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Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Archées

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Fiche mémoire sur Archées
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Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Archées  », n'a pu être restituée correctement ci-dessus.


ArchéesModifier

archeo blocsModifier

  • Lien tableur: archeo blocs
  • Légende:
    - 23s': possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends.
    - 23s°: 23S ribosomal RNA rRNA prediction is too short
    - 16s': possible 16S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends.
    - 16s°: 16S ribosomal RNA rRNA prediction is too short
    - thanitrop Nitrososphaerales
    - thanitrosp Nitrosopumilales
    - thaumu Thaumarchaeota unclas
    - Kor Korarchaeota
    - crenarcheota crenarcheota
    - aciduli Aciduliprofundum
    - tcocci thermococci
    - tplasma thermoplasma
archeo blocs
Euryarcheota
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc001 Notes
aciduli arc001 16,23,5 1 46 0 46 16235s 16, 23, 5 avant
1 sans 0 1 0
 
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc003-9 Notes
archeoglobi arc003 16gca23, 5 1 46 1 45 16235s 16gca23, 5 avant
arc006 16gca23, 5 1 53 1 52 5 sans 0 5 0
arc007 16gca23, 5 1 47 1 46
arc008 16gca23, 5 1 49 1 48
arc009 16gca23, 5 1 49 1 48
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc010-39 Notes
halobacteria arc010 16gca235-tgc-aag 1 50 3 47 16235s 16gca235 avant
arc011 16gca235-tgc 3 49 2 47 sans 4 23 2 1-3
16s23s5s 1-3 11 16gca235-tgc-aag
16s23s5s-5s 40 total 4 34 2 3*16gca235-tgc-aaa
  16gca235-tgc-tcc
arc015 16gca235-tgc 1 47 2 45 6*16gca235-tgc
arc019 2*16gca235 2 57 2 55
arc021 16gca235 2 53 3 50 avant
16gca235-tgc tcc-16gca235
  atc-16gca235
arc022 16gca235-tgc 3 48 2 46
2*16s23s5s autres incomplets
  23s5s
arc023 16gca235 3 50 6 44
tcc-16gca235 5s en trop
16gca235-tgc-aaa 16s23s5s-5s
5s 3*16gca2355
  2*5s
arc025 2*16gca235 2 45 2 43
arc026 16gca235 1 48 1 47
arc028 16gca235-tgc 1 51 2 49
 
arc029 16gca235 2 48 4 44
16gca235-tgc-aaa
 
arc030 16gca235 3 51 6 45
atc-16gca235
16gca235-tgc-aaa
5s
 
arc032 2*16gca235 3 50 3 47
16gca2355
23s5s
 
arc033 2*16gca235 3 49 3 46
16gca2355
 
arc035 3*16gca235 3 51 3 48
arc036 3*16gca235 4 55 4 51
16gca2355
 
arc037 16gca235-tgc-tcc 1 46 3 43
arc038 16gca235-tgc 1 47 2 45
arc039 16gca235 1 47 1 46
40
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc042-48 Notes
M.bacteria arc042 16gca235 2 47 2 45 16235s 16gca235 avant
16gca2355 10 sans 1 9 0 5s en trop
  2*16gca2355
arc044 3*16gca235 3 47 3 44
arc046 16gca235 2 59 2 57
16gca2355
 
arc048 2*16gca235 3 36 2 34
16s23s5s 10
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc054-69 Notes
M.cocci arc054 6aas-16gca235 2 38 13 25 16235s 16gca235 avant
aca-cca-tac-aaa-5s-gac 4 sans 1 2 1 avant
16gca23 6aas-16gca235
 
arc067 2*16gca235 2 40 2 38 incomplet
5s 16gca23
  6aas-16s23s
arc069 16s23s5s 2 35 12 23
6aas-16s23s 5s en trop
aca-cca-tac-aaa-5s-gac 6 2*aca-cca-tac-aaa-5s-gac
  5s
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc070-110 Notes
M.microbia arc070 2*16gca235 3 54 2 52 16235s 16gca235 avant
16s23s5s sans 7 15 1-3
1-3 1 15 3*16gca235-tgc-5s
arc073 3*16gca235-tgc-5s 3 51 6 45 38 total 8 30 10*16gca23-tgc-5s
arc075 3*16gca235 3 53 3 50 2*16gca23-tgc-5s-cgg
arc076 16gca23-tgc-5s 1 47 2 45 1623-tgc-5s
arc078 2*16gca23-tgc-5s 2 50 4 46
arc079 2*16gca23-tgc-5s 3 53 7 46 5s en trop
16gca23-tgc-5s-cgg 3*16gca235-tgc-5s
  5s-tgc
arc080 2*16gca235 2 48 3 45 5s
5s-tgc
 
arc081 16gca23-tgc-5s 1 47 2 45
arc082 2*16gca23-tgc-5s 3 53 7 46
16gca23-tgc-5s-gcg
5s
 
arc083 2*16gca23-tgc-5s 2 52 4 48
arc084 1623-tgc-5s 1 49 1 48
arc086 2*16gca235 2 49 2 47
arc089 3*16gca235 3 50 3 47
arc094 2*16s23s5s 3 63 1 62
16gca235
 
arc097 2*16s23s5s 3 58 1 57
16gca235
 
arc110 2*16s23s5s 3 56 1 55
16gca235 38
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc180-187 Notes
tcocci arc180 16gca23 1 46 2 44 16gca23, 5 5s en trop
5s-gac 3 sans 3 3*5s-gac
5s
 
arc181 16gca23 1 46 2 44
5s-gac
5s
 
arc187 16gca23 1 46 2 44
5s-gac
5s
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc212-217 Notes
tplasma arc212 16, 23, 5 1 46 0 46 16, 23, 5 5s en trop
arc213 16, 23, 5 1 46 0 46 6 sans 6 5s
arc214 16, 23, 5 1 47 0 47
arc215 16, 23, 5 1 46 0 46
arc216 16, 23, 5 1 46 0 46
arc217 16, 23, 5, 5 1 46 0 46
clade lien blocs 16s total avec sans total clade Total Notes
Euryarcheota 16235s 16gca235 avant
Total 2782 150 2632 sans 13 49 3 1-3
Moyenne 49 3 46 1-3 1 26 0 3*16gca235-tgc-aaa
ecartype 5 3 6 92 total 14 75 3 16gca235-tgc-aag
max 63 13 62 109 16gca235-tgc-tcc
min 35 0 23 3*16gca235-tgc-5s
  6*16gca235-tgc
  2*16gca23-tgc-5s-cgg
Synthèse Notes suite 10*16gca23-tgc-5s
génomes 63 génomes 1623-tgc-5s
blocs 109 7*16, 23, 5
cds 0 8*16gca23,5 autres incomplets
16gca235 75 23s5s
16s23s5s 14 avant
tcc-16gca235 5s en trop
16gca23-tgc-5s-z 12 atc-16gca235 2*aca-cca-tac-aaa-5s-gac
16gca235-tgc-z 14 6aas-16gca235 16s23s5s-5s
16gca23,5 8 3*16gca2355
16, 23, 5 7 incomplet 5*5s
6aas-16gca23 1 16gca23 5s-tgc
6aas-16s23s 1 6aas-16s23s 3*16gca235-tgc-5s
4aas-5s-gac 2 2*16gca2355
  3*5s-gac
autres archées
clade lien blocs 16s total avec sans total clade arc119-208 Notes
thanitrop arc200 1623, 5 1 43 0 43 1623, 5
thanitrosp arc206 1623, 5 1 46 0 46 sans 20 cds
thaumu arc208 1623, 5 1 46 0 46 1-3 2 16-cds-23-cds-gcg, 5, 5
22 total 22
Kor arc040 1623, 5 1 46 0 46 1-3
  1623s, 5s-atc
crenarcheota
protei arc119 1623, 5 1 47 0 47 5s en trop
arc120 1623, 5 1 46 0 46 5s
arc124 1623, 5 1 48 0 48
arc126 1623, 5 1 48 0 48
arc129 1623, 5 1 47 0 47
arc130 16-cds-23-cds-gcg, 5, 5 1 47 1 46
arc133 1623, 5 1 47 0 47
arc136 1623, 5 1 46 0 46
arc141 1623, 5s-atc 1 48 1 47
arc143 1623, 5 1 46 0 46
arc145 1623, 5 1 50 0 50
arc161 1623, 5 1 49 0 49
arc163 1623, 5 1 47 0 47
arc168 1623, 5 1 47 0 47
arc170 1623, 5 1 46 0 46
arc172 1623, 5 1 46 0 46
arc175 1623, 5 1 47 0 47
arc176 1623, 5 1 46 0 46
clade lien blocs 16s total avec sans total clade autres Notes
autres archées 1623, 5
sans 20 cds
Moyenne 47 0 47 1-3 2 16-cds-23-cds-gcg, 5, 5
ecartype 1 0 1 22 total 22
max 50 1 50 1-3
min 43 0 43 1623s, 5s-atc
 
génomes 22 5s en trop
blocs 22 5s
cds 1
1623, 5 22

archeo notesModifier

  • Lien tableur: archeo notes
  • Notice: Les archées présentent aussi des blocs à séquences longues en gènes de tRNA. Ici les 2 seuls M.cocci avec 6aas avant 16s.
  • arc054 Methanocaldococcus fervens AG86, 6aas-16gca235
comp	1008636..1009604		CDS		122	hp
comp	1009727..1009984		ncRNA		53
comp	1010038..1010152		5s		70
comp	1010223..1013210		23s		114
comp	1013325..1013397		gca		65
comp	1013463..1014943		16s		196
comp	1015140..1015211		cac		11
comp	1015223..1015310		cta		32
comp	1015343..1015417		gaa		13
comp	1015431..1015508		atgi		29
comp	1015538..1015613		aac		8
comp	1015622..1015698		ttc		109
comp	1015808..1016863		CDS			TIGR01177 family methyltransferase
  • arc069 Methanotorris igneus Kol 5, 6aas-16s23s
	1393589..1394737		cds		211	DNA double-strand break repair nuclease NurA
comp	1394949..1395025		ttc		96	
	1395122..1395197		aac		65	
	1395263..1395337		atgi		62	
	1395400..1395474		gaa		16	
	1395491..1395575		cta		8	
	1395584..1395655		cac		197	
	1395853..1397326		16s		171	
	1397498..1400473		23s		276	
	1400750..1401265		cds			flagella protein

archeo typageModifier

HalobacteriaModifier

halo type 16-y-235 après 16sModifier
  • Type
type		tableau		av16s	total	%
16s23s5s	4			4	10
gca		34		2	36	90
total		38		2	40
halo type 16235-z après 5sModifier
  • Type
type	total	%
sans	25	63
tgc	6	15
tgc-aaa	3	8
tgc-aag	1	3
tgc-tcc	1	3
5s	4	10
total	40
  • tRNAs
tRNA	total	%
sans	25	56
tgc	11	24
aaa	3	7
aag	1	2
tcc	1	2
5s	4	9
total	45
halo type x-16235 avant 16sModifier
  • Type:
type	
tcc	1
atc	1

M.microbiaModifier

microbia type 16-y-235 après 16sModifier
  • Type
type		tableau	 %
16s23s5s	8	21
gca		30	79
total		38
microbia type 16235-z après 5sModifier
  • Type
type		total	%
sans		22	58
5s-tgc-5s	3	8
tgc-5s-cgg	2	5
tgc-5s		11	29
total		38
  • tRNAs
tRNA	total	%
sans	22	50
tgc	17	39
cgg	2	5
5s	3	7
total	44
microbia type x-16235 avant 16sModifier
  • Type: néant

EuryarcheotaModifier

eury type 16-y-235 après 16sModifier
  • Abrégé
aciduli		16, 23, 5	1
T.plasma			6
		
archeoglobi	16gca23, 5	5
T.cocci				3
		
halobacteria	16gca235	25
		16gca235-z	11
M.microbia	16gca235	15
		16gca235-z	15
		
M.bacteria	16gca235	9
M.cocci				4
		
total abrégé			94
16s23s5s			15
total tableau			109
  • Type, 16s-y-23s5s
	
type		total	%
16gca23		87	80
16s23s		15	14
16,23,5		7	6
total abrégé	109	100

Les autres archéesModifier

autres type 16-y-235 après 16sModifier
  • Abrégé
type			1623,5	
Nitrososphaerales	1
Nitrosopumilales	1
Thaumarchaeota unclas	1
Korarchaeota		1
crenarcheota		17
		
total abrégé		21
total tableau		22
		
crenarcheota		
16-cds-23-cds-gcg, 5, 5

Tableau des noms archeoModifier

  • Lien tableur: Tableau des noms archeo
  • Prélèvement: fait vers le 20.8.19 et mise en forme le 17.8.19 Paris.
  • Légende:
    - rRNAs, 666 ou "10,10,10", sous la forme indiquée par NCBI, (5S, 16S, 23S).
    - rupture, sélection des génomes sur les 2 premiers attributs
    - fait, dans génomes archeo
    - code, utilisé dans les génomes "fait"
    - tRNAs, nombre de tRNAs tel qu'il est déduit de la de la construction des noms.
  • Construction de la liste des noms
  • Statistiques
tRNAs           total           10372
génomes		ruptures	faits	total
 		172		79	217
  • Clades
aciduli		Aciduliprofundum	nano		Nanoarchaeum
archeo		archeoglobi		protei		Thermoprotei
halo		halobacteria		tcocci		thermococci
kor		korarcheota		thanitrop	Nitrosopumilales
mbacteria	methanobacteria		thanitrosp	Nitrososphaerales
mcocci		methanococci		thaum		Cenarchaeales
microbia	methanomicrobia		thaumu		unclassified Thaumarchaeota
mpyri		methanopyri		tplasma		thermoplasmata
F. Noms des archeo
ruptures clade rRNAs fait code tRNAs génomes
1 aciduli 1, 1, 1 1 arc001 46 Aciduliprofundum boonei T469
1 aciduli 1, 1, 1 arc002 46 Aciduliprofundum sp. MAR08-339
1 archeo 1, 1, 1 1 arc003 46 Archaeoglobus fulgidus DSM 4304
archeo 1, 1, 1 arc004 46 Archaeoglobus fulgidus DSM 8774
1 archeo 1, 1, 1 arc005 49 Archaeoglobus profundus DSM 5631
1 archeo 1, 1, 1 1 arc006 53 Archaeoglobus sulfaticallidus PM70-1
1 archeo 1, 1, 1 1 arc007 47 Archaeoglobus veneficus SNP6
1 archeo 1, 1, 1 1 arc008 49 Ferroglobus placidus DSM 10642
1 archeo 1, 1, 1 1 arc009 49 Geoglobus acetivorans SBH6
1 halo 1, 1, 1 1 arc010 50 Halalkalicoccus jeotgali B3
1 halo 4, 3, 3 1 arc011 49 Haloarcula hispanica ATCC 33960 CGMCC 1.2049
halo arc012 49 Haloarcula hispanica N601
1 halo arc013 50 Haloarcula marismortui ATCC 43049
1 halo arc014 49 Haloarcula sp. CBA1115
1 halo 1, 1, 1 1 arc015 47 Halobacterium salinarum R1 DSM 671
1 halo arc016 47 Halobacterium sp. DL1
1 halo arc017 47 Halobacterium sp. NRC-1
1 halo arc018 55 Haloferax mediterranei ATCC 33500
halo 2, 2, 2 1 arc019 57 Haloferax mediterranei ATCC 33500 CGMCC 1.2087
1 halo arc020 53 Haloferax volcanii DS2
1 halo 2, 2, 2 1 arc021 53 Halogeometricum borinquense DSM 11551 PR 3
1 halo 3, 3, 3 1 arc022 48 Halomicrobium mukohataei DSM 12286
1 halo 4, 3, 3 1 arc023 50 Halopiger xanaduensis SH-6
1 halo arc024 45 Haloquadratum walsbyi C23
halo 2, 2, 2 1 arc025 45 Haloquadratum walsbyi DSM 16790 HBSQ001
1 halo 1, 1, 1 1 arc026 48 Halorhabdus tiamatea SARL4B
1 halo arc027 46 Halorhabdus utahensis DSM 12940
1 halo 1, 1, 1 1 arc028 51 Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239
1 halo 2, 2, 2 1 arc029 48 Halostagnicola larsenii XH-48
1 halo 4, 3, 3 1 arc030 51 Haloterrigena turkmenica DSM 5511
1 halo arc031 47 Halovivax ruber XH-70
1 halo 5, 3, 4 1 arc032 50 Natrialba magadii ATCC 43099
1 halo 4, 3, 3 1 arc033 49 Natrinema pellirubrum DSM 15624
1 halo arc034 51 Natrinema sp. J7-2
1 halo 3, 3, 3 1 arc035 51 Natronobacterium gregoryi SP2
1 halo 5, 4, 4 1 arc036 55 Natronococcus occultus SP4
1 halo 1, 1, 1 1 arc037 46 Natronomonas moolapensis 8.8.11
1 halo 1, 1, 1 1 arc038 47 Natronomonas pharaonis DSM 2160 Gabara
1 halo 1, 1, 1 1 arc039 47 Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1
1 Kor 1, 1, 1 1 arc040 46 Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8
1 mbacteria arc041 46 Methanobacterium formicicum
mbacteria 3, 2, 2 1 arc042 47 Methanobacterium formicicum BRM9
1 mbacteria arc043 43 Methanobacterium lacus AL-21
1 mbacteria 3, 3, 3 1 arc044 47 Methanobacterium paludis SWAN1
1 mbacteria arc045 44 Methanobacterium sp. MB1
1 mbacteria 3, 2, 2 1 arc046 59 Methanobrevibacter ruminantium M1
1 mbacteria arc047 36 Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 PS DSMZ 861
1 mbacteria 3, 3, 3 1 arc048 36 Methanobrevibacter sp. AbM4
1 mbacteria arc049 42 Methanosphaera stadtmanae DSM 3091
1 mbacteria arc050 40 Methanothermobacter marburgensis str. Marburg
1 mbacteria arc051 39 Methanothermobacter sp. CaT2
1 mbacteria arc052 39 Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H
1 mbacteria arc053 41 Methanothermus fervidus DSM 2088
1 mcocci 2, 2, 2 1 arc054 38 Methanocaldococcus fervens AG86
1 mcocci arc055 38 Methanocaldococcus infernus ME
1 mcocci arc056 37 Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
1 mcocci arc057 37 Methanocaldococcus sp. FS406-22
1 mcocci arc058 37 Methanocaldococcus sp. JH146
1 mcocci arc059 38 Methanocaldococcus vulcanius M7
1 mcocci arc060 39 Methanococcus aeolicus Nankai-3
1 mcocci arc061 38 Methanococcus maripaludis C5
mcocci arc062 38 Methanococcus maripaludis C6
mcocci arc063 38 Methanococcus maripaludis C7
mcocci arc064 38 Methanococcus maripaludis S2
mcocci arc065 38 Methanococcus maripaludis X1
1 mcocci arc066 38 Methanococcus vannielii SB
1 mcocci 3, 2, 2 1 arc067 40 Methanococcus voltae A3
1 mcocci arc068 38 Methanothermococcus okinawensis IH1
1 mcocci 2, 2, 2 1 arc069 35 Methanotorris igneus Kol 5
1 microbia 3, 3, 3 1 arc070 54 Methanocella arvoryzae MRE50
1 microbia arc071 50 Methanocella conradii HZ254
1 microbia arc072 50 Methanocella paludicola SANAE
1 microbia 6, 3, 3 1 arc073 51 Methanococcoides burtonii DSM 6242
1 microbia arc074 54 Methanococcoides methylutens MM1
1 microbia 3, 3, 3 1 arc075 53 Methanocorpusculum labreanum Z
1 microbia 1, 1, 1 1 arc076 47 Methanoculleus bourgensis MS2 MS2T
1 microbia arc077 49 Methanoculleus marisnigri JR1
1 microbia 2, 2, 2 1 arc078 50 Methanohalobium evestigatum Z-7303
1 microbia 3, 3, 3 1 arc079 53 Methanohalophilus mahii DSM 5219
1 microbia 3, 2, 2 1 arc080 48 Methanolacinia petrolearia DSM 11571
1 microbia 1, 1, 1 1 arc081 47 Methanolinea tarda NOBI-1
1 microbia 4, 3, 3 1 arc082 53 Methanolobus psychrophilus R15
1 microbia 2, 2, 2 1 arc083 52 Methanomethylovorans hollandica DSM 15978
1 microbia 1, 1, 1 1 arc084 49 Methanoregula boonei 6A8
1 microbia arc085 49 Methanoregula formicica SMSP
1 microbia 2, 2, 2 1 arc086 49 Methanosaeta concilii GP6
1 microbia arc087 48 Methanosaeta harundinacea 6Ac
1 microbia arc088 48 Methanosaeta thermophila PT
1 microbia 3, 3, 3 1 arc089 50 Methanosalsum zhilinae DSM 4017
1 microbia arc090 58 Methanosarcina acetivorans C2A
1 microbia arc091 61 Methanosarcina barkeri 227
microbia arc092 60 Methanosarcina barkeri 3
microbia arc093 59 Methanosarcina barkeri MS
microbia 3, 3, 3 1 arc094 63 Methanosarcina barkeri str. Fusaro
microbia arc095 63 Methanosarcina barkeri str. Wiesmoor
1 microbia arc096 60 Methanosarcina horonobensis HB-1 JCM 15518
1 microbia 3, 3, 3 1 arc097 58 Methanosarcina lacustris Z-7289
1 microbia arc098 59 Methanosarcina mazei C16
microbia arc099 57 Methanosarcina mazei Go1
microbia arc100 57 Methanosarcina mazei LYC
microbia arc101 57 Methanosarcina mazei S-6
microbia arc102 57 Methanosarcina mazei SarPi
microbia arc103 43 Methanosarcina mazei Tuc01
microbia arc104 57 Methanosarcina mazei WWM610
1 microbia arc105 57 Methanosarcina siciliae C2J
microbia arc106 57 Methanosarcina siciliae HI350
microbia arc107 57 Methanosarcina siciliae T4/M
1 microbia arc108 62 Methanosarcina sp. Kolksee
1 microbia arc109 57 Methanosarcina sp. MTP4
1 microbia 3, 3, 3 1 arc110 56 Methanosarcina sp. WH1
1 microbia arc111 58 Methanosarcina sp. WWM596
microbia arc112 58 Methanosarcina thermophila CHTI-55
1 microbia arc113 58 Methanosarcina thermophila TM-1
1 microbia arc114 61 Methanosarcina vacuolata Z-761
1 microbia arc115 56 Methanosphaerula palustris E1-9c
1 microbia arc116 51 Methanospirillum hungatei JF-1
1 mpyri arc117 35 Methanopyrus kandleri AV19
1 nano arc118 44 Nanoarchaeum equitans Kin4-M
1 protei 1, 1, 1 1 arc119 47 Acidianus hospitalis W1
1 protei 1, 1, 1 1 arc120 46 Acidilobus saccharovorans 345-15
1 protei arc121 47 Aeropyrum camini SY1 JCM 12091
1 protei arc122 49 Aeropyrum pernix K1
1 protei arc123 46 Caldisphaera lagunensis DSM 15908
1 protei 1, 1, 1 1 arc124 48 Caldivirga maquilingensis IC-167
1 protei arc125 46 Desulfurococcus fermentans DSM 16532
1 protei 1, 1, 1 1 arc126 48 Desulfurococcus kamchatkensis 1221n
1 protei arc127 46 Desulfurococcus mucosus DSM 2162
1 protei arc128 45 Fervidicoccus fontis Kam940
1 protei 1, 1, 1 1 arc129 47 Hyperthermus butylicus DSM 5456
1 protei 2, 1, 1 1 arc130 47 Ignicoccus hospitalis KIN4/I
1 protei arc131 47 Ignisphaera aggregans DSM 17230
1 protei arc132 46 Metallosphaera cuprina Ar-4
1 protei 1, 1, 1 1 arc133 47 Metallosphaera sedula CuR1
protei arc134 47 Metallosphaera sedula DSM 5348
1 protei arc135 47 Pyrobaculum aerophilum str. IM2
1 protei 1, 1, 1 1 arc136 46 Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514
1 protei arc137 46 Pyrobaculum calidifontis JCM 11548
1 protei arc138 46 Pyrobaculum islandicum DSM 4184
1 protei arc139 49 Pyrobaculum oguniense TE7
1 protei arc140 47 Pyrobaculum sp. 1860
1 protei 1, 1, 1 1 arc141 48 Pyrolobus fumarii 1A
1 protei arc142 46 Staphylothermus hellenicus DSM 12710
1 protei 1, 1, 1 1 arc143 46 Staphylothermus marinus F1
1 protei arc144 50 Sulfolobus acidocaldarius DSM 639
protei 1, 1, 1 1 arc145 50 Sulfolobus acidocaldarius N8
protei arc146 50 Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I
protei arc147 46 Sulfolobus acidocaldarius SUSAZ
1 protei arc148 47 Sulfolobus islandicus HVE10/4
protei arc149 47 Sulfolobus islandicus L.D.8.5
protei arc150 47 Sulfolobus islandicus L.S.2.15
protei arc151 49 Sulfolobus islandicus LAL14/1
protei arc152 47 Sulfolobus islandicus M.14.25
protei arc153 46 Sulfolobus islandicus M.16.2
protei arc154 46 Sulfolobus islandicus M.16.23
protei arc155 46 Sulfolobus islandicus M.16.27
protei arc156 47 Sulfolobus islandicus M.16.4
protei arc157 47 Sulfolobus islandicus M.16.40
protei arc158 46 Sulfolobus islandicus M.16.43
protei arc159 47 Sulfolobus islandicus M.16.47
protei arc160 48 Sulfolobus islandicus REY15A
protei 1, 1, 1 1 arc161 49 Sulfolobus islandicus Y.G.57.14
protei arc162 46 Sulfolobus islandicus Y.N.15.51
1 protei 1, 1, 1 1 arc163 47 Sulfolobus solfataricus 98/2
protei arc164 46 Sulfolobus solfataricus 98/2 SULC
protei arc165 45 Sulfolobus solfataricus P2
protei arc166 47 Sulfolobus solfataricus SULA
protei arc167 47 Sulfolobus solfataricus SULB
1 protei 1, 1, 1 1 arc168 47 Sulfolobus tokodaii str. 7
1 protei arc169 46 Thermofilum carboxyditrophus 1505
1 protei 1, 1, 1 1 arc170 46 Thermofilum pendens Hrk 5
1 protei arc171 46 Thermofilum sp. 1910b
1 protei 1, 1, 1 1 arc172 46 Thermogladius cellulolyticus 1633
1 protei arc173 46 Thermoproteus neutrophilus V24Sta
1 protei arc174 46 Thermoproteus tenax Kra 1
1 protei 1, 1, 1 1 arc175 47 Thermoproteus uzoniensis 768-20
1 protei 1, 1, 1 1 arc176 46 Thermosphaera aggregans DSM 11486
1 protei arc177 46 Vulcanisaeta distributa DSM 14429
1 protei arc178 47 Vulcanisaeta moutnovskia 768-28
1 tcocci arc179 47 Palaeococcus pacificus DY20341
1 tcocci 2, 1, 1 1 arc180 46 Pyrococcus abyssi GE5
1 tcocci 2, 1, 1 1 arc181 46 Pyrococcus furiosus COM1
tcocci arc182 46 Pyrococcus furiosus DSM 3638
1 tcocci arc183 46 Pyrococcus horikoshii OT3
1 tcocci arc184 46 Pyrococcus sp. NA2
1 tcocci arc185 46 Pyrococcus sp. ST04
1 tcocci arc186 47 Pyrococcus yayanosii CH1
1 tcocci 2, 1, 1 1 arc187 46 Thermococcus barophilus MP
1 tcocci arc188 46 Thermococcus eurythermalis A501
1 tcocci arc189 47 Thermococcus gammatolerans EJ3 DSM 15229
1 tcocci arc190 48 Thermococcus kodakarensis KOD1
1 tcocci arc191 47 Thermococcus litoralis DSM 5473
1 tcocci arc192 47 Thermococcus nautili 30-1
1 tcocci arc193 46 Thermococcus onnurineus NA1
1 tcocci arc194 46 Thermococcus sibiricus MM 739
1 tcocci arc195 46 Thermococcus sp. 4557
1 tcocci arc196 46 Thermococcus sp. AM4
1 tcocci arc197 46 Thermococcus sp. CL1
1 tcocci arc198 48 Thermococcus sp. ES1
1 thanitrop arc199 44 Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1
1 thanitrop 1, 1, 1 1 arc200 43 Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2
1 thanitrop arc201 44 Candidatus Nitrosopumilus sp. D3C
1 thanitrop arc202 43 Candidatus Nitrosopumilus sp. NF5
1 thanitrop arc203 44 Nitrosopumilus maritimus SCM1
1 thanitrosp arc204 48 Candidatus Nitrososphaera evergladensis SR1
1 thanitrosp arc205 47 Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2
1 thanitrosp 1, 1, 1 1 arc206 46 Nitrososphaera viennensis EN76
1 thaum arc207 46 Cenarchaeum symbiosum A
1 thaumu 1, 1, 1 1 arc208 46 Candidatus Caldiarchaeum subterraneum
1 thaumu arc209 47 Thaumarchaeota archaeon SAT1
1 tplasma arc210 46 Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1
1 tplasma arc211 46 Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201
1 tplasma 1, 1, 1 1 arc212 46 Candidatus Methanoplasma termitum MpT1
1 tplasma 1, 1, 1 1 arc213 46 Ferroplasma acidarmanus fer1
1 tplasma 1, 1, 1 1 arc214 47 Picrophilus torridus DSM 9790
1 tplasma 1, 1, 1 1 arc215 46 Thermoplasma acidophilum DSM 1728
1 tplasma 1, 1, 1 1 arc216 46 Thermoplasma volcanium GSS1
1 tplasma 2, 1, 1 1 arc217 46 Thermoplasmatales archaeon BRNA1
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