« Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Annexe/génomes synthèse » : différence entre les versions

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*Légende:
#génomes1: '''gen''' pour génome, '''n-cds''' pour total des cds du NCBI, '''inter%''' pour le rapport du total des intercalaires positifs sur la longueur du génome, '''moy''' pour moyenne de l'intervalle 0-200, '''rap''' pour le rapport de la somme des fréquences 0-100 sur celle de 101-370 (colonnes 100 et 200+370 du tableau génomes3), '''a37''' et '''b37R2''' les paramètres de la droite de détermination du diagramme du total des fréquences de 26 à 370 par pas de 5, a37 la pente, obtenue en multipliant par 100 la valeur du diagramme, et b37R2 lale constantecoefficient dude diagrammedétermination.
#génomes2 et 3: '''cds''' pour nombre total des intercalaires entre cds, les fréquences en '''<0''' négatif, '''100''' entre 0-100, '''200''' entre 101-200, '''300''' entre 201-370, '''600''' entre 371-600, '''max''' au-delà de 600.
*Notes: Ces 3 tableaux servent à comparer les 21 génomes entre eux. Je n'ai pas déterminé les intercalaires cds-cds des 30 autres génomes des annexes. Les fréquences des intercalaires cds-cds me permet de savoir si les intercalaires tRNA-cds des relevés dans les tableaux "'''génome opérons'''" sont différents. Les diagrammes faits sur une grande plage des fréquences ne permet d'obtenir qu'une courbe de détermination de fonction puissance, très difficile à manipuler. La plage de fréquences 26-370 avec un pas de 5 est plus caractéristique de chaque génome et permet d'obtenir une droite comme courbe de détermination avec un R2 souvent supérieur à 0.60.
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|+génomes1. Synthèse des fréquences
|-style="border-bottom:2px solid black;"
!gen!!n-cds!!inter%!!moy!!rap!!a37!!b37R2
|-
|bgcolor="#ffff00"| '''pub||1,343||'''3.0||'''37||'''14||bgcolor="#ffff00"| 5.93||17'''63
|-
|bgcolor="#ffff00"| '''rtb||828||'''20.2||'''85||109||bgcolor="#ffff00"| 3.05||12'''58
|-
|'''rru||3,854||9.9||78||89||18.99||7191
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|'''eco||4,285||9.1||72||76||20.08||7488
|-
|bgcolor="#ff6600"| '''spl||4,269||'''14.1||'''82||105||bgcolor="#ff6600"| 17.06||7376
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#99ff66"| '''bsu||4,325||9.5||72||64||bgcolor="#99ff66"| 29.29||9681
|-
|bgcolor="#99ff66"| '''pmq||7,258||'''13.8||'''88||'''130||bgcolor="#99ff66"| 28.46||12790
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#ff6600"| '''cbn||2,521||11.3||71||79||bgcolor="#ff6600"| 14.59||5382
|-
|bgcolor="#ff6600"| '''cbei||5,665||'''17.9||'''83||'''136||bgcolor="#ff6600"| 14.71||7983
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#99ff66"| '''ase||8,256||11.5||76||79||bgcolor="#99ff66"| 43.46||15688
|-
|bgcolor="#66ffff"| '''blo||1,824||10.6||'''88||116||bgcolor="#66ffff"| 9.53||3678
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|'''myr||3,611||12.2||'''67||63||19.62||6984
|-
|bgcolor="#66ffff"| '''pmg||1,839||8.5||'''55||'''35||bgcolor="#66ffff"| 11.99||3876
|-
|bgcolor="#66ffff"| '''abra||1,712||'''7.2||65||57||bgcolor="#66ffff"| 8.52||2882
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#99ff66"| '''cvi||4,345||9.5||74||67||bgcolor="#99ff66"| 26.5||9078
|-
|bgcolor="#99ff66"| '''ade||4,506||8.5||70||66||bgcolor="#99ff66"| 25.6||8890
|-
|bgcolor="#ff6600"| '''ant||3,119||'''6.0||'''56||'''38||bgcolor="#ff6600"| 16.12||5181
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#66ffff"| '''afn||2,093||9.5||66||75||bgcolor="#66ffff"| 8.68||3477
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#66ffff"| '''scc||1,847||8.8||69||72||bgcolor="#66ffff"| 8.68||3282
|-
|&emsp;||||||||||||
|-
|bgcolor="#66ffff"| '''mja||1,768||9.1||64||53||bgcolor="#66ffff"| 9.96||3480
|-
|bgcolor="#ffff00"| '''mba||3,995||'''26.7||'''85||'''154||bgcolor="#ffff00"| 5.54||39'''46
|}
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