;3;7;8;1
mgp;2;2;2;0;2;0;0;4;3;5;2;0;1;0;4;2;1;3;1;0;2;0;1;2;1;0;2;2;1;0;3;1;4;1;3;0;4;0;3;3;2;1;2;0;2;1;3;3;0;4;0;0;3;0;1;3;0;3;3;0;1;4;2;0
mlu;2;2;7;0;3;0;3;3;4;3;5;0;3;0;6;4;3;3;5;5;3;0;1;1;4;0;2;5;2;0;2;2;4;3;1;0;1;0;3;5;2;2;2;0;3;0;1;2;0;5;0;0;2;0;2;2;0;10;2;0;2;2;3;0
mmr;2;5;2;0;3;0;2;3;5;5;3;0;2;0;6;2;3;3;5;0;3;0;1;1;2;0;2;4;2;0;3;2;6;2;4;0;5;0;3;8;2;3;2;0;2;0;2;2;0;8;0;0;2;0;3;6;0;9;4;1;3;2;3;0
mmu;6;5;19;0;3;0;4;9;6;6;4;0;5;1;11;5;6;3;7;1;5;1;1;3;4;0;3;3;4;0;4;3;3;4;6;0;8;4;7;19;2;6;5;2;1;1;8;6;1;11;0;0;2;1;3;5;1;28;6;1;5;3;4;0
mpu;25;8;266;6;6;0;5;8;15;8;21;0;5;0;14;4;35;2;14;1;6;0;1;1;28;0;3;3;4;0;3;2;6;4;15;0;7;0;4;13;7;2;3;0;6;0;4;5;2;9;5;0;4;0;4;3;1;10;9;0;4;5;6;0
mtr;13;16;3;44;7;2;1;2;6;9;4;0;7;0;23;9;10;8;3;0;3;1;1;1;2;0;2;7;4;0;2;6;9;14;3;1;8;0;3;10;6;4;2;1;5;3;5;6;30;11;0;3;4;2;1;5;1;3;7;1;5;6;9;1
mun;2;5;10;0;2;0;0;4;4;8;3;0;1;0;3;2;1;4;5;0;3;0;2;3;1;0;1;2;0;0;6;3;3;5;1;0;5;0;2;2;6;6;1;0;1;1;2;3;1;5;0;0;4;1;2;4;1;5;3;0;3;4;3;0
nle;15;14;14;3;6;0;5;9;7;6;4;0;5;3;10;9;8;4;14;0;3;2;1;4;7;0;2;3;4;0;6;6;12;8;10;0;11;1;4;17;2;8;9;0;6;1;9;7;3;19;5;0;6;3;5;7;3;14;10;1;8;13;6;1
oaa;25;11;15;0;16;1;8;16;6;12;7;11;8;0;18;17;8;20;14;1;9;4;3;6;5;0;11;8;5;0;13;5;13;14;14;0;11;0;8;51;9;23;5;2;13;1;5;16;3;26;0;0;6;4;7;0;5;19;9;0;7;18;10;1
oas;17;5;11;0;4;0;3;5;22;6;32;0;5;0;14;3;7;5;6;0;4;0;1;1;6;2;6;2;3;0;2;3;136;6;57;2;12;3;6;11;132;27;339;5;8;0;7;4;0;16;3;2;4;3;3;1;4;56;45;16;5;4;7;1
ocu;8;15;20;1;6;1;5;6;6;3;5;0;7;1;10;5;3;1;7;0;3;0;1;1;3;0;3;3;4;0;6;3;9;6;5;1;9;0;4;14;2;3;11;0;5;0;4;8;0;12;0;0;4;0;4;3;1;16;7;0;5;8;3;0
oga;7;4;5;0;5;0;3;8;4;5;5;2;11;9;8;4;4;1;4;0;3;0;1;1;4;0;3;4;3;0;4;1;4;4;2;0;5;0;2;8;6;5;1;0;2;0;2;3;1;7;0;0;2;0;3;4;1;11;6;0;3;2;5;1
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opr;6;5;7;0;5;0;7;6;5;3;5;0;4;0;4;2;3;1;6;0;3;0;1;1;5;0;3;3;5;0;3;3;4;3;4;0;6;0;3;11;2;6;2;0;4;0;2;5;0;10;0;0;3;0;3;2;1;4;4;0;3;6;4;0
osa;8;13;5;0;7;3;2;3;6;6;5;0;3;0;29;4;12;10;7;0;9;0;6;4;2;0;5;7;5;0;2;4;6;11;11;1;1;1;5;4;5;9;5;0;1;4;4;7;0;17;0;2;7;1;6;5;0;9;7;1;3;7;5;0
pan;13;20;11;2;8;0;7;7;6;7;4;0;7;2;11;9;12;1;10;0;4;0;1;4;5;0;2;3;3;0;6;4;6;7;3;2;10;1;4;16;2;10;6;0;5;2;6;5;3;23;0;4;9;1;3;4;3;18;6;4;10;5;9;1
pfa;0;1;0;0;1;0;1;0;1;1;0;0;1;0;2;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;0;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;0;0;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;0;1;1;0;0;0;0;1;1;1;0
pha;6;10;6;1;7;0;6;6;6;5;4;0;4;2;6;7;4;1;7;0;4;0;1;2;5;0;2;4;3;0;5;5;7;4;1;1;9;1;4;16;2;7;5;0;5;1;6;4;1;13;0;0;5;0;3;3;1;15;5;2;7;3;6;0
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zma;68;18;91;0;6;5;2;13;6;4;6;0;4;0;48;37;14;8;7;1;18;0;4;4;4;0;3;10;5;0;3;10;10;12;14;1;7;0;11;32;3;3;2;0;2;1;3;11;0;18;4;0;5;12;3;5;0;15;7;1;3;8;8;1
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Simples 79;;fréquences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe
critère;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
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Distribution des simples des champignons C42

modifier 
Simples 42;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe
;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
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Simples 42;;fréquences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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critère;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
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Distribution des doublons des eucaryotes E79

modifier 
Doublons 79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe
;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
acs;2;6;3;0;1;0;0;1;0;2;0;0;0;0;4;4;0;3;2;0;2;0;1;2;0;0;0;2;0;0;2;2;5;6;1;0;0;0;0;6;5;5;1;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;4;0;8;3;0;0;4;1;0
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doublonss 79;;fréquences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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58;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
59;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0

Distribution des doublons des champignons C42

modifier

Légende: 

Doublons 42;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe
;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
ani;0;0;7;0;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;2;2;0;3;1;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;0;0;0;0;2;5;0;0;0;2;7;0;10;0;0;0;0;0;6;0;1;0;0;0;0;0;4;0;1;2;0;0;2;0;0
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Doublons 42;;fréquences;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe
critère;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt
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Tableaux pour les diagrammes des simples, E79-C42

modifier 
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Tableaux pour les diagrammes des doublons, E79-C42

modifier 
;Phe;;Leu;;;;Leu;;;;;;Ile;;;;Met;;Val;;;;;;;;Ser;;;;;;Pro;;;;;;Thr;;;;;;Ala;;;;;;;;Tyr;;Stp;;;;His;;Gln;;;;Asn;;Lys;;;;Asp;;Glu;;;;;;Cys;;SeC;;Trp;;Arg;;;;;;Ser;;Arg;;;;Gly;;;;;
critère;d79-ttc;d42-ttc;d79-tta;d42-tta;d79-ttg;d42-ttg;d79-ctt;d42-ctt;d79-cta;d42-cta;d79-ctg;d42-ctg;d79-att;d42-att;d79-ata;d42-ata;d79-atg;d42-atg;d79-gtt;d42-gtt;d79-gta;d42-gta;d79-gtg;d42-gtg;;critère;d79-tct;d42-tct;d79-tca;d42-tca;d79-tcg;d42-tcg;d79-cct;d42-cct;d79-cca;d42-cca;d79-ccg;d42-ccg;d79-act;d42-act;d79-aca;d42-aca;d79-acg;d42-acg;d79-gct;d42-gct;d79-gca;d42-gca;d79-gcg;d42-gcg;;critère;d79-tac;d42-tac;d79-taa;d42-taa;d79-tag;d42-tag;d79-cac;d42-cac;d79-caa;d42-caa;d79-cag;d42-cag;d79-aac;d42-aac;d79-aaa;d42-aaa;d79-aag;d42-aag;d79-gac;d42-gac;d79-gaa;d42-gaa;d79-gag;d42-gag;;critère;d79-tgc;d42-tgc;d79-tga;d42-tga;d79-tgg;d42-tgg;d79-cgt;d42-cgt;d79-cga;d42-cga;d79-cgg;d42-cgg;d79-agc;d42-agc;d79-aga;d42-aga;d79-agg;d42-agg;d79-ggc;d42-ggc;d79-gga;d42-gga;d79-ggg;d42-ggg
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49;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;49;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;49;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;49;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
50;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;50;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;50;1;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;50;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
51;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;51;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;51;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;51;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
52;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;52;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;52;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;52;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0
53;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;53;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;53;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;53;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
54;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;54;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;54;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;54;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
55;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;55;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;55;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;55;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
56;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;56;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;56;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;56;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
57;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;57;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;57;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;57;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
58;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;58;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;58;0;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;58;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
59;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;59;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;59;1;0;;;;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;59;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;60;0;0;;;;;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;;60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0

Les indices de multiplicité dans les 3 domaines

modifier

Multiplicité Tableau I

modifier 
bacilli;nombres;;672;;;;;;Bactéries;Nombres;;4032;;;;;;E79t-tg;;nombres;;db + diff;;79;!!!;;C42-tg;;nombres;;db + diff;;42;!!!
ttt;4;tct;2;tat;1;tgt;1;;ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;51;tct;920;tat;57;tgt;68;;ttt;2;tct;310;tat;2;tgt;1
att;0;act;71;aat;2;agt;0;;att;5;act;103;aat;5;agt;1;;atc;71;act;1021;aat;75;agt;80;;atc;6;act;332;aat;2;agt;0
ctt;290;cct;4;cat;1;cgc;0;;ctt;369;cct;10;cat;4;cgc;333;;ctt;857;cct;908;cat;36;cgt;884;;ctt;170;cct;155;cat;0;cgt;238
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;1022;gct;1733;gat;76;ggc;1411;;gtt;401;gct;389;gat;2;ggc;487
ttc;1642;tcc;723;tac;1440;tgc;710;;ttc;6105;tcc;4520;tac;6420;tgc;4473;;ttc;1195;tcc;86;tac;1310;tgc;1845;;ttc;296;tcc;1;tac;252;tgc;143
atc;1865;acc;559;aac;2286;agc;960;;atc;9203;acc;4513;aac;8764;agc;4422;;att;1238;acc;68;aac;1592;agc;910;;att;378;acc;0;aac;297;agc;155
ctc;451;ccc;38;cac;1123;cgt;1741;;ctc;3849;ccc;2742;cac;4715;cgt;7478;;ctc;11;ccc;29;cac;1028;cgc;24;;ctc;18;ccc;1;cac;220;cgc;0
gtc;316;gcc;178;gac;2321;ggc;1874;;gtc;4430;gcc;4166;gac;9023;ggc;9273;;gtc;67;gcc;69;gac;1571;ggt;80;;gtc;1;gcc;0;gac;409;ggt;2
tta;1252;tca;1459;taa;1;tga;6;;tta;4749;tca;5299;taa;12;tga;1315;;tta;592;tca;579;taa;75;tga;140;;tta;132;tca;92;taa;1;tga;12
ata;13;aca;1771;aaa;2045;aga;726;;ata;55;aca;5878;aaa;9105;aga;4804;;ata;564;aca;716;aaa;1413;aga;682;;ata;59;aca;100;aaa;155;aga;207
cta;1204;cca;1463;caa;1803;cga;36;;cta;4940;cca;5453;caa;6388;cga;887;;cta;486;cca;995;caa;942;cga;609;;cta;75;cca;205;caa;196;cga;92
gta;2397;gca;2677;gaa;2823;gga;1669;;gta;8859;gca;10185;gaa;9679;gga;5515;;gta;635;gca;1100;gaa;1176;gga;1041;;gta;64;gca;141;gaa;252;gga;146
ttg;752;tcg;309;tag;1;tgg;824;;ttg;3999;tcg;2622;tag;18;tgg;4366;;ttg;657;tcg;438;tag;81;tgg;936;;ttg;190;tcg;80;tag;1;tgg;173
atg;3527;acg;290;aag;447;agg;446;;atg;18026;acg;2760;aag;2427;agg;3452;;atg;2188;acg;480;aag;1627;agg;794;;atg;324;acg;66;aag;426;agg;69
ctg;370;ccg;115;cag;105;cgg;662;;ctg;5186;ccg;2183;cag;2389;cgg;3355;;ctg;711;ccg;405;cag;1095;cgg;369;;ctg;89;ccg;36;cag;149;cgg;55
gtg;5;gcg;53;gag;98;ggg;112;;gtg;1313;gcg;1224;gag;1388;ggg;2266;;gtg;1002;gcg;611;gag;1401;ggg;582;;gtg;94;gcg;60;gag;296;ggg;69
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
bacilli;Indices;;672;;;;;;Bactéries;Indices;;4032;;;;;;E79t-tg;;Indices;;db + diff;;79;!!!;;C42-tg;;Indices;;db + diff;;42;!!!
ttt;0.6;tct;0.3;tat;0.1;tgt;0.1;;ttt;0.2;tct;0.1;tat;0.1;tgt;0.1;;ttt;7.2;tct;131;tat;8.1;tgt;10;;ttt;1.1;tct;177;tat;1.1;tgt;0.6
att;0;act;11;aat;0.3;agt;0;;att;0.1;act;2.6;aat;0.1;agt;0.0;;atc;10;act;145;aat;11;agt;11;;atc;3.4;act;190;aat;1.1;agt;0
ctt;43;cct;0.6;cat;0.1;cgc;0;;ctt;9.2;cct;0.2;cat;0.1;cgc;8.3;;ctt;122;cct;129;cat;5.1;cgt;126;;ctt;97;cct;89;cat;0;cgt;136
gtt;0.1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0.2;gct;0.0;gat;0;ggt;0.0;;gtt;145;gct;246;gat;11;ggc;200;;gtt;229;gct;222;gat;1.1;ggc;278
ttc;244;tcc;108;tac;214;tgc;106;;ttc;151;tcc;112;tac;159;tgc;111;;ttc;170;tcc;12;tac;186;tgc;262;;ttc;169;tcc;0.6;tac;144;tgc;82
atc;278;acc;83;aac;340;agc;143;;atc;228;acc;112;aac;217;agc;110;;att;176;acc;10;aac;226;agc;129;;att;216;acc;0;aac;170;agc;89
ctc;67;ccc;5.7;cac;167;cgt;259;;ctc;95;ccc;68;cac;117;cgt;185;;ctc;1.6;ccc;4.1;cac;146;cgc;3.4;;ctc;10;ccc;0.6;cac;126;cgc;0
gtc;47;gcc;26;gac;345;ggc;279;;gtc;110;gcc;103;gac;224;ggc;230;;gtc;10;gcc;10;gac;223;ggt;11;;gtc;0.6;gcc;0;gac;234;ggt;1.1
tta;186;tca;217;taa;0.1;tga;0.9;;tta;118;tca;131;taa;0.3;tga;33;;tta;84;tca;82;taa;11;tga;20;;tta;75;tca;53;taa;0.6;tga;6.9
ata;1.9;aca;264;aaa;304;aga;108;;ata;1.4;aca;146;aaa;226;aga;119;;ata;80;aca;102;aaa;201;aga;97;;ata;34;aca;57;aaa;89;aga;118
cta;179;cca;218;caa;268;cga;5.4;;cta;123;cca;135;caa;158;cga;22;;cta;69;cca;141;caa;134;cga;87;;cta;43;cca;117;caa;112;cga;53
gta;357;gca;398;gaa;420;gga;248;;gta;220;gca;253;gaa;240;gga;137;;gta;90;gca;156;gaa;167;gga;148;;gta;37;gca;81;gaa;144;gga;83
ttg;112;tcg;46;tag;0.1;tgg;123;;ttg;99;tcg;65;tag;0.4;tgg;108;;ttg;93;tcg;62;tag;12;tgg;133;;ttg;108;tcg;46;tag;0.6;tgg;99
atg;525;acg;43;aag;67;agg;66;;atg;447;acg;68;aag;60;agg;86;;atg;311;acg;68;aag;231;agg;113;;atg;185;acg;38;aag;243;agg;39
ctg;55;ccg;17;cag;16;cgg;99;;ctg;129;ccg;54;cag;59;cgg;83;;ctg;101;ccg;58;cag;156;cgg;52;;ctg;51;ccg;21;cag;85;cgg;31
gtg;0.7;gcg;7.9;gag;15;ggg;17;;gtg;33;gcg;30;gag;34;ggg;56;;gtg;142;gcg;87;gag;199;ggg;83;;gtg;54;gcg;34;gag;169;ggg;39

Multiplicité Tableau II

modifier 
Archées;nombres;;184;;;;;;methanococci;;nombres;;16;;;;;alpha bactéries;;Nombres;;354;;;;;cyanobactéries;;Nombres;;83;;;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;2;tgt;0;;ttt;2;tct;0;tat;0;tgt;0
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;1;act;1;aat;3;agt;0
ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;1;cct;1;cat;0;cgc;0;;ctt;14;cct;0;cat;2;cgc;1
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;1;gat;0;ggt;0
ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;362;tcc;343;tac;354;tgc;358;;ttc;99;tcc;85;tac;101;tgc;94
atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;atc;827;acc;360;aac;379;agc;345;;atc;161;acc;88;aac;97;agc;94
ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;389;ccc;277;cac;348;cgt;368;;ctc;77;ccc;83;cac;91;cgt;91
gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;16;gcc;16;gac;25;ggc;16;;gtc;356;gcc;332;gac;511;ggc;448;;gtc;84;gcc;85;gac;100;ggc;92
tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;321;tca;345;taa;1;tga;32;;tta;69;tca;93;taa;2;tga;0
ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;16;aaa;25;aga;16;;ata;4;aca;353;aaa;354;aga;345;;ata;2;aca;96;aaa;97;aga;93
cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;16;cca;16;caa;16;cga;17;;cta;349;cca;354;caa;377;cga;30;;cta;97;cca;97;caa;94;cga;2
gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;17;gca;22;gaa;32;gga;17;;gta;358;gca;814;gaa;471;gga;351;;gta;90;gca;228;gaa;97;gga;91
ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;298;tcg;268;tag;0;tgg;347;;ttg;91;tcg;87;tag;2;tgg;91
atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;56;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;1536;acg;305;aag;263;agg;250;;atg;264;acg;84;aag;31;agg;64
ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;307;ccg;239;cag;221;cgg;358;;ctg;76;ccg;69;cag;11;cgg;83
gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;196;gcg;196;gag;178;ggg;234;;gtg;35;gcg;68;gag;7;ggg;63
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Archées;Indices;;184;;;;;;methanococci;;Indices;;16;;;;;alpha bactéries;;Indices;;354;;;;;cyanobactéries;;Indices;;83;;;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0.6;tgt;0;;ttt;2.4;tct;0;tat;0;tgt;0
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;1.2;act;1.2;aat;3.6;agt;0
ctt;0.5;cct;0;cat;0;cgt;1.1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0.3;cct;0.3;cat;0;cgc;0;;ctt;17;cct;0;cat;2.4;cgc;1.2
gtt;0.5;gct;0;gat;0;ggt;0.5;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;1.2;gat;0;ggt;0
ttc;117;tcc;103;tac;103;tgc;163;;ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;102;tcc;97;tac;100;tgc;101;;ttc;119;tcc;102;tac;122;tgc;113
atc;115;acc;103;aac;116;agc;102;;atc;100;acc;100;aac;100;agc;100;;atc;234;acc;102;aac;107;agc;97;;atc;194;acc;106;aac;117;agc;113
ctc;116;ccc;93;cac;101;cgc;102;;ctc;100;ccc;94;cac;100;cgc;100;;ctc;110;ccc;78;cac;98;cgt;104;;ctc;93;ccc;100;cac;110;cgt;110
gtc;115;gcc;100;gac;118;ggc;132;;gtc;100;gcc;100;gac;156;ggc;100;;gtc;101;gcc;94;gac;144;ggc;127;;gtc;101;gcc;102;gac;120;ggc;111
tta;104;tca;100;taa;0;tga;10;;tta;100;tca;100;taa;0;tga;100;;tta;91;tca;97;taa;0.3;tga;9.0;;tta;83;tca;112;taa;2.4;tga;0
ata;1.1;aca;108;aaa;107;aga;101;;ata;0;aca;100;aaa;156;aga;100;;ata;1.1;aca;100;aaa;100;aga;97;;ata;2.4;aca;116;aaa;117;aga;112
cta;101;cca;100;caa;107;cga;101;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;106;;cta;99;cca;100;caa;106;cga;8.5;;cta;117;cca;117;caa;113;cga;2.4
gta;101;gca;139;gaa;125;gga;103;;gta;106;gca;138;gaa;200;gga;106;;gta;101;gca;230;gaa;133;gga;99;;gta;108;gca;275;gaa;117;gga;110
ttg;89;tcg;83;tag;0.5;tgg;100;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;100;;ttg;84;tcg;76;tag;0;tgg;98;;ttg;110;tcg;105;tag;2.4;tgg;110
atg;320;acg;92;aag;90;agg;90;;atg;350;acg;6.3;aag;0;agg;0;;atg;434;acg;86;aag;74;agg;71;;atg;318;acg;101;aag;37;agg;77
ctg;87;ccg;82;cag;90;cgg;76;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;87;ccg;68;cag;62;cgg;101;;ctg;92;ccg;83;cag;13;cgg;100
gtg;92;gcg;86;gag;87;ggg;84;;gtg;44;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;55;gcg;55;gag;50;ggg;66;;gtg;42;gcg;82;gag;8.4;ggg;76

Multiplicité Tableau III

modifier 
26.5.20 Tanger;;tRNAs total des actino;;;;;
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
434;;21937;;587;450;;
ttt;2;tct;1;tat;1;tgt;1
att;0;act;3;aat;0;agt;1
ctt;4;cct;2;cat;4;cgc;6
gtt;1;gct;1;gat;4;ggt;1
ttc;460;tcc;435;tac;451;tgc;510
atc;453;acc;480;aac;546;agc;450
ctc;489;ccc;462;cac;436;cgt;570
gtc;628;gcc;561;gac;598;ggc;798
tta;434;tca;434;taa;0;tga;82
ata;5;aca;432;aaa;452;aga;446
cta;433;cca;432;caa;429;cga;6
gta;427;gca;518;gaa;437;gga;470
ttg;455;tcg;543;tag;4;tgg;471
atgj;444;acg;453;aag;549;agg;450
ctg;436;ccg;428;cag;476;cgg;457
gtg;496;gcg;372;gag;619;ggg;451
;;;;;;;
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
100;;5055;;135;104;;
ttt;0;tct;0,2;tat;0;tgt;0,2
att;0;act;0,7;aat;0;agt;0,2
ctt;0,9;cct;0,5;cat;0,9;cgc;1,4
gtt;0,2;gct;0,2;gat;0,9;ggt;0,2
ttc;106;tcc;100;tac;104;tgc;118
atc;104;acc;111;aac;126;agc;104
ctc;113;ccc;106;cac;100;cgt;131
gtc;145;gcc;129;gac;138;ggc;184
tta;100;tca;100;taa;0;tga;19
ata;1,2;aca;100;aaa;104;aga;103
cta;100;cca;100;caa;99;cga;1,4
gta;98;gca;119;gaa;101;gga;108
ttg;105;tcg;125;tag;0,9;tgg;109
atgj;102;acg;104;aag;126;agg;104
ctg;100;ccg;99;cag;110;cgg;105
gtg;114;gcg;86;gag;143;ggg;104
;;;;;;;
;;;;;;;
;;;;;;;
27.5.20 Tanger;;tRNAs total des clostridia;;;;;
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
174;;11144;;326;277;;
ttt;7;tct;2;tat;0;tgt;1
att;2;act;0;aat;0;agt;1
ctt;27;cct;4;cat;0;cgc;0
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0
ttc;358;tcc;179;tac;326;tgc;263
atc;264;acc;178;aac;431;agc;232
ctc;141;ccc;108;cac;243;cgt;202
gtc;92;gcc;106;gac;421;ggc;383
tta;300;tca;247;taa;2;tga;95
ata;5;aca;380;aaa;472;aga;303
cta;257;cca;283;caa;272;cga;83
gta;498;gca;381;gaa;415;gga;422
ttg;188;tcg;144;tag;4;tgg;209
atgj;230;acg;134;aag;208;agg;167
ctg;133;ccg;111;cag;134;cgg;105
gtg;60;gcg;61;gag;144;ggg;122
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
100;;6405;;187;159;;
ttt;4,0;tct;1,1;tat;0;tgt;0,6
att;1,1;act;0;aat;0;agt;0,6
ctt;15,5;cct;2,3;cat;0;cgc;0
gtt;0,6;gct;0;gat;0;ggt;0
ttc;206;tcc;103;tac;187;tgc;151
atc;152;acc;102;aac;248;agc;133
ctc;81;ccc;62;cac;140;cgt;116
gtc;53;gcc;61;gac;242;ggc;220
tta;172;tca;142;taa;1,1;tga;55
ata;2,9;aca;218;aaa;271;aga;174
cta;148;cca;163;caa;156;cga;48
gta;286;gca;219;gaa;239;gga;243
ttg;108;tcg;83;tag;2,3;tgg;120
atgj;132;acg;77;aag;120;agg;96
ctg;76;ccg;64;cag;77;cgg;60
gtg;34;gcg;35;gag;83;ggg;70
;;;;;;;
;;;;;;;
27.5.20 Tanger;;tRNAs total des gamma;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
1183;;86713;;3454;1540;;
ttt;18;tct;20;tat;15;tgt;2
att;1;act;6;aat;2;agt;0
ctt;11;cct;1;cat;3;cgc;0
gtt;6;gct;0;gat;0;ggt;6
ttc;2075;tcc;1795;tac;2687;tgc;1345
atc;3369;acc;1829;aac;3679;agc;1256
ctc;1204;ccc;1012;cac;1362;cgt;3520
gtc;2046;gcc;1973;gac;3421;ggc;4151
tta;1422;tca;1662;taa;12;tga;762
ata;10;aca;1666;aaa;4457;aga;1784
cta;1516;cca;1671;caa;2239;cga;156
gta;3798;gca;3342;gaa;3829;gga;1347
ttg;1214;tcg;984;tag;32;tgg;1340
atgj;2015;acg;845;aag;282;agg;1298
ctg;2977;ccg;729;cag;1208;cgg;1182
gtg;98;gcg;82;gag;90;ggg;855
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
100;;7330;;292;130;;
ttt;1,5;tct;1,7;tat;1,3;tgt;0
att;0,1;act;0,5;aat;0,2;agt;0
ctt;0,9;cct;0;cat;0;cgc;0
gtt;0,5;gct;0;gat;0;ggt;0,5
ttc;175;tcc;152;tac;227;tgc;114
atc;285;acc;155;aac;311;agc;106
ctc;102;ccc;86;cac;115;cgt;298
gtc;173;gcc;167;gac;289;ggc;351
tta;120;tca;140;taa;1,0;tga;64
ata;0,8;aca;141;aaa;377;aga;151
cta;128;cca;141;caa;189;cga;13
gta;321;gca;283;gaa;324;gga;114
ttg;103;tcg;83;tag;2,7;tgg;113
atgj;170;acg;71;aag;24;agg;110
ctg;252;ccg;62;cag;102;cgg;100
gtg;8,3;gcg;6,9;gag;7,6;ggg;72
;;;;;;;
;;;;;;;
27.5.20 Tanger;;tRNAs total des bacteroides;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
146;;7096;;188;153;;
ttt;2;tct;1;tat;1;tgt;1
att;1;act;0;aat;0;agt;0
ctt;1;cct;2;cat;0;cgc;2
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1
ttc;188;tcc;143;tac;222;tgc;174
atc;430;acc;149;aac;190;agc;161
ctc;144;ccc;84;cac;167;cgt;195
gtc;51;gcc;121;gac;252;ggc;221
tta;164;tca;182;taa;9;tga;3
ata;1;aca;235;aaa;271;aga;157
cta;159;cca;218;caa;165;cga;62
gta;269;gca;417;gaa;264;gga;206
ttg;147;tcg;31;tag;1;tgg;171
atgj;166;acg;47;aag;69;agg;99
ctg;72;ccg;44;cag;42;cgg;81
gtg;5;gcg;6;gag;37;ggg;50
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
100;;4860;;129;105;;
ttt;1,4;tct;0,7;tat;0,7;tgt;0,7
att;0,7;act;0;aat;0;agt;0
ctt;0,7;cct;1,4;cat;0;cgc;1,4
gtt;0,7;gct;0;gat;0;ggt;0,7
ttc;129;tcc;98;tac;152;tgc;119
atc;295;acc;102;aac;130;agc;110
ctc;99;ccc;58;cac;114;cgt;134
gtc;35;gcc;83;gac;173;ggc;151
tta;112;tca;125;taa;6,2;tga;2,1
ata;0,7;aca;161;aaa;186;aga;108
cta;109;cca;149;caa;113;cga;42
gta;184;gca;286;gaa;181;gga;141
ttg;101;tcg;21;tag;0,7;tgg;117
atgj;114;acg;32;aag;47;agg;68
ctg;49;ccg;30;cag;29;cgg;55
gtg;3,4;gcg;4,1;gag;25;ggg;34

Multiplicité Tableau IV

modifier 
29.5.20 Tanger;;tRNAs total des bacilli;;49599;;;
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
618;;49366;;1762;901;;
ttt;1;tct;2;tat;3;tgt;0
att;1;act;71;aat;3;agt;0
ctt;292;cct;4;cat;1;cgc;1
gtt;1;gct;3;gat;0;ggt;0
ttc;1683;tcc;739;tac;1475;tgc;726
atc;1915;acc;567;aac;2337;agc;980
ctc;464;ccc;38;cac;1152;cgt;1779
gtc;328;gcc;185;gac;2384;ggc;1913
tta;1301;tca;1506;taa;7;tga;11
ata;13;aca;1818;aaa;2100;aga;736
cta;1227;cca;1501;caa;1846;cga;39
gta;2451;gca;2740;gaa;2895;gga;1884
ttg;770;tcg;292;tag;5;tgg;847
atgj;941;acg;293;aag;452;agg;446
ctg;372;ccg;115;cag;105;cgg;672
gtg;5;gcg;53;gag;98;ggg;114
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
100;;7988;;285;146;;
ttt;0,2;tct;0,3;tat;0,5;tgt;0
att;0,2;act;11;aat;0,5;agt;0
ctt;47;cct;0,6;cat;0,2;cgc;0,2
gtt;0,2;gct;0,5;gat;0;ggt;0
ttc;272;tcc;120;tac;239;tgc;117
atc;310;acc;92;aac;378;agc;159
ctc;75;ccc;6,1;cac;186;cgt;288
gtc;53;gcc;30;gac;386;ggc;310
tta;211;tca;244;taa;1,1;tga;1,8
ata;2,1;aca;294;aaa;340;aga;119
cta;199;cca;243;caa;299;cga;6,3
gta;397;gca;443;gaa;468;gga;305
ttg;125;tcg;47;tag;0,8;tgg;137
atgj;152;acg;47;aag;73;agg;72
ctg;60;ccg;19;cag;17;cgg;109
gtg;0,8;gcg;8,6;gag;16;ggg;18
;;;;;;;
;;;;;;;
;;;;;;;
;;;;;;;
30.5.20 Tanger;;tRNAs total des alpha;;17165;;;
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
347;;16935;;820;368;;
ttt;2;tct;0;tat;3;tgt;1
att;0;act;1;aat;0;agt;0
ctt;4;cct;1;cat;0;cgc;1
gtt;0;gct;0;gat;2;ggt;0
ttc;378;tcc;351;tac;361;tgc;363
atc;838;acc;375;aac;384;agc;349
ctc;401;ccc;283;cac;353;cgt;387
gtc;363;gcc;337;gac;519;ggc;460
tta;327;tca;353;taa;4;tga;36
ata;6;aca;370;aaa;367;aga;356
cta;356;cca;360;caa;391;cga;32
gta;366;gca;829;gaa;489;gga;360
ttg;317;tcg;309;tag;1;tgg;355
atgj;403;acg;315;aag;278;agg;261
ctg;312;ccg;245;cag;225;cgg;370
gtg;203;gcg;203;gag;187;ggg;244
;;;;;;;
genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds
100;;4880;;236;106;;
ttt;0,6;tct;0;tat;0,9;tgt;0,3
att;0;act;0,3;aat;0;agt;0
ctt;1,2;cct;0,3;cat;0;cgc;0,3
gtt;0;gct;0;gat;0,6;ggt;0
ttc;109;tcc;101;tac;104;tgc;105
atc;241;acc;108;aac;111;agc;101
ctc;116;ccc;82;cac;102;cgt;112
gtc;105;gcc;97;gac;150;ggc;133
tta;94;tca;102;taa;1,2;tga;10
ata;1,7;aca;107;aaa;106;aga;103
cta;103;cca;104;caa;113;cga;9,2
gta;105;gca;239;gaa;141;gga;104
ttg;91;tcg;89;tag;0,3;tgg;102
atgj;116;acg;91;aag;80;agg;75
ctg;90;ccg;71;cag;65;cgg;107
gtg;59;gcg;59;gag;54;ggg;70

Multiplicité Tableau V

modifier 
tener;effectifs;;10.1.21;ttt 1;3535;génomes;112;;spiro;effectifs;;11.1.21;ttt ;2823;génomes;73;;cyano;;ttt;3;nombres;25.11.20;84;3956
atgi;97;tct;;tat;;atgf;107;;atgi;70;tct;;tat;;atgf;70;;atgi;88;tct;0;tat;0;atgf;82
att;1;act;22;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;6;act;2;aat;3;agt;0
ctt;15;cct;;cat;;cgc;43;;ctt;;cct;;cat;;cgc;66;;ctt;14;cct;2;cat;2;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;1;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;0;gct;1;gat;0;ggt;0
ttc;116;tcc;45;tac;112;tgc;111;;ttc;91;tcc;73;tac;73;tgc;73;;ttc;103;tcc;86;tac;99;tgc;95
atc;115;acc;80;aac;116;agc;111;;atc;73;acc;73;aac;73;agc;73;;atc;164;acc;89;aac;98;agc;96
ctc;36;ccc;;cac;112;cgt;81;;ctc;75;ccc;40;cac;73;cgt;9;;ctc;79;ccc;85;cac;92;cgt;93
gtc;2;gcc;1;gac;114;ggc;63;;gtc;40;gcc;43;gac;78;ggc;75;;gtc;86;gcc;91;gac;100;ggc;91
tta;110;tca;112;taa;;tga;101;;tta;73;tca;73;taa;;tga;12;;tta;70;tca;96;taa;2;tga;0
ata;10;aca;115;aaa;136;aga;115;;ata;1;aca;73;aaa;73;aga;74;;ata;8;aca;96;aaa;97;aga;96
cta;112;cca;111;caa;115;cga;42;;cta;73;cca;73;caa;73;cga;67;;cta;99;cca;109;caa;96;cga;2
gta;118;gca;116;gaa;117;gga;114;;gta;74;gca;83;gaa;60;gga;73;;gta;93;gca;162;gaa;99;gga;93
ttg;110;tcg;37;tag;;tgg;112;;ttg;73;tcg;30;tag;;tgg;73;;ttg;100;tcg;95;tag;2;tgg;92
atgj;105;acg;28;aag;69;agg;25;;atgj;71;acg;42;aag;57;agg;48;;atgj;99;acg;86;aag;32;agg;65
ctg;;ccg;;cag;;cgg;3;;ctg;38;ccg;31;cag;31;cgg;34;;ctg;77;ccg;71;cag;11;cgg;84
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;25;gcg;30;gag;29;ggg;15;;gtg;36;gcg;69;gag;7;ggg;64
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
tener;indices;;10.1.21;ttt 1;;génomes;112;;spiro;indices;;11.1.21;ttt ;;génomes;73;;cyano;;ttt;3.6;;indices;25.11.20;84
atgi;87;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;96;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;105;tct;;tat;;atgf;98
att;1;act;20;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;7.1;act;2.4;aat;3.6;agt;
ctt;13;cct;;cat;;cgc;38;;ctt;;cct;;cat;;cgc;90;;ctt;17;cct;2.4;cat;2.4;cgc;1.2
gtt;;gct;;gat;;ggt;1;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;1.2;gat;;ggt;
ttc;104;tcc;40;tac;100;tgc;99;;ttc;125;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;123;tcc;102;tac;118;tgc;113
atc;103;acc;71;aac;104;agc;99;;atc;100;acc;100;aac;100;agc;100;;atc;195;acc;106;aac;117;agc;114
ctc;32;ccc;;cac;100;cgt;72;;ctc;103;ccc;55;cac;100;cgt;12;;ctc;94;ccc;101;cac;110;cgt;111
gtc;2;gcc;1;gac;102;ggc;56;;gtc;55;gcc;59;gac;107;ggc;103;;gtc;102;gcc;108;gac;119;ggc;108
tta;98;tca;100;taa;;tga;90;;tta;100;tca;100;taa;;tga;16;;tta;83;tca;114;taa;2.4;tga;
ata;9;aca;103;aaa;121;aga;103;;ata;1;aca;100;aaa;100;aga;101;;ata;9.5;aca;114;aaa;115;aga;114
cta;100;cca;99;caa;103;cga;38;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;92;;cta;118;cca;130;caa;114;cga;2.4
gta;105;gca;104;gaa;104;gga;102;;gta;101;gca;114;gaa;82;gga;100;;gta;111;gca;193;gaa;118;gga;111
ttg;98;tcg;33;tag;;tgg;100;;ttg;100;tcg;41;tag;;tgg;100;;ttg;119;tcg;113;tag;2.4;tgg;110
atgj;94;acg;25;aag;62;agg;22;;atgj;97;acg;58;aag;78;agg;66;;atgj;118;acg;102;aag;38;agg;77
ctg;;ccg;;cag;;cgg;3;;ctg;52;ccg;42;cag;42;cgg;47;;ctg;92;ccg;85;cag;13;cgg;100
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;34;gcg;41;gag;40;ggg;21;;gtg;43;gcg;82;gag;8.3;ggg;76

Multiplicité Tableau VI

modifier 
beta;effectifs;;11.1.21;ttt 14;15707;génomes;268;;epsilon;effectifs;;11.1.21;ttt ;6531;génomes;161;;delta;effectifs;ttt 1;11.1.21;;3550;genomes;65
atgi;264;tct;1;tat;;atgf;474;;atgi;159;tct;;tat;1;atgf;170;;atgi;63;tct;;tat;;atgf;97
att;3;act;2;aat;1;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;6;cct;;cat;;cgc;2;;ctt;;cct;;cat;;cgc;156;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;6
gtt;2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;289;tcc;272;tac;288;tgc;380;;ttc;172;tcc;156;tac;166;tgc;162;;ttc;79;tcc;71;tac;77;tgc;70
atc;983;acc;273;aac;492;agc;271;;atc;307;acc;159;aac;181;agc;162;;atc;158;acc;77;aac;79;agc;68
ctc;383;ccc;267;cac;291;cgt;502;;ctc;162;ccc;89;cac;161;cgt;0;;ctc;84;ccc;69;cac;72;cgt;87
gtc;403;gcc;331;gac;660;ggc;599;;gtc;157;gcc;153;gac;224;ggc;225;;gtc;65;gcc;85;gac;107;ggc;114
tta;148;tca;266;taa;;tga;161;;tta;167;tca;163;taa;;tga;97;;tta;70;tca;70;taa;2;tga;56
ata;1;aca;306;aaa;325;aga;306;;ata;;aca;174;aaa;241;aga;200;;ata;;aca;66;aaa;77;aga;69
cta;272;cca;366;caa;330;cga;;;cta;162;cca;162;caa;175;cga;161;;cta;70;cca;68;caa;72;cga;42
gta;315;gca;1000;gaa;542;gga;272;;gta;224;gca;320;gaa;278;gga;178;;gta;75;gca;152;gaa;117;gga;68
ttg;274;tcg;297;tag;7;tgg;274;;ttg;163;tcg;1;tag;1;tgg;161;;ttg;82;tcg;69;tag;1;tgg;72
atgj;287;acg;257;aag;275;agg;264;;atgj;158;acg;3;aag;15;agg;154;;atgj;73;acg;64;aag;55;agg;65
ctg;513;ccg;247;cag;2;cgg;286;;ctg;2;ccg;1;cag;1;cgg;2;;ctg;79;ccg;64;cag;57;cgg;60
gtg;242;gcg;211;gag;1;ggg;220;;gtg;;gcg;;gag;40;ggg;3;;gtg;54;gcg;51;gag;40;ggg;61
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
beta;indices;;11.1.21;ttt 5;;génomes;268;;epsilon;indices;;11.1.21;ttt;;génomes;161;;delta;11.1.21;ttt;1.4;;;genomes;65
atgi;99;tct;0.4;tat;;atgf;177;;atgi;99;tct;;tat;0.6;atgf;106;;atgi;97;tct;;tat;;atgf;149
att;1;act;1;aat;0.4;agt;0.4;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;2;cct;;cat;;cgc;1;;ctt;;cct;;cat;;cgc;97;;ctt;1.5;cct;;cat;;cgc;9
gtt;0.7;gct;;gat;;ggt;;;gtt;1.2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;108;tcc;101;tac;107;tgc;142;;ttc;107;tcc;97;tac;103;tgc;101;;ttc;122;tcc;109;tac;118;tgc;108
atc;367;acc;102;aac;184;agc;101;;atc;191;acc;99;aac;112;agc;101;;atc;243;acc;118;aac;122;agc;105
ctc;143;ccc;100;cac;109;cgt;187;;ctc;101;ccc;55;cac;100;cgt;0;;ctc;129;ccc;106;cac;111;cgt;134
gtc;150;gcc;124;gac;246;ggc;224;;gtc;98;gcc;95;gac;139;ggc;140;;gtc;100;gcc;131;gac;165;ggc;175
tta;55;tca;99;taa;;tga;60;;tta;104;tca;101;taa;;tga;60;;tta;108;tca;108;taa;3.1;tga;86
ata;0;aca;114;aaa;121;aga;114;;ata;;aca;108;aaa;150;aga;124;;ata;;aca;102;aaa;118;aga;106
cta;101;cca;137;caa;123;cga;;;cta;101;cca;101;caa;109;cga;100;;cta;108;cca;105;caa;111;cga;65
gta;118;gca;373;gaa;202;gga;101;;gta;139;gca;199;gaa;173;gga;111;;gta;115;gca;234;gaa;180;gga;105
ttg;102;tcg;111;tag;3;tgg;102;;ttg;101;tcg;0.6;tag;0.6;tgg;100;;ttg;126;tcg;106;tag;1.5;tgg;111
atgj;107;acg;96;aag;103;agg;99;;atgj;98;acg;1.9;aag;9;agg;96;;atgj;112;acg;98;aag;85;agg;100
ctg;191;ccg;92;cag;0.7;cgg;107;;ctg;1.2;ccg;0.6;cag;0.6;cgg;1.2;;ctg;122;ccg;98;cag;88;cgg;92
gtg;90;gcg;79;gag;0.4;ggg;82;;gtg;;gcg;;gag;25;ggg;1.9;;gtg;83;gcg;78;gag;40;ggg;94

Cinq eucaryotes à effectifs élevés

modifier 
;;;;;;;13732;;;;;;;;;
cmkf;différents;;;db,dif;;;10269;;cmkb;double;;db,dif;;;;3402
ttt;2;tct;13;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;12;tat;0;tgt;0
atc;−;act;16;aat;1;agt;−;;atc;0;act;7;aat;0;agt;0
ctt;13;cct;10;cat;0;cgt;4;;ctt;6;cct;1;cat;0;cgt;4
gtt;15;gct;55;gat;5;ggc;6;;gtt;6;gct;19;gat;0;ggc;12
ttc;24;tcc;0;tac;28;tgc;9;;ttc;10;tcc;0;tac;7;tgc;5
att;22;acc;11;aac;31;agc;22;;att;8;acc;0;aac;16;agc;10
ctc;1;ccc;5;cac;26;cgc;−;;ctc;0;ccc;0;cac;10;cgc;0
gtc;15;gcc;164;gac;34;ggt;1;;gtc;0;gcc;3;gac;14;ggt;0
tta;11;tca;50;taa;0;tga;2;;tta;1;tca;3;taa;0;tga;0
ata;18;aca;156;aaa;37;aga;13;;ata;4;aca;49;aaa;5;aga;0
cta;17;cca;43;caa;5;cga;21;;cta;2;cca;7;caa;1;cga;3
gta;115;gca;3008;gaa;58;gga;43;;gta;29;gca;2889;gaa;7;gga;22
ttg;29;tcg;47;tag;3;tgg;19;;ttg;1;tcg;0;tag;0;tgg;10
atg;73;acg;132;aag;24;agg;6;;atg;20;acg;4;aag;11;agg;5
ctg;19;ccg;40;cag;9;cgg;1;;ctg;5;ccg;0;cag;8;cgg;0
gtg;1502;gcg;3757;gag;405;ggg;73;;gtg;37;gcg;100;gag;22;ggg;7
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;7113;;;;;;;;;
bacuf;;différents;;;db,dif;;6717;;bacub;;double;;db,dif;;;342
ttt;−;tct;6;tat;−;tgt;1;;ttt;0;tct;3;tat;0;tgt;0
atc;0;act;8;aat;−;agt;−;;atc;0;act;4;aat;0;agt;0
ctt;1;cct;1;cat;−;cgt;5;;ctt;4;cct;5;cat;0;cgt;3
gtt;8;gct;17;gat;18;ggc;50;;gtt;5;gct;2;gat;1;ggc;13
ttc;8;tcc;0;tac;13;tgc;18;;ttc;4;tcc;0;tac;0;tgc;5
att;5;acc;−;aac;6;agc;9;;att;6;acc;0;aac;17;agc;3
ctc;−;ccc;−;cac;3;cgc;−;;ctc;0;ccc;0;cac;7;cgc;0
gtc;0;gcc;−;gac;37;ggt;10;;gtc;0;gcc;0;gac;7;ggt;1
tta;11;tca;4;taa;23;tga;16;;tta;1;tca;0;taa;0;tga;0
ata;7;aca;6;aaa;81;aga;54;;ata;0;aca;1;aaa;4;aga;0
cta;3;cca;2;caa;7;cga;7;;cta;0;cca;2;caa;2;cga;1
gta;17;gca;41;gaa;2320;gga;961;;gta;0;gca;0;gaa;47;gga;25
ttg;7;tcg;3;tag;8;tgg;242;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;13
atg;12;acg;3;aag;23;agg;66;;atg;8;acg;0;aag;5;agg;0
ctg;3;ccg;1;cag;15;cgg;19;;ctg;3;ccg;2;cag;4;cgg;1
gtg;23;gcg;18;gag;446;ggg;2044;;gtg;8;gcg;1;gag;21;ggg;103
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;5873;;;;;;;;;
ttrf;;différents;;;db,dif;;5586;;ttrb;;double;;db,dif;;;231
ttt;−;tct;8;tat;0;tgt;4;;ttt;0;tct;3;tat;0;tgt;1
atc;−;act;6;aat;−;agt;−;;atc;0;act;2;aat;0;agt;0
ctt;0;cct;2;cat;−;cgt;4;;ctt;5;cct;4;cat;0;cgt;2
gtt;6;gct;13;gat;9;ggc;36;;gtt;1;gct;5;gat;0;ggc;6
ttc;7;tcc;−;tac;16;tgc;19;;ttc;4;tcc;0;tac;1;tgc;2
att;5;acc;0;aac;5;agc;7;;att;5;acc;0;aac;7;agc;3
ctc;−;ccc;−;cac;4;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;4;cgc;0
gtc;2;gcc;1;gac;43;ggt;17;;gtc;0;gcc;0;gac;5;ggt;1
tta;5;tca;5;taa;19;tga;20;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0
ata;4;aca;4;aaa;69;aga;47;;ata;0;aca;1;aaa;4;aga;0
cta;3;cca;2;caa;11;cga;6;;cta;0;cca;2;caa;4;cga;0
gta;15;gca;35;gaa;1871;gga;813;;gta;0;gca;0;gaa;29;gga;19
ttg;6;tcg;3;tag;7;tgg;207;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;9
atg;10;acg;2;aag;15;agg;52;;atg;6;acg;0;aag;3;agg;1
ctg;4;ccg;1;cag;7;cgg;11;;ctg;1;ccg;2;cag;7;cgg;0
gtg;18;gcg;19;gag;386;ggg;1695;;gtg;3;gcg;1;gag;8;ggg;70
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;4061;;;;;;;;;
btaf;;différents;;;db,dif;;3678;;btab;;double;;db,dif;;;320
ttt;5;tct;4;tat;10;tgt;133;;ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;9
atc;−;act;9;aat;−;agt;3;;atc;0;act;4;aat;0;agt;0
ctt;4;cct;1;cat;3;cgt;5;;ctt;6;cct;11;cat;0;cgt;7
gtt;12;gct;18;gat;5;ggc;54;;gtt;7;gct;12;gat;0;ggc;8
ttc;17;tcc;27;tac;37;tgc;312;;ttc;12;tcc;4;tac;1;tgc;25
att;3;acc;0;aac;13;agc;10;;att;14;acc;0;aac;16;agc;8
ctc;−;ccc;−;cac;4;cgc;6;;ctc;0;ccc;0;cac;14;cgc;0
gtc;−;gcc;1;gac;32;ggt;19;;gtc;0;gcc;0;gac;9;ggt;0
tta;9;tca;6;taa;3;tga;28;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0
ata;7;aca;7;aaa;67;aga;43;;ata;0;aca;2;aaa;10;aga;0
cta;4;cca;2;caa;17;cga;10;;cta;0;cca;6;caa;2;cga;1
gta;18;gca;30;gaa;423;gga;384;;gta;2;gca;4;gaa;11;gga;6
ttg;13;tcg;6;tag;12;tgg;172;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;5
atg;18;acg;6;aag;24;agg;113;;atg;16;acg;0;aag;15;agg;2
ctg;2;ccg;0;cag;31;cgg;12;;ctg;3;ccg;3;cag;8;cgg;3
gtg;26;gcg;13;gag;160;ggg;1265;;gtg;12;gcg;2;gag;3;ggg;29
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;3778;;;;;;;;;
fcaf;;différents;;;db,dif;;3561;;fcab;;double;;db,dif;;;158
ttt;0;tct;2;tat;−;tgt;0;;ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0
atc;−;act;5;aat;4;agt;1;;atc;0;act;3;aat;0;agt;0
ctt;0;cct;1;cat;1;cgt;3;;ctt;5;cct;6;cat;0;cgt;5
gtt;3;gct;13;gat;0;ggc;2;;gtt;4;gct;4;gat;0;ggc;7
ttc;7;tcc;0;tac;8;tgc;18;;ttc;4;tcc;0;tac;1;tgc;13
att;1;acc;−;aac;20;agc;7;;att;8;acc;0;aac;7;agc;4
ctc;−;ccc;0;cac;7;cgc;8;;ctc;0;ccc;0;cac;8;cgc;0
gtc;−;gcc;0;gac;1;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;7;ggt;0
tta;18;tca;12;taa;35;tga;17;;tta;0;tca;1;taa;1;tga;0
ata;8;aca;11;aaa;44;aga;53;;ata;0;aca;1;aaa;5;aga;0
cta;32;cca;63;caa;776;cga;1193;;cta;0;cca;4;caa;5;cga;7
gta;5;gca;8;gaa;10;gga;45;;gta;0;gca;1;gaa;4;gga;2
ttg;7;tcg;4;tag;11;tgg;21;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;1
atg;14;acg;8;aag;878;agg;51;;atg;9;acg;0;aag;8;agg;1
ctg;2;ccg;4;cag;44;cgg;23;;ctg;2;ccg;2;cag;2;cgg;0
gtg;2;gcg;5;gag;40;ggg;4;;gtg;6;gcg;1;gag;3;ggg;1
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;433;;;;;;;;;
hsa-18f;;dif,db;différents;;;;221;;hsa-18b;;dif,db;double;;;;164
ttt;−;tct;3;tat;0;tgt;−;;ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0
atc;0;act;5;aat;−;agt;−;;atc;2;act;3;aat;0;agt;0
ctt;3;cct;1;cat;−;cgt;1;;ctt;5;cct;7;cat;0;cgt;5
gtt;5;gct;15;gat;−;ggc;4;;gtt;4;gct;10;gat;0;ggc;9
ttc;4;tcc;−;tac;12;tgc;22;;ttc;5;tcc;0;tac;0;tgc;6
att;9;acc;−;aac;16;agc;5;;att;5;acc;0;aac;8;agc;2
ctc;−;ccc;−;cac;0;cgc;−;;ctc;0;ccc;0;cac;8;cgc;0
gtc;−;gcc;−;gac;2;ggt;−;;gtc;0;gcc;0;gac;10;ggt;0
tta;3;tca;3;taa;−;tga;1;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0
ata;4;aca;5;aaa;7;aga;5;;ata;0;aca;0;aaa;4;aga;0
cta;2;cca;2;caa;3;cga;5;;cta;0;cca;4;caa;2;cga;0
gta;3;gca;6;gaa;4;gga;3;;gta;1;gca;1;gaa;3;gga;5
ttg;6;tcg;3;tag;−;tgg;4;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;2
atg;8;acg;4;aag;9;agg;4;;atg;11;acg;0;aag;5;agg;0
ctg;1;ccg;1;cag;6;cgg;1;;ctg;7;ccg;2;cag;6;cgg;2
gtg;5;gcg;3;gag;1;ggg;2;;gtg;7;gcg;0;gag;6;ggg;2

La genèse des tRNAs dans les 3 domaines

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La genèse des 4032 bactéries

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Les solitaires

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;;;Les soliaires;;;;;;;;;;;;;;;
;4;ct;ag;;;4;ct;ag;;;4;ct;ag;;;4;ct;ag
total;3948;3938;3933;;total;3945;3825;3943;;total;3932;3932;29;;total;3947;3927;3934
ttt;0;0;;;tct;0;3;;;tat;0;0;;;tgt;0;0;
ttc;15;3928;;;tcc;2;3820;;;tac;3899;3928;;;tgc;12;3924;
tta;0;;96;;tca;85;;1493;;taa;0;;12;;tga;0;;15
ttg;2;;190;;tcg;0;;22;;tag;0;;16;;tgg;17;;2629
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;3940;3832;3933;;total;3940;2665;3937;;total;3938;3933;3943;;total;3946;3930;3833
ctt;0;322;;;cct;0;8;;;cat;0;0;;;cgt;106;3610;
ctc;7;3501;;;ccc;3;2656;;;cac;5;3930;;;cgc;1;307;
cta;98;;1151;;cca;1173;;1813;;caa;6;;2130;;cga;7;;539
ctg;0;;17;;ccg;1;;5;;cag;2;;18;;cgg;7;;3026
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;3949;3864;3947;;total;3946;3775;3944;;total;3949;3930;3941;;total;3944;3931;3928
att;0;1;;;act;0;41;;;aat;0;0;;;agt;0;0;
atc;2;3856;;;acc;2;3682;;;aac;2;3925;;;agc;1;3930;
ata;0;;0;;aca;152;;1288;;aaa;5;;1899;;aga;0;;780
atg;81;;3947;;acg;3;;13;;aag;1;;9;;agg;0;;10
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;3943;3212;3935;;total;3934;3035;3902;;total;3949;3933;3928;;total;3948;3880;3939
gtt;0;5;;;gct;0;0;;;gat;0;0;;;ggt;0;1;
gtc;8;3200;;;gcc;32;3033;;;gac;5;3933;;;ggc;9;3879;
gta;724;;2724;;gca;877;;2721;;gaa;8;;2808;;gga;66;;1699
gtg;1;;2;;gcg;7;;11;;gag;1;;5;;ggg;0;;11

La genèse

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  • Lien aux tableaux:La genèse.
  • Légende: Prélèvement du 29.10.18
Bactéries ;;4032;;genèse;;;;;Bactéries ;;4032;;Effectifs;;;;;Bactéries ;;4032;genèse;;duplication;;%
ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0
att;5;act;92;aat;5;agt;1;;att;5;act;101;aat;5;agt;1;;att;0;act;10;aat;0;agt;0
ctt;331;cct;10;cat;3;cgc;318;;ctt;368;cct;10;cat;4;cgc;333;;ctt;11;cct;0;cat;33;cgc;5
gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;-;ggt;0
ttc;3938;tcc;3822;tac;3932;tgc;3927;;ttc;6100;tcc;4517;tac;6416;tgc;4471;;ttc;55;tcc;18;tac;63;tgc;14
atc;3863;acc;3732;aac;3930;agc;3931;;atc;9193;acc;4511;aac;8758;agc;4419;;atc;138;acc;21;aac;123;agc;12
ctc;3510;ccc;2657;cac;3933;cgt;3623;;ctc;3848;ccc;2741;cac;4712;cgt;7473;;ctc;10;ccc;3;cac;20;cgt;106
gtc;3207;gcc;3035;gac;3933;ggc;3879;;gtc;4426;gcc;4164;gac;9017;ggc;9265;;gtc;38;gcc;37;gac;129;ggc;139
tta;3741;tca;3921;taa;12;tga;1304;;tta;4746;tca;5296;taa;12;tga;1314;;tta;27;tca;35;taa;0;tga;1
ata;48;aca;3929;aaa;3930;aga;3916;;ata;55;aca;5874;aaa;9100;aga;4802;;ata;15;aca;50;aaa;132;aga;23
cta;3916;cca;3932;caa;3924;cga;807;;cta;4937;cca;5449;caa;6385;cga;887;;cta;26;cca;39;caa;63;cga;10
gta;3931;gca;3889;gaa;3923;gga;3926;;gta;8853;gca;10177;gaa;9673;gga;5511;;gta;125;gca;162;gaa;147;gga;40
ttg;3835;tcg;2449;tag;17;tgg;3918;;ttg;3997;tcg;2621;tag;18;tgg;4364;;ttg;4;tcg;7;tag;6;tgg;11
atg;3945;acg;2655;aag;2040;agg;3147;;atg;18014;acg;2759;aag;2425;agg;3449;;atg;357;acg;4;aag;19;agg;10
ctg;2782;ccg;2124;cag;1811;cgg;3292;;ctg;5182;ccg;2182;cag;2387;cgg;3353;;ctg;86;ccg;3;cag;32;cgg;2
gtg;1209;gcg;1181;gag;1121;ggg;2238;;gtg;1313;gcg;1224;gag;1387;ggg;2264;;gtg;9;gcg;4;gag;24;ggg;1

Distribution des duplications

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  • Lien aux tableaux:Distribution des duplications.
  • Légende: Décompte du 04.12.18. Le séparateur de calc est :. ? * § $ pour les couleurs de la genèse, respectivement de 3,945−3,822   3,741−3,035  2,782−1,811   1,304−807.
occur.;ctt;gtt;tct;act;cct;gct;cgc;ggt;;occur.;ttt;att;tat;aat;cat;gat;tgt;agt
1;295;9;5;83;10;2;304;1;;1;10;5;4;5;2;0;3;1
2;35; ; ;9; ; ;13;;;2; ; ; ; ;1; ; ; 
3;1; ; ; ; ; ;1;;;3; ; ; ; ; ; ; ; 
genèse;331;9;5;92;10;2;318;1;;genèse;10;5;4;5;3;0;3;1
Dup %;11;0;0;10;0;0;5;0;;Dup %;0;0;0;0;33;−;0;0
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
occur.;ctc;gtc;tcc;acc;ccc;gcc;cgt;ggc;;occur.;ttc;atc;tac;aac;cac;gac;tgc;agc
1;3192;2189;3165;2965;2586;2055;1623;1359;;1;2281;1329;2373;1753;3208;1402;348;3471
2;307;849;624;755;58;884;910;1008;;2;1304;832;826;770;686;889;377;435
3;7;152;29;12;13;61;551;565;;3;217;1,055;630;466;31;1,087;52;22
4;1;6;3; ; ;20;429;741;;4;125;391;52;706;4;363;12;3
5;2;7;1; ; ;12;50;110;;5;7;135;27;189;2;65;4; 
6;0;4; ; ; ;3;45;48;;6;3;77;14;31;1;104;1; 
7;1; ; ; ; ; ;5;23;;7;1;26;7;10;1;17;1; 
8; ; ; ; ; ; ;6;11;;8; ;14;2;3; ;3; ; 
9; ; ; ; ; ; ;2;4;;9; ;1;1;2; ;1; ; 
10; ; ; ; ; ; ;0;4;;10; ;2; ; ; ;0; ; 
11; ; ; ; ; ; ;0;4;;11; ;0; ; ; ;1; ; 
12; ; ; ; ; ; ;0;2;;12; ;0; ; ; ;1; ; 
13; ; ; ; ; ; ;1; ;;13; ;1; ; ; ; ; ; 
27; ; ; ; ; ; ;1; ;;14; ; ; ; ; ; ; ; 
genèse;*3510;*3207;?3822;*3732;§2657;*3035;*3623;?3879;;genèse;?3938;?3863;?3932;?3930;?3933;?3933;?3927;?3931
Dup %;10;38;18;21;3;37;106;139;;Dup %;55;138;63;123;20;129;14;12
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
occur.;cta;gta;tca;aca;cca;gca;cga;gga;;occur.;tta;ata;taa;aaa;caa;gaa;tga;aga
1;3277;1957;2982;2824;2822;1343;772;3018;;1;2969;44;12;193;2289;1566;1294;3314
2;436;475;654;612;794;582;13;475;;2;576;2; ;724;1,162;837;10;449
3;133;596;165;253;241;1000;8;250;;3;167;1; ;416;185;523; ;97
4;27;525;101;150;64;482;9;141;;4;22;1; ;204;235;569; ;25
5;24;258;13;73;7;250;1;28;;5;6; ; ;393;42;168; ;13
6;2;90;3;17;3;167;4;10;;6;1; ; ;197;10;117; ;5
7;7;20;2; ;1;43; ;3;;7; ; ; ;38;1;118; ;4
8;2;6;0; ; ;16; ;1;;8; ; ; ;16; ;17; ;5
9;0;2;0; ; ;2; ; ;;9; ; ; ;9; ;3; ;4
10;4;0;0; ; ;1; ; ;;10; ; ; ;1; ;1; ; 
11;4;2;1; ; ;3; ; ;;11; ; ; ;0; ;2; ; 
12; ; ; ; ; ; ; ; ;;12; ; ; ;1; ;1; ; 
13; ; ; ; ; ; ; ; ;;13; ; ; ;0; ;1; ; 
14; ; ; ; ; ; ; ; ;;14; ; ; ;1; ; ; ; 
genèse;?3916;?3931;?3921;?3929;?3932;?3889;$807;?3926;;genèse;*3741;48;12;?3930;?3924;?3923;1304;?3916
Dup %;26;125;35;50;39;162;10;40;;Dup %;27;15;0;132;63;147;1;23
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
occur.;ctg;gtg;tcg;acg;ccg;gcg;cgg;ggg;;occur.;ttg;atg;tag;aag;cag;gag;tgg;agg
1;1668;1114;23;2556;2069;1145;3241;2214;;1;3696;-;16;1746;1247;915;3539;2846
2;440;88;129;95;53;30;45;22;;2;119;-;1;219;556;152;321;300
3;119;5;17;3;1;5;4;2;;3;17;-; ;65;6;50;51;1
4;530;2;3;1;1;1;1; ;;4;3;-; ;6;1;3;5; 
5;5; ; ; ; ; ;0; ;;5; ; ; ;2;0;0;2; 
6;15; ; ; ; ; ;1; ;;6; ; ; ;2;1;1; ; 
7;1; ; ; ; ; ; ; ;;7; ; ; ; ; ; ; ; 
8;2; ; ; ; ; ; ; ;;8; ; ; ; ; ; ; ; 
9;1; ; ; ; ; ; ; ;;9; ; ; ; ; ; ; ; 
10;1; ; ; ; ; ; ; ;;10; ; ; ; ; ; ; ; 
genèse;§2782;$1209;§2449;§2655;§2124;$1181;*3292;§2238;;genèse;?3835;-;17;§2040;§1811;$1121;?3918;*3147
Dup %;86;9;7;4;3;4;2;1;;Dup %;4;-;6;19;32;24;11;10

Distribution des gènes de tRNAs du codon atg

modifier 
occur .;atg;fMet;Met;Ile
0;0;0;0;9
1;7;55;78;85
2;54;19;22;6
3;1567;15;1;1
4;848;8;;
5;368;1;;
6;534;1;;
7;238;1;;
8;151;0;;
9;64;1;;
10;45;;;
11;21;;;
12;20;;;
13;17;;;
14;4;;;
15;2;;;
16;2;;;
17;2;;;
18;1;;;
genèse;3945;101;101;92
Dup %;357;95;24;9
génomes;3945;101;101;101

Les zéros des 79 eucaryotes

modifier 
E79z-tg;;zéros;−;;;;zéros;;E79g;;Genèse;;;;;;;E79t-tg;;db,diff;;db + diff;;mtri+1;;;E79d;;taux duplications;;;;;
ttt;52;tct;2;tat;52;tgt;48;;ttt;27;tct;77;tat;27;tgt;31;;ttt;51;tct;920;tat;57;tgt;68;;ttt;89;tct;1095;tat;111;tgt;119
atc;52;act;1;aat;46;agt;61;;atc;27;act;78;aat;33;agt;18;;atc;71;act;1021;aat;75;agt;80;;atc;163;act;1209;aat;127;agt;344
ctt;0;cct;0;cat;57;cgt;1;;ctt;79;cct;79;cat;22;cgt;78;;ctt;857;cct;908;cat;36;cgt;884;;ctt;985;cct;1049;cat;64;cgt;1033
gtt;0;gct;0;gat;44;ggc;1;;gtt;79;gct;79;gat;35;ggc;78;;gtt;1022;gct;1733;gat;76;ggc;1411;;gtt;1194;gct;2094;gat;117;ggc;1709
ttc;1;tcc;52;tac;0;tgc;1;;ttc;78;tcc;27;tac;79;tgc;78;;ttc;1195;tcc;86;tac;1310;tgc;1845;;ttc;1432;tcc;219;tac;1558;tgc;2265
att;0;acc;56;aac;0;agc;1;;att;79;acc;23;aac;79;agc;78;;att;1238;acc;68;aac;1592;agc;910;;att;1467;acc;196;aac;1915;agc;1067
ctc;70;ccc;61;cac;1;cgc;65;;ctc;9;ccc;18;cac;78;cgc;14;;ctc;11;ccc;29;cac;1028;cgc;24;;ctc;22;ccc;61;cac;1218;cgc;71
gtc;42;gcc;55;gac;0;ggt;61;;gtc;37;gcc;24;gac;79;ggt;18;;gtc;67;gcc;69;gac;1571;ggt;80;;gtc;81;gcc;188;gac;1889;ggt;344
tta;0;tca;0;taa;41;tga;16;;tta;79;tca;79;taa;38;tga;63;;tta;592;tca;579;taa;75;tga;140;;tta;649;tca;633;taa;97;tga;122
ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0;;ata;78;aca;79;aaa;78;aga;79;;ata;564;aca;716;aaa;1413;aga;682;;ata;623;aca;806;aaa;1712;aga;763
cta;3;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;76;cca;79;caa;79;cga;79;;cta;486;cca;995;caa;942;cga;609;;cta;539;cca;1159;caa;1092;cga;671
gta;0;gca;1;gaa;0;gga;0;;gta;79;gca;78;gaa;79;gga;79;;gta;635;gca;1100;gaa;1176;gga;1041;;gta;704;gca;1310;gaa;1389;gga;1218
ttg;1;tcg;0;tag;53;tgg;1;;ttg;78;tcg;79;tag;26;tgg;78;;ttg;657;tcg;438;tag;81;tgg;936;;ttg;742;tcg;454;tag;212;tgg;1100
atg;0;acg;2;aag;1;agg;1;;atg;79;acg;77;aag;78;agg;78;;atg;2188;acg;480;aag;1627;agg;794;;atg;2670;acg;523;aag;1986;agg;918
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;8;;ctg;79;ccg;79;cag;79;cgg;71;;ctg;711;ccg;405;cag;1095;cgg;369;;ctg;800;ccg;413;cag;1286;cgg;420
gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;4;;gtg;78;gcg;79;gag;79;ggg;75;;gtg;1002;gcg;611;gag;1401;ggg;582;;gtg;1185;gcg;673;gag;1673;ggg;676

Les zéros des 42 champignons

modifier 
C42z-tg;;zéros;−;;;;;;C42g;;Genèse;;;;;;;C42-tg;;effectifs;;;;;;;C42d;;taux duplications;;;;;
ttt;41;tct;0;tat;40;tgt;41;;ttt;1;tct;42;tat;2;tgt;1;;ttt;2;tct;310;tat;2;tgt;1;;ttt;100;tct;638;tat;0;tgt;0
atc;36;act;0;aat;40;agt;42;;atc;6;act;42;aat;2;agt;0;;atc;6;act;332;aat;2;agt;0;;atc;0;act;690;aat;0;agt;-
ctt;11;cct;4;cat;42;cgt;0;;ctt;31;cct;38;cat;0;cgt;42;;ctt;170;cct;155;cat;0;cgt;238;;ctt;448;cct;308;cat;-;cgt;467
gtt;0;gct;0;gat;40;ggc;0;;gtt;42;gct;42;gat;2;ggc;42;;gtt;401;gct;389;gat;2;ggc;487;;gtt;855;gct;826;gat;0;ggc;1060
ttc;0;tcc;41;tac;0;tgc;2;;ttc;42;tcc;1;tac;42;tgc;40;;ttc;296;tcc;1;tac;252;tgc;143;;ttc;605;tcc;0;tac;500;tgc;258
att;0;acc;42;aac;0;agc;1;;att;42;acc;0;aac;42;agc;41;;att;378;acc;0;aac;297;agc;155;;att;800;acc;-;aac;607;agc;278
ctc;30;ccc;41;cac;0;cgc;42;;ctc;12;ccc;1;cac;42;cgc;0;;ctc;18;ccc;1;cac;220;cgc;0;;ctc;50;ccc;0;cac;424;cgc;-
gtc;41;gcc;42;gac;0;ggt;40;;gtc;1;gcc;0;gac;42;ggt;2;;gtc;1;gcc;0;gac;409;ggt;2;;gtc;0;gcc;-;gac;874;ggt;0
tta;3;tca;0;taa;41;tga;31;;tta;39;tca;42;taa;1;tga;11;;tta;132;tca;92;taa;1;tga;12;;tta;238;tca;119;taa;0;tga;9
ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2;;ata;41;aca;42;aaa;41;aga;40;;ata;59;aca;100;aaa;155;aga;207;;ata;44;aca;138;aaa;278;aga;418
cta;6;cca;1;caa;0;cga;20;;cta;36;cca;41;caa;42;cga;22;;cta;75;cca;205;caa;196;cga;92;;cta;108;cca;400;caa;367;cga;318
gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;40;gca;42;gaa;42;gga;42;;gta;64;gca;141;gaa;252;gga;146;;gta;60;gca;236;gaa;500;gga;248
ttg;4;tcg;0;tag;41;tgg;2;;ttg;38;tcg;42;tag;1;tgg;40;;ttg;190;tcg;80;tag;1;tgg;173;;ttg;400;tcg;90;tag;0;tgg;333
atg;0;acg;1;aag;1;agg;1;;atg;42;acg;41;aag;41;agg;41;;atg;324;acg;66;aag;426;agg;69;;atg;671;acg;61;aag;939;agg;68
ctg;11;ccg;21;cag;0;cgg;4;;ctg;31;ccg;21;cag;42;cgg;38;;ctg;89;ccg;36;cag;149;cgg;55;;ctg;187;ccg;71;cag;255;cgg;45
gtg;0;gcg;16;gag;0;ggg;3;;gtg;42;gcg;26;gag;42;ggg;39;;gtg;94;gcg;60;gag;296;ggg;69;;gtg;124;gcg;131;gag;605;ggg;77

La genèse des 184 archées

modifier

Les effectifs des tRNAs des archées

modifier 
Archées;nombres;;184;;;;;;methanococci;;nombres;;16;;;;;archée;;;1 methanopyri;;;;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0
ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0
ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgc;1
gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;16;gcc;16;gac;25;ggc;16;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;1;tca;1;taa;0;tga;1
ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;16;aaa;25;aga;16;;ata;0;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;16;cca;16;caa;16;cga;17;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;17;gca;22;gaa;32;gga;17;;gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1
ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;1
atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;56;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;3;acg;0;aag;0;agg;0
ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0
gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0

La genèse des archées

modifier 
Archées;;184;;genèse;;;;;Archées;;184;;Effectifs;;;;;Archées;;184;genèse;;duplication;;%
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;-;tct;-;tat;-;tgt;-
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;-;act;-;aat;-;agt;-
ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;-;cat;-;cgt;0
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;-;gat;-;ggt;0
ttc;183;tcc;183;tac;183;tgc;183;;ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;17;tcc;4;tac;4;tgc;63
atc;183;acc;182;aac;183;agc;183;;atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;16;acc;4;aac;17;agc;2
ctc;180;ccc;170;cac;183;cgc;183;;ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;19;ccc;1;cac;1;cgc;2
gtc;183;gcc;182;gac;183;ggc;181;;gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;16;gcc;1;gac;19;ggc;34
tta;183;tca;182;taa;0;tga;18;;tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;4;tca;1;taa;-;tga;0
ata;2;aca;183;aaa;182;aga;183;;ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;8;aaa;8;aga;2
cta;183;cca;183;caa;182;cga;183;;cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;1;cca;1;caa;8;cga;1
gta;183;gca;182;gaa;183;gga;182;;gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;2;gca;41;gaa;26;gga;4
ttg;158;tcg;151;tag;1;tgg;183;;ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;3;tcg;1;tag;0;tgg;1
atg;183;acg;166;aag;160;agg;164;;atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;222;acg;2;aag;4;agg;1
ctg;154;ccg;149;cag;164;cgg;139;;ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;4;ccg;1;cag;1;cgg;0
gtg;168;gcg;155;gag;157;ggg;153;;gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;1;gcg;3;gag;2;ggg;1

Les taux de genèse dans les 3 domaines

modifier 
C42g;;Genèse;;Taux;;42;;;E79g;;Genèse;;Taux;;79;
ttt;2;tct;100;tat;5;tgt;2;;ttt;34;tct;97;tat;34;tgt;39
atc;14;act;100;aat;5;agt;0;;atc;34;act;99;aat;42;agt;23
ctt;74;cct;90;cat;0;cgt;100;;ctt;100;cct;100;cat;28;cgt;99
gtt;100;gct;100;gat;5;ggc;100;;gtt;100;gct;100;gat;44;ggc;99
ttc;100;tcc;2;tac;100;tgc;95;;ttc;99;tcc;34;tac;100;tgc;99
att;100;acc;0;aac;100;agc;98;;att;100;acc;29;aac;100;agc;99
ctc;29;ccc;2;cac;100;cgc;0;;ctc;11;ccc;23;cac;99;cgc;18
gtc;2;gcc;0;gac;100;ggt;5;;gtc;47;gcc;30;gac;100;ggt;23
tta;93;tca;100;taa;2;tga;26;;tta;100;tca;100;taa;48;tga;80
ata;98;aca;100;aaa;98;aga;95;;ata;99;aca;100;aaa;99;aga;100
cta;86;cca;98;caa;100;cga;52;;cta;96;cca;100;caa;100;cga;100
gta;95;gca;100;gaa;100;gga;100;;gta;100;gca;99;gaa;100;gga;100
ttg;90;tcg;100;tag;2;tgg;95;;ttg;99;tcg;100;tag;33;tgg;99
atg;100;acg;98;aag;98;agg;98;;atg;100;acg;97;aag;99;agg;99
ctg;74;ccg;50;cag;100;cgg;90;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;90
gtg;100;gcg;62;gag;100;ggg;93;;gtg;99;gcg;100;gag;100;ggg;95
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
Archées;;genèse;;Taux;;183;;;Bactéries ;;4032;genèse;Taux;;3949;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;2;aat;0;agt;0
ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;8;cct;0;cat;0;cgc;8
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;100;tcc;97;tac;100;tgc;99
atc;100;acc;99;aac;100;agc;100;;atc;98;acc;95;aac;100;agc;100
ctc;98;ccc;93;cac;100;cgc;100;;ctc;89;ccc;67;cac;100;cgt;92
gtc;100;gcc;99;gac;100;ggc;99;;gtc;81;gcc;77;gac;100;ggc;98
tta;100;tca;99;taa;0;tga;10;;tta;95;tca;99;taa;0;tga;33
ata;1;aca;100;aaa;99;aga;100;;ata;1;aca;99;aaa;100;aga;99
cta;100;cca;100;caa;99;cga;100;;cta;99;cca;100;caa;99;cga;20
gta;100;gca;99;gaa;100;gga;99;;gta;100;gca;98;gaa;99;gga;99
ttg;86;tcg;83;tag;1;tgg;100;;ttg;97;tcg;62;tag;0;tgg;99
atg;100;acg;91;aag;87;agg;90;;atg;100;acg;67;aag;52;agg;80
ctg;84;ccg;81;cag;90;cgg;76;;ctg;70;ccg;54;cag;46;cgg;83
gtg;92;gcg;85;gag;86;ggg;84;;gtg;31;gcg;30;gag;28;ggg;57

Les introns des eucaryotes

modifier 
Effectifs;;;;;Effectifs;;;;;Génomes;;;;Génomes;;
C42;;;;;E79;;;;;C42;;;;E79;;
faibles;%;autres;;;faibles;%;autres;;;faibles;%;autres;;faibles;%;autres
18;<5;;;;11;0-6;14;;;18;<5;;;16;0-6;19
tga;21;;;;5;8-19;14;;;tga;17;;;-;8-14;22
13;40-88;aga 48;;;tcc tat;22-30;5;;;19;21-38;aga 29;;tag tat;13 22;
13;100-190;ata 140;;;tga;4;;;;16;43-57;aag 50;;tga;3;
16;217-405;ttg 360;;;4;35-68;gaa ctt cca aaa;;;8;71-90;ttc ttg;;3;73-87;aga ttg ata
3;481-621;aag tac ttc;;;3;166-189;cga caa atg;;;2;98100;ata tac;;1;100;tac
-;;;;;4;406-594;aag ttg ata aga;;;-;;;;-;;
-;;;;;1;1568;tac;;;-;;;;-;;

Les introns des eucaryotes. Effectifs

modifier 
C42;introns;;effectifs;;;;;;C42;introns;;génomes;;;;
ttt;2;tct;35;tat;0;tgt;1;;ttt;1;tct;9;tat;0;tgt;1
atc;1;act;42;aat;2;agt;0;;atc;1;act;13;aat;2;agt;0
ctt;143;cct;125;cat;0;cgt;91;;ctt;21;cct;20;cat;0;cgt;22
gtt;59;gct;119;gat;2;ggc;102;;gtt;9;gct;14;gat;2;ggc;11
ttc;261;tcc;1;tac;250;tgc;30;;ttc;35;tcc;1;tac;42;tgc;12
att;141;acc;0;aac;94;agc;144;;att;16;acc;0;aac;16;agc;38
ctc;2;ccc;0;cac;92;cgc;0;;ctc;2;ccc;0;cac;19;cgc;0
gtc;1;gcc;0;gac;125;ggt;1;;gtc;1;gcc;0;gac;15;ggt;1
tta;35;tca;43;taa;1;tga;9;;tta;19;tca;24;taa;1;tga;7
ata;59;aca;30;aaa;131;aga;20;;ata;41;aca;15;aaa;36;aga;12
cta;68;cca;168;caa;59;cga;80;;cta;32;cca;33;caa;20;cga;16
gta;25;gca;43;gaa;50;gga;42;;gta;21;gca;16;gaa;18;gga;14
ttg;151;tcg;66;tag;1;tgg;124;;ttg;32;tcg;37;tag;1;tgg;30
atg;104;acg;25;aag;202;agg;36;;atg;24;acg;15;aag;21;agg;18
ctg;71;ccg;31;cag;65;cgg;17;;ctg;20;ccg;18;cag;15;cgg;12
gtg;37;gcg;36;gag;170;ggg;33;;gtg;20;gcg;18;gag;16;ggg;16
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
E79;introns;;effectifs;;;;;;E79;introns;;génomes;;;;
ttt;11;tct;2;tat;24;tgt;2;;ttt;5;tct;2;tat;17;tgt;2
atc;14;act;10;aat;4;agt;2;;atc;5;act;7;aat;4;agt;2
ctt;45;cct;18;cat;6;cgt;0;;ctt;10;cct;6;cat;3;cgt;0
gtt;3;gct;4;gat;4;ggc;7;;gtt;2;gct;4;gat;3;ggc;4
ttc;2;tcc;23;tac;1239;tgc;14;;ttc;2;tcc;4;tac;79;tgc;10
att;5;acc;0;aac;8;agc;9;;att;3;acc;0;aac;5;agc;6
ctc;1;ccc;5;cac;11;cgc;3;;ctc;1;ccc;3;cac;9;cgc;3
gtc;0;gcc;1;gac;18;ggt;4;;gtc;0;gcc;1;gac;2;ggt;3
tta;18;tca;13;taa;8;tga;3;;tta;8;tca;9;taa;3;tga;2
ata;454;aca;5;aaa;54;aga;469;;ata;69;aca;3;aaa;8;aga;58
cta;2;cca;50;caa;148;cga;131;;cta;2;cca;7;caa;8;cga;7
gta;5;gca;2;gaa;28;gga;21;;gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9
ttg;400;tcg;2;tag;13;tgg;5;;ttg;65;tcg;1;tag;10;tgg;4
atg;149;acg;7;aag;321;agg;14;;atg;11;acg;6;aag;7;agg;5
ctg;7;ccg;11;cag;17;cgg;4;;ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2
gtg;6;gcg;4;gag;13;ggg;15;;gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7

Les introns des eucaryotes. Comparaisons

modifier 
C42;introns;;effectifs;;%;;;;C42;introns;;génomes;;%;;
ttt;5;tct;83;tat;0;tgt;2;;ttt;5;tct;21;tat;0;tgt;2
atc;2;act;100;aat;5;agt;0;;atc;2;act;31;aat;5;agt;0
ctt;340;cct;298;cat;0;cgt;217;;ctt;50;cct;48;cat;0;cgt;52
gtt;140;gct;283;gat;5;ggc;243;;gtt;21;gct;33;gat;5;ggc;26
ttc;621;tcc;2;tac;595;tgc;71;;ttc;83;tcc;2;tac;100;tgc;29
att;336;acc;0;aac;224;agc;343;;att;38;acc;0;aac;38;agc;90
ctc;5;ccc;0;cac;219;cgc;0;;ctc;5;ccc;0;cac;45;cgc;0
gtc;2;gcc;0;gac;298;ggt;2;;gtc;2;gcc;0;gac;36;ggt;2
tta;83;tca;102;taa;2;tga;21;;tta;45;tca;57;taa;2;tga;17
ata;140;aca;71;aaa;312;aga;48;;ata;98;aca;36;aaa;86;aga;29
cta;162;cca;400;caa;140;cga;190;;cta;76;cca;79;caa;48;cga;38
gta;60;gca;102;gaa;119;gga;100;;gta;50;gca;38;gaa;43;gga;33
ttg;360;tcg;157;tag;2;tgg;295;;ttg;76;tcg;88;tag;2;tgg;71
atg;248;acg;60;aag;481;agg;86;;atg;57;acg;36;aag;50;agg;43
ctg;169;ccg;74;cag;155;cgg;40;;ctg;48;ccg;43;cag;36;cgg;29
gtg;88;gcg;86;gag;405;ggg;79;;gtg;48;gcg;43;gag;38;ggg;38
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
E79;introns;;effectifs;;%;;;;E79;introns;;génomes;;%;;
ttt;14;tct;3;tat;30;tgt;3;;ttt;6;tct;3;tat;22;tgt;3
atc;18;act;13;aat;5;agt;3;;atc;6;act;9;aat;5;agt;3
ctt;57;cct;23;cat;8;cgt;0;;ctt;13;cct;8;cat;4;cgt;0
gtt;4;gct;5;gat;5;ggc;9;;gtt;3;gct;5;gat;4;ggc;5
ttc;3;tcc;29;tac;1568;tgc;18;;ttc;3;tcc;5;tac;100;tgc;13
att;6;acc;0;aac;10;agc;11;;att;4;acc;0;aac;6;agc;8
ctc;1;ccc;6;cac;14;cgc;4;;ctc;1;ccc;4;cac;11;cgc;4
gtc;0;gcc;1;gac;23;ggt;5;;gtc;0;gcc;1;gac;3;ggt;4
tta;23;tca;16;taa;10;tga;4;;tta;10;tca;11;taa;4;tga;3
ata;575;aca;6;aaa;68;aga;594;;ata;87;aca;4;aaa;10;aga;73
cta;3;cca;63;caa;187;cga;166;;cta;3;cca;9;caa;10;cga;9
gta;6;gca;3;gaa;35;gga;27;;gta;6;gca;3;gaa;10;gga;11
ttg;506;tcg;3;tag;16;tgg;6;;ttg;82;tcg;1;tag;13;tgg;5
atg;189;acg;9;aag;406;agg;18;;atg;14;acg;8;aag;9;agg;6
ctg;9;ccg;14;cag;22;cgg;5;;ctg;9;ccg;5;cag;10;cgg;3
gtg;8;gcg;5;gag;16;ggg;19;;gtg;8;gcg;5;gag;8;ggg;9

Les introns des eucaryotes. Corrélation introns/tRNAs

modifier 
E79;tRNAs;introns;sans in;%sans;;C42;tRNAs;introns;sans in;%sans
ctc;11;1;10;91;;acc;0;0;0;100
cgc;24;3;21;88;;agt;0;0;0;100
ccc;29;5;24;83;;cat;0;0;0;100
cat;36;6;30;83;;cgc;0;0;0;100
ttt;51;11;40;78;;gcc;0;0;0;100
tat;57;24;33;58;;gtc;1;1;0;0
gtc;67;0;67;100;;taa;1;1;0;0
tgt;68;2;66;97;;tag;1;1;0;0
acc;68;0;68;100;;tcc;1;1;0;0
gcc;69;1;68;99;;tgt;1;1;0;0
atc;71;14;57;80;;ccc;1;0;1;100
taa;75;8;67;89;;aat;2;2;0;0
aat;75;4;71;95;;gat;2;2;0;0
gat;76;4;72;95;;ttt;2;2;0;0
ggt;80;4;76;95;;ggt;2;1;1;50
agt;80;2;78;98;;tat;2;0;2;100
tag;81;13;68;84;;atc;6;1;5;83
tcc;86;23;63;73;;tga;12;9;3;25
tga;140;3;137;98;;ctc;18;2;16;89
cgg;369;4;365;99;;ccg;36;31;5;14
ccg;405;11;394;97;;cgg;55;17;38;69
tcg;438;2;436;100;;ata;59;59;0;0
acg;480;7;473;99;;gcg;60;36;24;40
cta;486;2;484;100;;gta;64;25;39;61
ata;564;*454;110;20;;acg;66;25;41;62
tca;579;13;566;98;;agg;69;36;33;48
ggg;582;15;567;97;;ggg;69;33;36;52
tta;592;18;574;97;;cta;75;68;7;9
cga;609;*131;478;78;;tcg;80;66;14;18
gcg;611;4;607;99;;ctg;89;71;18;20
gta;635;5;630;99;;cga;92;80;12;13
ttg;657;*400;257;39;;tca;92;43;49;53
aga;682;*469;213;31;;gtg;94;37;57;61
ctg;711;7;704;99;;aca;100;30;70;70
aca;716;5;711;99;;tta;132;35;97;73
agg;794;14;780;98;;gca;141;43;98;70
ctt;857;*45;812;95;;tgc;143;30;113;79
cgt;884;0;884;100;;gga;146;42;104;71
cct;908;18;890;98;;cag;149;65;84;56
agc;910;9;901;99;;agc;155;144;11;7
tct;920;2;918;100;;aaa;155;131;24;15
tgg;936;5;931;99;;cct;155;125;30;19
caa;942;*148;794;84;;ctt;170;143;27;16
cca;995;*50;945;95;;tgg;173;124;49;28
gtg;1 002;6;996;99;;ttg;190;151;39;21
act;1 021;10;1011;99;;caa;196;59;137;70
gtt;1 022;3;1019;100;;cca;205;168;37;18
cac;1 028;11;1017;99;;aga;207;20;187;90
gga;1 041;21;1020;98;;cac;220;92;128;58
cag;1 095;17;1078;98;;cgt;238;91;147;62
gca;1 100;2;1098;100;;tac;252;250;2;1
gaa;1 176;28;1148;98;;gaa;252;50;202;80
ttc;1 195;2;1193;100;;ttc;296;261;35;12
att;1 238;5;1233;100;;gag;296;170;126;43
tac;1 310;*1239;71;5;;aac;297;94;203;68
gag;1 401;13;1388;99;;tct;310;35;275;89
ggc;1 411;7;1404;100;;atg;324;104;220;68
aaa;1 413;*54;1359;96;;act;332;42;290;87
gac;1 571;18;1553;99;;att;378;141;237;63
aac;1 592;8;1584;99;;gct;389;119;270;69
aag;1 627;*321;1306;80;;gtt;401;59;342;85
gct;1 733;4;1729;100;;gac;409;125;284;69
tgc;1 845;14;1831;99;;aag;426;202;224;53
atg;2 188;*149;2039;93;;ggc;487;102;385;79

Les introns des champignons: genèse duplications et introns

modifier

Principe du codon obligatoire

modifier 
29.10.18;;;;;;;;;23.2.19;;;;;;;;;;;;;;;;
Bactéries ;;4032.0;;genèse;;;;;Bacilli;;genèse;678;;;;;;E79g;;Genèse;;79;;;
ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;4;tct;2;tat;1;tgt;1;;ttt;27;tct;77;tat;27;tgt;31
att;5;act;92;aat;5;agt;1;;att;0;act;62;aat;2;agt;0;;atc;27;act;78;aat;33;agt;18
ctt;331;cct;10;cat;3;cgc;318;;ctt;262;cct;4;cat;1;cgc;0;;ctt;79;cct;79;cat;22;cgt;78
gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;79;gct;79;gat;35;ggc;78
ttc;3 938;tcc;3 822;tac;3 932;tgc;3 927;;ttc;663;tcc;648;tac;663;tgc;659;;ttc;78;tcc;27;tac;79;tgc;78
atc;3 863;acc;3 732;aac;3 930;agc;3 931;;atc;649;acc;540;aac;661;agc;658;;att;79;acc;23;aac;79;agc;78
ctc;3 510;ccc;2 657;cac;3 933;cgt;3 623;;ctc;396;ccc;38;cac;659;cgt;661;;ctc;9;ccc;18;cac;78;cgc;14
gtc;3 207;gcc;3 035;gac;3 933;ggc;3 879;;gtc;292;gcc;165;gac;663;ggc;658;;gtc;37;gcc;24;gac;79;ggt;18
tta;3 741;tca;3 921;taa;12;tga;1 304;;tta;658;tca;660;taa;1;tga;6;;tta;79;tca;79;taa;38;tga;63
ata;48;aca;3 929;aaa;3 930;aga;3 916;;ata;12;aca;662;aaa;662;aga;646;;ata;78;aca;79;aaa;78;aga;79
cta;3 916;cca;3 932;caa;3 924;cga;807;;cta;656;cca;659;caa;663;cga;35;;cta;76;cca;79;caa;79;cga;79
gta;3 931;gca;3 889;gaa;3 923;gga;3 926;;gta;661;gca;656;gaa;663;gga;662;;gta;79;gca;78;gaa;79;gga;79
ttg;3 835;tcg;2 449;tag;17;tgg;3 918;;ttg;657;tcg;263;tag;1;tgg;653;;ttg;78;tcg;79;tag;26;tgg;78
atg;3 945;acg;2 655;aag;2 040;agg;3 147;;atg;663;acg;275;aag;368;agg;437;;atg;79;acg;77;aag;78;agg;78
ctg;2 782;ccg;2 124;cag;1 811;cgg;3 292;;ctg;287;ccg;106;cag;105;cgg;658;;ctg;79;ccg;79;cag;79;cgg;71
gtg;1 209;gcg;1 181;gag;1 121;ggg;2 238;;gtg;5.2.19;gcg;52;gag;93;ggg;109;;gtg;78;gcg;79;gag;79;ggg;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;25.2.19;;;;;;;;;;;;;;;;
Archées;;genèse;184;;;;;;Methanococci;;genèse;16;;;;;;C42g;;Genèse;;;;;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;1;tct;42;tat;2;tgt;1
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;atc;6;act;42;aat;2;agt;0
ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;31;cct;38;cat;0;cgt;42
gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;42;gct;42;gat;2;ggc;42
ttc;183;tcc;183;tac;183;tgc;183;;ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;42;tcc;1;tac;42;tgc;40
atc;183;acc;182;aac;183;agc;183;;atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;att;42;acc;0;aac;42;agc;41
ctc;180;ccc;170;cac;183;cgc;183;;ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;12;ccc;1;cac;42;cgc;0
gtc;183;gcc;182;gac;183;ggc;181;;gtc;16;gcc;16;gac;16;ggc;16;;gtc;1;gcc;0;gac;42;ggt;2
tta;183;tca;182;taa;0;tga;18;;tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;39;tca;42;taa;1;tga;11
ata;2;aca;183;aaa;182;aga;183;;ata;0;aca;16;aaa;16;aga;16;;ata;41;aca;42;aaa;41;aga;40
cta;183;cca;183;caa;182;cga;183;;cta;16;cca;16;caa;16;cga;16;;cta;36;cca;41;caa;42;cga;22
gta;183;gca;182;gaa;183;gga;182;;gta;16;gca;15;gaa;16;gga;16;;gta;40;gca;42;gaa;42;gga;42
ttg;158;tcg;151;tag;1;tgg;183;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;38;tcg;42;tag;1;tgg;40
atg;183;acg;166;aag;160;agg;164;;atg;16;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;42;acg;41;aag;41;agg;41
ctg;154;ccg;149;cag;164;cgg;139;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;31;ccg;21;cag;42;cgg;38
gtg;168;gcg;155;gag;157;ggg;153;;gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;42;gcg;26;gag;42;ggg;39

C42.GDI Les carrés

modifier
  • Lien aux tableaux:C42.GDI Les carrés.
  • Note: Ici les tableaux des genèses, des duplications et des introns des tRNAs sont présentés sous forme de carrés plus faciles à lire.
  • Légende:
C42.GDI tRNAs et introns
modifier 
tRNAs introns;;;;;;;;;;;;;;;;
tRNA;;;;;;;;;sint/tot;X100;;;;;;
ttt;2;tct;310;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;89;tat;0;tgt;0
atc;6;act;332;aat;2;agt;0;;atc;83;act;87;aat;0;agt;0
ctt;170;cct;155;cat;0;cgt;238;;ctt;20;cct;19;cat;0;cgt;62
gtt;401;gct;389;gat;2;ggc;487;;gtt;85;gct;69;gat;0;ggc;79
ttc;296;tcc;1;tac;252;tgc;143;;ttc;12;tcc;0;tac;2;tgc;79
att;378;acc;0;aac;297;agc;155;;att;63;acc;0;aac;68;agc;7
ctc;18;ccc;1;cac;220;cgc;0;;ctc;89;ccc;0;cac;59;cgc;0
gtc;1;gcc;0;gac;409;ggt;2;;gtc;0;gcc;0;gac;69;ggt;0
tta;132;tca;92;taa;1;tga;12;;tta;75;tca;53;taa;0;tga;33
ata;59;aca;100;aaa;155;aga;207;;ata;2;aca;70;aaa;15;aga;90
cta;75;cca;205;caa;196;cga;92;;cta;9;cca;18;caa;70;cga;14
gta;64;gca;141;gaa;252;gga;146;;gta;61;gca;70;gaa;80;gga;71
ttg;190;tcg;80;tag;1;tgg;173;;ttg;21;tcg;18;tag;0;tgg;28
atg;324;acg;66;aag;426;agg;69;;atg;69;acg;62;aag;54;agg;48
ctg;89;ccg;36;cag;149;cgg;55;;ctg;20;ccg;14;cag;56;cgg;69
gtg;94;gcg;60;gag;296;ggg;69;;gtg;61;gcg;42;gag;45;ggg;52
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
in_t;;;;;;;;;sin_t;;;;;;ok;
ttt;2;tct;35;tat;0;tgt;1;;ttt;0;tct;275;tat;2;tgt;0
atc;1;act;42;aat;2;agt;0;;atc;5;act;290;aat;0;agt;0
ctt;136;cct;125;cat;0;cgt;91;;ctt;34;cct;30;cat;0;cgt;147
gtt;59;gct;119;gat;2;ggc;101;;gtt;342;gct;270;gat;0;ggc;386
ttc;260;tcc;1;tac;248;tgc;30;;ttc;36;tcc;0;tac;4;tgc;113
att;139;acc;0;aac;94;agc;144;;att;239;acc;0;aac;203;agc;11
ctc;2;ccc;0;cac;90;cgc;0;;ctc;16;ccc;1;cac;130;cgc;0
gtc;1;gcc;0;gac;125;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;284;ggt;1
tta;33;tca;43;taa;1;tga;8;;tta;99;tca;49;taa;0;tga;4
ata;59;aca;30;aaa;131;aga;20;;ata;0;aca;70;aaa;24;aga;187
cta;68;cca;168;caa;59;cga;79;;cta;7;cca;37;caa;137;cga;13
gta;25;gca;43;gaa;50;gga;42;;gta;39;gca;98;gaa;202;gga;104
ttg;151;tcg;66;tag;1;tgg;124;;ttg;39;tcg;14;tag;0;tgg;49
atg;102;acg;25;aag;198;agg;36;;atg;222;acg;41;aag;228;agg;33
ctg;71;ccg;31;cag;65;cgg;17;;ctg;18;ccg;5;cag;84;cgg;38
gtg;37;gcg;35;gag;164;ggg;33;;gtg;57;gcg;25;gag;132;ggg;36
C42.GDI Genèse
modifier 
Genèse;;;;;;;;;;;;;;;;
gen_in;;;;;;;;;gen_sin;;;;;;;
ttt;1;tct;6;tat;0;tgt;1;;ttt;0;tct;33;tat;2;tgt;0
atc;1;act;3;aat;2;agt;0;;atc;5;act;29;aat;0;agt;0
ctt;19;cct;19;cat;0;cgt;14;;ctt;10;cct;18;cat;0;cgt;20
gtt;6;gct;12;gat;2;ggc;7;;gtt;33;gct;28;gat;0;ggc;31
ttc;31;tcc;1;tac;39;tgc;10;;ttc;7;tcc;0;tac;0;tgc;28
att;14;acc;0;aac;13;agc;36;;att;26;acc;0;aac;26;agc;3
ctc;2;ccc;0;cac;15;cgc;0;;ctc;10;ccc;1;cac;23;cgc;0
gtc;1;gcc;0;gac;11;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;27;ggt;1
tta;16;tca;21;taa;1;tga;7;;tta;22;tca;18;taa;0;tga;4
ata;41;aca;12;aaa;29;aga;7;;ata;0;aca;27;aaa;5;aga;28
cta;31;cca;31;caa;20;cga;13;;cta;4;cca;8;caa;22;cga;6
gta;13;gca;14;gaa;9;gga;4;;gta;19;gca;26;gaa;24;gga;28
ttg;30;tcg;35;tag;1;tgg;26;;ttg;6;tcg;5;tag;0;tgg;10
atg;4;acg;12;aag;17;agg;13;;atg;18;acg;26;aag;20;agg;23
ctg;18;ccg;17;cag;12;cgg;10;;ctg;11;ccg;3;cag;27;cgg;26
gtg;14;gcg;14;gag;11;ggg;12;;gtg;22;gcg;8;gag;26;ggg;23
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
gen_isi;;;;;;;;;zéros;;;;;;;
ttt;0;tct;3;tat;0;tgt;0;;ttt;41;tct;0;tat;40;tgt;41
atc;0;act;10;aat;0;agt;0;;atc;36;act;0;aat;40;agt;42
ctt;2;cct;1;cat;0;cgt;8;;ctt;10;cct;4;cat;42;cgt;0
gtt;3;gct;2;gat;0;ggc;4;;gtt;0;gct;0;gat;40;ggc;0
ttc;4;tcc;0;tac;3;tgc;2;;ttc;0;tcc;41;tac;0;tgc;2
att;2;acc;0;aac;3;agc;2;;att;0;acc;42;aac;0;agc;1
ctc;0;ccc;0;cac;4;cgc;0;;ctc;30;ccc;41;cac;0;cgc;42
gtc;0;gcc;0;gac;4;ggt;0;;gtc;41;gcc;42;gac;0;ggt;40
tta;1;tca;3;taa;0;tga;0;;tta;3;tca;0;taa;41;tga;31
ata;0;aca;3;aaa;7;aga;5;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2
cta;1;cca;2;caa;0;cga;3;;cta;6;cca;1;caa;0;cga;20
gta;8;gca;2;gaa;9;gga;10;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0
ttg;2;tcg;2;tag;0;tgg;4;;ttg;4;tcg;0;tag;41;tgg;2
atg;20;acg;3;aag;4;agg;5;;atg;0;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;2;ccg;1;cag;3;cgg;2;;ctg;11;ccg;21;cag;0;cgg;4
gtg;6;gcg;4;gag;5;ggg;4;;gtg;0;gcg;16;gag;0;ggg;3
C42.GDI Absence de duplication
modifier 
Absence de duplication;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
unit1;;;;;;;;;in_1;;;;;;;;;sin_1;;;;;;;
ttt;0;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;1;tat;0;tgt;1;;ttt;0;tct;1;tat;2;tgt;0
atc;6;act;1;aat;2;agt;0;;atc;2;act;0;aat;2;agt;0;;atc;5;act;1;aat;0;agt;0
ctt;5;cct;16;cat;0;cgt;2;;ctt;3;cct;4;cat;0;cgt;0;;ctt;2;cct;12;cat;0;cgt;2
gtt;1;gct;1;gat;2;ggc;1;;gtt;0;gct;0;gat;2;ggc;0;;gtt;1;gct;1;gat;0;ggc;1
ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;3;;ttc;1;tcc;2;tac;2;tgc;1;;ttc;1;tcc;0;tac;0;tgc;2
att;1;acc;0;aac;1;agc;3;;att;0;acc;0;aac;1;agc;2;;att;1;acc;0;aac;0;agc;1
ctc;10;ccc;1;cac;3;cgc;0;;ctc;2;ccc;0;cac;2;cgc;0;;ctc;8;ccc;1;cac;1;cgc;0
gtc;1;gcc;0;gac;1;ggt;2;;gtc;1;gcc;0;gac;0;ggt;2;;gtc;1;gcc;0;gac;1;ggt;1
tta;14;tca;12;taa;1;tga;10;;tta;8;tca;7;taa;2;tga;6;;tta;5;tca;3;taa;0;tga;4
ata;27;aca;8;aaa;6;aga;8;;ata;26;aca;4;aaa;5;aga;5;;ata;0;aca;4;aaa;1;aga;3
cta;13;cca;5;caa;2;cga;6;;cta;9;cca;4;caa;1;cga;2;;cta;3;cca;1;caa;1;cga;4
gta;18;gca;6;gaa;2;gga;4;;gta;10;gca;4;gaa;1;gga;0;;gta;8;gca;2;gaa;1;gga;4
ttg;4;tcg;19;tag;1;tgg;2;;ttg;3;tcg;17;tag;2;tgg;1;;ttg;1;tcg;2;tag;0;tgg;1
atg;0;acg;23;aag;1;agg;25;;atg;0;acg;5;aag;0;agg;5;;atg;0;acg;18;aag;1;agg;20
ctg;12;ccg;10;cag;13;cgg;24;;ctg;3;ccg;8;cag;4;cgg;5;;ctg;9;ccg;2;cag;9;cgg;19
gtg;15;gcg;7;gag;7;ggg;21;;gtg;4;gcg;4;gag;1;ggg;5;;gtg;11;gcg;3;gag;6;ggg;15
C42.GDI Les duplications
modifier 
Les duplications;;;;;;;;;;;;;;;;
in;dblei;;;;;;;;in;difi;;;;;;
ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0;;ttt;1;tct;16;tat;0;tgt;0
atc;0;act;0;aat;0;agt;0;;atc;0;act;8;aat;0;agt;0
ctt;43;cct;33;cat;0;cgt;14;;ctt;52;cct;62;cat;0;cgt;24
gtt;9;gct;14;gat;0;ggc;14;;gtt;23;gct;79;gat;0;ggc;43
ttc;84;tcc;0;tac;83;tgc;1;;ttc;110;tcc;0;tac;111;tgc;17
att;27;acc;0;aac;22;agc;24;;att;83;acc;0;aac;54;agc;79
ctc;0;ccc;0;cac;19;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;39;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;25;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;65;ggt;0
tta;5;tca;2;taa;0;tga;0;;tta;11;tca;14;taa;0;tga;1
ata;2;aca;0;aaa;35;aga;0;;ata;16;aca;12;aaa;48;aga;5
cta;6;cca;31;caa;1;cga;25;;cta;30;cca;98;caa;38;cga;34
gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1;;gta;2;gca;17;gaa;20;gga;13
ttg;34;tcg;2;tag;0;tgg;32;;ttg;84;tcg;26;tag;0;tgg;59
atg;0;acg;0;aag;71;agg;3;;atg;11;acg;9;aag;79;agg;14
ctg;6;ccg;0;cag;3;cgg;1;;ctg;35;ccg;13;cag;30;cgg;4
gtg;3;gcg;1;gag;36;ggg;0;;gtg;12;gcg;15;gag;81;ggg;11
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
sin;dbles;;;;;;;;sin;difs;;;;;;
ttt;0;tct;198;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;33;tat;0;tgt;0
atc;0;act;194;aat;0;agt;0;;atc;0;act;24;aat;0;agt;0
ctt;10;cct;10;cat;0;cgt;99;;ctt;6;cct;1;cat;0;cgt;13
gtt;261;gct;219;gat;0;ggc;340;;gtt;42;gct;10;gat;0;ggc;8
ttc;16;tcc;0;tac;0;tgc;59;;ttc;6;tcc;0;tac;0;tgc;19
att;194;acc;0;aac;135;agc;4;;att;14;acc;0;aac;24;agc;0
ctc;5;ccc;0;cac;85;cgc;0;;ctc;1;ccc;0;cac;9;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;230;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;16;ggt;0
tta;66;tca;22;taa;0;tga;0;;tta;10;tca;6;taa;0;tga;0
ata;0;aca;22;aaa;6;aga;133;;ata;0;aca;18;aaa;2;aga;18
cta;1;cca;21;caa;96;cga;1;;cta;1;cca;4;caa;19;cga;1
gta;5;gca;54;gaa;141;gga;36;;gta;7;gca;16;gaa;20;gga;21
ttg;30;tcg;2;tag;0;tgg;27;;ttg;1;tcg;3;tag;0;tgg;3
atg;85;acg;5;aag;173;agg;2;;atg;40;acg;7;aag;7;agg;1
ctg;1;ccg;0;cag;41;cgg;3;;ctg;3;ccg;1;cag;12;cgg;5
gtg;15;gcg;4;gag;79;ggg;4;;gtg;5;gcg;2;gag;10;ggg;4
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
isi;dbleisi;;;;;;;;isi;difisi;;;;;;
ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;0
atc;0;act;27;aat;0;agt;0;;atc;0;act;37;aat;0;agt;0
ctt;13;cct;8;cat;0;cgt;13;;ctt;15;cct;3;cat;0;cgt;33
gtt;6;gct;15;gat;0;ggc;6;;gtt;18;gct;10;gat;0;ggc;34
ttc;11;tcc;0;tac;8;tgc;1;;ttc;27;tcc;0;tac;8;tgc;6
att;10;acc;0;aac;13;agc;3;;att;8;acc;0;aac;7;agc;4
ctc;0;ccc;0;cac;8;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;18;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;12;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;19;ggt;0
tta;0;tca;0;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;6;taa;0;tga;0
ata;0;aca;0;aaa;11;aga;1;;ata;0;aca;6;aaa;12;aga;10
cta;0;cca;4;caa;0;cga;4;;cta;1;cca;6;caa;0;cga;5
gta;0;gca;3;gaa;7;gga;9;;gta;9;gca;8;gaa;20;gga;24
ttg;0;tcg;1;tag;0;tgg;5;;ttg;3;tcg;4;tag;0;tgg;7
atg;47;acg;0;aag;35;agg;0;;atg;99;acg;4;aag;20;agg;8
ctg;6;ccg;0;cag;0;cgg;1;;ctg;7;ccg;1;cag;21;cgg;3
gtg;3;gcg;6;gag;18;ggg;1;;gtg;14;gcg;6;gag;30;ggg;10
;;;;;;;;;;;;;;;;
tRNAi;;;;;;;;;tRNAs;;;;;;;
ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;11;tat;0;tgt;0
atc;0;act;21;aat;0;agt;0;;att;5;act;43;aat;0;agt;0
ctt;20;cct;10;cat;0;cgt;31;;ctt;8;cct;1;cat;0;cgt;15
gtt;18;gct;12;gat;0;ggc;33;;gtt;6;gct;13;gat;0;ggc;7
ttc;31;tcc;0;tac;12;tgc;0;;ttc;7;tcc;0;tac;4;tgc;7
att;13;acc;0;aac;2;agc;3;;atc;0;acc;0;aac;18;agc;4
ctc;0;ccc;0;cac;13;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;13;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;20;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;11;ggt;0
tta;0;tca;3;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;3;taa;0;tga;0
ata;0;aca;3;aaa;12;aga;3;;ata;0;aca;3;aaa;11;aga;8
cta;0;cca;6;caa;0;cga;4;;cta;1;cca;4;caa;0;cga;5
gta;1;gca;9;gaa;10;gga;14;;gta;8;gca;2;gaa;17;gga;19
ttg;1;tcg;1;tag;0;tgg;3;;ttg;2;tcg;4;tag;0;tgg;9
atg;67;acg;1;aag;27;agg;1;;atg;79;acg;3;aag;28;agg;7
ctg;10;ccg;0;cag;17;cgg;0;;ctg;3;ccg;1;cag;4;cgg;4
gtg;2;gcg;1;gag;31;ggg;6;;gtg;15;gcg;11;gag;17;ggg;5
C42.GDI Les rapports des duplications doublons-différents
modifier 
Les rapports;;;;;;;;;;;;;;;;
ri;;;;;;;;;1/rs;;;;;;;
ttt;0;tct;3.2;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;6.0;tat;0;tgt;0
atc;0;act;8;aat;0;agt;0;;atc;0;act;8.1;aat;0;agt;0
ctt;1.2;cct;1.9;cat;0;cgt;1.7;;ctt;1.7;cct;10;cat;0;cgt;7.6
gtt;2.6;gct;5.6;gat;0;ggc;3.1;;gtt;6.2;gct;22;gat;0;ggc;43
ttc;1.3;tcc;0;tac;1.3;tgc;17;;ttc;2.7;tcc;0;tac;0;tgc;3.1
att;3.1;acc;0;aac;2.5;agc;3.3;;att;14;acc;0;aac;5.6;agc;4
ctc;0;ccc;0;cac;2.1;cgc;0;;ctc;5.0;ccc;0;cac;9.4;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;2.6;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;14;ggt;0
tta;2.2;tca;7.0;taa;0;tga;0;;tta;6.6;tca;3.7;taa;0;tga;0
ata;8;aca;12;aaa;1.4;aga;5;;ata;0;aca;1.2;aaa;3.0;aga;7.4
cta;5.0;cca;3.2;caa;38;cga;1.4;;cta;1.0;cca;5.3;caa;5.1;cga;1.0
gta;2.0;gca;17;gaa;10;gga;13;;gta;0.7;gca;3.4;gaa;7.1;gga;1.7
ttg;2.5;tcg;13;tag;0;tgg;1.8;;ttg;30;tcg;0.7;tag;0;tgg;9.0
atg;11;acg;9;aag;1.1;agg;4.7;;atg;2.1;acg;0.7;aag;25;agg;2.0
ctg;5.8;ccg;13;cag;10;cgg;4.0;;ctg;0.3;ccg;0;cag;3.4;cgg;0.6
gtg;4.0;gcg;15;gag;2.3;ggg;11;;gtg;3.0;gcg;2.0;gag;7.9;ggg;1.0
;;;;;;;;;;;;;;;;
rsi;;;;;;;;;s/i;;;;;;;
ttt;0;tct;1.0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;2.2;tat;0;tgt;0
atc;0;act;1.4;aat;0;agt;0;;atc;0;act;2.0;aat;0;agt;0
ctt;1.2;cct;0.4;cat;0;cgt;2.5;;ctt;0.4;cct;0.1;cat;0;cgt;0
gtt;3.0;gct;0.7;gat;0;ggc;5.7;;gtt;0.3;gct;1.1;gat;0;ggc;0
ttc;2.5;tcc;0;tac;1.0;tgc;6.0;;ttc;0.2;tcc;0;tac;0.3;tgc;7
att;0.8;acc;0;aac;0.5;agc;1.3;;att;0.4;acc;0;aac;9.0;agc;1.3
ctc;0;ccc;0;cac;2.3;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;1.0;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;1.6;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;0.6;ggt;0
tta;1;tca;6;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;1.0;taa;0;tga;0
ata;0;aca;6;aaa;1.1;aga;10;;ata;0;aca;1.0;aaa;0.9;aga;2.7
cta;1;cca;1.5;caa;0;cga;1.3;;cta;1;cca;0.7;caa;0;cga;1.3
gta;9;gca;2.7;gaa;2.9;gga;2.7;;gta;8.0;gca;0.2;gaa;1.7;gga;1.4
ttg;3;tcg;4.0;tag;0;tgg;1.4;;ttg;2.0;tcg;4.0;tag;0;tgg;3.0
atg;2.1;acg;4;aag;0.6;agg;8;;atg;1.2;acg;3.0;aag;1.0;agg;7.0
ctg;1.2;ccg;1;cag;21;cgg;3.0;;ctg;0.3;ccg;1;cag;0.2;cgg;4
gtg;4.7;gcg;1.0;gag;1.7;ggg;10;;gtg;7.5;gcg;11;gag;0.5;ggg;0.8
C42.GDI Total duplications
modifier 
Total duplications;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
in;dble+dif;;;;;;;;sin;dble+dif;;;;;;;;isi;dble+dif;;;;;;
ttt;0;tct;21;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;231;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;16;tat;0;tgt;0
atc;0;act;8;aat;0;agt;0;;atc;0;act;218;aat;0;agt;0;;atc;0;act;64;aat;0;agt;0
ctt;95;cct;95;cat;0;cgt;38;;ctt;16;cct;11;cat;0;cgt;112;;ctt;28;cct;11;cat;0;cgt;46
gtt;32;gct;93;gat;0;ggc;57;;gtt;303;gct;229;gat;0;ggc;348;;gtt;24;gct;25;gat;0;ggc;40
ttc;194;tcc;0;tac;194;tgc;18;;ttc;22;tcc;0;tac;0;tgc;78;;ttc;38;tcc;0;tac;16;tgc;7
att;110;acc;0;aac;76;agc;103;;att;208;acc;0;aac;159;agc;4;;att;18;acc;0;aac;20;agc;7
ctc;0;ccc;0;cac;58;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;94;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;26;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;90;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;246;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;31;ggt;0
tta;16;tca;16;taa;0;tga;1;;tta;76;tca;28;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;6;taa;0;tga;0
ata;18;aca;12;aaa;83;aga;5;;ata;0;aca;40;aaa;8;aga;151;;ata;0;aca;6;aaa;23;aga;11
cta;36;cca;129;caa;39;cga;59;;cta;2;cca;25;caa;115;cga;2;;cta;1;cca;10;caa;0;cga;9
gta;3;gca;18;gaa;22;gga;14;;gta;12;gca;70;gaa;161;gga;57;;gta;9;gca;11;gaa;27;gga;33
ttg;118;tcg;28;tag;0;tgg;91;;ttg;31;tcg;5;tag;0;tgg;30;;ttg;3;tcg;5;tag;0;tgg;12
atg;11;acg;9;aag;150;agg;17;;atg;125;acg;12;aag;180;agg;3;;atg;146;acg;4;aag;55;agg;8
ctg;41;ccg;13;cag;33;cgg;5;;ctg;4;ccg;1;cag;53;cgg;8;;ctg;13;ccg;1;cag;21;cgg;4
gtg;15;gcg;16;gag;117;ggg;11;;gtg;20;gcg;6;gag;89;ggg;8;;gtg;17;gcg;12;gag;48;ggg;11
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
in;dble+dif;;%;;;;;;sin;dble+dif;;%;;;;;;isi;dble+dif;;%;;;;
ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;86;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;6;tat;0;tgt;0
atc;0;act;3;aat;0;agt;0;;atc;0;act;75;aat;0;agt;0;;atc;0;act;22;aat;0;agt;0
ctt;68;cct;81;cat;0;cgt;19;;ctt;12;cct;9;cat;0;cgt;57;;ctt;20;cct;9;cat;0;cgt;23
gtt;9;gct;27;gat;0;ggc;13;;gtt;84;gct;66;gat;0;ggc;78;;gtt;7;gct;7;gat;0;ggc;9
ttc;76;tcc;0;tac;92;tgc;17;;ttc;9;tcc;0;tac;0;tgc;76;;ttc;15;tcc;0;tac;8;tgc;7
att;33;acc;0;aac;30;agc;90;;att;62;acc;0;aac;62;agc;4;;att;5;acc;0;aac;8;agc;6
ctc;0;ccc;0;cac;33;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;53;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;15;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;25;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;67;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;8;ggt;0
tta;17;tca;32;taa;0;tga;100;;tta;82;tca;56;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;12;taa;0;tga;0
ata;100;aca;21;aaa;73;aga;3;;ata;0;aca;69;aaa;7;aga;90;;ata;0;aca;10;aaa;20;aga;7
cta;92;cca;79;caa;25;cga;84;;cta;5;cca;15;caa;75;cga;3;;cta;3;cca;6;caa;0;cga;13
gta;13;gca;18;gaa;10;gga;13;;gta;50;gca;71;gaa;77;gga;55;;gta;38;gca;11;gaa;13;gga;32
ttg;78;tcg;74;tag;0;tgg;68;;ttg;20;tcg;13;tag;0;tgg;23;;ttg;2;tcg;13;tag;0;tgg;9
atg;4;acg;36;aag;39;agg;61;;atg;44;acg;48;aag;47;agg;11;;atg;52;acg;16;aag;14;agg;29
ctg;71;ccg;87;cag;31;cgg;29;;ctg;7;ccg;7;cag;50;cgg;47;;ctg;22;ccg;7;cag;20;cgg;24
gtg;29;gcg;47;gag;46;ggg;37;;gtg;38;gcg;18;gag;35;ggg;27;;gtg;33;gcg;35;gag;19;ggg;37

C42.GDI Synthèse

modifier 
C42;;;;;;;;;;intron;;;;;;in;;sin;;isi;;tRNAis;;;;;;total;;;%;;;
obligat;aa;Trad;ADN;alpha;zéros;unit1;sint/tot;tRNA;sin_t;in_t;sin_1;in_1;gen_isi;gen sin;gen in;dblei;difi;dbles;difs;dbleisi;difisi;tRNAi;tRNAs;ri;1/rs;rsi;s/i;in;sin;isi;in;sin;isi;
57;Met;12;15;atg;0;0;0.69;324;222;102;0;0;20;18;4;0;11;85;40;47;99;67;79;11;2.1;2.1;1.2;11;125;146;4;44;52;atg
17;Ile;9;7;att;0;1;0.63;378;239;139;1;0;2;26;14;27;83;194;14;10;8;13;5;3.1;14;0.8;0.4;110;208;18;33;62;5;att
13;Asn;42;39;aac;0;1;0.68;297;203;94;0;1;3;26;13;22;54;135;24;13;7;2;18;2.5;5.6;0.5;9.0;76;159;20;30;62;8;aac
24;Ala;29;24;gct;0;1;0.69;389;270;119;1;0;2;28;12;14;79;219;10;15;10;12;13;5.6;22;0.7;1.1;93;229;25;27;66;7;gct
14;Asp;46;40;gac;0;1;0.69;409;284;125;1;0;4;27;11;25;65;230;16;12;19;20;11;2.6;14;1.6;0.6;90;246;31;25;67;8;gac
28;Gly;62;56;ggc;0;1;0.79;487;386;101;1;0;4;31;7;14;43;340;8;6;34;33;7;3.1;43;5.7;0.2;57;348;40;13;78;9;ggc
27;Val;13;8;gtt;0;1;0.85;401;342;59;1;0;3;33;6;9;23;261;42;6;18;18;6;2.6;6.2;3.0;0.3;32;303;24;9;84;7;gtt
23;Thr;25;23;act;0;1;0.87;332;290;42;1;0;10;29;3;0;8;194;24;27;37;21;43;8;8.1;1.4;2.0;8;218;64;3;75;22;act
11;Tyr;34;37;tac;0;2;0.02;252;4;248;0;2;3;0;39;83;111;0;0;8;8;12;4;1.3;0;1.0;0.3;194;0;16;92;0;8;tac
15;Phe;2;5;ttc;0;2;0.12;296;36;260;1;1;4;7;31;84;110;16;6;11;27;31;7;1.3;2.7;2.5;0.2;194;22;38;76;9;15;ttc
26;Arg;53;54;cgt;0;2;0.62;238;147;91;2;0;8;20;14;14;24;99;13;13;33;31;15;1.7;7.6;2.5;0.5;38;112;46;19;57;23;cgt
32;Gln;39;42;caa;0;2;0.70;196;137;59;1;1;0;22;20;1;38;96;19;0;0;0;0;38;5.1;0;0;39;115;0;25;75;0;caa
34;Glu;47;44;gaa;0;2;0.80;252;202;50;1;1;9;24;9;2;20;141;20;7;20;10;17;10;7.1;2.9;1.7;22;161;27;10;77;13;gaa
21;Ser;17;21;tct;0;2;0.89;310;275;35;1;1;3;33;6;5;16;198;33;8;8;5;11;3.2;6.0;1.0;2.2;21;231;16;8;86;6;tct
12;His;38;38;cac;0;3;0.59;220;130;90;1;2;4;23;15;19;39;85;9;8;18;13;13;2.1;9.4;2.3;1.0;58;94;26;33;53;15;cac
48;Gly;63;60;gga;0;4;0.71;146;104;42;4;0;10;28;4;1;13;36;21;9;24;14;19;13;1.7;2.7;1.4;14;57;33;13;55;32;gga
44;Ala;31;28;gca;0;6;0.70;141;98;43;2;4;2;26;14;1;17;54;16;3;8;9;2;17;3.4;2.7;0.2;18;70;11;18;71;11;gca
54;Glu;48;48;gag;0;7;0.45;296;132;164;6;1;5;26;11;36;81;79;10;18;30;31;17;2.3;7.9;1.7;0.5;117;89;48;46;35;19;gag
43;Thr;27;27;aca;0;8;0.70;100;70;30;4;4;3;27;12;0;12;22;18;0;6;3;3;12;1.2;6;1.0;12;40;6;21;69;10;aca
41;Ser;19;25;tca;0;12;0.53;92;49;43;3;7;3;18;21;2;14;22;6;0;6;3;3;7.0;3.7;6;1.0;16;28;6;32;56;12;tca
52;Gln;40;46;cag;0;13;0.56;149;84;65;9;4;3;27;12;3;30;41;12;0;21;17;4;10;3.4;21;0.2;33;53;21;31;50;20;cag
67;Val;16;16;gtg;0;15;0.61;94;57;37;11;4;6;22;14;3;12;15;5;3;14;2;15;4.0;3.0;4.7;7.5;15;20;17;29;38;33;gtg
61;Ser;20;29;tcg;0;19;0.18;80;14;66;2;17;2;5;35;2;26;2;3;1;4;1;4;13;0.7;4.0;4.0;28;5;5;74;13;13;tcg
53;Lys;44;47;aag;1;1;0.54;426;228;198;1;0;4;20;17;71;79;173;7;35;20;27;28;1.1;25;0.6;1.0;150;180;55;39;47;14;aag
18;Ser;58;55;agc;1;3;0.07;155;11;144;1;2;2;3;36;24;79;4;0;3;4;3;4;3.3;4;1.3;1.3;103;4;7;90;4;6;agc
42;Pro;23;26;cca;1;5;0.18;205;37;168;1;4;2;8;31;31;98;21;4;4;6;6;4;3.2;5.3;1.5;0.7;129;25;10;79;15;6;cca
33;Lys;43;43;aaa;1;6;0.15;155;24;131;1;5;7;5;29;35;48;6;2;11;12;12;11;1.4;3.0;1.1;0.9;83;8;23;73;7;20;aaa
63;Thr;28;31;acg;1;23;0.62;66;41;25;18;5;3;26;12;0;9;5;7;0;4;1;3;9;0.7;4;3.0;9;12;4;36;48;16;acg
58;Arg;60;63;agg;1;25;0.48;69;33;36;20;5;5;23;13;3;14;2;1;0;8;1;7;4.7;2.0;8;7.0;17;3;8;61;11;29;agg
37;Ile;11;11;ata;1;27;0.02;59;0;59;0;26;0;0;41;2;16;0;0;0;0;0;0;8.0;0;0;0;18;0;0;100;0;0;ata
56;Trp;52;61;tgg;2;2;0.28;173;49;124;1;1;4;10;26;32;59;27;3;5;7;3;9;1.8;9.0;1.4;3.0;91;30;12;68;23;9;tgg
16;Cys;50;53;tgc;2;3;0.79;143;113;30;2;1;2;28;10;1;17;59;19;1;6;0;7;17;3.1;6.0;7;18;78;7;17;76;7;tgc
38;Arg;59;59;aga;2;8;0.90;207;187;20;3;5;5;28;7;0;5;133;18;1;10;3;8;5;7.4;10;2.7;5;151;11;3;90;7;aga
47;Val;15;12;gta;2;18;0.61;64;39;25;8;10;8;19;13;1;2;5;7;0;9;1;8;2.0;0.7;9;8.0;3;12;9;13;50;38;gta
35;Leu;3;9;tta;3;14;0.75;132;99;33;5;8;1;22;16;5;11;66;10;0;1;0;1;2.2;6.6;1;1;16;76;1;17;82;1;tta
68;Gly;64;64;ggg;3;21;0.52;69;36;33;15;5;4;23;12;0;11;4;4;1;10;6;5;11;1.0;10.0;0.8;11;8;11;37;27;37;ggg
55;Leu;4;13;ttg;4;4;0.21;190;39;151;1;3;2;6;30;34;84;30;1;0;3;1;2;2.5;30;3;2.0;118;31;3;78;20;2;ttg
22;Pro;21;22;cct;4;16;0.19;155;30;125;12;4;1;18;19;33;62;10;1;8;3;10;1;1.9;10;0.4;0.1;95;11;11;81;9;9;cct
66;Arg;56;62;cgg;4;24;0.69;55;38;17;19;5;2;26;10;1;4;3;5;1;3;0;4;4.0;0.6;3.0;4;5;8;4;29;47;24;cgg
45;Leu;7;10;cta;6;13;0.09;75;7;68;3;9;1;4;31;6;30;1;1;0;1;0;1;5.0;1.0;1;1;36;2;1;92;5;3;cta
25;Leu;5;6;ctt;10;5;0.20;170;34;136;2;3;2;10;19;43;52;10;6;13;15;20;8;1.2;1.7;1.2;0.4;95;16;28;68;12;20;ctt
65;Leu;8;14;ctg;11;12;0.20;89;18;71;9;3;2;11;18;6;35;1;3;6;7;10;3;5.8;0.3;1.2;0.3;41;4;13;71;7;22;ctg
64;Ala;32;32;gcg;16;7;0.42;60;25;35;3;4;4;8;14;1;15;4;2;6;6;1;11;15;2.0;1.0;11;16;6;12;47;18;35;gcg
46;Arg;55;58;cga;20;6;0.14;92;13;79;4;2;3;6;13;25;34;1;1;4;5;4;5;1.4;1.0;1.3;1.3;59;2;9;84;3;13;cga
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85;Leu;6;2;ctc;30;10;0.89;18;16;2;8;2;0;10;2;0;0;5;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;ctc
36;SeC;51;57;tga;31;10;0.33;12;4;8;4;6;0;4;7;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;100;0;0;tga
77;Ile;10;3;atc;36;6;0.83;6;5;1;5;2;0;5;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;atc
71;Tyr;33;33;tat;40;2;0;2;2;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tat
73;Asn;41;35;aat;40;2;0;2;0;2;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;aat
74;Asp;45;36;gat;40;2;0;2;0;2;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;gat
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82;Pro;22;18;ccc;41;1;0;1;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ccc
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78;Ser;57;51;agt;42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;agt

C42.GDI Méthode

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C42.GDI Niveau 1
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  • exception: 6*? voir les décomptes des duplications
C42;tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;diff;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;dble;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;dif;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;unit1;zéros;tRNA;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro
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tcg;2;3;2;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;3;3;1;1;1;1;1;2;2;3;3;4;1;1;2;2;3;1;1;2;2;1;1;3;3;4;3;4;2;19;0;80;tcg;2;3;2;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;3;3;1;1;1;1;1;2;1;3;2;3;1;1;2;2;3;1;1;2;2;1;1;3;3;3;3;3;2;;;;tcg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;;;;tcg;1;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;0;1;0;2;1;2;0;0;1;1;2;0;0;1;1;0;0;2;2;2;2;2;1
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tgt;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;41;1;tgt;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;;;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;;;tgt;−;0;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−
tta;1;3;2;5;3;1;1;3;10;1;1;2;1;1;2;14;3;3;1;3;2;4;1;1;1;7;1;2;3;3;7;2;0;12;3;9;7;0;1;0;1;4;14;3;132;tta;1;3;2;2;1;1;1;1;2;1;1;2;1;1;2;3;2;1;1;1;1;2;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;0;2;1;1;7;0;1;0;1;1;;;;tta;0;0;0;3;2;0;0;2;8;0;0;0;0;0;0;11;1;2;0;2;1;2;0;0;0;5;0;0;2;1;6;0;0;10;2;8;0;0;0;0;0;3;;;;tta;0;2;1;1;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;2;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;−;1;0;0;6;−;0;−;0;0
ttc;5;7;7;5;6;8;5;2;9;1;1;11;9;15;10;9;5;6;5;8;7;10;7;5;12;10;3;5;6;7;10;5;4;12;6;9;5;3;7;4;17;8;2;0;296;ttc;3;6;5;4;1;4;5;2;4;1;1;8;7;15;9;7;1;5;1;4;7;1;5;4;4;7;1;2;2;4;5;2;4;7;4;3;5;2;5;3;11;4;;;;ttc;2;1;2;1;5;4;0;0;5;0;0;3;2;0;1;2;4;1;4;4;0;9;2;1;8;3;2;3;4;3;5;3;0;5;2;6;0;1;2;1;6;4;;;;ttc;2;5;4;3;0;3;4;1;3;0;0;7;6;14;8;6;0;4;0;3;6;0;4;3;3;6;0;1;1;3;4;1;3;6;3;2;4;1;4;2;10;3
ttg;2;0;5;6;8;7;3;1;4;1;1;3;3;4;4;2;7;5;3;11;8;14;2;2;5;9;3;0;8;7;10;4;0;9;8;2;1;0;2;3;3;10;4;4;190;ttg;2;0;5;5;5;1;3;1;1;1;1;3;3;4;4;2;3;3;3;7;7;2;2;2;5;9;1;0;1;3;5;1;0;6;5;1;1;0;2;3;3;10;;;;ttg;0;0;0;1;3;6;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;4;2;0;4;1;12;0;0;0;0;2;0;7;4;5;3;0;3;3;1;0;0;0;0;0;0;;;;ttg;1;−;4;4;4;0;2;0;0;0;0;2;2;3;3;1;2;2;2;6;6;1;1;1;4;8;0;−;0;2;4;0;−;5;4;0;0;−;1;2;2;9
ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;41;2;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;;;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;;;ttt;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;1;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−;−
C42.GDI Niveau 2
modifier
  • Exceptions: ? d’après fasta et non d’après le tableau des introns pour sre* et uma, erreur d’affichage pour ede*. fgr et fgr5 correction des introns dans la base, Relevé du 30.1.19
C42;intron;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;introns
aaa;2;3;1;1;3;4;1;0;7;0;1;2;2;6;2;8;4;4;3;5;4;6;0;0;2;8;2;1;3;3;7;0;1;9;5;6;1;1;2;0;4;7;131
aac;6;0;6;3;0;0;4;0;0;0;1;9;9;12;8;0;0;0;0;0;0;0;6;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;6;3;16;0;94
aag;0;11;8;2;0;0;7;3;10;0;0;12;12?;11;15;0;0;0;0;0;0;10;6;9;5;0;0;0;9;0;0;9;5;0;0;0;6;5;0;9;34;0;198
aat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2
aca;2;2;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;3;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;3;3;3;0;30
acc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
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agg;2;2;0;1;0;0;3;0;0;0;1;1;1;6;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;5;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;2;1;1;2;0;0;36
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gag;1;0;9;0;0;0;10;1;0;0;0;13;13?;10;16;0;0;0;0;0;0;0;9;8;24;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;7;4;0;8;27;0;164
gat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2
gca;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;1;3;3;8;3;0;0;0;0;0;3;0;3;2;3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;2;1;2;2;0;0;43
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gct;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;2;12;13;2;14;0;0;0;0;0;0;0;9;7;19;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;7;5;11;7;0;0;119
gga;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;4;3;2;0;2;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;1;2;2;0;11;0;42
ggc;0;0;8;0;0;0;5;0;0;0;2;14;14;10;14;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;6;0;8;0;0;101
ggg;1;0;2;0;0;0;2;0;0;0;1;1;1;7;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;6;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;2;1;1;1;0;0;33
ggt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1
gta;0;1;2;1;0;0;0;1;1;0;1;1;1;2;1;0;0;0;0;0;0;2;1;1;2;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;1;1;1;1;0;0;25
gtc;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
gtg;1;3;2;0;0;0;2;1;0;0;1;1;1;3;1;0;0;0;0;0;0;0;2;3;1;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;3;1;2;2;3;0;37
gtt;0;0;8;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;8;0;0;0;9;4;0;0;0;0;4;8;5;0;0;59
taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
tac;6;13;6;4;6;5;4;3;6;1;1;6;6?;6;8;9;5;5;4;7;6;10;5;6;10;9;2;5;5;5;8;4;2;9;7;6;4;3;6;4;14;7;248
tag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
tat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
tca;1;1;4;0;0;2;1;2;0;0;1;2;2;2;2;0;0;0;2;0;0;0;2;2;2;0;0;1;0;0;0;2;1;0;0;0;1;1;3;1;2;3;43
tcc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1
tcg;2;3;2;1;1;1;1;1;1;0;1;2;2;3;3;1;1;1;0;1;2;0;3;0;4;1;1;2;2;3;1;1;2;2;1;1;0;3;1;2;4;2;66
tct;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;1;0;0;3;0;0;0;0;0;11;0;0;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;3;0;2;0;0;35
tga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;2;1;0;0;0;8
tgc;3;4;5;2;0;0;3;0;0;0;1?;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;2;1;0;0;0;30
tgg;0;0;1;2;5;4;3;1;0;0;0;4;4;3;5;6;4;4;3;5;5;0;0;2;0;7;1;0;0;5;6;0;2;7;4;4;0;2;3;3;13;6;124
tgt;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
tta;1;0;2;5;0;0;1;3;0;0;1;1;1;1;2;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;2;0;0;0;2;0?;0;0;0;7;0?;1;0;0;0;33
ttc;5;7;7;5;6;0;5;0;8;0;1;9;9?;12;10;9;0;6;5;8;7;10;7;5;12;10;0;0;6;6;10;0;4;12;6;9;5;3;7;4;17;8;260
ttg;2;0;5;6;8;0;3;1;0;0;1;3;3;4;4;2;7;5;3;11;8;0;2;2;5;9;0;0;0;7;10;4;0;9;8;2;1;0;1;2;3;10;151
ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2
C42.GDI Niveau 3
modifier 
C42;format;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro
aaa;&;&;;;&;;&;;;;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;;&;&;&;&;&;;&;;&;&;&;&;;&;&;&;&;&
aac;&;;&;&;;;&;;;;&;&;&;&;&;;;;;;;;&;;;;;;;;;;;;;;&;;&;;&;
aag;;&;;&;;;&;&;&;;&;;&;&;&;;;;;;;&;;&;;;;;&;;;&;&;;;;&;&;;&;&;
aat;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
aca;&;&;;;;;&;;;;;;;;;;;;;;;;&;&;&;;;;;;;;&;;;;&;&;&;&;&;
acc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
acg;&;&;&;&;;;&;&;;;;;;;;;;;;;;;&;;&;;;;;;;;&;;;;&;&;&;&;;
act;;;;;;;&;;;;&;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;&;;;;;
aga;;&;&;;;;&;;;;&;;;;;;;;;;;;&;&;;;;&;;;;;&;;;;;&;;;;
agc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&
agg;&;&;;&;;&;&;;;;&;;;&;;;;;;;;;&;&;&;;;;;;;&;&;;;;&;&;;;;
agt;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
ata;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
atc;&;&;&;&;&;;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;
atg;;;;;;;;;;;&;;&;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;&;;;;;&;;;;
att;;;&;&;;;&;;;;&;;&;;&;;;;;;;;&;&;&;;;;;;;;&;;;;&;&;;&;&;
caa;&;&;;&;;;&;&;;;&;&;&;&;&;;;;;;;;&;&;&;;;&;;;;;&;;;;&;&;&;&;&;
cac;;;&;&;;;;&;;;&;&;&;&;&;;;;;;;;;&;&;;;&;;;;;&;;;;&;&;&;;;
cag;&;;;;;;;&;;;&;;;&;;;&;;;&;;;&;;&;;;;;&;;;&;;;;&;&;;;;
cat;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
cca;&;&;&;&;&;;&;&;&;;&;&;&;&;;&;&;&;;&;&;&;&;&;;&;;&;&;;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;;
ccc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
ccg;;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&
cct;&;&;&;&;;&;&;&;;;&;&;&;&;&;;;;;;;;&;&;;;&;&;&;;;;&;;;;&;&;&;&;&;
cga;&;;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;;&;&;&;&;;&;&;&;&;;;&;&;;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;;&;&;&
cgc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
cgg;&;;;&;;;&;;&;&;&;;;&;;;;;;;;&;;&;;;;;;;;&;&;;;;;&;;&;&;
cgt;;;;&;;;&;&;;;;;;;;;&;;&;&;&;&;&;;;;;;&;&;;;&;;;;&;&;;;;
cta;&;&;&;&;&;;&;&;;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&
ctc;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;;;&;&;&;&;&;&;&;&;;;&;&;;;;&;&;&;&;&;
ctg;&;&;&;;&;;&;;;;;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;;&;&;&;&;;&;;;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;;&
ctt;&;&;&;&;&;;&;&;;;&;;&;&;&;;&;&;;&;&;;&;&;;;;&;;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
gaa;;;&;&;;;&;;;;&;;&;;&;;;;;;;;;;;;;;;;;;&;;;;;&;&;;;
gac;&;&;&;;;;&;;;;&;;;&;;;;;;;;;;;&;;;;;;;;&;;;;&;&;;;&;
gag;;;&;;;;&;&;;;;;&;;&;;;;;;;;&;&;&;;;;;;;;&;;;;&;;;;&;
gat;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
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gcc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
gcg;;;&;&;&;&;&;&;;;&;&;;;&;&;&;;&;&;;;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;;&
gct;;;;;;;&;;;;&;;&;;&;;;;;;;;&;&;&;;;;;;;;&;;;;&;&;&;&;;
gga;;;;;;;;;;;;;;;;;&;;;;;;&;;;;;;;;;;;;;;;&;;;&;
ggc;;;&;;;;;;;;&;&;;;&;;;;;;;;&;;;;;;;;;;&;;;;;&;;;;
ggg;&;;&;;;;&;&;;;;&;&;;;;;;;;;;&;&;&;;&;&;;;;;&;;;;&;&;;;&;
ggt;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
gta;;;&;&;;;&;&;;;&;;;;;;;;;;;&;&;;&;;&;&;;;;;&;;;;&;&;&;&;;
gtc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
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gtt;;;&;;;;&;;;;;;;;;;;;;;;;&;;;;;;;;;&;&;;;;;&;;;;
taa;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
tac;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&
tag;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
tat;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&
tca;&;&;&;;;;&;&;;;&;&;&;&;&;;;;&;;;;&;;;;;&;;;;&;&;;;;&;&;&;&;&;&
tcc;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
tcg;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;;;&;&
tct;;;;;;;&;;;;&;;;;;;;;;&;;;&;;;;;;;;;;&;;;;;&;;;;
tga;&;&;&;&;&;;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
tgc;&;&;&;&;;;&;&;;;&;;;;;;;;;;;;&;;;;;&;;;;;&;&;;;;&;;;;
tgg;;;;&;&;&;&;&;;;&;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;;;;;&;;&;;&;&;;&;&;&;&;;&;&;&;&;&
tgt;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
tta;&;;&;&;;;&;&;;;&;;&;&;&;;;;;;;;&;&;&;;;&;;;;&;&;;;;&;&;&;&;;
ttc;&;&;&;&;&;;&;;;;&;;&;;&;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;;&;;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
ttg;&;&;&;&;&;;&;&;;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;&;&;&;&;;&;;&;&;&;&;&;&;&;&;&;;;&;&
ttt;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&;&
C42.GDI Niveau 4
modifier
  • Calculs à droite de tRNAi et tRNAs
;;;;C42;in tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;in diff;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;in dble;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;in dif;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;introns-in(tot);;;duplications effectives;;;;;duplications effectives;
gen_in;nbsi0;nbvide;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;tot;in;in_1;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;diff;in;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dble;in;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dif;in;;;;introns isi;;;tRNAi;introns isi − gen_isi;;;;tRNAs;isi dble+isi dif − tRNAi
29;0;13;;aaa;2;3;;;3;;1;;;;1;;2;6;2;8;4;4;3;5;4;6;;;2;8;2;1;3;;7;;1;9;5;6;;1;2;;4;7;aaa;112;5;aaa;2;3;;;1;;1;;;;1;;2;6;2;7;2;3;3;4;2;4;;;2;6;2;1;3;;2;;1;3;3;2;;1;2;;4;2;aaa;77;;aaa;;;;;2;;;;;;;;;;;1;2;1;;1;2;2;;;;2;;;;;5;;;6;2;4;;;;;;5;aaa;35;;aaa;1;2;;;;;;;;;;;1;5;1;6;1;2;2;3;1;3;;;1;5;1;;2;;1;;;2;2;1;;;1;;3;1;aaa;48;;;;19;;;12;;;;;11;
13;0;29;;aac;6;;6;3;;;4;;;;1;9;9;12;8;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;3;;6;;16;;aac;89;1;aac;6;;5;3;;;4;;;;1;6;5;8;5;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;3;;6;;9;;aac;67;;aac;;;1;;;;;;;;;3;4;4;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;;aac;22;;aac;5;;4;2;;;3;;;;;5;4;7;4;;;;;;;;5;;;;;;;;;;;;;;2;;5;;8;;aac;54;;;;5;;;2;;;;;18;
17;0;25;;aag;;11;;2;;;7;3;10;;;;12;11;15;;;;;;;10;;9;;;;;9;;;9;5;;;;6;5;;9;34;;aag;167;0;aag;;3;;2;;;2;3;4;;;;4;9;5;;;;;;;2;;9;;;;;3;;;3;5;;;;6;5;;7;24;;aag;96;;aag;;8;;;;;5;;6;;;;8;2;10;;;;;;;8;;;;;;;6;;;6;;;;;;;;2;10;;aag;71;;aag;;2;;1;;;1;2;3;;;;3;8;4;;;;;;;1;;8;;;;;2;;;2;4;;;;5;4;;6;23;;aag;79;;;;31;;;27;;;;;28;
2;0;40;;aat;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aat;2;2;aat;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aat;2;;aat;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aat;0;;aat;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aat;0;;;;0;;;0;;;;;0;
12;0;30;;aca;2;2;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;2;2;3;;;;;;;;1;;;;1;1;3;3;3;;aca;24;4;aca;2;2;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;2;2;3;;;;;;;;1;;;;1;1;3;3;3;;aca;24;;aca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aca;0;;aca;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;2;;;;;;;;;;;;;;2;2;2;;aca;12;;;;6;;;3;;;;;3;
0;0;42;;acc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;acc;0;0;acc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;acc;0;;acc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;acc;0;;acc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;acc;0;;;;0;;;0;;;;;0;
12;0;30;;acg;2;2;;1;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;2;;3;;;;;;;;1;;;;2;1;3;2;;;acg;21;5;acg;2;2;;1;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;2;;3;;;;;;;;1;;;;2;1;3;2;;;acg;21;;acg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;acg;0;;acg;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;2;;;;;;;;;;;;1;;2;1;;;acg;9;;;;4;;;1;;;;;3;
3;0;39;;act;;;;;;;5;;;;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;;;;;;act;11;0;act;;;;;;;5;;;;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;;;;;;act;11;;act;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;act;0;;act;;;;;;;4;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;;;;;act;8;;;;31;;;21;;;;;43;
7;0;35;;aga;;2;5;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;aga;12;5;aga;;2;5;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;aga;12;;aga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aga;0;;aga;;1;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aga;5;;;;8;;;3;;;;;8;
36;0;6;;agc;4;6;5;2;3;3;2;1;3;;1;8;8;;7;4;2;3;2;4;3;6;3;5;6;4;;4;2;;4;3;;6;3;3;3;2;;3;6;5;agc;139;2;agc;4;5;5;2;2;1;2;1;2;;1;7;7;;6;2;2;1;2;4;3;3;3;5;6;3;;3;2;;2;1;;6;1;3;3;1;;3;6;5;agc;115;;agc;;1;;;1;2;;;1;;;1;1;;1;2;;2;;;;3;;;;1;;1;;;2;2;;;2;;;1;;;;;agc;24;;agc;3;4;4;1;1;;1;;1;;;6;6;;5;1;1;;1;3;2;2;2;4;5;2;;2;1;;1;;;5;;2;2;;;2;5;4;agc;79;;;;5;;;3;;;;;4;
13;0;29;;agg;2;2;;1;;;3;;;;1;;;6;;;;;;;;;3;2;5;;;;;;;1;1;;;;2;1;;;;;agg;30;5;agg;2;2;;1;;;3;;;;1;;;4;;;;;;;;;3;2;4;;;;;;;1;1;;;;2;1;;;;;agg;27;;agg;;;;;;;;;;;;;;2;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;agg;3;;agg;1;1;;;;;2;;;;;;;3;;;;;;;;;2;1;3;;;;;;;;;;;;1;;;;;;agg;14;;;;6;;;1;;;;;7;
0;0;42;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;agt;0;0;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;agt;0;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;agt;0;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;agt;0;;;;0;;;0;;;;;0;
41;0;1;;ata;1;2;1;1;2;1;1;1;2;1;1;3;3;2;1;2;1;2;1;1;1;4;1;1;1;2;1;2;1;1;2;1;1;2;1;2;1;1;;1;1;1;ata;59;26;ata;1;2;1;1;2;1;1;1;2;1;1;3;3;2;1;2;1;2;1;1;1;3;1;1;1;2;1;2;1;1;2;1;1;2;1;1;1;1;;1;1;1;ata;57;;ata;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;ata;2;;ata;;1;;;1;;;;1;;;2;2;1;;1;;1;;;;2;;;;1;;1;;;1;;;1;;;;;;;;;ata;16;;;;0;;;0;;;;;0;
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1;0;41;;ttt;;;;;;;;;;;;;;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttt;2;0;ttt;;;;;;;;;;;;;;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttt;2;;ttt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttt;0;;ttt;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttt;1;;;;0;;;0;;;;;0;
C42.GDI Niveau 5
modifier 
C42;isi tot;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;isi diff  1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;isi dble  1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;isi dif  1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro
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C42.GDI Niveau 6
modifier 
;;;;C42;isi tot;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;isi diff  2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;isi dble  2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;isi dif  2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gen_isi;nbsi0;nbvide;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;tot;isi;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;diff;isi;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dble;isi;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dif;isi
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C42.GDI Niveau 7
modifier 
;;;;C42;sin tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;sin diff;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;sin dble;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;sin dif;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gen_sin;nbsi0;nbvide;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;tot;sin;sin_1;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;diff;sin;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dble;sin;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dif;sin
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10;32;0;;tgg;3;4;0;0;0;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;4;0;7;0;0;0;4;0;0;3;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;tgg;40;1;tgg;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;2;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;tgg;13;;tgg;2;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;3;0;5;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;tgg;27;;tgg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;tgg;3
0;42;0;;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt;0;0;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt;0;;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt;0;;tgt;;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;tgt;0
22;20;0;;tta;0;3;0;0;3;1;0;0;10;1;0;0;0;0;0;14;3;3;1;3;2;4;0;0;0;7;1;0;3;3;7;0;0;12;3;9;0;0;0;0;1;4;tta;98;5;tta;0;3;0;0;1;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;3;2;1;1;1;1;2;0;0;0;2;1;0;1;2;1;0;0;2;1;1;0;0;0;0;1;1;tta;32;;tta;0;0;0;0;2;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;11;1;2;0;2;1;2;0;0;0;5;0;0;2;1;6;0;0;10;2;8;0;0;0;0;0;3;tta;66;;tta;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;;1;0;0;0;;0;;0;0;tta;10
7;35;0;;ttc;0;0;0;0;0;8;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;29;1;ttc;0;0;0;0;0;4;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;13;;ttc;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;3;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;16;;ttc;0;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;6
6;36;0;;ttg;0;0;0;0;0;7;0;0;4;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;3;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttg;37;1;ttg;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttg;7;;ttg;0;0;0;0;0;6;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;0;2;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttg;30;;ttg;0;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;0;0;0;0;;0;0;0;0;;0;0;0;0;ttg;1
0;42;0;;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt;0;0;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt;0;;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt;0;;ttt;;;;;;;;;;;;;;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttt;0

Les introns des E79 eucaryotes: genèse duplications et introns

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  • Lien aux tableaux:Les introns des E79 eucaryotes: genèse duplications et introns.
  • Légende: Pour plus de détails, voir la légende des C42 champignons pour la construction et la coloration de ces tableaux.
    − Source des données pour les codons étudiés ici aag aga ata atg caa cga tac ttg: effectifs des tRNAs, des introns et correspondance entre code KEGG et le nom de l'espèce.
    − Coloration: Ce sont les couleurs des C42 champignons, jaune pour les tRNAs à intron seuls, vert pour les tRNAs sans intron seuls, blanc pour le mélange des 2. Le nombre réduit des codons à étudier permet de sélectionner les zéros affichés du tableau des introns et de les colorer en vert (tRNAs sans intron). Le nombre réduit des cellules avec intron permet de différencier facilement celles qui n'ont que des tRNAs à introns (jaune) de celle qui en contiennent sans (blanc). Après il suffit de copier le tableau des introns coloré ainsi et de coller son format (ctrl+v) sur les tableaux des tRNAs (tot), diff, double (égale tot-diff), dif (égale diff-1).
    − Les décomptes se font manuellement suivant les couleurs sur le tableau tot en sélectionnant les cellules à sommer. On obtient ainsi le tableau des totaux (tot). Il suffit alors de copier et puis coller les formules (ctrl+v) de ce tableau sous les colonnes de diff, intron, double et dif pour obtenir les totaux de diff, introns, double et dif.
    − Les calculs pour les tableaux en fin des données sont expliqués dans les tableaux formatés pour la synthèse.
  • Données pour tableur.

E79.GDI Les carrés

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  • Lien aux tableaux:E79.GDI Les carrés.
  • Note: Ici les tableaux des genèses, des duplications et des introns des tRNAs sont présentés sous forme de carrés plus faciles à lire pour contrôler les tableaux de
  • Légende:
E79.GDI tRNAs et introns
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tRNAs et introns;;;;;;;;;;;;;;;;
tRNA;;;;;;;;;sint/tot;X100;;;;;;
ttt;51;tct;920;tat;63;tgt;216;;ttt;78;tct;100;tat;63;tgt;100
atc;74;act;1201;aat;113;agt;80;;atc;81;act;99;aat;96;agt;98
ctt;936;cct;981;cat;36;cgt;920;;ctt;95;cct;98;cat;83;cgt;100
gtt;1153;gct;2141;gat;96;ggc;1563;;gtt;100;gct;100;gat;96;ggc;100
ttc;1195;tcc;169;tac;1464;tgc;2274;;ttc;100;tcc;86;tac;15;tgc;99
att;1468;acc;87;aac;1788;agc;1075;;att;100;acc;100;aac;100;agc;99
ctc;11;ccc;29;cac;1028;cgc;34;;ctc;91;ccc;83;cac;99;cgc;91
gtc;99;gcc;250;gac;1864;ggt;117;;gtc;100;gcc;100;gac;99;ggt;97
tta;592;tca;660;taa;169;tga;237;;tta;97;tca;98;taa;95;tga;99
ata;626;aca;969;aaa;1757;aga;1171;;ata;27;aca;99;aaa;97;aga;60
cta;486;cca;1054;caa;1796;cga;1938;;cta;100;cca;95;caa;92;cga;93
gta;730;gca;7013;gaa;6391;gga;5135;;gta;99;gca;100;gaa;100;gga;100
ttg;657;tcg;482;tag;108;tgg;1585;;ttg;39;tcg;100;tag;89;tgg;100
atg;2618;acg;609;aag;4270;agg;1035;;atg;94;acg;99;aag;92;agg;99
ctg;785;ccg;444;cag;1202;cgg;369;;ctg;99;ccg;98;cag;99;cgg;99
gtg;2602;gcg;4486;gag;2851;ggg;6665;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100
;;;;;;;;;;;;;;;;
int;;;;;;;;;sin_t;;;;;;;
ttt;11;tct;2;tat;23;tgt;1;;ttt;40;tct;918;tat;40;tgt;215
atc;14;act;10;aat;4;agt;2;;atc;60;act;1191;aat;109;agt;78
ctt;45;cct;17;cat;6;cgt;0;;ctt;891;cct;964;cat;30;cgt;920
gtt;3;gct;4;gat;4;ggc;7;;gtt;1150;gct;2137;gat;92;ggc;1556
ttc;2;tcc;23;tac;1239;tgc;13;;ttc;1193;tcc;146;tac;225;tgc;2261
att;5;acc;0;aac;8;agc;9;;att;1463;acc;87;aac;1780;agc;1066
ctc;1;ccc;5;cac;11;cgc;3;;ctc;10;ccc;24;cac;1017;cgc;31
gtc;0;gcc;1;gac;18;ggt;4;;gtc;99;gcc;249;gac;1846;ggt;113
tta;18;tca;13;taa;8;tga;3;;tta;574;tca;647;taa;161;tga;234
ata;454;aca;5;aaa;54;aga;469;;ata;172;aca;964;aaa;1703;aga;702
cta;2;cca;50;caa;148;cga;131;;cta;484;cca;1004;caa;1648;cga;1807
gta;5;gca;2;gaa;28;gga;21;;gta;725;gca;7011;gaa;6363;gga;5114
ttg;400;tcg;2;tag;12;tgg;5;;ttg;257;tcg;480;tag;96;tgg;1580
atg;149;acg;6;aag;321;agg;14;;atg;2469;acg;603;aag;3949;agg;1021
ctg;7;ccg;11;cag;17;cgg;4;;ctg;778;ccg;433;cag;1185;cgg;365
gtg;6;gcg;4;gag;13;ggg;15;;gtg;2596;gcg;4482;gag;2838;ggg;6650
E79.GDI Genèse
modifier 
Genèse;;;;;;;;;;;;;;;;
gen_in;;;;;;;;;gen_sin;;;;;;;
ttt;4;tct;0;tat;8;tgt;1;;ttt;22;tct;76;tat;10;tgt;30
atc;4;act;0;aat;0;agt;0;;atc;22;act;71;aat;29;agt;16
ctt;0;cct;1;cat;1;cgt;0;;ctt;69;cct;73;cat;19;cgt;78
gtt;0;gct;0;gat;1;ggc;0;;gtt;77;gct;75;gat;32;ggc;74
ttc;0;tcc;2;tac;38;tgc;0;;ttc;76;tcc;23;tac;0;tgc;68
att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;76;acc;23;aac;74;agc;72
ctc;1;ccc;2;cac;0;cgc;3;;ctc;8;ccc;15;cac;69;cgc;11
gtc;0;gcc;1;gac;0;ggt;1;;gtc;37;gcc;23;gac;77;ggt;15
tta;0;tca;0;taa;2;tga;1;;tta;71;tca;70;taa;35;tga;61
ata;34;aca;0;aaa;0;aga;1;;ata;9;aca;76;aaa;70;aga;21
cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;74;cca;72;caa;71;cga;72
gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;74;gca;76;gaa;71;gga;70
ttg;33;tcg;0;tag;2;tgg;0;;ttg;13;tcg;78;tag;18;tgg;74
atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;68;acg;71;aag;71;agg;73
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;72;ccg;75;cag;71;cgg;69
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;72;gcg;75;gag;73;ggg;68
;;;;;;;;;;;;;;;;
gen_isi;;;;;;;;;zéros;;;;;;;
ttt;1;tct;1;tat;8;tgt;0;;ttt;52;tct;2;tat;52;tgt;48
atc;1;act;7;aat;4;agt;2;;atc;52;act;1;aat;46;agt;61
ctt;10;cct;4;cat;2;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;57;cgt;1
gtt;2;gct;4;gat;2;ggc;4;;gtt;0;gct;0;gat;44;ggc;1
ttc;2;tcc;2;tac;41;tgc;9;;ttc;1;tcc;52;tac;0;tgc;1
att;3;acc;0;aac;5;agc;6;;att;0;acc;56;aac;0;agc;1
ctc;0;ccc;1;cac;9;cgc;0;;ctc;70;ccc;61;cac;1;cgc;65
gtc;0;gcc;0;gac;2;ggt;2;;gtc;42;gcc;55;gac;0;ggt;61
tta;8;tca;9;taa;1;tga;1;;tta;0;tca;0;taa;41;tga;16
ata;35;aca;3;aaa;8;aga;57;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0
cta;2;cca;7;caa;8;cga;7;;cta;3;cca;0;caa;0;cga;0
gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9;;gta;0;gca;1;gaa;0;gga;0
ttg;32;tcg;1;tag;7;tgg;4;;ttg;1;tcg;0;tag;53;tgg;1
atg;11;acg;5;aag;7;agg;5;;atg;0;acg;2;aag;1;agg;1
ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;8
gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;4
E79.GDI Absence de duplication
modifier 
Absence de duplication;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
unit1;;;;;;;;;in 1;;;;;;;;;sin 1;;;;;;;
ttt;16;tct;2;tat;13;tgt;18;;ttt;3;tct;0;tat;6;tgt;1;;ttt;13;tct;2;tat;6;tgt;17
atc;10;act;0;aat;15;agt;5;;atc;2;act;0;aat;0;agt;0;;atc;8;act;0;aat;15;agt;5
ctt;3;cct;1;cat;15;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;1;cgt;0;;ctt;3;cct;1;cat;14;cgt;0
gtt;1;gct;1;gat;21;ggc;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggc;0;;gtt;1;gct;1;gat;21;ggc;0
ttc;1;tcc;10;tac;1;tgc;1;;ttc;0;tcc;2;tac;1;tgc;0;;ttc;1;tcc;8;tac;0;tgc;1
att;1;acc;12;aac;1;agc;1;;att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;1;acc;12;aac;1;agc;1
ctc;7;ccc;13;cac;0;cgc;8;;ctc;1;ccc;2;cac;0;cgc;3;;ctc;6;ccc;11;cac;0;cgc;5
gtc;23;gcc;11;gac;1;ggt;5;;gtc;0;gcc;1;gac;0;ggt;1;;gtc;23;gcc;10;gac;1;ggt;4
tta;3;tca;3;taa;19;tga;32;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;1;;tta;3;tca;3;taa;19;tga;31
ata;6;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;4;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;2;aca;2;aaa;2;aga;2
cta;5;cca;3;caa;3;cga;4;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;5;cca;3;caa;3;cga;4
gta;5;gca;3;gaa;2;gga;2;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;5;gca;3;gaa;2;gga;2
ttg;2;tcg;5;tag;5;tgg;1;;ttg;0;tcg;0;tag;2;tgg;0;;ttg;2;tcg;5;tag;4;tgg;1
atg;0;acg;4;aag;0;agg;1;;atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;0;acg;4;aag;0;agg;1
ctg;1;ccg;5;cag;2;cgg;7;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;1;ccg;5;cag;2;cgg;7
gtg;2;gcg;1;gag;2;ggg;3;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;2;gcg;1;gag;2;ggg;3
E79.GDI Les duplications
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Duplications;;;;;;;;;;;;;;;;
dblei;;;;;;;;;difi;;;;;;;
ttt;1;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;4;tct;0;tat;3;tgt;0
atc;1;act;0;aat;0;agt;0;;atc;8;act;0;aat;0;agt;0
ctt;0;cct;1;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;10;cat;0;cgt;0
gtt;0;gct;0;gat;1;ggc;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggc;0
ttc;0;tcc;0;tac;79;tgc;0;;ttc;0;tcc;0;tac;352;tgc;0
att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;0;acc;0;aac;0;agc;0
ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0
tta;0;tca;0;taa;1;tga;0;;tta;0;tca;0;taa;2;tga;0
ata;2;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;93;aca;0;aaa;0;aga;4
cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;0
gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0
ttg;12;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;135;tcg;0;tag;0;tgg;0
atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;0;acg;0;aag;0;agg;0
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0
;;;;;;;;;;;;;;;;
sin;dbles;;;;;;;;sin;difs;;;;;;
ttt;0;tct;501;tat;0;tgt;10;;ttt;14;tct;333;tat;13;tgt;175
atc;5;act;458;aat;1;agt;8;;atc;32;act;583;aat;22;agt;28
ctt;431;cct;623;cat;0;cgt;543;;ctt;281;cct;225;cat;9;cgt;299
gtt;580;gct;798;gat;0;ggc;891;;gtt;474;gct;931;gat;32;ggc;463
ttc;621;tcc;37;tac;0;tgc;795;;ttc;450;tcc;82;tac;0;tgc;851
att;827;acc;25;aac;811;agc;394;;att;490;acc;39;aac;649;agc;512
ctc;1;ccc;1;cac;541;cgc;2;;ctc;1;ccc;5;cac;271;cgc;18
gtc;27;gcc;8;gac;1051;ggt;2;;gtc;35;gcc;218;gac;590;ggt;77
tta;75;tca;150;taa;3;tga;7;;tta;321;tca;346;taa;89;tga;150
ata;15;aca;271;aaa;521;aga;78;;ata;15;aca;565;aaa;846;aga;74
cta;120;cca;512;caa;303;cga;228;;cta;267;cca;288;caa;369;cga;275
gta;119;gca;3191;gaa;427;gga;557;;gta;349;gca;3720;gaa;863;gga;434
ttg;73;tcg;133;tag;1;tgg;406;;ttg;65;tcg;263;tag;48;tgg;634
atg;1154;acg;117;aag;859;agg;205;;atg;823;acg;385;aag;770;agg;599
ctg;341;ccg;205;cag;485;cgg;84;;ctg;296;ccg;107;cag;455;cgg;186
gtg;424;gcg;205;gag;653;ggg;230;;gtg;470;gcg;317;gag;981;ggg;469
;;;;;;;;;;;;;;;;
isi;dbleisi;;;;;;;;isi;difisi;;;;;;
ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0;;ttt;5;tct;4;tat;20;tgt;0
atc;0;act;19;aat;4;agt;17;;atc;1;act;63;aat;53;agt;9
ctt;60;cct;26;cat;0;cgt;0;;ctt;85;cct;17;cat;5;cgt;0
gtt;14;gct;24;gat;2;ggc;25;;gtt;6;gct;309;gat;26;ggc;106
ttc;24;tcc;5;tac;228;tgc;92;;ttc;22;tcc;18;tac;726;tgc;458
att;23;acc;0;aac;131;agc;49;;att;49;acc;0;aac;118;agc;42
ctc;0;ccc;0;cac;90;cgc;0;;ctc;0;ccc;5;cac;48;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;19;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;125;ggt;20
tta;22;tca;28;taa;1;tga;0;;tta;95;tca;57;taa;35;tga;17
ata;136;aca;24;aaa;68;aga;115;;ata;287;aca;30;aaa;244;aga;821
cta;2;cca;19;caa;57;cga;13;;cta;21;cca;156;caa;988;cga;1343
gta;29;gca;9;gaa;174;gga;125;;gta;154;gca;15;gaa;4848;gga;3940
ttg;29;tcg;1;tag;0;tgg;24;;ttg;265;tcg;6;tag;33;tgg;443
atg;233;acg;1;aag;91;agg;7;;atg;329;acg;29;aag;2472;agg;146
ctg;27;ccg;6;cag;30;cgg;0;;ctg;42;ccg;47;cag;153;cgg;28
gtg;70;gcg;103;gag;44;ggg;214;;gtg;1560;gcg;3782;gag;1094;ggg;5677
;;;;;;;;;;;;;;;;
tRNAi;;;;;;;;;tRNAs;;;;;;;
ttt;1;tct;1;tat;4;tgt;0;;ttt;4;tct;8;tat;16;tgt;0
atc;0;act;3;aat;0;agt;0;;atc;1;act;79;aat;57;agt;26
ctt;35;cct;1;cat;3;cgt;0;;ctt;110;cct;42;cat;2;cgt;0
gtt;1;gct;0;gat;0;ggc;3;;gtt;19;gct;333;gat;28;ggc;128
ttc;0;tcc;19;tac;729;tgc;4;;ttc;46;tcc;4;tac;225;tgc;546
att;2;acc;0;aac;3;agc;3;;att;70;acc;0;aac;246;agc;88
ctc;0;ccc;2;cac;2;cgc;0;;ctc;0;ccc;3;cac;136;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;16;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;128;ggt;19
tta;10;tca;4;taa;2;tga;1;;tta;107;tca;81;taa;34;tga;16
ata;290;aca;2;aaa;46;aga;407;;ata;133;aca;52;aaa;266;aga;529
cta;0;cca;43;caa;140;cga;124;;cta;23;cca;132;caa;905;cga;1232
gta;0;gca;0;gaa;20;gga;12;;gta;183;gca;24;gaa;5002;gga;4053
ttg;188;tcg;1;tag;3;tgg;1;;ttg;106;tcg;6;tag;30;tgg;466
atg;138;acg;1;aag;314;agg;9;;atg;424;acg;29;aag;2249;agg;144
ctg;0;ccg;7;cag;9;cgg;2;;ctg;69;ccg;46;cag;174;cgg;26
gtg;0;gcg;0;gag;7;ggg;8;;gtg;1630;gcg;3885;gag;1131;ggg;5883
E79.GDI Les rapports des duplications doublons-différents
modifier 
Rapports;;;;;;;;;;;;;;;;
ri;;;;;;;;;rs;;;;;;;
ttt;4.0;tct;0;tat;3;tgt;0;;ttt;14;tct;0.7;tat;13;tgt;18
atc;8.0;act;0;aat;0;agt;0;;atc;6.4;act;1.3;aat;22;agt;3.5
ctt;0;cct;10;cat;0;cgt;0;;ctt;0.7;cct;0.0;cat;9;cgt;0.6
gtt;0;gct;0;gat;0;ggc;0;;gtt;0.8;gct;1.2;gat;32;ggc;0.5
ttc;0;tcc;0;tac;4.5;tgc;0;;ttc;0.7;tcc;2.2;tac;0;tgc;1.1
att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;0.6;acc;1.6;aac;0.8;agc;1.3
ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;1.0;ccc;5.0;cac;0.5;cgc;9.0
gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;1.3;gcc;27;gac;0.6;ggt;39
tta;0;tca;0;taa;2.0;tga;0;;tta;4.3;tca;2.3;taa;30;tga;21
ata;47;aca;0;aaa;0;aga;4;;ata;1.0;aca;2.1;aaa;1.6;aga;0.9
cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;2.2;cca;0.6;caa;1.2;cga;1.2
gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;2.9;gca;1.2;gaa;2.0;gga;0.8
ttg;11;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;0.9;tcg;2.0;tag;48;tgg;1.6
atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;0.7;acg;3.3;aag;0.9;agg;2.9
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0.9;ccg;0.5;cag;0.9;cgg;2.2
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;1.1;gcg;1.5;gag;1.5;ggg;2.0
;;;;;;;;;;;;;;;;
rsi;;;;;;;;;s/i;;;;;;;
ttt;5;tct;0.8;tat;20;tgt;0;;ttt;4.0;tct;8.0;tat;4.0;tgt;0
atc;1;act;3.3;aat;13;agt;0.5;;atc;1;act;26;aat;57;agt;26
ctt;1.4;cct;0.7;cat;5;cgt;0;;ctt;3.1;cct;42;cat;0.7;cgt;0
gtt;0.0;gct;13;gat;13;ggc;4.2;;gtt;19;gct;333;gat;28;ggc;43
ttc;0.9;tcc;3.6;tac;3.2;tgc;5.0;;ttc;46;tcc;0.2;tac;0.3;tgc;137
att;2.1;acc;0;aac;0.9;agc;0.9;;att;35;acc;0;aac;82;agc;29
ctc;0;ccc;5;cac;0.5;cgc;0;;ctc;0;ccc;1.5;cac;68;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;6.6;ggt;20;;gtc;0;gcc;0;gac;8.0;ggt;19
tta;4.3;tca;2.0;taa;35;tga;17;;tta;11;tca;20;taa;17;tga;16
ata;2.1;aca;1.3;aaa;3.6;aga;7.0;;ata;0.5;aca;26;aaa;5.8;aga;1.3
cta;11;cca;8.2;caa;17;cga;103;;cta;23;cca;3.1;caa;6.5;cga;9.9
gta;5.3;gca;1.7;gaa;28;gga;32;;gta;183;gca;24;gaa;250;gga;338
ttg;9.1;tcg;6.0;tag;33;tgg;18;;ttg;0.6;tcg;6.0;tag;10;tgg;466
atg;1.4;acg;29;aag;27;agg;21;;atg;3.1;acg;29;aag;7.2;agg;16
ctg;1.6;ccg;7.8;cag;5.1;cgg;28;;ctg;69;ccg;6.6;cag;19;cgg;13
gtg;22;gcg;37;gag;25;ggg;27;;gtg;1630;gcg;3885;gag;162;ggg;735
E79.GDI Total duplications
modifier 
total duplications;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
in;dble+dif;;;;;;;;sin;dble+dif;;;;;;;;isi;dble+dif;;;;;;
ttt;5;tct;0;tat;3;tgt;0;;ttt;14;tct;834;tat;13;tgt;185;;ttt;5;tct;9;tat;20;tgt;0
atc;9;act;0;aat;0;agt;0;;atc;37;act;1041;aat;23;agt;36;;atc;1;act;82;aat;57;agt;26
ctt;0;cct;11;cat;0;cgt;0;;ctt;712;cct;848;cat;9;cgt;842;;ctt;145;cct;43;cat;5;cgt;0
gtt;0;gct;0;gat;1;ggc;0;;gtt;1054;gct;1729;gat;32;ggc;1354;;gtt;20;gct;333;gat;28;ggc;131
ttc;0;tcc;0;tac;431;tgc;0;;ttc;1071;tcc;119;tac;0;tgc;1646;;ttc;46;tcc;23;tac;954;tgc;550
att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;1317;acc;64;aac;1460;agc;906;;att;72;acc;0;aac;249;agc;91
ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;2;ccc;6;cac;812;cgc;20;;ctc;0;ccc;5;cac;138;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;62;gcc;226;gac;1641;ggt;79;;gtc;0;gcc;0;gac;144;ggt;20
tta;0;tca;0;taa;3;tga;0;;tta;396;tca;496;taa;92;tga;157;;tta;117;tca;85;taa;36;tga;17
ata;95;aca;0;aaa;0;aga;4;;ata;30;aca;836;aaa;1367;aga;152;;ata;423;aca;54;aaa;312;aga;936
cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;387;cca;800;caa;672;cga;503;;cta;23;cca;175;caa;1045;cga;1356
gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;468;gca;6911;gaa;1290;gga;991;;gta;183;gca;24;gaa;5022;gga;4065
ttg;147;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;138;tcg;396;tag;49;tgg;1040;;ttg;294;tcg;7;tag;33;tgg;467
atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;1977;acg;502;aag;1629;agg;804;;atg;562;acg;30;aag;2563;agg;153
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;637;ccg;312;cag;940;cgg;270;;ctg;69;ccg;53;cag;183;cgg;28
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;894;gcg;522;gag;1634;ggg;699;;gtg;1630;gcg;3885;gag;1138;ggg;5891
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
in%;dble+dif;;;;;;;;sin%;dble+dif;;;;;;;;isi%;dble+dif;;;;;;
ttt;21;tct;0;tat;8;tgt;0;;ttt;58;tct;99;tat;36;tgt;100;;ttt;21;tct;1;tat;56;tgt;0
atc;19;act;0;aat;0;agt;0;;atc;79;act;93;aat;29;agt;58;;atc;2;act;7;aat;71;agt;42
ctt;0;cct;1;cat;0;cgt;0;;ctt;83;cct;94;cat;64;cgt;100;;ctt;17;cct;5;cat;36;cgt;0
gtt;0;gct;0;gat;2;ggc;0;;gtt;98;gct;84;gat;52;ggc;91;;gtt;2;gct;16;gat;46;ggc;9
ttc;0;tcc;0;tac;31;tgc;0;;ttc;96;tcc;84;tac;0;tgc;75;;ttc;4;tcc;16;tac;69;tgc;25
att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;95;acc;100;aac;85;agc;91;;att;5;acc;0;aac;15;agc;9
ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;100;ccc;55;cac;85;cgc;100;;ctc;0;ccc;45;cac;15;cgc;0
gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;100;gcc;100;gac;92;ggt;80;;gtc;0;gcc;0;gac;8;ggt;20
tta;0;tca;0;taa;2;tga;0;;tta;77;tca;85;taa;70;tga;90;;tta;23;tca;15;taa;27;tga;10
ata;17;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;5;aca;94;aaa;81;aga;14;;ata;77;aca;6;aaa;19;aga;86
cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;94;cca;82;caa;39;cga;27;;cta;6;cca;18;caa;61;cga;73
gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;72;gca;100;gaa;20;gga;20;;gta;28;gca;0;gaa;80;gga;80
ttg;25;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;24;tcg;98;tag;60;tgg;69;;ttg;51;tcg;2;tag;40;tgg;31
atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;78;acg;94;aag;39;agg;84;;atg;22;acg;6;aag;61;agg;16
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;90;ccg;85;cag;84;cgg;91;;ctg;10;ccg;15;cag;16;cgg;9
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;35;gcg;12;gag;59;ggg;11;;gtg;65;gcg;88;gag;41;ggg;89

E79.GDI Synthèse

modifier 
E79;;;;;;;;;;intron;;;;;;in;;sin;;isi;;tRNAis;;;;;;total;;;%;;;
obligat;aa;Trad;ADN;alpha;zéros;unit1;sint/tot;tRNA;sin t;int;sin 1;in 1;gen isi;gen sin;gen in;dblei;difi;dbles;difs;dbleisi;difisi;tRNAi;tRNAs;ri;rs;rsi;s/i;in;sin;isi;in;sin;isi;
57;Met;12;15;atg;0;0;0.94;2618;2469;149;0;0;11;68;0;0;0;1154;823;233;329;138;424;0;0.7;1.4;3.1;0;1977;562;0;78;22;atg
11;Tyr;34;37;tac;0;1;0.15;1464;225;1239;0;1;41;0;38;79;352;0;0;228;726;729;225;4.5;0;3.2;0.3;431;0;954;31;0;69;tac
22;Pro;21;22;cct;0;1;0.98;981;964;17;1;0;4;73;1;1;10;623;225;26;17;1;42;10;0.4;0.7;42;11;848;43;1;94;5;cct
14;Asp;46;40;gac;0;1;0.99;1864;1846;18;1;0;2;77;0;0;0;1051;590;19;125;16;128;0;0.6;6.6;8.0;0;1641;144;0;92;8;gac
65;Leu;8;14;ctg;0;1;0.99;785;778;7;1;0;7;72;0;0;0;341;296;27;42;0;69;0;0.9;1.6;69;0;637;69;0;90;10;ctg
13;Asn;42;39;aac;0;1;1.00;1788;1,780;8;1;0;5;74;0;0;0;811;649;131;118;3;246;0;0.8;0.9;82;0;1460;249;0;85;15;aac
17;Ile;9;7;att;0;1;1.00;1468;1463;5;1;0;3;76;0;0;0;827;490;23;49;2;70;0;0.6;2.1;35;0;1317;72;0;95;5;att
27;Val;13;8;gtt;0;1;1.00;1153;1150;3;1;0;2;77;0;0;0;580;474;14;6;1;19;0;0.8;0.4;19;0;1054;20;0;98;2;gtt
24;Ala;29;24;gct;0;1;1.00;2141;2137;4;1;0;4;75;0;0;0;798;931;24;309;0;333;0;1.2;13;333;0;1729;333;0;84;16;gct
64;Ala;32;32;gcg;0;1;1.00;4486;4482;4;1;0;4;75;0;0;0;205;317;103;3782;0;3885;0;1.5;37;3885;0;522;3885;0;12;88;gcg
38;Arg;59;59;aga;0;2;0.60;1171;702;469;2;0;57;21;1;0;4;78;74;115;821;407;529;4;0.9;7.1;1.3;4;152;936;0;14;86;aga
52;Gln;40;46;cag;0;2;0.99;1202;1185;17;2;0;8;71;0;0;0;485;455;30;153;9;174;0;0.9;5.1;19;0;940;183;0;84;16;cag
43;Thr;27;27;aca;0;2;0.99;969;964;5;2;0;3;76;0;0;0;271;565;24;30;2;52;0;2.1;1.3;26;0;836;54;0;94;6;aca
54;Glu;48;48;gag;0;2;1.00;2851;2838;13;2;0;6;73;0;0;0;653;981;44;1094;7;1131;0;1.5;25;162;0;1634;1138;0;59;41;gag
34;Glu;47;44;gaa;0;2;1.00;6391;6,363;28;2;0;8;71;0;0;0;427;863;174;4848;20;5002;0;2.0;28;250;0;1290;5022;0;20;80;gaa
48;Gly;63;60;gga;0;2;1.00;5135;5114;21;2;0;9;70;0;0;0;557;434;125;3940;12;4053;0;0.8;32;338;0;991;4065;0;20;80;gga
32;Gln;39;42;caa;0;3;0.92;1796;1648;148;3;0;8;71;0;0;0;303;369;57;988;140;905;0;1.2;17;6.5;0;672;1045;0;39;61;caa
25;Leu;5;6;ctt;0;3;0.95;936;891;45;3;0;10;69;0;0;0;431;281;60;85;35;110;0;0.7;1.4;3.1;0;712;145;0;83;17;ctt
42;Pro;23;26;cca;0;3;0.95;1054;1004;50;3;0;7;72;0;0;0;512;288;19;156;43;132;0;0.6;8.2;3.1;0;800;175;0;82;18;cca
35;Leu;3;9;tta;0;3;0.97;592;574;18;3;0;8;71;0;0;0;75;321;22;95;10;107;0;4.3;4.3;11;0;396;117;0;77;23;tta
41;Ser;19;25;tca;0;3;0.98;660;647;13;3;0;9;70;0;0;0;150;346;28;57;4;81;0;2.3;2.0;20;0;496;85;0;85;15;tca
46;Arg;55;58;cga;0;4;0.93;1938;1807;131;4;0;7;72;0;0;0;228;275;13;1343;124;1232;0;1.2;103;9.9;0;503;1356;0;27;73;cga
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E79.GDI Méthode

modifier
E79.GDI Niveau 1
modifier 
E79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;E79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;vient;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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E79.GDI Niveau 2
modifier 
intron;acs;aga;aml;ath;bacu;bdi;bta;cbr;cbr*;cel;cfa;cge;cja*;cjc;cmk;cpic;cpo*;csi*;dme;dno*;dsi;dya;ecb;eeu*;fca;gac*;gfr;gga;ggo;gmo*;gmx;hgl;hsa;lav;lcm;lma;mcc;mdo;meu*;mgp;mlu*;mmr*;mmu;mpu*;mtr;mun*;nle;oaa;oas;ocu;oga*;oni*;opr*;osa;pan*;pfa;pha*;pma*;pop;ppp;ppy*;ptr;rno;san*;sbi;sbq;shr;spu;ssc;str*;tgu;tma*;tng;tru;tsy*;ttr*;vvi;xtr;zma;;intron
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E79.GDI Niveau 3
modifier 
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